- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT04047719
Pneumonie chez les immunodéprimés - Utilisation du test de Karius pour la détection de pathogènes non diagnostiqués (PICKUP)
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
La pneumonie est une cause majeure de morbidité et de mortalité chez les personnes hautement immunodéprimées telles que les patients atteints d'hémopathies malignes et/ou de greffes de cellules souches hématopoïétiques. Ces patients peuvent être infectés par un large éventail d'agents pathogènes potentiels, y compris des étiologies virales, bactériennes et fongiques et parfois par plusieurs agents pathogènes simultanément. Les tests diagnostiques échouent souvent à identifier une étiologie microbienne pour les maladies des voies respiratoires inférieures, même avec un lavage bronchoalvéolaire (BAL). En fait, les méthodes de culture, la PCR et les tests d'antigène sur les échantillons de BAL ne donnent un résultat positif que 30 à 67 % du temps. De plus, le syndrome pulmonaire idiopathique (IPS), une complication pulmonaire non infectieuse de la greffe, peut avoir de nombreux symptômes qui se chevauchent avec une pneumonie infectieuse. Le traitement de l'IPS est l'administration de stéroïdes qui peuvent exacerber les infections. Compte tenu de ces raisons, il est nécessaire de disposer de meilleurs diagnostics pour faciliter la prise en charge des patients immunodéprimés atteints de pneumonie.
Karius a développé un test de séquençage de nouvelle génération au plasma microbien acellulaire pour la détection d'agents pathogènes capable de détecter plus de 1 000 organismes, notamment des virus à ADN, des bactéries, des levures, des moisissures et d'autres agents pathogènes eucaryotes. Le test est effectué dans un laboratoire certifié CLIA/accrédité CAP et les résultats sont généralement fournis dans un délai d'un jour à compter de la réception de l'échantillon. Étant donné la nécessité d'un test de diagnostic plus sensible pour la pneumonie dans cette population, nous évaluons les performances du test de Karius pour la détection des agents pathogènes.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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California
-
Duarte, California, États-Unis, 91010
- City of Hope Comprehensive Cancer Center
-
San Francisco, California, États-Unis, 94143
- UCSF Department of Medicine
-
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Colorado
-
Aurora, Colorado, États-Unis, 80045
- University of Colorado Denver
-
-
Louisiana
-
New Orleans, Louisiana, États-Unis, 70112
- Tulane Section of Infectious Disease
-
-
New York
-
New York, New York, États-Unis, 10065
- Memorial Sloan Kettering Cancer Center
-
New York, New York, États-Unis, 10021
- Weill Cornell Medicine
-
-
North Carolina
-
Durham, North Carolina, États-Unis, 27710
- Duke University
-
-
Pennsylvania
-
Pittsburgh, Pennsylvania, États-Unis, 15025
- University of Pittsburgh
-
-
Texas
-
Houston, Texas, États-Unis, 77030
- MD Anderson Cancer Center
-
-
Washington
-
Seattle, Washington, États-Unis, 98109
- Fred Hutchinson Cancer Center
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
Les sujets doivent répondre à tous les critères de la section A et à tous les critères de la section B, de la section C ou de la section D.
Section A :
- Le patient a ≥ 18 ans.
- Est actuellement admis à l'hôpital.
- A une suspicion de pneumonie infectieuse justifiant une évaluation diagnostique et un traitement.
- A subi une bronchoscopie diagnostique pour l'évaluation de l'étiologie microbiologique de la pneumonie dans la journée précédant ou a une bronchoscopie prévue dans les 5 jours suivant l'inscription.
- Le patient ou le représentant légalement autorisé (LAR) du patient a donné son consentement pour l'étude.
Section B :
- Présente l'une des hémopathies malignes suivantes : leucémie aiguë lymphoblastique (LAL), leucémie aiguë myéloïde (LAM), syndrome myélodysplasique (SMD), lymphome (tout type), myélome multiple (MM) ou transformation maligne de la leucémie lymphoïde chronique (LLC/SLL) ).
Sont immunodéprimés définis comme ayant au moins l'un des éléments suivants :
- A reçu une chimiothérapie au cours des 45 derniers jours.
- Une rechute d'une hémopathie maligne pour laquelle un traitement de chimiothérapie est prévu dans les 45 prochains jours.
- ANC < 500 pendant au moins 14 jours et dans les 8 semaines précédant l'inscription.
Rubrique C :
- A subi une greffe autologue de cellules souches hématopoïétiques (par ex. greffe de moelle osseuse) pour l'une des hémopathies malignes suivantes : leucémie aiguë lymphoblastique (LAL), leucémie aiguë myéloïde (LAM), syndrome myélodysplasique (SMD), lymphome (tout type) ou myélome multiple (MM) ;), ou transformation maligne de la leucémie lymphoïde chronique (CLL/SLL).
Sont immunodéprimés définis comme ayant au moins l'un des éléments suivants :
- Avoir subi une greffe autologue de cellules souches hématopoïétiques (GCSH) au cours des 6 derniers mois.
- A reçu une chimiothérapie au cours des 45 derniers jours.
- Une rechute d'une hémopathie maligne pour laquelle un traitement de chimiothérapie est prévu dans les 45 prochains jours.
Rubrique D :
- A subi une allogreffe de cellules souches hématopoïétiques (par exemple, une greffe de moelle osseuse) pour toute indication clinique.
Sont immunodéprimés définis comme ayant au moins l'un des éléments suivants :
- A subi une greffe de cellules souches hématopoïétiques (HCST) au cours de la dernière année.
- A une maladie active du greffon contre l'hôte (GVHD) nécessitant un traitement pharmacologique immunosuppresseur.
Critère d'exclusion:
- Le patient est moribond et, de l'avis du médecin traitant, on ne s'attend pas à ce qu'il survive plus de 24 heures au-delà du moment de la visite potentielle d'inscription à l'étude.
- L'étiologie microbiologique de l'événement index de pneumonie a déjà été identifiée par les tests de la norme de soins locale.
- Le patient a déjà été inscrit dans cette étude.
- Le patient a une condition qui, de l'avis du médecin traitant, empêchera le patient de terminer l'étude. (Remarque : un patient qualifié peut toujours s'inscrire à l'étude s'il refuse de faire prélever un échantillon de recherche exploratoire.)
- Le patient est positif pour le SRAS-COV-2 par tout test moléculaire dans les 14 jours précédant l'inscription.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
|
Population en intention de diagnostiquer
Tous les sujets inscrits à l'étude qui ont au moins un test de Karius avec un résultat valide
|
Test de Karius pour la détection de l'ADN microbien sans cellule (mcfDNA) dans le plasma
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
Valeur diagnostique clinique additive
Délai: 7 jours
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Pourcentage de patients avec ≥ 1 agent pathogène identifié par le test de Karius collecté lors de l'inscription et considéré comme une cause probable de l'événement de pneumonie index du sujet sans aucun agent pathogène identifié comme cause probable de l'événement de pneumonie index du sujet à partir d'un composite jugé de tous les tests microbiologiques résultats effectués selon la norme de soins avec des résultats disponibles dans les 7 jours suivant l'inscription à l'étude.
|
7 jours
|
Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Publications et liens utiles
Publications générales
- Norton ME, Baer RJ, Wapner RJ, Kuppermann M, Jelliffe-Pawlowski LL, Currier RJ. Cell-free DNA vs sequential screening for the detection of fetal chromosomal abnormalities. Am J Obstet Gynecol. 2016 Jun;214(6):727.e1-6. doi: 10.1016/j.ajog.2015.12.018. Epub 2015 Dec 18.
- Alix-Panabieres C, Pantel K. Clinical Applications of Circulating Tumor Cells and Circulating Tumor DNA as Liquid Biopsy. Cancer Discov. 2016 May;6(5):479-91. doi: 10.1158/2159-8290.CD-15-1483. Epub 2016 Mar 11.
- Evans SE, Ost DE. Pneumonia in the neutropenic cancer patient. Curr Opin Pulm Med. 2015 May;21(3):260-71. doi: 10.1097/MCP.0000000000000156.
- Schuster MG, Cleveland AA, Dubberke ER, Kauffman CA, Avery RK, Husain S, Paterson DL, Silveira FP, Chiller TM, Benedict K, Murphy K, Pappas PG. Infections in Hematopoietic Cell Transplant Recipients: Results From the Organ Transplant Infection Project, a Multicenter, Prospective, Cohort Study. Open Forum Infect Dis. 2017 Mar 22;4(2):ofx050. doi: 10.1093/ofid/ofx050. eCollection 2017 Spring.
- Chen CS, Boeckh M, Seidel K, Clark JG, Kansu E, Madtes DK, Wagner JL, Witherspoon RP, Anasetti C, Appelbaum FR, Bensinger WI, Deeg HJ, Martin PJ, Sanders JE, Storb R, Storek J, Wade J, Siadak M, Flowers ME, Sullivan KM. Incidence, risk factors, and mortality from pneumonia developing late after hematopoietic stem cell transplantation. Bone Marrow Transplant. 2003 Sep;32(5):515-22. doi: 10.1038/sj.bmt.1704162.
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- Hohenthal U, Itala M, Salonen J, Sipila J, Rantakokko-Jalava K, Meurman O, Nikoskelainen J, Vainionpaa R, Kotilainen P. Bronchoalveolar lavage in immunocompromised patients with haematological malignancy--value of new microbiological methods. Eur J Haematol. 2005 Mar;74(3):203-11. doi: 10.1111/j.1600-0609.2004.00373.x.
- Blauwkamp TA, Thair S, Rosen MJ, Blair L, Lindner MS, Vilfan ID, Kawli T, Christians FC, Venkatasubrahmanyam S, Wall GD, Cheung A, Rogers ZN, Meshulam-Simon G, Huijse L, Balakrishnan S, Quinn JV, Hollemon D, Hong DK, Vaughn ML, Kertesz M, Bercovici S, Wilber JC, Yang S. Analytical and clinical validation of a microbial cell-free DNA sequencing test for infectious disease. Nat Microbiol. 2019 Apr;4(4):663-674. doi: 10.1038/s41564-018-0349-6. Epub 2019 Feb 11.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (RÉEL)
Achèvement primaire (RÉEL)
Achèvement de l'étude (RÉEL)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (RÉEL)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (ESTIMATION)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- KDC-010
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