Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Vymezení nových monogenních poruch v populaci Spojených arabských emirátů

11. února 2020 aktualizováno: Imperial College London Diabetes Centre

Vymezení nových monogenních poruch ve Spojených arabských emirátech

Cílem studie je identifikovat nové monogenní fenotypy ze specifických rodokmenů a objevit základní kauzální genetickou variantu pomocí metod genetického sekvenování (Sanger a/nebo Next Generation Sequencing - Panel/WES/WGS) v rodinách ve Spojených arabských emirátech (SAE).

Přehled studie

Detailní popis

Monogenní poruchy jsou výsledkem jediného defektního genu a dědí se podle Mendelových zákonů (Mendelovy poruchy). Takové genové defekty vznikají z mutace, která může být buď zděděná, nebo se může objevit spontánně; obojí se může objevit bez předchozí rodinné anamnézy. Dědičné mutace mohou být dominantní nebo recesivní a autozomální nebo vázané na pohlaví. Podle WHO, ačkoli individuálně vzácné, kolektivně monogenní poruchy postihují miliony lidí na celém světě. V současné době se odhaduje, že více než 10 000 lidských onemocnění je monogenních. Až donedávna nebyla identifikace genetických příčin, zejména extrémně vzácných fenotypů, možná nebo nákladově efektivní kvůli vědeckým problémům identifikace kauzativních mutací pomocí vazebné analýzy. Nástup nákladově efektivního sekvenování nové generace nyní usnadňuje identifikaci všech vzácných variant v celém genomu, což zase umožňuje identifikaci mutací v malých rodinách, a pokud de novo, dokonce i v jednotlivých případech.

Klinická aplikace sekvenování jednoho genu potenciálně poskytuje pacientům hmatatelné výhody, informování o diagnóze a prognóze a může být vodítkem pro volbu léčby. Panely sekvenování nové generace (NGS) sekvenují paralelně několik genů a nyní vstupují do klinické domény. NGS poskytuje významné výhody oproti sekvenování jednoho genu pro stavy, které jsou geneticky heterogenní, jako jsou epilepsie. S tím, jak je však do panelu NGS zahrnuto více genů, výrazně stoupá možnost náhodných nálezů, s tím související problémy při interpretaci výsledků. Protože mnoho stavů je fenotypově i geneticky heterogenních, je získání podrobných fenotypových informací zásadní pro smysluplnou interpretaci výsledků NGS.

Monogenní (Mendelovské) poruchy historicky poskytovaly nejjasnější prostředek k objasnění funkce lidských genů. Vazba vzácné varianty DNA na změněnou funkci proteinu nebo dávku na diskrétní fenotyp má důležité důsledky pro základní biologii, patogenezi monogenních chorob, komplexní znaky, diagnostiku a terapii. Tím, že studium monogenních poruch představuje nejsnáze interpretovatelnou složku lidské genetiky při definování jasného fenotypu s vysokou penetrací vyplývajícího ze změny funkce jednoho genu, může identifikovat genetický základ pro nové nebo existující fenotypy a poskytnout pohled na neredundantní. biologické cesty, které mohou informovat o terapeutickém zacílení jak pro specifickou vzácnou variantu, tak pro běžná onemocnění. Primárním účelem tohoto programu je tedy identifikovat nové monogenní fenotypy a objevit základní kauzální genetické varianty genetickým sekvenováním v rodinách v SAE.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

150

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

  • Dítě
  • Dospělý
  • Starší dospělý

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Ukázka pravděpodobnosti

Studijní populace

Účastníci budou vykazovat klinické fenotypy naznačující základní novou monogenní poruchu, s/bez přítomnosti familiární recidivy fenotypu a/nebo rodičovského příbuzenství.

Rodokmeny zvláštního zájmu (v preferovaném pořadí) budou zahrnovat:

  • Příbuzenské rodiny, ideálně tam, kde je postižen jeden nebo více členů rodiny
  • De novo založené - tedy tria probanda a obou rodičů, kde pouze proband vykazuje fenotyp
  • Autozomálně recesivní
  • Autosomálně dominantní, i když s velkým příbuzným (např. ideálně 6-8 postižených členů napříč 2-3 generacemi)

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Specifický fenotyp – fenotypy zájmu naznačující základní novou genetickou poruchu:

    1. Neobvyklé projevy běžných poruch, např. s jasně definovanými syndromickými/dysmorfickými rysy*.
    2. Extrémní fenotypové prezentace.
    3. Zcela nové, dříve nedefinované fenotypy.
  • Rodinná anamnéza/rodokmen – Fenotyp, u kterého existuje podezření, že je způsoben jedinou genetickou mutací (de novo nebo zděděnou), založenou, je-li k dispozici, na kterékoli z:

    1. Přítomnost syndromických/dysmorfních rysů.
    2. Rodinná anamnéza podobných projevů u jiných příbuzných.
    3. Vzor dědičnosti.
    4. Rodičovská příbuznost.
  • Klinická interpretace – pokud je k dispozici (tj. není povinné, ale zvýší důvěru ve vhodnost), přítomnost klinických a/nebo výzkumných výsledků v souladu s novou dědičnou/monogenní poruchou:

    1. Vyloučení negenetických získaných příčin - např. ti s jasnou historií pravděpodobné environmentální příčiny.
    2. Genotyp negativní pro známé geny, které jsou základem poruchy/fenotypu.
  • Souhlas – Účastník (nebo rodič/zákonný zástupce, pokud je mladší 18 let) ochotný a schopný dát informovaný souhlas s účastí ve studii jako proband (muž/žena), rodič v triu nebo člen širší rodiny.

Kritéria vyloučení:

  • Účastník nebo jeho zákonný zástupce/zákonný zástupce není ochoten nebo schopen dát informovaný souhlas. V případech, kdy potenciální dětský účastník má schopnost vyjádřit souhlas, ale odmítne se zúčastnit, bude vůle dítěte respektována.
  • Účastník, který již prošel genotypizací/panelovým/laboratorním testováním (např. na známé vrozené poruchy metabolismu) a má definovaný/diagnostikovaný genetický stav.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Kohorta
  • Časové perspektivy: Průřezový

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Monogenní porucha
Budou zahrnuti účastníci vykazující klinické fenotypy naznačující základní novou monogenní poruchu, s/bez přítomnosti familiární recidivy fenotypu a/nebo rodičovského příbuzenství. Sanger a/nebo sekvenování nové generace (NGS) - Panel/WES/WGS přístupy budou použity k usnadnění identifikace de novo/zděděných variant u dítěte/probanda.
NGS panel, sekvenování celého exomu / genomu (WES/WGS)

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Nový fenotyp a objev genů
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky

Identifikace a charakterizace nových monogenních fenotypů ze specifických rodokmenů.

Nezaujatá identifikace nových, vzácných onemocnění způsobujících genů prostřednictvím aplikace metod genetického sekvenování na nové nebo zavedené fenotypy.

ukončením studia v průměru 2 roky

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Vytvářejte nové biologické poznatky
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
Získejte vhled do patologických mechanismů (známých nebo nových následných cest onemocnění), které jsou základem monogenních onemocnění a v širším smyslu běžných/komplexních onemocnění, kromě základních poznatků týkajících se fyziologické funkce genů.
ukončením studia v průměru 2 roky
Modifikační geny monogenních poruch
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
Identifikujte modifikační geny monogenních poruch – napomůžete pochopení fenotypové heterogenity mendelovských poruch.
ukončením studia v průměru 2 roky
Potenciální nové terapeutické cíle
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
Identifikujte potenciální nové terapeutické cíle – využijte tyto poznatky k identifikaci robustních, geneticky definovaných potenciálních molekulárních a buněčných cílů léků (souvisejících s primárním genem a/nebo modifikačními geny) pro léčbu vzácných (osiřelých) a/nebo běžných onemocnění.
ukončením studia v průměru 2 roky
Genová funkce a validace cíle
Časové okno: ukončením studia v průměru 2 roky
Kde je to možné, určit funkční dopad identifikovaných patogenních variant a ověřit cíle založené na mechanismu onemocnění pomocí předklinických (in vitro/in vivo) a/nebo časných experimentálních studií na lidech.
ukončením studia v průměru 2 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

1. ledna 2018

Primární dokončení (Očekávaný)

1. ledna 2021

Dokončení studie (Očekávaný)

1. ledna 2021

Termíny zápisu do studia

První předloženo

2. července 2018

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

16. července 2018

První zveřejněno (Aktuální)

17. července 2018

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

12. února 2020

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

11. února 2020

Naposledy ověřeno

1. února 2020

Více informací

Termíny související s touto studií

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • IREC038

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

produkt vyrobený a vyvážený z USA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Sanger a/nebo sekvenování nové generace (NGS)

Předplatit