- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT03589079
Vymezení nových monogenních poruch v populaci Spojených arabských emirátů
Vymezení nových monogenních poruch ve Spojených arabských emirátech
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Monogenní poruchy jsou výsledkem jediného defektního genu a dědí se podle Mendelových zákonů (Mendelovy poruchy). Takové genové defekty vznikají z mutace, která může být buď zděděná, nebo se může objevit spontánně; obojí se může objevit bez předchozí rodinné anamnézy. Dědičné mutace mohou být dominantní nebo recesivní a autozomální nebo vázané na pohlaví. Podle WHO, ačkoli individuálně vzácné, kolektivně monogenní poruchy postihují miliony lidí na celém světě. V současné době se odhaduje, že více než 10 000 lidských onemocnění je monogenních. Až donedávna nebyla identifikace genetických příčin, zejména extrémně vzácných fenotypů, možná nebo nákladově efektivní kvůli vědeckým problémům identifikace kauzativních mutací pomocí vazebné analýzy. Nástup nákladově efektivního sekvenování nové generace nyní usnadňuje identifikaci všech vzácných variant v celém genomu, což zase umožňuje identifikaci mutací v malých rodinách, a pokud de novo, dokonce i v jednotlivých případech.
Klinická aplikace sekvenování jednoho genu potenciálně poskytuje pacientům hmatatelné výhody, informování o diagnóze a prognóze a může být vodítkem pro volbu léčby. Panely sekvenování nové generace (NGS) sekvenují paralelně několik genů a nyní vstupují do klinické domény. NGS poskytuje významné výhody oproti sekvenování jednoho genu pro stavy, které jsou geneticky heterogenní, jako jsou epilepsie. S tím, jak je však do panelu NGS zahrnuto více genů, výrazně stoupá možnost náhodných nálezů, s tím související problémy při interpretaci výsledků. Protože mnoho stavů je fenotypově i geneticky heterogenních, je získání podrobných fenotypových informací zásadní pro smysluplnou interpretaci výsledků NGS.
Monogenní (Mendelovské) poruchy historicky poskytovaly nejjasnější prostředek k objasnění funkce lidských genů. Vazba vzácné varianty DNA na změněnou funkci proteinu nebo dávku na diskrétní fenotyp má důležité důsledky pro základní biologii, patogenezi monogenních chorob, komplexní znaky, diagnostiku a terapii. Tím, že studium monogenních poruch představuje nejsnáze interpretovatelnou složku lidské genetiky při definování jasného fenotypu s vysokou penetrací vyplývajícího ze změny funkce jednoho genu, může identifikovat genetický základ pro nové nebo existující fenotypy a poskytnout pohled na neredundantní. biologické cesty, které mohou informovat o terapeutickém zacílení jak pro specifickou vzácnou variantu, tak pro běžná onemocnění. Primárním účelem tohoto programu je tedy identifikovat nové monogenní fenotypy a objevit základní kauzální genetické varianty genetickým sekvenováním v rodinách v SAE.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Abu Dhabi, Spojené arabské emiráty, 48338
- Nábor
- Imperial College London Diabetes Centre
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Účastníci budou vykazovat klinické fenotypy naznačující základní novou monogenní poruchu, s/bez přítomnosti familiární recidivy fenotypu a/nebo rodičovského příbuzenství.
Rodokmeny zvláštního zájmu (v preferovaném pořadí) budou zahrnovat:
- Příbuzenské rodiny, ideálně tam, kde je postižen jeden nebo více členů rodiny
- De novo založené - tedy tria probanda a obou rodičů, kde pouze proband vykazuje fenotyp
- Autozomálně recesivní
- Autosomálně dominantní, i když s velkým příbuzným (např. ideálně 6-8 postižených členů napříč 2-3 generacemi)
Popis
Kritéria pro zařazení:
Specifický fenotyp – fenotypy zájmu naznačující základní novou genetickou poruchu:
- Neobvyklé projevy běžných poruch, např. s jasně definovanými syndromickými/dysmorfickými rysy*.
- Extrémní fenotypové prezentace.
- Zcela nové, dříve nedefinované fenotypy.
Rodinná anamnéza/rodokmen – Fenotyp, u kterého existuje podezření, že je způsoben jedinou genetickou mutací (de novo nebo zděděnou), založenou, je-li k dispozici, na kterékoli z:
- Přítomnost syndromických/dysmorfních rysů.
- Rodinná anamnéza podobných projevů u jiných příbuzných.
- Vzor dědičnosti.
- Rodičovská příbuznost.
Klinická interpretace – pokud je k dispozici (tj. není povinné, ale zvýší důvěru ve vhodnost), přítomnost klinických a/nebo výzkumných výsledků v souladu s novou dědičnou/monogenní poruchou:
- Vyloučení negenetických získaných příčin - např. ti s jasnou historií pravděpodobné environmentální příčiny.
- Genotyp negativní pro známé geny, které jsou základem poruchy/fenotypu.
- Souhlas – Účastník (nebo rodič/zákonný zástupce, pokud je mladší 18 let) ochotný a schopný dát informovaný souhlas s účastí ve studii jako proband (muž/žena), rodič v triu nebo člen širší rodiny.
Kritéria vyloučení:
- Účastník nebo jeho zákonný zástupce/zákonný zástupce není ochoten nebo schopen dát informovaný souhlas. V případech, kdy potenciální dětský účastník má schopnost vyjádřit souhlas, ale odmítne se zúčastnit, bude vůle dítěte respektována.
- Účastník, který již prošel genotypizací/panelovým/laboratorním testováním (např. na známé vrozené poruchy metabolismu) a má definovaný/diagnostikovaný genetický stav.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Průřezový
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Monogenní porucha
Budou zahrnuti účastníci vykazující klinické fenotypy naznačující základní novou monogenní poruchu, s/bez přítomnosti familiární recidivy fenotypu a/nebo rodičovského příbuzenství.
Sanger a/nebo sekvenování nové generace (NGS) - Panel/WES/WGS přístupy budou použity k usnadnění identifikace de novo/zděděných variant u dítěte/probanda.
|
NGS panel, sekvenování celého exomu / genomu (WES/WGS)
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Nový fenotyp a objev genů
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
|
Identifikace a charakterizace nových monogenních fenotypů ze specifických rodokmenů. Nezaujatá identifikace nových, vzácných onemocnění způsobujících genů prostřednictvím aplikace metod genetického sekvenování na nové nebo zavedené fenotypy. |
ukončením studia v průměru 2 roky
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Vytvářejte nové biologické poznatky
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
|
Získejte vhled do patologických mechanismů (známých nebo nových následných cest onemocnění), které jsou základem monogenních onemocnění a v širším smyslu běžných/komplexních onemocnění, kromě základních poznatků týkajících se fyziologické funkce genů.
|
ukončením studia v průměru 2 roky
|
|
Modifikační geny monogenních poruch
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
|
Identifikujte modifikační geny monogenních poruch – napomůžete pochopení fenotypové heterogenity mendelovských poruch.
|
ukončením studia v průměru 2 roky
|
|
Potenciální nové terapeutické cíle
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
|
Identifikujte potenciální nové terapeutické cíle – využijte tyto poznatky k identifikaci robustních, geneticky definovaných potenciálních molekulárních a buněčných cílů léků (souvisejících s primárním genem a/nebo modifikačními geny) pro léčbu vzácných (osiřelých) a/nebo běžných onemocnění.
|
ukončením studia v průměru 2 roky
|
|
Genová funkce a validace cíle
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
|
Kde je to možné, určit funkční dopad identifikovaných patogenních variant a ověřit cíle založené na mechanismu onemocnění pomocí předklinických (in vitro/in vivo) a/nebo časných experimentálních studií na lidech.
|
ukončením studia v průměru 2 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- 1- Chial H. Rare Genetic Disorders: Learning About Genetic Disease Through Gene Mapping, SNPs, and Microarray Data. Nature Education 2008;1(1):192.
- 2- Genes and human disease. World Heath Organization 2017. Retrieved from http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.html
- Ku CS, Cooper DN, Patrinos GP. The Rise and Rise of Exome Sequencing. Public Health Genomics. 2016;19(6):315-324. doi: 10.1159/000450991. Epub 2016 Nov 30.
- Mefford HC. Clinical Genetic Testing in Epilepsy. Epilepsy Curr. 2015 Jul-Aug;15(4):197-201. doi: 10.5698/1535-7511-15.4.197.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Della Mina E, Ciccone R, Brustia F, Bayindir B, Limongelli I, Vetro A, Iascone M, Pezzoli L, Bellazzi R, Perotti G, De Giorgis V, Lunghi S, Coppola G, Orcesi S, Merli P, Savasta S, Veggiotti P, Zuffardi O. Improving molecular diagnosis in epilepsy by a dedicated high-throughput sequencing platform. Eur J Hum Genet. 2015 Mar;23(3):354-62. doi: 10.1038/ejhg.2014.92. Epub 2014 May 21.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- IREC038
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Sanger a/nebo sekvenování nové generace (NGS)
-
Tianjin Medical University Second HospitalNeznámýSolidní nádor, dospělýČína
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Institut Bergonié; Plateforme labellisée Inca - Institut Bergonié, Bordeaux; Plateforme... a další spolupracovníciDokončenoSarkom měkkých tkání | Kolorektální karcinomFrancie
-
Dr. Rebecca SchuleGerman Federal Ministry of Education and Research; German Center for Neurodegenerative...NáborDědičná spastická paraplegieRakousko, Německo, Itálie
-
Dr. Rebecca SchuleGerman Research Foundation; German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE)NáborSpastická ataxieKanada, Francie, Německo, Itálie, Holandsko, Krocan, Spojené království