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Delineazione di nuovi disturbi monogenici nella popolazione degli Emirati Arabi Uniti

11 febbraio 2020 aggiornato da: Imperial College London Diabetes Centre

Delineazione di nuovi disturbi monogenici negli Emirati Arabi Uniti

Lo studio mira a identificare nuovi fenotipi monogenici da specifici pedigree e scoprire la variante genetica causale sottostante utilizzando metodologie di sequenziamento genetico (Sanger e/o Next Generation Sequencing - Panel/WES/WGS) nelle famiglie degli Emirati Arabi Uniti (UAE).

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

Le malattie monogeniche derivano da un singolo gene difettoso e sono ereditate secondo le leggi di Mendel (malattie mendeliane). Tali difetti genetici derivano da una mutazione che può essere ereditata o verificarsi spontaneamente; entrambi possono verificarsi in assenza di una precedente storia familiare. Le mutazioni ereditarie possono essere dominanti o recessive, autosomiche o legate al sesso. Secondo l'OMS, sebbene individualmente rare, le malattie monogeniche colpiscono collettivamente milioni di persone in tutto il mondo. Attualmente, si stima che oltre 10.000 malattie umane siano monogeniche. Fino a poco tempo fa l'identificazione delle cause genetiche, in particolare di fenotipi estremamente rari, non era possibile o conveniente a causa delle sfide scientifiche nell'identificare le mutazioni causali attraverso l'analisi di linkage. L'avvento del sequenziamento di nuova generazione a costi contenuti ora facilita l'identificazione di tutte le varianti rare nell'intero genoma, consentendo a sua volta l'identificazione della mutazione in piccole famiglie e, se de novo, anche in singoli casi.

L'applicazione clinica del sequenziamento di un singolo gene offre potenzialmente vantaggi tangibili ai pazienti, informando la diagnosi e la prognosi e può guidare la scelta del trattamento. I pannelli di sequenziamento di nuova generazione (NGS) sequenziano più geni in parallelo e stanno ora entrando nel dominio clinico. NGS offre vantaggi significativi rispetto al sequenziamento di un singolo gene per condizioni geneticamente eterogenee, come le epilessie. Tuttavia, poiché più geni sono inclusi in un pannello NGS, la possibilità di scoperte accidentali aumenta in modo significativo, con difficoltà associate nell'interpretazione dei risultati. Poiché molte condizioni sono fenotipicamente e geneticamente eterogenee, l'acquisizione di informazioni fenotipiche dettagliate è essenziale per un'interpretazione significativa dei risultati NGS.

I disordini monogenici (mendeliani) hanno storicamente fornito i mezzi più chiari per chiarire la funzione dei geni umani. Il collegamento di una rara variante del DNA alla funzione proteica alterata o alla dose al fenotipo discreto ha importanti implicazioni per la biologia fondamentale, la patogenesi della malattia monogenica, i tratti complessi, la diagnostica e la terapia. Rappresentando la componente più facilmente interpretabile della genetica umana nella definizione di un fenotipo chiaro e ad alta penetranza derivante dall'alterazione della funzione di un singolo gene, lo studio dei disordini monogenici può identificare la base genetica per fenotipi nuovi o esistenti e fornire approfondimenti sulle malattie non ridondanti percorsi biologici che possono informare il targeting terapeutico sia per la specifica variante rara che per le malattie comuni. Di conseguenza, lo scopo principale di questo programma è identificare nuovi fenotipi monogenici e scoprire varianti genetiche causali sottostanti mediante sequenziamento genetico nelle famiglie negli Emirati Arabi Uniti.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

150

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

      • Abu Dhabi, Emirati Arabi Uniti, 48338
        • Reclutamento
        • Imperial College London Diabetes Centre

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino
  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione di probabilità

Popolazione di studio

I partecipanti presenteranno fenotipi clinici suggestivi di un nuovo disturbo monogenico sottostante, con/senza la presenza di recidiva familiare del fenotipo e/o consanguineità dei genitori.

I pedigree di particolare interesse (in ordine di preferenza) includeranno:

  • Famiglie consanguinee, idealmente in cui uno o più membri della famiglia sono affetti
  • Base de novo - cioè trii di probando ed entrambi i genitori, dove solo il probando esibisce il fenotipo
  • Autosomica recessiva
  • Autosomica dominante, anche se con una grande parentela (es. idealmente 6-8 membri affetti in 2-3 generazioni)

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Fenotipo specifico - Fenotipi di interesse indicativi di una nuova malattia genetica sottostante:

    1. Presentazioni insolite di disturbi comuni, ad es. con caratteristiche sindromiche/dismorfiche chiaramente definite*.
    2. Presentazioni fenotipiche estreme.
    3. Fenotipi completamente nuovi, precedentemente indefiniti.
  • Anamnesi familiare/pedigree - Fenotipo sospettato di essere dovuto a una singola mutazione genetica (de novo o ereditaria) basata, ove disponibile, su uno qualsiasi di:

    1. Presenza di caratteristiche sindromiche/dismorfiche.
    2. Storia familiare di presentazioni simili in altri parenti.
    3. Modello di ereditarietà.
    4. Consanguineità parentale.
  • Interpretazione clinica - Ove disponibile (ad es. non obbligatorio ma aumenterà la fiducia nell'idoneità), la presenza di risultati clinici e/o di indagine coerenti con una nuova malattia ereditaria/monogenica:

    1. Esclusione di cause acquisite non genetiche - ad es. quelli con una storia chiara di probabile causa ambientale.
    2. Genotipo negativo per geni noti alla base del disturbo/fenotipo.
  • Consenso - Partecipante (o genitore/tutore legale se di età inferiore a 18 anni) disposto e in grado di fornire il consenso informato per la partecipazione allo studio come probando (maschio/femmina), genitore in un trio o membro della famiglia allargata.

Criteri di esclusione:

  • Il partecipante o il suo tutore legale/rappresentante legale non vuole o non è in grado di fornire il consenso informato. Nei casi in cui un potenziale bambino partecipante abbia la capacità di acconsentire ma si rifiuti di partecipare, la volontà del bambino sarà rispettata.
  • Partecipante che è già stato sottoposto a test di genotipizzazione/pannello/di laboratorio (ad es. per errori congeniti noti del metabolismo) e presenta una condizione genetica definita/diagnosticata.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Coorte
  • Prospettive temporali: Trasversale

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Disturbo monogenico
Saranno inclusi i partecipanti che presentano fenotipi clinici suggestivi di un nuovo disturbo monogenico sottostante, con/senza la presenza di recidiva familiare del fenotipo e/o consanguineità dei genitori. Gli approcci Sanger e/o Next Generation Sequencing (NGS) - Panel/WES/WGS saranno utilizzati per facilitare l'identificazione di varianti de novo/ereditate nel bambino/probando.
Pannello NGS, sequenziamento dell'intero esoma/genoma (WES/WGS)

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Nuovo fenotipo e scoperta genica
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni

Identificazione e caratterizzazione di nuovi fenotipi monogenici da specifici pedigree.

Identificazione imparziale di geni nuovi e rari che causano malattie attraverso l'applicazione di metodologie di sequenziamento genetico a fenotipi nuovi o consolidati.

attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Genera nuove intuizioni biologiche
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Ottenere approfondimenti sui meccanismi patologici (percorsi della malattia a valle noti o nuovi) alla base della malattia monogenica e più in generale delle malattie comuni/complesse, oltre a approfondimenti fondamentali riguardanti la funzione genica fisiologica.
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Geni modificatori di malattie monogeniche
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Identificare i geni modificatori dei disturbi monogenici - per aiutare la comprensione dell'eterogeneità fenotipica dei disturbi mendeliani.
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Potenziali nuovi bersagli terapeutici
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Identificare potenziali nuovi bersagli terapeutici: sfruttare queste informazioni per identificare potenziali bersagli farmacologici molecolari e cellulari robusti e geneticamente definiti (correlati al gene primario e/o ai geni modificatori) per il trattamento di malattie rare (orfane) e/o comuni.
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Funzione genica e validazione del target
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
Ove possibile, determinare l'impatto funzionale delle varianti patogene identificate e convalidare gli obiettivi basati sul meccanismo della malattia attraverso l'uso di studi sperimentali preclinici (in vitro/in vivo) e/o precoci sull'uomo.
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

1 gennaio 2018

Completamento primario (Anticipato)

1 gennaio 2021

Completamento dello studio (Anticipato)

1 gennaio 2021

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

2 luglio 2018

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

16 luglio 2018

Primo Inserito (Effettivo)

17 luglio 2018

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

12 febbraio 2020

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

11 febbraio 2020

Ultimo verificato

1 febbraio 2020

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • IREC038

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Disturbi mendeliani

Prove cliniche su Sanger e/o Next Generation Sequencing (NGS)

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