- ICH GCP
- Amerikanska kliniska prövningsregistret
- Klinisk prövning NCT04047719
Lunginflammation hos immunkomprometterade - Användning av Karius-testet för upptäckt av odiagnostiserade patogener (PICKUP)
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Lunginflammation är en viktig orsak till sjuklighet och dödlighet hos personer med högt immunförsvar, såsom patienter med hematologiska maligniteter och/eller hematopoetiska stamcellstransplantationer. Dessa patienter kan infekteras av ett brett spektrum av potentiella patogener, inklusive virala, bakteriella och svampetiologier och ibland med flera patogener samtidigt. Diagnostiska tester misslyckas ofta med att identifiera en mikrobiell etiologi för sjukdomar i nedre luftvägarna även med bronkoalveolär lavage (BAL). Faktum är att odlingsmetoder, PCR och antigentestning på BAL-prover ger ett positivt resultat endast 30-67 % av gångerna. Dessutom kan idiopatiskt lungsyndrom (IPS), en icke-infektiös lungkomplikation vid transplantation, ha många överlappande symtom med infektiös lunginflammation. Behandling för IPS är administrering av steroider som kan förvärra infektioner. Med tanke på dessa skäl finns det ett behov av bättre diagnostik för att hjälpa till vid hanteringen av immunförsvagade patienter med lunginflammation.
Karius har utvecklat ett mikrobiellt cellfritt plasma nästa generations sekvenseringstest för patogendetektering som kan detektera >1 000 organismer inklusive DNA-virus, bakterier, jästsvampar, mögel och andra eukaryota patogener. Testet utförs i ett CLIA-certifierat/CAP-ackrediterat laboratorium med resultat som vanligtvis tillhandahålls inom en dag från mottagandet av provet. Med tanke på behovet av ett mer känsligt diagnostiskt test för lunginflammation i denna population, utvärderar vi prestandan hos Karius-testet för upptäckt av patogener.
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
California
-
Duarte, California, Förenta staterna, 91010
- City of Hope Comprehensive Cancer Center
-
San Francisco, California, Förenta staterna, 94143
- UCSF Department of Medicine
-
-
Colorado
-
Aurora, Colorado, Förenta staterna, 80045
- University of Colorado Denver
-
-
Louisiana
-
New Orleans, Louisiana, Förenta staterna, 70112
- Tulane Section of Infectious Disease
-
-
New York
-
New York, New York, Förenta staterna, 10065
- Memorial Sloan Kettering Cancer Center
-
New York, New York, Förenta staterna, 10021
- Weill Cornell Medicine
-
-
North Carolina
-
Durham, North Carolina, Förenta staterna, 27710
- Duke University
-
-
Pennsylvania
-
Pittsburgh, Pennsylvania, Förenta staterna, 15025
- University of Pittsburgh
-
-
Texas
-
Houston, Texas, Förenta staterna, 77030
- MD Anderson Cancer Center
-
-
Washington
-
Seattle, Washington, Förenta staterna, 98109
- Fred Hutchinson Cancer Center
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inklusionskriterier:
Ämnen måste uppfylla alla kriterier i avsnitt A och alla kriterier i antingen avsnitt B, avsnitt C eller avsnitt D.
Sektion A:
- Patienten är ≥ 18 år.
- Är just nu inlagd på sjukhuset.
- Har en misstänkt infektiös lunginflammation som motiverar diagnostisk utvärdering och behandling.
- Har genomgått en diagnostisk bronkoskopi för utvärdering av mikrobiologisk etiologi av lunginflammation inom 1 dag före eller har en planerad bronkoskopi inom 5 dagar efter inskrivningen.
- Patient eller patientens juridiskt auktoriserade representant (LAR) har lämnat samtycke till studien.
Avsnitt B:
- Har en av följande hematologiska maligniteter: Akut lymfatisk leukemi (ALL), akut myelogen leukemi (AML), myelodysplastiskt syndrom (MDS), lymfom (alla typer), multipelt myelom (MM) eller malign transformation av kronisk lymfatisk leukemi (KLL/SLL) ).
Är immunsupprimerad definierad som att ha minst ett av följande:
- Fick kemoterapi inom de senaste 45 dagarna.
- Ett återfall av hematologisk malignitet för vilken kemoterapibehandling förväntas inom de närmaste 45 dagarna.
- ANC<500 i minst 14 dagar och inom 8 veckor före registrering.
Avsnitt C:
- Har genomgått autolog hematopoetisk stamcellstransplantation (t. benmärgstransplantation) för en av följande hematologiska maligniteter: Akut lymfoblastisk leukemi (ALL), akut myelogen leukemi (AML), myelodysplastiskt syndrom (MDS), lymfom (valfri typ) eller multipelt myelom (MM) eller malign transformation; av kronisk lymfatisk leukemi (KLL/SLL).
Är immunsupprimerad definierad som att ha minst ett av följande:
- Genomgått autolog hematopoetisk stamcellstransplantation (HSCT) under de senaste 6 månaderna.
- Fick kemoterapi inom de senaste 45 dagarna.
- Ett återfall av hematologisk malignitet för vilken kemoterapibehandling förväntas inom de närmaste 45 dagarna.
Avsnitt D:
- Har genomgått allogen hematopoetisk stamcellstransplantation (t.ex. benmärgstransplantation) för någon klinisk indikation.
Är immunsupprimerad definierad som att ha minst ett av följande:
- Har genomgått hematopoetisk stamcellstransplantation (HCST) under det senaste året.
- Har aktiv graft versus host disease (GVHD) som kräver immunsuppressiv farmakologisk behandling.
Exklusions kriterier:
- Patienten är döende och, enligt den behandlande läkarens uppfattning, förväntas den inte överleva >24 timmar efter tidpunkten för eventuellt studiebesök.
- Mikrobiologisk etiologi för indexpneumonihändelse har redan identifierats enligt lokal standard för omsorgstestning.
- Patienten var tidigare inskriven i denna studie.
- Patienten har något tillstånd som, enligt den behandlande läkarens uppfattning, kommer att hindra patienten från att slutföra studien. (Obs: en kvalificerad patient kan fortfarande anmäla sig till studien om de avböjer att få ett explorativt forskningsprov insamlat.)
- Patienten är positiv för SARS-COV-2 genom alla molekylära tester inom 14 dagar före inskrivningen.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Blivande
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Intent-to-Diagnose Population
Alla försökspersoner som är inskrivna i studien som har minst ett Kariustest med giltigt resultat
|
Karius Test för detektion av mikrobiellt cellfritt DNA (mcfDNA) i plasma
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Additivt kliniskt diagnostiskt värde
Tidsram: 7 dagar
|
Procent av patienter med ≥1 patogen identifierad av Karius-testet som samlades in vid inskrivningen som bedöms som en trolig orsak till patientens indexpneumonihändelse utan patogen identifierad som en trolig orsak till patientens indexpneumonihändelse från en bedömd sammansättning av alla mikrobiologiska test resultat utförda enligt Standard of Care med resultat tillgängliga inom 7 dagar efter studieregistreringen.
|
7 dagar
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Samarbetspartners
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Norton ME, Baer RJ, Wapner RJ, Kuppermann M, Jelliffe-Pawlowski LL, Currier RJ. Cell-free DNA vs sequential screening for the detection of fetal chromosomal abnormalities. Am J Obstet Gynecol. 2016 Jun;214(6):727.e1-6. doi: 10.1016/j.ajog.2015.12.018. Epub 2015 Dec 18.
- Alix-Panabieres C, Pantel K. Clinical Applications of Circulating Tumor Cells and Circulating Tumor DNA as Liquid Biopsy. Cancer Discov. 2016 May;6(5):479-91. doi: 10.1158/2159-8290.CD-15-1483. Epub 2016 Mar 11.
- Evans SE, Ost DE. Pneumonia in the neutropenic cancer patient. Curr Opin Pulm Med. 2015 May;21(3):260-71. doi: 10.1097/MCP.0000000000000156.
- Schuster MG, Cleveland AA, Dubberke ER, Kauffman CA, Avery RK, Husain S, Paterson DL, Silveira FP, Chiller TM, Benedict K, Murphy K, Pappas PG. Infections in Hematopoietic Cell Transplant Recipients: Results From the Organ Transplant Infection Project, a Multicenter, Prospective, Cohort Study. Open Forum Infect Dis. 2017 Mar 22;4(2):ofx050. doi: 10.1093/ofid/ofx050. eCollection 2017 Spring.
- Chen CS, Boeckh M, Seidel K, Clark JG, Kansu E, Madtes DK, Wagner JL, Witherspoon RP, Anasetti C, Appelbaum FR, Bensinger WI, Deeg HJ, Martin PJ, Sanders JE, Storb R, Storek J, Wade J, Siadak M, Flowers ME, Sullivan KM. Incidence, risk factors, and mortality from pneumonia developing late after hematopoietic stem cell transplantation. Bone Marrow Transplant. 2003 Sep;32(5):515-22. doi: 10.1038/sj.bmt.1704162.
- Harris B, Geyer AI. Diagnostic Evaluation of Pulmonary Abnormalities in Patients with Hematologic Malignancies and Hematopoietic Cell Transplantation. Clin Chest Med. 2017 Jun;38(2):317-331. doi: 10.1016/j.ccm.2016.12.008.
- Hohenthal U, Itala M, Salonen J, Sipila J, Rantakokko-Jalava K, Meurman O, Nikoskelainen J, Vainionpaa R, Kotilainen P. Bronchoalveolar lavage in immunocompromised patients with haematological malignancy--value of new microbiological methods. Eur J Haematol. 2005 Mar;74(3):203-11. doi: 10.1111/j.1600-0609.2004.00373.x.
- Blauwkamp TA, Thair S, Rosen MJ, Blair L, Lindner MS, Vilfan ID, Kawli T, Christians FC, Venkatasubrahmanyam S, Wall GD, Cheung A, Rogers ZN, Meshulam-Simon G, Huijse L, Balakrishnan S, Quinn JV, Hollemon D, Hong DK, Vaughn ML, Kertesz M, Bercovici S, Wilber JC, Yang S. Analytical and clinical validation of a microbial cell-free DNA sequencing test for infectious disease. Nat Microbiol. 2019 Apr;4(4):663-674. doi: 10.1038/s41564-018-0349-6. Epub 2019 Feb 11.
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (FAKTISK)
Primärt slutförande (FAKTISK)
Avslutad studie (FAKTISK)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (FAKTISK)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (UPPSKATTA)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- KDC-010
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .