Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Integratieve persoonlijke omics-profilering voor monitoring van dynamische moleculaire fenotypes tijdens vezelsuppletie

9 januari 2021 bijgewerkt door: Michael Snyder, Stanford University

De onderzoekers stellen een uitgebreide, multiomische studie voor die longitudinale gegevens zal integreren die verband houden met veranderingen in specifieke darmbacteriën en gastheer als reactie op suppletie met prebiotische vezels. Deze gegevens zullen de ontwikkeling begeleiden van een integratieve biologische handtekening die van bacteriën afkomstige metabolieten relateert aan de biologische uitkomst in de gastheer.

Studie Overzicht

Toestand

Voltooid

Conditie

Prebiotica

Interventie / Behandeling

Voedingssupplement: Suppletie van voedingsvezels

Gedetailleerde beschrijving

Met deze studie stellen de onderzoekers voor om een cohort van gezonde individuen samen te stellen die prebiotische suppletie zullen krijgen, tijdens uitgebreide, longitudinale karakterisering van de microbiota en gastheerveranderingen met klinische markers en meerdere omics-assays. Deze multiomische gegevens zullen vervolgens worden geïntegreerd, waardoor unieke biologische handtekeningen worden gegenereerd die de rol definiëren die microbiële metabolieten van specifieke bacteriën spelen in de biologische activiteit van de gastheer. Door middel van deze studie verwachten de onderzoekers een gedetailleerd en duidelijk inzicht te krijgen in de fysiologische veranderingen, op mechanistisch niveau, die optreden in het microbioom en de gastheer als reactie op voedingssuppletie met prebiotische vezels.

Studietype

Ingrijpend

Inschrijving (Werkelijk)

Fase

Niet toepasbaar

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

Verenigde Staten
- California
  - Stanford, California, Verenigde Staten, 94304
    - Stanford University

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar tot 65 jaar (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Beschrijving

Inclusiecriteria:

Goede algemene gezondheid

Uitsluitingscriteria:

Nuchtere bloedsuiker >126 mg/dL
Triglyceriden >400 mg/dL
Ongecontroleerde hypertensie
Vaatziekte
Chronische ontstekingsaandoeningen
Ernstige orgaanziekte
Zwaar alcoholgebruik
Zwangerschap/borstvoeding
Voorafgaande bariatrische chirurgie
Actieve psychiatrische ziekte
Gebruik van medicijnen waarvan bekend is dat ze het koolhydraat- of vetmetabolisme beïnvloeden
Actieve eetstoornis

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Primair doel: Fundamentele wetenschap
Toewijzing: NVT
Interventioneel model: Sequentiële toewijzing
Masker: Enkel

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat	Maatregel Beschrijving	Tijdsspanne
In kaart brengen van microbiota-veranderingen als reactie op prebiotische interventie Tijdsspanne: 3 jaar	Een gedetailleerde kaart van microben en microbiële genexpressieveranderingen tijdens de interventie zal worden ontwikkeld. De complexiteit van de microbiota in fecale monsters zal worden bepaald door shotgun-metagenomische sequencing. Nieuwe microben en genpathways zullen worden geïdentificeerd door de novo verzameling van hele fecale metagenomen.	3 jaar
Veranderingen in het lipidenprofiel als reactie op prebiotische interventie Tijdsspanne: 3 jaar	Analyse van veranderingen in het lipidenprofiel van deelnemers aan de prebiotische interventie. Gemeten lipiden in mg/dL omvatten totaal cholesterol, LDL-cholesterol, HDL-cholesterol en triglyceriden.	3 jaar

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat	Maatregel Beschrijving	Tijdsspanne
Uitgebreid metagenoomprofiel tijdens prebiotische interventie Tijdsspanne: 3 jaar	Veranderingen in het metagenoomprofiel van de gastheer (mens) tijdens de prebiotische interventie zullen worden bepaald. Ontlasting-DNA-sequenties worden geanalyseerd met behulp van de Humann2- en Metaphlan-pijplijnen om paddekkingswaarden, genfamilie-abundanties en taxa-abundanties te genereren {Franzosa, 2018}. Deze worden voor uitlijning toegewezen aan de Human Microbiome Project-database.	3 jaar
Uitgebreid transcriptoomprofiel tijdens prebiotische interventie Tijdsspanne: 3 jaar	Veranderingen in gastheer (menselijk) transcriptoomprofiel tijdens de prebiotische interventie zullen worden bepaald. RNA geïsoleerd uit PBMC-monsters worden uitgelijnd met hg38 met behulp van het programma Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR). Transcriptabundantie wordt berekend met behulp van RNA-Seq door Expectation Maximization (RSEM). Normalisatie van transcriptiefrequentie en paarsgewijze statistieken die verschillen in transcriptiefrequentie tussen tijdstippen meten, worden berekend met behulp van het softwarepakket voor R van Bioconductor (DESeq2).	3 jaar
Uitgebreid metaboloomprofiel tijdens prebiotische interventie Tijdsspanne: 3 jaar	Veranderingen in het metaboloomprofiel van de gastheer (mens) tijdens de prebiotische interventie zullen worden bepaald. Plasmametabolieten worden uitgevoerd in massaspectrometerkolommen (HILIC- en RPLC-scheiding in zowel positieve als negatieve ionisatiemodi). MetID en onze MS/MS-gegevens worden gebruikt om 12740 metabolieten te identificeren met betrouwbaarheidsniveaus variërend van 1-3, waarbij 1 overeenkomt met MS/MS, retentietijd en m/z van standaarden op ons platform, 2 heeft MS/MS en m/z komt overeen met een database en 3 komt overeen met de m/z van een database.	3 jaar
Uitgebreid cytokineprofiel tijdens prebiotische interventie Tijdsspanne: 3 jaar	Veranderingen in gastheer (menselijk) cytokineprofiel tijdens de prebiotische interventie zullen worden bepaald. Cytokines worden geprofileerd met behulp van een Luminex xMAP cytokine-profileringssysteem in het Stanford Human Immune Monitoring Center. Dit omvat het bevestigen van antilichamen die specifiek zijn voor cytokines aan korrels met behulp van een vangmolecuul. De fluorescerende moleculen zijn gehecht aan de cytokines en fluorescentie wordt gebruikt als maatstaf voor de overvloed aan cytokines.	3 jaar

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Stanford University

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

15 oktober 2014

Primaire voltooiing (Werkelijk)

11 augustus 2017

Studie voltooiing (Werkelijk)

11 augustus 2017

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

3 december 2020

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

9 januari 2021

Eerst geplaatst (Werkelijk)

13 januari 2021

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)