En multicenter klinisk prövning av avföringsbaserad DNA-testning för tidig upptäckt av tjocktarmscancer i Kina

Den kliniska multicenterprövningen kommer att genomföras med en enkelblind metod. Avföringsprover från deltagarna kommer att utvärderas av Human Multigene Methylation Detection Kit (Fluorescent PCR). Kitet kommer att användas för att kvalitativt detektera metyleringsnivåer av flera gener i mänskliga avföringsprover in vitro genom att använda kvantitativ metyleringsspecifik PCR (qMSP). Principen för metoden är följande. Först extraheras mål-DNA:t i mänsklig avföring med magnetisk pärlfångningsteknik och behandlas sedan med natriumbisulfit. Sekvensen för ometylerat DNA kommer att ändras medan det för det metylerade DNA:t förblir densamma efter natriumbisulfitbehandling. Därefter används qMSP för att detektera metyleringsnivåer av målgener utöver ACTB-genen (en referensgen). Kontroller av ACTB-genen med och utan metylering testas samtidigt. Resultatet av qMSP är dikotomiserat som positivt och negativt baserat på erhållet Ct-värde. Testresultatet verifieras sedan med Sanger-sekvensering och jämförs med det från koloskopiundersökning och patologirapport. De viktigaste utvärderingsindexen för testprestanda är sensitivitet, specificitet, konsistenshastighet, kappa-koefficient.