- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT03589079
Delineazione di nuovi disturbi monogenici nella popolazione degli Emirati Arabi Uniti
Delineazione di nuovi disturbi monogenici negli Emirati Arabi Uniti
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Le malattie monogeniche derivano da un singolo gene difettoso e sono ereditate secondo le leggi di Mendel (malattie mendeliane). Tali difetti genetici derivano da una mutazione che può essere ereditata o verificarsi spontaneamente; entrambi possono verificarsi in assenza di una precedente storia familiare. Le mutazioni ereditarie possono essere dominanti o recessive, autosomiche o legate al sesso. Secondo l'OMS, sebbene individualmente rare, le malattie monogeniche colpiscono collettivamente milioni di persone in tutto il mondo. Attualmente, si stima che oltre 10.000 malattie umane siano monogeniche. Fino a poco tempo fa l'identificazione delle cause genetiche, in particolare di fenotipi estremamente rari, non era possibile o conveniente a causa delle sfide scientifiche nell'identificare le mutazioni causali attraverso l'analisi di linkage. L'avvento del sequenziamento di nuova generazione a costi contenuti ora facilita l'identificazione di tutte le varianti rare nell'intero genoma, consentendo a sua volta l'identificazione della mutazione in piccole famiglie e, se de novo, anche in singoli casi.
L'applicazione clinica del sequenziamento di un singolo gene offre potenzialmente vantaggi tangibili ai pazienti, informando la diagnosi e la prognosi e può guidare la scelta del trattamento. I pannelli di sequenziamento di nuova generazione (NGS) sequenziano più geni in parallelo e stanno ora entrando nel dominio clinico. NGS offre vantaggi significativi rispetto al sequenziamento di un singolo gene per condizioni geneticamente eterogenee, come le epilessie. Tuttavia, poiché più geni sono inclusi in un pannello NGS, la possibilità di scoperte accidentali aumenta in modo significativo, con difficoltà associate nell'interpretazione dei risultati. Poiché molte condizioni sono fenotipicamente e geneticamente eterogenee, l'acquisizione di informazioni fenotipiche dettagliate è essenziale per un'interpretazione significativa dei risultati NGS.
I disordini monogenici (mendeliani) hanno storicamente fornito i mezzi più chiari per chiarire la funzione dei geni umani. Il collegamento di una rara variante del DNA alla funzione proteica alterata o alla dose al fenotipo discreto ha importanti implicazioni per la biologia fondamentale, la patogenesi della malattia monogenica, i tratti complessi, la diagnostica e la terapia. Rappresentando la componente più facilmente interpretabile della genetica umana nella definizione di un fenotipo chiaro e ad alta penetranza derivante dall'alterazione della funzione di un singolo gene, lo studio dei disordini monogenici può identificare la base genetica per fenotipi nuovi o esistenti e fornire approfondimenti sulle malattie non ridondanti percorsi biologici che possono informare il targeting terapeutico sia per la specifica variante rara che per le malattie comuni. Di conseguenza, lo scopo principale di questo programma è identificare nuovi fenotipi monogenici e scoprire varianti genetiche causali sottostanti mediante sequenziamento genetico nelle famiglie negli Emirati Arabi Uniti.
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
-
Abu Dhabi, Emirati Arabi Uniti, 48338
- Reclutamento
- Imperial College London Diabetes Centre
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
I partecipanti presenteranno fenotipi clinici suggestivi di un nuovo disturbo monogenico sottostante, con/senza la presenza di recidiva familiare del fenotipo e/o consanguineità dei genitori.
I pedigree di particolare interesse (in ordine di preferenza) includeranno:
- Famiglie consanguinee, idealmente in cui uno o più membri della famiglia sono affetti
- Base de novo - cioè trii di probando ed entrambi i genitori, dove solo il probando esibisce il fenotipo
- Autosomica recessiva
- Autosomica dominante, anche se con una grande parentela (es. idealmente 6-8 membri affetti in 2-3 generazioni)
Descrizione
Criterio di inclusione:
Fenotipo specifico - Fenotipi di interesse indicativi di una nuova malattia genetica sottostante:
- Presentazioni insolite di disturbi comuni, ad es. con caratteristiche sindromiche/dismorfiche chiaramente definite*.
- Presentazioni fenotipiche estreme.
- Fenotipi completamente nuovi, precedentemente indefiniti.
Anamnesi familiare/pedigree - Fenotipo sospettato di essere dovuto a una singola mutazione genetica (de novo o ereditaria) basata, ove disponibile, su uno qualsiasi di:
- Presenza di caratteristiche sindromiche/dismorfiche.
- Storia familiare di presentazioni simili in altri parenti.
- Modello di ereditarietà.
- Consanguineità parentale.
Interpretazione clinica - Ove disponibile (ad es. non obbligatorio ma aumenterà la fiducia nell'idoneità), la presenza di risultati clinici e/o di indagine coerenti con una nuova malattia ereditaria/monogenica:
- Esclusione di cause acquisite non genetiche - ad es. quelli con una storia chiara di probabile causa ambientale.
- Genotipo negativo per geni noti alla base del disturbo/fenotipo.
- Consenso - Partecipante (o genitore/tutore legale se di età inferiore a 18 anni) disposto e in grado di fornire il consenso informato per la partecipazione allo studio come probando (maschio/femmina), genitore in un trio o membro della famiglia allargata.
Criteri di esclusione:
- Il partecipante o il suo tutore legale/rappresentante legale non vuole o non è in grado di fornire il consenso informato. Nei casi in cui un potenziale bambino partecipante abbia la capacità di acconsentire ma si rifiuti di partecipare, la volontà del bambino sarà rispettata.
- Partecipante che è già stato sottoposto a test di genotipizzazione/pannello/di laboratorio (ad es. per errori congeniti noti del metabolismo) e presenta una condizione genetica definita/diagnosticata.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Trasversale
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
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Disturbo monogenico
Saranno inclusi i partecipanti che presentano fenotipi clinici suggestivi di un nuovo disturbo monogenico sottostante, con/senza la presenza di recidiva familiare del fenotipo e/o consanguineità dei genitori.
Gli approcci Sanger e/o Next Generation Sequencing (NGS) - Panel/WES/WGS saranno utilizzati per facilitare l'identificazione di varianti de novo/ereditate nel bambino/probando.
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Pannello NGS, sequenziamento dell'intero esoma/genoma (WES/WGS)
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Nuovo fenotipo e scoperta genica
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Identificazione e caratterizzazione di nuovi fenotipi monogenici da specifici pedigree. Identificazione imparziale di geni nuovi e rari che causano malattie attraverso l'applicazione di metodologie di sequenziamento genetico a fenotipi nuovi o consolidati. |
attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Genera nuove intuizioni biologiche
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Ottenere approfondimenti sui meccanismi patologici (percorsi della malattia a valle noti o nuovi) alla base della malattia monogenica e più in generale delle malattie comuni/complesse, oltre a approfondimenti fondamentali riguardanti la funzione genica fisiologica.
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attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Geni modificatori di malattie monogeniche
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Identificare i geni modificatori dei disturbi monogenici - per aiutare la comprensione dell'eterogeneità fenotipica dei disturbi mendeliani.
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attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Potenziali nuovi bersagli terapeutici
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Identificare potenziali nuovi bersagli terapeutici: sfruttare queste informazioni per identificare potenziali bersagli farmacologici molecolari e cellulari robusti e geneticamente definiti (correlati al gene primario e/o ai geni modificatori) per il trattamento di malattie rare (orfane) e/o comuni.
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attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Funzione genica e validazione del target
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Ove possibile, determinare l'impatto funzionale delle varianti patogene identificate e convalidare gli obiettivi basati sul meccanismo della malattia attraverso l'uso di studi sperimentali preclinici (in vitro/in vivo) e/o precoci sull'uomo.
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attraverso il completamento degli studi, una media di 2 anni
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Collaboratori e investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- 1- Chial H. Rare Genetic Disorders: Learning About Genetic Disease Through Gene Mapping, SNPs, and Microarray Data. Nature Education 2008;1(1):192.
- 2- Genes and human disease. World Heath Organization 2017. Retrieved from http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.html
- Ku CS, Cooper DN, Patrinos GP. The Rise and Rise of Exome Sequencing. Public Health Genomics. 2016;19(6):315-324. doi: 10.1159/000450991. Epub 2016 Nov 30.
- Mefford HC. Clinical Genetic Testing in Epilepsy. Epilepsy Curr. 2015 Jul-Aug;15(4):197-201. doi: 10.5698/1535-7511-15.4.197.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Della Mina E, Ciccone R, Brustia F, Bayindir B, Limongelli I, Vetro A, Iascone M, Pezzoli L, Bellazzi R, Perotti G, De Giorgis V, Lunghi S, Coppola G, Orcesi S, Merli P, Savasta S, Veggiotti P, Zuffardi O. Improving molecular diagnosis in epilepsy by a dedicated high-throughput sequencing platform. Eur J Hum Genet. 2015 Mar;23(3):354-62. doi: 10.1038/ejhg.2014.92. Epub 2014 May 21.
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Ultimo verificato
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Parole chiave
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- IREC038
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