Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Integrativ personlig omics-profilering för övervakning av dynamiska molekylära fenotyper under fibertillskott

9 januari 2021 uppdaterad av: Michael Snyder, Stanford University

Utredarna föreslår en omfattande, multiomisk studie som kommer att integrera longitudinella data som associerar förändringar i specifika tarmbakterier och värd som svar på tillskott av prebiotisk fiber. Dessa data kommer att styra utvecklingen av en integrerad biologisk signatur som relaterar till bakteriehärledda metaboliter med biologiskt resultat i värden.

Studieöversikt

Status

Avslutad

Betingelser

Prebiotika

Intervention / Behandling

Kosttillskott: Kostfibertillskott

Detaljerad beskrivning

Med denna studie föreslår utredarna att sammanställa en kohort av friska individer som kommer att få prebiotiskt tillskott, under omfattande, longitudinell karakterisering av mikrobiotan och värdförändringar med kliniska markörer och flera omics-analyser. Dessa multiomiska data kommer sedan att integreras och generera unika biologiska signaturer som definierar den roll som mikrobiella metaboliter från specifika bakterier spelar i värdens biologiska aktivitet. Genom denna studie förväntar sig utredarna att få en detaljerad och tydlig förståelse av de fysiologiska förändringar, på mekanistisk nivå, som sker i mikrobiomet och värden som svar på kosttillskott med prebiotisk fiber.

Studietyp

Interventionell

Inskrivning (Faktisk)

Fas

Inte tillämpbar

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

Förenta staterna
- California
  - Stanford, California, Förenta staterna, 94304
    - Stanford University

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år till 65 år (Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Kön som är behöriga för studier

Allt

Beskrivning

Inklusionskriterier:

God allmän hälsa

Exklusions kriterier:

Fasteblodsocker >126 mg/dL
Triglycerider >400 mg/dL
Okontrollerad hypertoni
Kärlsjukdom
Kroniska inflammatoriska tillstånd
Stor organsjukdom
Stort alkoholbruk
Graviditet/amning
Tidigare bariatrisk operation
Aktiv psykiatrisk sjukdom
Användning av läkemedel som är känt för att påverka kolhydrat- eller lipidmetabolismen
Aktiv ätstörning

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Primärt syfte: Grundläggande vetenskap
Tilldelning: N/A
Interventionsmodell: Sekventiell tilldelning
Maskning: Enda

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått	Åtgärdsbeskrivning	Tidsram
Kartläggning av mikrobiotaförändringar som svar på prebiotisk intervention Tidsram: 3 år	En detaljerad karta över mikrober och mikrobiella genuttrycksförändringar under interventionen kommer att utvecklas. Mikrobiotakomplexiteten i fekala prover kommer att bestämmas genom hagelgevärs metagenomisk sekvensering. Nya mikrober och genvägar kommer att identifieras genom de novo sammansättning av hela fekala metagenomer.	3 år
Lipidprofilförändringar som svar på prebiotisk intervention Tidsram: 3 år	Analys av förändringar i lipidprofilen för deltagare på den prebiotiska interventionen. Uppmätta lipider i mg/dL inkluderar totalkolesterol, LDL-kolesterol, HDL-kolesterol och triglycerider.	3 år

Sekundära resultatmått

Resultatmått	Åtgärdsbeskrivning	Tidsram
Omfattande metagenomprofil under prebiotisk intervention Tidsram: 3 år	Förändringar i värd (human) metagenomprofil under den prebiotiska interventionen kommer att bestämmas. Avförings-DNA-sekvenser analyseras med hjälp av Humann2- och Metaphlan-pipelines för att generera vägtäckningsvärden, överflöd av genfamiljer och överflöd av taxa {Franzosa, 2018}. Dessa mappas till Human Microbiome Project-databasen för anpassning.	3 år
Omfattande transkriptomprofil under prebiotisk intervention Tidsram: 3 år	Förändringar i värd (human) transkriptomprofil under den prebiotiska interventionen kommer att bestämmas. RNA isolerat från PBMC-prover läser in i linje med hg38 med hjälp av programmet Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR). Transkriptmängden beräknas med användning av RNA-Seq genom Expectation Maximization (RSEM). Normalisering av transkriptionsfrekvens och parvis statistik som mäter skillnader i transkriptionsfrekvens mellan tidpunkter beräknas med hjälp av mjukvarupaketet för R från Bioconductor (DESeq2).	3 år
Omfattande metabolomprofil under prebiotisk intervention Tidsram: 3 år	Förändringar i värdens (mänskliga) metabolomprofil under den prebiotiska interventionen kommer att bestämmas. Plasmametaboliter körs i masspektrometerkolonner (HILIC- och RPLC-separation i både positiva och negativa joniseringslägen). MetID och vår MS/MS-data används för att identifiera 12740 metaboliter med konfidensnivåer från 1-3, där 1 matchar MS/MS, retentionstid och m/z från standarder på vår plattform, 2 har MS/MS och m/z matchar från en databas, och 3 matchar m/z för en databas.	3 år
Omfattande cytokinprofil under prebiotisk intervention Tidsram: 3 år	Förändringar i värd(human) cytokinprofil under den prebiotiska interventionen kommer att bestämmas. Cytokiner profileras med hjälp av ett Luminex xMAP cytokinprofileringssystem vid Stanford Human Immune Monitoring Center. Detta innebär att antikroppar som är specifika för cytokiner fästs på pärlor med hjälp av en infångningsmolekyl. De fluorescerande molekylerna är fästa vid cytokinerna, och fluorescens används som mått på cytokinförekomst.	3 år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Stanford University

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

15 oktober 2014

Primärt slutförande (Faktisk)

11 augusti 2017

Avslutad studie (Faktisk)

11 augusti 2017

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

3 december 2020

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

9 januari 2021

Första postat (Faktisk)

13 januari 2021

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)