- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT03589079
Uusien monogeenisten häiriöiden määrittely Yhdistyneiden arabiemiirikuntien väestössä
Uusien monogeenisten häiriöiden määrittely Yhdistyneissä arabiemiirikunnissa
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Monogeeniset häiriöt johtuvat yhdestä viallisesta geenistä ja periytyvät Mendelin lakien mukaan (Mendelin häiriöt). Tällaiset geenivirheet johtuvat mutaatiosta, joka voi olla joko peritty tai esiintyä spontaanisti; molemmat voivat ilmaantua ilman aikaisempaa sukuhistoriaa. Perinnölliset mutaatiot voivat olla hallitsevia tai resessiivisiä ja autosomaalisia tai sukupuoleen liittyviä. WHO:n mukaan yksittäiset monogeeniset sairaudet vaikuttavat miljooniin ihmisiin maailmanlaajuisesti, vaikka ne ovat yksilöllisesti harvinaisia. Tällä hetkellä yli 10 000 ihmisen sairauden arvioidaan olevan monogeenisiä. Viime aikoihin asti geneettisten syiden, varsinkin erittäin harvinaisten fenotyyppien, tunnistaminen ei ole ollut mahdollista tai kustannustehokasta johtuen tieteellisistä haasteista, jotka liittyvät kausatiivisten mutaatioiden tunnistamiseen kytkentäanalyysin avulla. Kustannustehokkaan seuraavan sukupolven sekvensoinnin tulo helpottaa nyt kaikkien harvinaisten varianttien tunnistamista koko genomissa, mikä puolestaan mahdollistaa mutaatioiden tunnistamisen pienissä perheissä ja, jos de novo, jopa yksittäisissä tapauksissa.
Yksittäisen geenin sekvensoinnin kliininen soveltaminen voi tarjota potilaille konkreettisia etuja, antaa tietoa diagnoosista ja ennusteesta ja saattaa ohjata hoidon valintaa. Seuraavan sukupolven sekvensointipaneelit (NGS) sekvensoivat useita geenejä rinnakkain ja ovat nyt siirtymässä kliiniseen alueeseen. NGS tarjoaa merkittäviä etuja yhden geenin sekvensointiin verrattuna tiloihin, jotka ovat geneettisesti heterogeenisiä, kuten epilepsiat. Kuitenkin, kun enemmän geenejä sisällytetään NGS-paneeliin, satunnaisten löydösten mahdollisuus kasvaa merkittävästi, mikä aiheuttaa haasteita tulosten tulkinnassa. Koska monet olosuhteet ovat fenotyyppisesti ja geneettisesti heterogeenisiä, yksityiskohtaisen fenotyyppitiedon hankkiminen on välttämätöntä NGS-tulosten mielekkään tulkinnan kannalta.
Monogeeniset (Mendelin) häiriöt ovat historiallisesti tarjonneet selkeimmän keinon ihmisen geenien toiminnan selvittämiseen. Harvinaisen DNA-variantin kytkeytymisellä muuttuneeseen proteiinin toimintaan tai annokseen erilliseen fenotyyppiin on tärkeitä vaikutuksia perusbiologiaan, monogeenisen sairauden patogeneesiin, monimutkaisiin piirteisiin, diagnostiikkaan ja hoitoon. Monogeenisten sairauksien tutkimus edustaa ihmisen genetiikan helpoimmin tulkittavissa olevaa komponenttia määriteltäessä selkeää, tunkeutuvaa fenotyyppiä, joka johtuu yhden geenin toiminnan muutoksista, ja se voi tunnistaa uusien tai olemassa olevien fenotyyppien geneettisen perustan ja antaa näkemyksiä ei-redundanteista. biologiset reitit, jotka voivat ohjata terapeuttista kohdentamista sekä erityisiin harvinaisiin variantteihin että yleisiin sairauksiin. Sen mukaisesti tämän ohjelman ensisijainen tarkoitus on tunnistaa uusia monogeenisiä fenotyyppejä ja löytää taustalla olevia kausaalisia geneettisiä variantteja geneettisen sekvensoinnin avulla perheissä kaikkialla Arabiemiirikunnissa.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Abu Dhabi, Yhdistyneet Arabiemiirikunnat, 48338
- Rekrytointi
- Imperial College London Diabetes Centre
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Osallistujat esittelevät kliinisiä fenotyyppejä, jotka viittaavat taustalla olevaan uuteen monogeeniseen häiriöön, joissa esiintyy/ilman fenotyypin ja/tai vanhempien sukulaisuutta.
Erityisen kiinnostavat sukutaulut (etujärjestysjärjestyksessä) sisältävät:
- Sukuperäiset perheet, ihannetapauksessa, jossa yksi tai useampi perheenjäsen vaikuttaa
- De novo -pohjainen - eli probandin ja molempien vanhempien trio, jossa vain koehenkilöllä on fenotyyppi
- Autosomaalinen resessiivinen
- Autosomaalinen dominantti, vaikkakin suurella sukulaisella (esim. ihannetapauksessa 6-8 jäsentä 2-3 sukupolven aikana)
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Spesifinen fenotyyppi - Kiinnostavat fenotyypit, jotka viittaavat taustalla olevaan uuteen geneettiseen sairauteen:
- Yleisten häiriöiden epätavalliset esitykset, esim. joilla on selkeästi määritellyt syndroomiset/dysmorfiset ominaisuudet*.
- Äärimmäiset fenotyyppiset esitykset.
- Täysin uusia, aiemmin määrittelemättömiä fenotyyppejä.
Sukuhistoria/sukuhistoria – Fenotyypin epäillään johtuvan yhdestä geneettisestä mutaatiosta (de novo tai perinnöllinen), joka perustuu mahdollisuuksien mukaan johonkin seuraavista:
- Syndromisten/dysmorfisten piirteiden esiintyminen.
- Suvussa samankaltaisia esityksiä muissa sukulaisissa.
- Perinnön malli.
- Vanhempien sukulaisuus.
Kliininen tulkinta – jos mahdollista (esim. ei pakollinen, mutta lisää luottamusta soveltuvuuteen), kliiniset ja/tai tutkimustulokset, jotka ovat yhdenmukaisia uuden perinnöllisen/monogeenisen sairauden kanssa:
- Ei-geneettisten hankittujen syiden poissulkeminen - esim. joilla on selkeä historia todennäköisestä ympäristösyystä.
- Genotyyppi negatiivinen häiriön/fenotyypin taustalla oleville tunnetuille geeneille.
- Suostumus – Osallistuja (tai vanhempi/laillinen huoltaja, jos hän on alle 18-vuotias), joka haluaa ja pystyy antamaan tietoisen suostumuksen osallistuakseen tutkimukseen tutkittavana (mies/nainen), kolmikon vanhempana tai suurperheenjäsenenä.
Poissulkemiskriteerit:
- Osallistuja tai hänen laillinen huoltajansa/laillinen edustajansa ei halua tai pysty antamaan tietoon perustuvaa suostumusta. Tapauksissa, joissa potentiaalinen lapsiosanottaja pystyy antamaan suostumuksensa, mutta kieltäytyy osallistumasta, lapsen tahtoa kunnioitetaan.
- Osallistuja, jolle on jo tehty genotyyppi-/paneeli-/laboratoriotestit (esim. tunnettujen synnynnäisten aineenvaihduntavirheiden varalta) ja jolla on määritelty/diagnosoitu geneettinen tila.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Poikkileikkaus
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
---|---|
Monogeeninen häiriö
Osallistujat, joilla on kliinisiä fenotyyppejä, jotka viittaavat taustalla olevaan uuteen monogeeniseen häiriöön, joissa esiintyy/ei ole esiintynyt fenotyypin suvun uusiutumista ja/tai vanhempien sukulaisuutta.
Sanger ja/tai seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS) – Paneeli/WES/WGS-lähestymistapoja käytetään helpottamaan de novo/perinnöllisten varianttien tunnistamista lapsessa/probandissa.
|
NGS-paneeli, koko eksomin / genomin sekvensointi (WES/WGS)
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
Uusi fenotyyppi ja geenilöytö
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Uusien monogeenisten fenotyyppien tunnistaminen ja karakterisointi tietyistä sukutauluista. Uusien, harvinaisia sairauksia aiheuttavien geenien puolueeton tunnistaminen soveltamalla geneettisiä sekvensointimenetelmiä uusiin tai vakiintuneisiin fenotyyppeihin. |
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
Luo uusia biologisia oivalluksia
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Hanki näkemyksiä monogeenisen taudin taustalla olevista patologisista mekanismeista (tunnetuista tai uusista myöhemmistä taudeista) ja laajemmin yleisistä/monimutkaisista sairauksista fysiologista geenitoimintaa koskevien perusoivallusten lisäksi.
|
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Monogeenisten häiriöiden modifioijageenit
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Tunnista monogeenisten sairauksien modifioijageenit - auttaaksesi ymmärtämään Mendelin sairauksien fenotyyppisen heterogeenisyyden.
|
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Mahdollisia uusia terapeuttisia kohteita
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Tunnista mahdolliset uudet terapeuttiset kohteet – hyödynnä näitä oivalluksia tunnistaaksesi vankat, geneettisesti määritellyt mahdolliset molekyyli- ja solulääkekohteet (liittyvät ensisijaiseen geeniin ja/tai muuntajageeneihin) harvinaisten (harvinaisten) ja/tai yleisten sairauksien hoitoon.
|
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Geenitoiminto ja kohteen validointi
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Jos mahdollista, määritä tunnistettujen patogeenisten varianttien toiminnallinen vaikutus ja validoi sairausmekanismiin perustuvat kohteet käyttämällä esikliinisiä (in vitro/in vivo) ja/tai varhaisia ihmiskokeita.
|
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- 1- Chial H. Rare Genetic Disorders: Learning About Genetic Disease Through Gene Mapping, SNPs, and Microarray Data. Nature Education 2008;1(1):192.
- 2- Genes and human disease. World Heath Organization 2017. Retrieved from http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.html
- Ku CS, Cooper DN, Patrinos GP. The Rise and Rise of Exome Sequencing. Public Health Genomics. 2016;19(6):315-324. doi: 10.1159/000450991. Epub 2016 Nov 30.
- Mefford HC. Clinical Genetic Testing in Epilepsy. Epilepsy Curr. 2015 Jul-Aug;15(4):197-201. doi: 10.5698/1535-7511-15.4.197.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Della Mina E, Ciccone R, Brustia F, Bayindir B, Limongelli I, Vetro A, Iascone M, Pezzoli L, Bellazzi R, Perotti G, De Giorgis V, Lunghi S, Coppola G, Orcesi S, Merli P, Savasta S, Veggiotti P, Zuffardi O. Improving molecular diagnosis in epilepsy by a dedicated high-throughput sequencing platform. Eur J Hum Genet. 2015 Mar;23(3):354-62. doi: 10.1038/ejhg.2014.92. Epub 2014 May 21.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- IREC038
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Sanger ja/tai Next Generation Sequencing (NGS)
-
ReprogeneticsReproductive Medicine Lab, LLCTuntematon
-
Peking Union Medical CollegeTuntematonNaisen rintojen kasvain | Mutaatio | TerapeutiikkaKiina