アラブ首長国連邦人口における新規単一遺伝子疾患の描写
アラブ首長国連邦における新規単一遺伝子疾患の描写
調査の概要
詳細な説明
単一遺伝子性疾患は、単一の欠陥遺伝子に起因し、メンデルの法則に従って遺伝します (メンデル性疾患)。 このような遺伝子欠陥は、遺伝するか自然に発生する可能性のある突然変異から生じます。どちらも以前の家族歴がない場合に発生する可能性があります。 遺伝する突然変異は、優性または劣性、常染色体または性連鎖の可能性があります。 WHO によると、個々にはまれですが、集合的に単一遺伝子性疾患が世界中の何百万人もの人々に影響を与えています。 現在、10,000 を超えるヒト疾患が単一遺伝子性であると推定されています。 最近まで、遺伝的原因の特定、特に非常にまれな表現型の特定は、連鎖解析を通じて原因となる変異を特定するという科学的な課題のために、不可能であるか、費用対効果が高くありませんでした。 費用対効果の高い次世代シーケンシングの出現により、ゲノム全体ですべての希少バリアントの識別が容易になり、小さな家族での突然変異の識別が可能になり、de novo の場合は単一のケースでも可能になります。
単一遺伝子シーケンシングの臨床応用は、患者に具体的な利益をもたらし、診断と予後を知らせ、治療の選択を導く可能性があります。 次世代シーケンシング (NGS) パネルは複数の遺伝子を並行してシーケンシングし、現在臨床領域に入っています。 NGS は、てんかんなどの遺伝的に異質な状態に対して、単一遺伝子シーケンシングよりも大きな利点を提供します。 しかし、より多くの遺伝子が NGS パネルに含まれるにつれて、付随的な発見の可能性が大幅に高まり、結果の解釈に関連する課題が伴います。 多くの状態は表現型および遺伝的に異質であるため、詳細な表現型情報の取得は、NGS 結果の有意義な解釈に不可欠です。
単一遺伝子 (メンデル) 障害は、歴史的に人間の遺伝子機能を解明する最も明確な手段を提供してきました。 まれな DNA バリアントとタンパク質機能の変化または個別の表現型への投与との関連は、基礎生物学、単一遺伝子疾患の病因、複雑な形質、診断および治療に重要な意味を持ちます。 単一遺伝子の機能の変化から生じる明確で浸透度の高い表現型を定義する際に、ヒト遺伝学の最も容易に解釈可能な要素を表すことにより、単一遺伝子疾患の研究は、新規または既存の表現型の遺伝的基盤を特定し、非冗長性への洞察を提供できます。特定のまれなバリアントと一般的な疾患の両方に対する治療的ターゲティングを通知する可能性のある生物学的経路。 したがって、このプログラムの主な目的は、アラブ首長国連邦全体の家族の遺伝子配列決定により、新規の単一遺伝子表現型を特定し、根底にある原因となる遺伝的変異を発見することです。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究場所
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Abu Dhabi、アラブ首長国連邦、48338
- 募集
- Imperial College London Diabetes Centre
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
参加者は、表現型の家族性再発および/または親の血族関係の有無にかかわらず、根底にある新規単一遺伝子障害を示唆する臨床的表現型を示します。
特に関心のある血統(優先順)には、次のものが含まれます。
- 近親家族、理想的には 1 人または複数の家族メンバーが罹患している場合
- 新規ベース - すなわち、発端者と両親のトリオで、発端者のみが表現型を示す
- 常染色体劣性
- 常染色体優性ですが、大きな家系があります (例: 理想的には、2~3 世代にわたって 6~8 人の罹患メンバー)
説明
包含基準:
特定の表現型 - 基礎となる新規遺伝性疾患を示唆する関心のある表現型:
- 一般的な疾患の異常な症状。明確に定義された症候性/異形性の特徴を備えています*。
- 極端な表現型のプレゼンテーション。
- 完全に新規で、以前は未定義の表現型。
家族歴/血統 - 可能であれば、以下のいずれかに基づいて、単一の遺伝子変異 (de novo または継承) によると疑われる表現型:
- 症候性/異形性の特徴の存在。
- 他の近親者における同様の症状の家族歴。
- 継承のパターン。
- 親の血族。
臨床的解釈 - 利用可能な場合 (つまり、 必須ではありませんが、適合性の信頼性を高めます)、新しい遺伝性/単一遺伝子性疾患と一致する臨床および/または調査結果の存在:
- 非遺伝的後天的原因の除外 - 例: 可能性が高い環境原因の明確な履歴を持つもの。
- -障害/表現型の根底にある既知の遺伝子に対して遺伝子型陰性。
- 同意 - 参加者 (または 18 歳未満の場合は親/法定後見人) 発端者 (男性/女性)、トリオの親、または大家族のメンバーとして研究に参加するためのインフォームドコンセントを喜んで与えることができます。
除外基準:
- -参加者またはその法定後見人/法定代理人は、インフォームドコンセントを提供することを望まない、または提供することができません。 お子様が参加する可能性があるが、参加を拒否する場合、お子様の意思が尊重されます。
- -すでにジェノタイピング/パネル/ラボテスト(既知の先天性代謝異常など)を受けており、遺伝的状態が定義/診断されている参加者。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:断面図
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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単一原性障害
基礎となる新規単一遺伝子障害を示唆する臨床的表現型を示す参加者は、表現型の家族性再発および/または親の血族の存在の有無にかかわらず含まれます。
サンガーおよび/または次世代シーケンシング (NGS) - パネル/WES/WGS アプローチを使用して、子供/発端者の de novo/継承バリアントの識別を容易にします。
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NGS パネル、全エクソーム / ゲノム シーケンス (WES/WGS)
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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新しい表現型と遺伝子の発見
時間枠:研究完了まで、平均2年
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特定の家系からの新規単一遺伝子表現型の同定と特徴付け。 新規または確立された表現型への遺伝子配列決定手法の適用による、新規で希少な疾患の原因となる遺伝子の偏りのない同定。 |
研究完了まで、平均2年
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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新しい生物学的洞察を生み出す
時間枠:研究完了まで、平均2年
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生理学的遺伝子機能に関する基本的な洞察に加えて、単一遺伝子疾患の根底にある病理学的メカニズム (既知または新しい下流の疾患経路) についての洞察を得て、一般的/複雑な疾患にまで広げます。
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研究完了まで、平均2年
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一遺伝子性疾患の修飾遺伝子
時間枠:研究完了まで、平均2年
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単一遺伝子性疾患の修飾遺伝子を特定する - メンデル性疾患の表現型の不均一性の理解を支援します。
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研究完了まで、平均2年
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潜在的な新しい治療標的
時間枠:研究完了まで、平均2年
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潜在的な新しい治療標的を特定する - これらの洞察を活用して、希少な (オーファン) および/または一般的な疾患の治療のための堅牢で遺伝的に定義された潜在的な分子および細胞の薬物標的 (一次遺伝子および/または修飾遺伝子に関連する) を特定します。
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研究完了まで、平均2年
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遺伝子機能と標的の検証
時間枠:研究完了まで、平均2年
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可能であれば、前臨床 (in vitro/in vivo) および/または初期のヒト実験研究を使用して、特定された病原性変異体の機能的影響を決定し、疾患メカニズムに基づく標的を検証します。
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研究完了まで、平均2年
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Houman Ashrafian, DPhil FRCP、University of Oxford
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- 1- Chial H. Rare Genetic Disorders: Learning About Genetic Disease Through Gene Mapping, SNPs, and Microarray Data. Nature Education 2008;1(1):192.
- 2- Genes and human disease. World Heath Organization 2017. Retrieved from http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.html
- Ku CS, Cooper DN, Patrinos GP. The Rise and Rise of Exome Sequencing. Public Health Genomics. 2016;19(6):315-324. doi: 10.1159/000450991. Epub 2016 Nov 30.
- Mefford HC. Clinical Genetic Testing in Epilepsy. Epilepsy Curr. 2015 Jul-Aug;15(4):197-201. doi: 10.5698/1535-7511-15.4.197.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Della Mina E, Ciccone R, Brustia F, Bayindir B, Limongelli I, Vetro A, Iascone M, Pezzoli L, Bellazzi R, Perotti G, De Giorgis V, Lunghi S, Coppola G, Orcesi S, Merli P, Savasta S, Veggiotti P, Zuffardi O. Improving molecular diagnosis in epilepsy by a dedicated high-throughput sequencing platform. Eur J Hum Genet. 2015 Mar;23(3):354-62. doi: 10.1038/ejhg.2014.92. Epub 2014 May 21.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- IREC038
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
米国で製造され、米国から輸出された製品。
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