Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

Integratív személyes omika profilalkotás a dinamikus molekuláris fenotípusok megfigyeléséhez rostkiegészítés során

2021. január 9. frissítette: Michael Snyder, Stanford University
A kutatók egy átfogó, multiomikus vizsgálatot javasolnak, amely integrálja a longitudinális adatokat, amelyek a specifikus bélbaktériumokban és a gazdaszervezetben bekövetkezett változásokat társítják a prebiotikus rostpótlás hatására. Ezek az adatok irányítják a bakteriális eredetű metabolitokra vonatkozó integratív biológiai aláírás kifejlesztését, és a gazdaszervezetben biológiai eredménnyel járnak.

A tanulmány áttekintése

Állapot

Befejezve

Körülmények

Részletes leírás

Ezzel a vizsgálattal a kutatók azt javasolják, hogy állítsanak össze egy csoportot egészséges egyénekből, akik prebiotikum-kiegészítésben részesülnek a mikrobiota és a gazdaszervezet változásainak átfogó, longitudinális jellemzése során klinikai markerekkel és többszörös omikavizsgálatokkal. Ezeket a multiomikus adatokat azután integrálják, egyedi biológiai aláírásokat generálva, amelyek meghatározzák azt a szerepet, amelyet a specifikus baktériumokból származó mikrobiális metabolitok játszanak a gazdaszervezet biológiai aktivitásában. Ezzel a vizsgálattal a kutatók arra számítanak, hogy részletes és világos megértést kapnak a mechanikai szinten a mikrobiómában és a gazdaszervezetben a prebiotikus rostokkal történő étrend-kiegészítés hatására bekövetkező fiziológiai változásokról.

Tanulmány típusa

Beavatkozó

Beiratkozás (Tényleges)

18

Fázis

  • Nem alkalmazható

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi helyek

    • California
      • Stanford, California, Egyesült Államok, 94304
        • Stanford University

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

18 év (Felnőtt, Idősebb felnőtt)

Egészséges önkénteseket fogad

Igen

Tanulmányozható nemek

Összes

Leírás

Bevételi kritériumok:

  • Jó általános egészségi állapot

Kizárási kritériumok:

  • Éhgyomri vércukorszint >126 mg/dl
  • Trigliceridek >400 mg/dl
  • Nem kontrollált magas vérnyomás
  • Érbetegség
  • Krónikus gyulladásos állapotok
  • Főbb szervi betegségek
  • Erős alkoholfogyasztás
  • Terhesség/szoptatás
  • Korábbi bariátriai műtét
  • Aktív pszichiátriai betegség
  • Olyan gyógyszerek alkalmazása, amelyekről ismert, hogy befolyásolják a szénhidrát- vagy lipidanyagcserét
  • Aktív étkezési zavar

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

  • Elsődleges cél: Alapvető tudomány
  • Kiosztás: N/A
  • Beavatkozó modell: Szekvenciális hozzárendelés
  • Maszkolás: Egyetlen

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
A mikrobióta változásainak feltérképezése a prebiotikus beavatkozás hatására
Időkeret: 3 év

Részletes térképet készítenek a mikrobákról és a mikrobiális génexpressziós változásokról a beavatkozás során.

A székletminták mikrobióta komplexitását sörétes metagenomikus szekvenálással határozzuk meg. Az új mikrobákat és génpályákat teljes széklet metagenomok de novo összeállításával azonosítják.

3 év
A lipidprofil megváltozik a prebiotikus beavatkozás hatására
Időkeret: 3 év
A prebiotikus beavatkozásban résztvevők lipidprofiljában bekövetkezett változások elemzése. A mg/dl-ben mért lipidek közé tartozik az összkoleszterin, az LDL-koleszterin, a HDL-koleszterin és a trigliceridek.
3 év

Másodlagos eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
Átfogó metagenom profil a prebiotikus beavatkozás során
Időkeret: 3 év
Meghatározzák a gazdaszervezet (humán) metagenom profiljában a prebiotikus beavatkozás során bekövetkezett változásokat. A széklet DNS-szekvenciáit a Humann2 és a Metaphlan csővezetékek segítségével elemezzük az útvonal lefedettségi értékeinek, a géncsaládok abundanciájának és a taxonok mennyiségének meghatározásához {Franzosa, 2018}. Ezeket a Human Microbiome Project adatbázishoz igazítjuk.
3 év
Átfogó transzkriptom profil a prebiotikus beavatkozás során
Időkeret: 3 év
Meghatározzák a gazdaszervezet (humán) transzkriptomprofiljában a prebiotikus beavatkozás során bekövetkezett változásokat. A leolvasott PBMC-mintákból izolált RNS-t a hg38-hoz igazítják a Spliced ​​Transcripts Alignment to a Reference (STAR) programmal. A transzkriptum abundanciáját az RNA-Seq segítségével számítjuk ki az Expectation Maximization (RSEM) segítségével. Az átírási gyakoriság normalizálását és az átírási gyakoriság különbségeit mérő páronkénti statisztikát az időpontok között a Bioconductor R szoftvercsomagjával (DESeq2) számítjuk ki.
3 év
Átfogó metabolom profil a prebiotikus beavatkozás során
Időkeret: 3 év
Meg kell határozni a gazdaszervezet (humán) metabolóma profiljában a prebiotikus beavatkozás során bekövetkezett változásokat. A plazma metabolitokat tömegspektrométer oszlopokon futtatjuk (HILIC és RPLC elválasztás pozitív és negatív ionizációs módban egyaránt). A MetID és az MS/MS adataink 12740 metabolit azonosítására szolgálnak 1-től 3-ig terjedő megbízhatósági szintekkel, ahol 1 megfelel az MS/MS-nek, a retenciós időnek és az m/z-nek a platformunkon található szabványok szerint, a 2-nek MS/MS és m/z. egyezik egy adatbázisból, 3 pedig egy adatbázis m/z értékével.
3 év
Átfogó citokin profil a prebiotikus beavatkozás során
Időkeret: 3 év
Meghatározzák a gazdaszervezet (humán) citokinprofiljában bekövetkezett változásokat a prebiotikus beavatkozás során. A citokinek profilozása Luminex xMAP citokinprofilozó rendszerrel történik a Stanford Human Immune Monitoring Centerben. Ez magában foglalja a citokinekre specifikus antitestek rögzítését a gyöngyökhöz egy befogó molekula segítségével. A fluoreszcens molekulák a citokinekhez kapcsolódnak, és a fluoreszcenciát használják a citokin mennyiségének mérésére.
3 év

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (Tényleges)

2014. október 15.

Elsődleges befejezés (Tényleges)

2017. augusztus 11.

A tanulmány befejezése (Tényleges)

2017. augusztus 11.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2020. december 3.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2021. január 9.

Első közzététel (Tényleges)

2021. január 13.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)

2021. január 13.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2021. január 9.

Utolsó ellenőrzés

2021. január 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

Egyéb vizsgálati azonosító számok

  • 1636

Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)

Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?

NEM

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Nem

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Klinikai vizsgálatok a Élelmi rost pótlás

3
Iratkozz fel