- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT03589079
Avgrensning av nye monogene lidelser i befolkningen i De forente arabiske emirater
Avgrensning av nye monogene lidelser i De forente arabiske emirater
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Monogene lidelser skyldes et enkelt defekt gen og arves i henhold til Mendels lover (mendelske lidelser). Slike genfeil oppstår fra en mutasjon som enten kan arves eller oppstå spontant; begge kan oppstå i fravær av en tidligere familiehistorie. Arvelige mutasjoner kan være dominante eller recessive, og autosomale eller kjønnsbundne. Ifølge WHO, selv om de er individuelt sjeldne, påvirker kollektivt monogene lidelser millioner av mennesker over hele verden. For tiden anslås over 10 000 menneskelige sykdommer å være monogene. Inntil nylig har identifisering av genetiske årsaker, spesielt av ekstremt sjeldne fenotyper, ikke vært mulig eller kostnadseffektiv på grunn av de vitenskapelige utfordringene med å identifisere kausative mutasjoner gjennom koblingsanalyse. Fremkomsten av kostnadseffektiv neste generasjons sekvensering letter nå identifiseringen av alle sjeldne varianter på tvers av hele genomet, og tillater i sin tur mutasjonsidentifikasjon i små familier og, hvis de novo, selv i enkelttilfeller.
Den kliniske anvendelsen av enkeltgensekvensering gir potensielt konkrete fordeler for pasienter, informerer om diagnose og prognose, og kan veilede behandlingsvalg. Neste generasjons sekvenseringspaneler (NGS) sekvenserer flere gener parallelt og går nå inn i det kliniske domenet. NGS gir betydelige fordeler i forhold til enkeltgensekvensering for tilstander som er genetisk heterogene, for eksempel epilepsiene. Men ettersom flere gener inkluderes i et NGS-panel, øker muligheten for tilfeldige funn betydelig, med tilhørende utfordringer i resultattolkning. Siden mange forhold er fenotypisk så vel som genetisk heterogene, er innhenting av detaljert fenotypisk informasjon avgjørende for meningsfull tolkning av NGS-resultater.
Monogene (mendelske) lidelser har historisk sett gitt den klareste måten å belyse menneskelig genfunksjon. Koblingen av en sjelden DNA-variant til endret proteinfunksjon eller dose til diskret fenotype har viktige implikasjoner for grunnleggende biologi, monogen sykdomspatogenese, komplekse egenskaper, diagnostikk og terapi. Ved å representere den lettest tolkbare komponenten av menneskelig genetikk i å definere en klar fenotype med høy penetrans som oppstår fra endring i funksjon av et enkelt gen, kan studier av monogene lidelser identifisere det genetiske grunnlaget for nye eller eksisterende fenotyper og gi innsikt i ikke-redundante biologiske veier som kan informere terapeutisk målretting for både den spesifikke sjeldne varianten og vanlige sykdommer. Følgelig er hovedformålet med dette programmet å identifisere nye monogene fenotyper og oppdage underliggende kausale genetiske varianter ved genetisk sekvensering i familier over hele UAE.
Studietype
Registrering (Forventet)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
Abu Dhabi, De forente arabiske emirater, 48338
- Rekruttering
- Imperial College London Diabetes Centre
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Deltakerne vil vise kliniske fenotyper som tyder på en underliggende ny monogen lidelse, med/uten tilstedeværelse av familiært tilbakefall av fenotypen og/eller foreldres slektskap.
Stamtavler av spesiell interesse (i preferanserekkefølge) vil inkludere:
- Slektsfamilier, ideelt sett der ett eller flere familiemedlemmer er berørt
- De novo basert - dvs. trioer av proband og begge foreldrene, der bare probanden viser fenotypen
- Autosomal recessiv
- Autosomal dominant, om enn med en stor slekt (f.eks. ideelt sett 6-8 berørte medlemmer over 2-3 generasjoner)
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
Spesifikk fenotype - fenotyper av interesse som tyder på en underliggende ny genetisk lidelse:
- Uvanlige presentasjoner av vanlige lidelser, f.eks. med klart definerte syndromiske/dysmorfe trekk*.
- Ekstreme fenotypiske presentasjoner.
- Helt nye, tidligere udefinerte fenotyper.
Familiehistorie/stamtavle - Fenotype mistenkt å skyldes en enkelt genetisk mutasjon (de novo eller arvet) basert, der tilgjengelig, på noen av:
- Tilstedeværelse av syndromiske/dysmorfe trekk.
- Familiehistorie med lignende presentasjoner i andre slektninger.
- Mønster av arv.
- Foreldres slektskap.
Klinisk tolkning – der tilgjengelig (dvs. ikke obligatorisk, men vil øke tilliten til egnethet), tilstedeværelsen av kliniske og/eller undersøkelsesresultater i samsvar med en ny arvelig/monogen lidelse:
- Utelukkelse av ikke-genetiske ervervede årsaker – f.eks. de med en klar historie med sannsynlig miljøårsak.
- Genotype negativ for kjente gener som ligger til grunn for lidelsen/fenotypen.
- Samtykke - Deltaker (eller forelder/verge hvis den er under 18 år) som er villig og i stand til å gi informert samtykke for deltakelse i studien som proband (mann/kvinnelig), forelder i en trio eller utvidet familiemedlem.
Ekskluderingskriterier:
- Deltakeren eller deres juridiske verge/rettslige representant er uvillig eller ute av stand til å gi informert samtykke. I tilfeller der en potensiell barnedeltaker har kapasitet til å samtykke, men nekter å delta, vil barnets vilje bli respektert.
- Deltaker som allerede har gjennomgått genotyping/panel/laboratorietesting (f.eks. for kjente medfødte stoffskiftefeil) og har en definert/diagnostisert genetisk tilstand.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiver: Tverrsnitt
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
---|---|
Monogen lidelse
Deltakere som viser kliniske fenotyper som tyder på en underliggende ny monogen lidelse, med/uten tilstedeværelse av familiært tilbakefall av fenotypen og/eller foreldres slektskap vil bli inkludert.
Sanger og/eller Next Generation Sequencing (NGS) - Panel/WES/WGS-tilnærminger vil bli brukt for å lette identifisering av de novo/arvede varianter i barnet/proben.
|
NGS-panel, heleksom/genomsekvensering (WES/WGS)
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Ny fenotype og genfunn
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Identifikasjon og karakterisering av nye monogene fenotyper fra spesifikke stamtavler. Objektiv identifikasjon av nye, sjeldne sykdomsfremkallende gener gjennom anvendelse av genetiske sekvenseringsmetodikker på nye eller etablerte fenotyper. |
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Generer ny biologisk innsikt
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Få innsikt i de patologiske mekanismene (kjente eller nye nedstrøms sykdomsveier) som ligger til grunn for monogen sykdom og mer generelt til vanlige/komplekse sykdommer, i tillegg til grunnleggende innsikt om fysiologisk genfunksjon.
|
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Modifikatorgener for monogene lidelser
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Identifisere modifiseringsgener for monogene lidelser - for å hjelpe til med forståelsen av fenotypisk heterogenitet av mendelske lidelser.
|
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Potensielle nye terapeutiske mål
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Identifiser potensielle nye terapeutiske mål - bruk denne innsikten for å identifisere robuste, genetisk definerte potensielle molekylære og cellulære medikamentmål (relatert til det primære genet og/eller modifiseringsgener) for behandling av sjeldne (foreldreløse) og/eller vanlig sykdom.
|
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Genfunksjon og målvalidering
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Bestem den funksjonelle effekten av identifiserte patogene varianter der det er mulig, og valider sykdomsmekanismebaserte mål gjennom bruk av prekliniske (in vitro/in vivo) og/eller tidlige eksperimentelle studier på mennesker.
|
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 2 år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- 1- Chial H. Rare Genetic Disorders: Learning About Genetic Disease Through Gene Mapping, SNPs, and Microarray Data. Nature Education 2008;1(1):192.
- 2- Genes and human disease. World Heath Organization 2017. Retrieved from http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.html
- Ku CS, Cooper DN, Patrinos GP. The Rise and Rise of Exome Sequencing. Public Health Genomics. 2016;19(6):315-324. doi: 10.1159/000450991. Epub 2016 Nov 30.
- Mefford HC. Clinical Genetic Testing in Epilepsy. Epilepsy Curr. 2015 Jul-Aug;15(4):197-201. doi: 10.5698/1535-7511-15.4.197.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Della Mina E, Ciccone R, Brustia F, Bayindir B, Limongelli I, Vetro A, Iascone M, Pezzoli L, Bellazzi R, Perotti G, De Giorgis V, Lunghi S, Coppola G, Orcesi S, Merli P, Savasta S, Veggiotti P, Zuffardi O. Improving molecular diagnosis in epilepsy by a dedicated high-throughput sequencing platform. Eur J Hum Genet. 2015 Mar;23(3):354-62. doi: 10.1038/ejhg.2014.92. Epub 2014 May 21.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Forventet)
Studiet fullført (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- IREC038
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
produkt produsert i og eksportert fra USA
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .
Kliniske studier på Sanger og/eller Next Generation Sequencing (NGS)
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteDana-Farber Cancer InstituteAktiv, ikke rekrutterendeIkke-småcellet lungekreftForente stater
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Institut Bergonié; Plateforme labellisée Inca - Institut Bergonié, Bordeaux og andre samarbeidspartnereFullførtMykvevssarkom | Kolorektal karsinomFrankrike
-
ReprogeneticsReproductive Medicine Lab, LLCUkjent
-
Tianjin Medical University Second HospitalUkjent
-
Duke UniversityNational Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)RekrutteringLungebetennelse, bakteriell | Ventilator Associated PneumoniaForente stater