Perfil ômico pessoal integrativo para monitoramento de fenótipos moleculares dinâmicos durante a suplementação de fibras
9 de janeiro de 2021 atualizado por: Michael Snyder, Stanford University
Os pesquisadores propõem um estudo multiômico abrangente que integrará dados longitudinais associando alterações em bactérias intestinais específicas e hospedeiro em resposta à suplementação de fibra prebiótica.
Esses dados orientarão o desenvolvimento de uma assinatura biológica integrativa relacionando metabólitos derivados de bactérias com resultados biológicos no hospedeiro.
Visão geral do estudo
Status
Concluído
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
Com este estudo, os pesquisadores se propõem a montar uma coorte de indivíduos saudáveis que receberão suplementação prebiótica, durante a caracterização abrangente e longitudinal da microbiota e alterações do hospedeiro com marcadores clínicos e ensaios ômicos múltiplos.
Esses dados multiômicos serão então integrados, gerando assinaturas biológicas únicas que definem o papel que os metabólitos microbianos de bactérias específicas desempenham na atividade biológica do hospedeiro.
Através deste estudo, os investigadores esperam obter uma compreensão detalhada e clara das mudanças fisiológicas, no nível mecanicista, que ocorrem no microbioma e no hospedeiro em resposta à suplementação dietética com fibra prebiótica.
Tipo de estudo
Intervencional
Inscrição (Real)
18
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.
Locais de estudo
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California
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Stanford, California, Estados Unidos, 94304
- Stanford University
-
-
Critérios de participação
Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
18 anos a 65 anos (Adulto, Adulto mais velho)
Aceita Voluntários Saudáveis
Sim
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Tudo
Descrição
Critério de inclusão:
- boa saúde geral
Critério de exclusão:
- Açúcar no sangue em jejum >126 mg/dL
- Triglicerídeos >400 mg/dL
- hipertensão descontrolada
- Doença vascular
- Condições inflamatórias crônicas
- Doença de órgão principal
- Uso pesado de álcool
- Gravidez/lactação
- Cirurgia bariátrica prévia
- Doença psiquiátrica ativa
- Uso de medicamentos conhecidos por afetar o metabolismo de carboidratos ou lipídios
- transtorno alimentar ativo
Plano de estudo
Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Ciência básica
- Alocação: N / D
- Modelo Intervencional: Atribuição sequencial
- Mascaramento: Solteiro
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Mapeamento das alterações da microbiota em resposta à intervenção prebiótica
Prazo: 3 anos
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Um mapa detalhado de micróbios e mudanças de expressão gênica microbiana durante a intervenção será desenvolvido. A complexidade da microbiota em amostras fecais será determinada por sequenciamento metagenômico shotgun. Novos micróbios e vias gênicas serão identificados por montagem de novo de metagenomas fecais inteiros. |
3 anos
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Mudanças no perfil lipídico em resposta à intervenção prebiótica
Prazo: 3 anos
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Análise das mudanças no perfil lipídico dos participantes da intervenção prebiótica.
Os lipídios medidos em mg/dL incluem colesterol total, colesterol LDL, colesterol HDL e triglicerídeos.
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3 anos
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Perfil abrangente do metagenoma durante a intervenção prebiótica
Prazo: 3 anos
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Serão determinadas as mudanças no perfil do metagenoma do hospedeiro (humano) durante a intervenção prebiótica.
As sequências de DNA de fezes são analisadas usando os pipelines Humann2 e Metaphlan para gerar valores de cobertura de via, abundância de famílias de genes e abundância de táxons {Franzosa, 2018}.
Estes são mapeados para o banco de dados do Projeto Microbioma Humano para alinhamento.
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3 anos
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Perfil abrangente do transcriptoma durante a intervenção prebiótica
Prazo: 3 anos
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As alterações no perfil do transcriptoma do hospedeiro (humano) durante a intervenção prebiótica serão determinadas.
O RNA isolado das leituras de amostras de PBMC é alinhado para hg38 usando o programa Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR).
A abundância de transcrição é calculada usando RNA-Seq por Expectation Maximization (RSEM).
A normalização da frequência de transcrição e as estatísticas pareadas medindo as diferenças na frequência de transcrição entre os pontos de tempo são calculadas usando o pacote de software para R da Bioconductor (DESeq2).
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3 anos
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Perfil abrangente do metaboloma durante a intervenção prebiótica
Prazo: 3 anos
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As alterações no perfil do metaboloma do hospedeiro (humano) durante a intervenção prebiótica serão determinadas.
Os metabólitos do plasma são executados em colunas de espectrômetros de massa (separação HILIC e RPLC nos modos de ionização positivo e negativo).
MetID e nossos dados de MS/MS são usados para identificar 12.740 metabólitos com níveis de confiança variando de 1 a 3, onde 1 corresponde a MS/MS, tempo de retenção e m/z dos padrões em nossa plataforma, 2 tem MS/MS e m/z corresponde a um banco de dados e 3 corresponde ao m/z de um banco de dados.
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3 anos
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Perfil abrangente de citocinas durante a intervenção prebiótica
Prazo: 3 anos
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As alterações no perfil de citocinas do hospedeiro (humano) durante a intervenção prebiótica serão determinadas.
As citocinas são perfiladas usando um sistema de perfis de citocinas Luminex xMAP no Stanford Human Immune Monitoring Center.
Isso envolve a ligação de anticorpos específicos para citocinas a grânulos usando uma molécula de captura.
As moléculas fluorescentes estão ligadas às citocinas e a fluorescência é usada como medida da abundância de citocinas.
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3 anos
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Colaboradores e Investigadores
É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.
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Datas de registro do estudo
Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
15 de outubro de 2014
Conclusão Primária (Real)
11 de agosto de 2017
Conclusão do estudo (Real)
11 de agosto de 2017
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
3 de dezembro de 2020
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
9 de janeiro de 2021
Primeira postagem (Real)
13 de janeiro de 2021
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
13 de janeiro de 2021
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
9 de janeiro de 2021
Última verificação
1 de janeiro de 2021
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Outros números de identificação do estudo
- 1636
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
NÃO
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Não
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
Não
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