Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Uusien monogeenisten häiriöiden määrittely Yhdistyneiden arabiemiirikuntien väestössä

tiistai 11. helmikuuta 2020 päivittänyt: Imperial College London Diabetes Centre

Uusien monogeenisten häiriöiden määrittely Yhdistyneissä arabiemiirikunnissa

Tutkimuksen tavoitteena on tunnistaa uusia monogeenisia fenotyyppejä tietyistä sukutauluista ja löytää taustalla oleva kausaalinen geneettinen variantti käyttämällä geneettistä sekvensointia (Sanger ja/tai Next Generation Sequencing - Panel/WES/WGS) perheissä Yhdistyneissä arabiemiirikunnissa (UAE).

Tutkimuksen yleiskatsaus

Yksityiskohtainen kuvaus

Monogeeniset häiriöt johtuvat yhdestä viallisesta geenistä ja periytyvät Mendelin lakien mukaan (Mendelin häiriöt). Tällaiset geenivirheet johtuvat mutaatiosta, joka voi olla joko peritty tai esiintyä spontaanisti; molemmat voivat ilmaantua ilman aikaisempaa sukuhistoriaa. Perinnölliset mutaatiot voivat olla hallitsevia tai resessiivisiä ja autosomaalisia tai sukupuoleen liittyviä. WHO:n mukaan yksittäiset monogeeniset sairaudet vaikuttavat miljooniin ihmisiin maailmanlaajuisesti, vaikka ne ovat yksilöllisesti harvinaisia. Tällä hetkellä yli 10 000 ihmisen sairauden arvioidaan olevan monogeenisiä. Viime aikoihin asti geneettisten syiden, varsinkin erittäin harvinaisten fenotyyppien, tunnistaminen ei ole ollut mahdollista tai kustannustehokasta johtuen tieteellisistä haasteista, jotka liittyvät kausatiivisten mutaatioiden tunnistamiseen kytkentäanalyysin avulla. Kustannustehokkaan seuraavan sukupolven sekvensoinnin tulo helpottaa nyt kaikkien harvinaisten varianttien tunnistamista koko genomissa, mikä puolestaan ​​mahdollistaa mutaatioiden tunnistamisen pienissä perheissä ja, jos de novo, jopa yksittäisissä tapauksissa.

Yksittäisen geenin sekvensoinnin kliininen soveltaminen voi tarjota potilaille konkreettisia etuja, antaa tietoa diagnoosista ja ennusteesta ja saattaa ohjata hoidon valintaa. Seuraavan sukupolven sekvensointipaneelit (NGS) sekvensoivat useita geenejä rinnakkain ja ovat nyt siirtymässä kliiniseen alueeseen. NGS tarjoaa merkittäviä etuja yhden geenin sekvensointiin verrattuna tiloihin, jotka ovat geneettisesti heterogeenisiä, kuten epilepsiat. Kuitenkin, kun enemmän geenejä sisällytetään NGS-paneeliin, satunnaisten löydösten mahdollisuus kasvaa merkittävästi, mikä aiheuttaa haasteita tulosten tulkinnassa. Koska monet olosuhteet ovat fenotyyppisesti ja geneettisesti heterogeenisiä, yksityiskohtaisen fenotyyppitiedon hankkiminen on välttämätöntä NGS-tulosten mielekkään tulkinnan kannalta.

Monogeeniset (Mendelin) häiriöt ovat historiallisesti tarjonneet selkeimmän keinon ihmisen geenien toiminnan selvittämiseen. Harvinaisen DNA-variantin kytkeytymisellä muuttuneeseen proteiinin toimintaan tai annokseen erilliseen fenotyyppiin on tärkeitä vaikutuksia perusbiologiaan, monogeenisen sairauden patogeneesiin, monimutkaisiin piirteisiin, diagnostiikkaan ja hoitoon. Monogeenisten sairauksien tutkimus edustaa ihmisen genetiikan helpoimmin tulkittavissa olevaa komponenttia määriteltäessä selkeää, tunkeutuvaa fenotyyppiä, joka johtuu yhden geenin toiminnan muutoksista, ja se voi tunnistaa uusien tai olemassa olevien fenotyyppien geneettisen perustan ja antaa näkemyksiä ei-redundanteista. biologiset reitit, jotka voivat ohjata terapeuttista kohdentamista sekä erityisiin harvinaisiin variantteihin että yleisiin sairauksiin. Sen mukaisesti tämän ohjelman ensisijainen tarkoitus on tunnistaa uusia monogeenisiä fenotyyppejä ja löytää taustalla olevia kausaalisia geneettisiä variantteja geneettisen sekvensoinnin avulla perheissä kaikkialla Arabiemiirikunnissa.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Odotettu)

150

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

  • Lapsi
  • Aikuinen
  • Vanhempi Aikuinen

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Osallistujat esittelevät kliinisiä fenotyyppejä, jotka viittaavat taustalla olevaan uuteen monogeeniseen häiriöön, joissa esiintyy/ilman fenotyypin ja/tai vanhempien sukulaisuutta.

Erityisen kiinnostavat sukutaulut (etujärjestysjärjestyksessä) sisältävät:

  • Sukuperäiset perheet, ihannetapauksessa, jossa yksi tai useampi perheenjäsen vaikuttaa
  • De novo -pohjainen - eli probandin ja molempien vanhempien trio, jossa vain koehenkilöllä on fenotyyppi
  • Autosomaalinen resessiivinen
  • Autosomaalinen dominantti, vaikkakin suurella sukulaisella (esim. ihannetapauksessa 6-8 jäsentä 2-3 sukupolven aikana)

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Spesifinen fenotyyppi - Kiinnostavat fenotyypit, jotka viittaavat taustalla olevaan uuteen geneettiseen sairauteen:

    1. Yleisten häiriöiden epätavalliset esitykset, esim. joilla on selkeästi määritellyt syndroomiset/dysmorfiset ominaisuudet*.
    2. Äärimmäiset fenotyyppiset esitykset.
    3. Täysin uusia, aiemmin määrittelemättömiä fenotyyppejä.
  • Sukuhistoria/sukuhistoria – Fenotyypin epäillään johtuvan yhdestä geneettisestä mutaatiosta (de novo tai perinnöllinen), joka perustuu mahdollisuuksien mukaan johonkin seuraavista:

    1. Syndromisten/dysmorfisten piirteiden esiintyminen.
    2. Suvussa samankaltaisia ​​esityksiä muissa sukulaisissa.
    3. Perinnön malli.
    4. Vanhempien sukulaisuus.
  • Kliininen tulkinta – jos mahdollista (esim. ei pakollinen, mutta lisää luottamusta soveltuvuuteen), kliiniset ja/tai tutkimustulokset, jotka ovat yhdenmukaisia ​​uuden perinnöllisen/monogeenisen sairauden kanssa:

    1. Ei-geneettisten hankittujen syiden poissulkeminen - esim. joilla on selkeä historia todennäköisestä ympäristösyystä.
    2. Genotyyppi negatiivinen häiriön/fenotyypin taustalla oleville tunnetuille geeneille.
  • Suostumus – Osallistuja (tai vanhempi/laillinen huoltaja, jos hän on alle 18-vuotias), joka haluaa ja pystyy antamaan tietoisen suostumuksen osallistuakseen tutkimukseen tutkittavana (mies/nainen), kolmikon vanhempana tai suurperheenjäsenenä.

Poissulkemiskriteerit:

  • Osallistuja tai hänen laillinen huoltajansa/laillinen edustajansa ei halua tai pysty antamaan tietoon perustuvaa suostumusta. Tapauksissa, joissa potentiaalinen lapsiosanottaja pystyy antamaan suostumuksensa, mutta kieltäytyy osallistumasta, lapsen tahtoa kunnioitetaan.
  • Osallistuja, jolle on jo tehty genotyyppi-/paneeli-/laboratoriotestit (esim. tunnettujen synnynnäisten aineenvaihduntavirheiden varalta) ja jolla on määritelty/diagnosoitu geneettinen tila.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Havaintomallit: Kohortti
  • Aikanäkymät: Poikkileikkaus

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Interventio / Hoito
Monogeeninen häiriö
Osallistujat, joilla on kliinisiä fenotyyppejä, jotka viittaavat taustalla olevaan uuteen monogeeniseen häiriöön, joissa esiintyy/ei ole esiintynyt fenotyypin suvun uusiutumista ja/tai vanhempien sukulaisuutta. Sanger ja/tai seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS) – Paneeli/WES/WGS-lähestymistapoja käytetään helpottamaan de novo/perinnöllisten varianttien tunnistamista lapsessa/probandissa.
NGS-paneeli, koko eksomin / genomin sekvensointi (WES/WGS)

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Uusi fenotyyppi ja geenilöytö
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta

Uusien monogeenisten fenotyyppien tunnistaminen ja karakterisointi tietyistä sukutauluista.

Uusien, harvinaisia ​​sairauksia aiheuttavien geenien puolueeton tunnistaminen soveltamalla geneettisiä sekvensointimenetelmiä uusiin tai vakiintuneisiin fenotyyppeihin.

opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Luo uusia biologisia oivalluksia
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
Hanki näkemyksiä monogeenisen taudin taustalla olevista patologisista mekanismeista (tunnetuista tai uusista myöhemmistä taudeista) ja laajemmin yleisistä/monimutkaisista sairauksista fysiologista geenitoimintaa koskevien perusoivallusten lisäksi.
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
Monogeenisten häiriöiden modifioijageenit
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
Tunnista monogeenisten sairauksien modifioijageenit - auttaaksesi ymmärtämään Mendelin sairauksien fenotyyppisen heterogeenisyyden.
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
Mahdollisia uusia terapeuttisia kohteita
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
Tunnista mahdolliset uudet terapeuttiset kohteet – hyödynnä näitä oivalluksia tunnistaaksesi vankat, geneettisesti määritellyt mahdolliset molekyyli- ja solulääkekohteet (liittyvät ensisijaiseen geeniin ja/tai muuntajageeneihin) harvinaisten (harvinaisten) ja/tai yleisten sairauksien hoitoon.
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
Geenitoiminto ja kohteen validointi
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
Jos mahdollista, määritä tunnistettujen patogeenisten varianttien toiminnallinen vaikutus ja validoi sairausmekanismiin perustuvat kohteet käyttämällä esikliinisiä (in vitro/in vivo) ja/tai varhaisia ​​ihmiskokeita.
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Tutkijat

  • Päätutkija: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford

Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä

Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Maanantai 1. tammikuuta 2018

Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)

Perjantai 1. tammikuuta 2021

Opintojen valmistuminen (Odotettu)

Perjantai 1. tammikuuta 2021

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Maanantai 2. heinäkuuta 2018

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 16. heinäkuuta 2018

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Tiistai 17. heinäkuuta 2018

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Keskiviikko 12. helmikuuta 2020

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 11. helmikuuta 2020

Viimeksi vahvistettu

Lauantai 1. helmikuuta 2020

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Sanger ja/tai Next Generation Sequencing (NGS)

3
Tilaa