- ICH GCP
- Amerikanska kliniska prövningsregistret
- Klinisk prövning NCT04733456
Hjärnaktivitet och syresättning Patienter med inflammatorisk tarmsjukdom (IBD).
Utvärdering av hjärnaktivitet och syresättning med hjälp av nära-infraröd spektroskopi (NIRS) hos patienter med inflammatorisk tarmsjukdom (IBD)
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Hypotes Tillstånd med akut systemisk inflammation kommer att korrelera med förändringar i tarmmikrobiomsignaturer, minskad cerebral syremättnad (StO2) och förändrade mönster av mikrovaskulär cerebral blodperfusion (som bestäms av nära-infraröd spektroskopi NIRS).
Bakgrund Utredarna undersöker förmågan hos nära-infraröd spektroskopi (NIRS) att upptäcka förändrad hjärnfunktion och syresättning under en rad kliniskt relevanta medicinska tillstånd.
NIRS möjliggör icke-invasiv mätning av koncentrationer av syresatt (O2Hb) och syrefattigt hemoglobin (HHb) i kortikal hjärnvävnad. Därför kan NIRS användas för att kvantifiera kortikal vävnads syremättnad (StO2), vilket återspeglar förändrad metabolisk hastighet och perfusion. Dessutom kan funktionell NIRS (fNIRS) användas för att undersöka hjärnaktivitet på ett liknande sätt som funktionell MRT, genom att anta att de uppmätta förändringarna i blodperfusion och syresättning beror på funktionell hyperemi (dvs. hemodynamiska förändringar orsakade av neural aktivitet). Användning av NIRS hos patienter har förändrade mönster av hjärnblodperfusion och minskade syresättningsnivåer i hjärnan visat sig korrelera med trötthet och nedsatt kognition, vilket kopplar minskad kortikal perfusion till symtom som har rapporterats förekomma hos patienter med IBD.
Stram reglering av cerebralt blodflöde är avgörande för att säkerställa normal hjärnsyresättning och funktion. Cerebrovaskulär dysfunktion och hypoxi har varit inblandade i en rad neurodegenerativa och neuroinflammatoriska störningar inklusive Alzheimers sjukdom och multipel skleros (MS). I en nyligen genomförd studie med hjälp av fNIRS fann forskarna förändrade uppgiftsrelaterade hemodynamiska svar och hjärnhypoxi hos patienter med den immunmedierade leversjukdomen, primär biliär kolangit (PBC). Dessutom tyder det experimentella arbetet på möss på att dessa förändringar kan bero på verkan av TNFa på den cerebrala kärlen. Den visade också att patienter med multipel skleros hade minskad interhemisfärisk koherens och hypoxi. Dessa observationer ledde till frågan om generell systemisk inflammation eller hjärna/tarm-interaktioner kunde kopplas till onormal hjärnfunktion och hypoxi, som kan upptäckas av NIRS.
Som stöd för denna hypotes är en färsk NIRS-studie av Fujiwara T et al på patienter med IBD. De visade att under utförandet av en uppgift var medelkoncentrationen av syresatt hemoglobin signifikant lägre i frontalloben hos IBD-patienter jämfört med friska kontroller. Ändringar i hjärnans syresättning har dock inte tidigare undersökts under vilotillstånd eller i samband med markörer för perifer inflammation, livskvalitetsmått och symtombörda eller tarmmikrobiomsignaturer hos IBD-patienter.
Denna för närvarande föreslagna delstudie är att undersöka patienter med inflammatorisk tarmsjukdom (IBD) för deras nivå av hypoxi, fNIRS funktionell respons och fNIRS koherens.
IBD ökar i incidens och prevalens över hela världen. Flera faktorer har varit inblandade i utvecklingen av IBD, inklusive ett dysregulerat immunsvar mot förändrad mikrobiota i en genetiskt mottaglig värd som utsätts för stimulerande miljöfaktorer, men den specifika orsaken till IBD är fortfarande okänd. Komorbida maladaptiva beteenden och smärta är vanliga hos patienter med IBD20-26. Dessa samsjukligheter för psykisk hälsa komplicerar hanteringen av IBD, påverkar patientens resultat och hälsa negativt och ökar resursbördan för hälso- och sjukvården. Emellertid är samsjukliga psykiska problem och symtom hos IBD-patienter dåligt förstådda och underbehandlade, parallellt med otillfredsställda psykiska behandlingsbehov i den allmänna kanadensiska befolkningen. Därför är en förbättrad förståelse av hur hjärnförändringar uppstår i samband med IBD, och deras potentiella roll i symtomutveckling och koppling till systemisk inflammation och tarmmikrobiomer signaturer av stor betydelse för att förbättra behandlingen av dessa patienter.
Mag-tarmkanalen fungerar som ett dynamiskt och lokalt ekosystem för tarmmikrobiota. Dysbios, som är en förändring av tarmens mikrobiella sammansättning som bidrar till värdsjukdom, förekommer hos IBD-patienter. Specifikt uppvisar IBD-patienter en lägre mikrobiell α-diversitet och är berikade i flera grupper av bakterier jämfört med friska kontroller. Nyligen har prekliniska, translationella och kliniska studier indikerat att förändringar i mikrobiomets strukturella sammansättning eller funktion kan bidra till utvecklingen av psykisk ohälsa, inklusive depressionsliknande beteende, och därför är en viktig komponent som länkar samman tarm-hjärnaxeln. . I enlighet med detta har starka samband identifierats mellan förändringar i tarmmikrobiota och utvecklingen av kroniska inflammatoriska störningar, såsom IBD, vilket tyder på att dysbios är en viktig faktor i både gastrointestinala störningar och mental hälsa. Men de exakta mekanismerna genom vilka tarmdysbios i IBD kan förändra beteendet är fortfarande dåligt förstådda.
Hur perifer inflammation, som förekommer vid IBD, leder till avlägsna förändringar i hjärnans funktion är fortfarande oklart och som ett resultat finns det begränsade terapeutiska alternativ tillgängliga kliniskt för att lösa detta problem. Ett antal allmänna vägar har beskrivits som kopplar systemisk inflammation till förändringar som sker i hjärnan, vilket i sin tur ger upphov till förändrat beteende. Dessa vägar har traditionellt inkluderat signalering via neurala vägar (främst vagala nervafferenter) och immunsignalering (främst via cirkulerande cytokiner som TNFα, som antingen kommer in i hjärnan direkt eller aktiverar cerebralt endotel). Nyligen beskrev forskare vid University of Calgary en ny signaleringsväg för inflammation som involverar ökad perifer TNF-α-produktion som driver ökad mikroglialaktivering, följt av monocytrekrytering till hjärnans kärl och hjärnparenkym, vilket i sin tur driver utvecklingen av sjukdomsbeteenden. TNFα är ett multifunktionellt cytokin som förmedlar en rad effekter som direkt kan påverka hjärnans funktion (via modulerande neurotransmission) och tarmen (t.ex. påverkar tarmbarriärpermeabiliteten) och modulerar vävnadsinflammation (t.ex. aktivera makrofager för att inducera cytokin- och kemokinexpression). Ökade cirkulerande nivåer av TNFα och förhöjd produktion av cirkulerande leukocyter dokumenteras vanligtvis hos patienter med kroniska inflammatoriska tillstånd associerade med en hög förekomst av sjukdomsbeteenden och humörstörningar, inklusive IBD. Därför har blockad av TNFα-signalering utvärderats omfattande i kliniska studier av IBD. Dessutom är förbättringar av symtomen genom TNFa-signaleringshämning ofta uppenbara hos behandlade patienter med kroniska inflammatoriska sjukdomar, före tydliga förändringar i sjukdomsaktivitet. Hos patienter med IBD var anti-TNFα-terapi associerad med signifikanta förbättringar av sömn, depression och ångest tidigt efter påbörjad behandling, och dessa förbättringar bibehölls. Dessutom utvärderade en annan studie effekten av anti-TNFα-terapi på interoceptiv signalering hos patienter med Crohns sjukdom och visade minskningar av visceral känslighet och förbättrad kognitiv-affektiv process efter anti-TNFα-administrering, parallellt med förbättrad känsla av välbefinnande. Förändringar i kognition var kopplade till förändringar i neural aktivitet i prefrontala och limbiska hjärnområden. Dessutom var de snabba beteende- och neurala förändringarna som observerades inte associerade med signifikanta förändringar i fekala kalprotektinnivåer (markör för tarminflammation) vilket tyder på att de var osannolikt relaterade till en samtidig minskning av tarminflammation. Anti-TNFα-terapi förändrar också tarmmikrobiomet hos patienter med IBD. Specifikt ökade anti-TNFα-terapi hos IBD-patienter tarmmikrobiella artrikedom och fylodiversitet till nivåer liknande friska kontroller. Dessutom minskade anti-TNF-terapi den relativa förekomsten av proinflammatoriska bakterier Escherichia och Enterococcus hos IBD-patienter och ökade släkten som producerar kortkedjiga fettsyror, som har väletablerade antiinflammatoriska effekter i tarmen.
Friska cerebrala endotelceller (CEC) är avgörande för reglering av blodflödet i hjärnan, såväl som för den normala funktionen av blod-hjärnbarriären (BBB). Cytokiner, inklusive TNFα, som härrör från centrala nervsystemet eller finns i den perifera blodcirkulationen, kan inducera CEC-dysfunktion och öka BBB-permeabiliteten, som är känd för att vara associerad med många neurologiska störningar inklusive Alzheimers och MS, såväl som perifert inducerad neuroinflammation . Faktum är att CEC exponerade för TNFα uttrycker färre interendotelproteiner och har större generering av reaktiva syrearter, vilket leder till ökad BBB-permeabilitet. Dessutom kan CEC aktiveras av cytokiner som antingen finns i blodet eller frigörs av cirkulerande immunceller i intim kontakt med CEC, för att producera sekundära signalmolekyler (t.ex. ytterligare cytokiner, prostaglandin E2, kväveoxid) som interagerar med celler i hjärnan för att ändra NVC-svar. I överensstämmelse med detta förslag, i en musmodell av perifer inflammation, visades det att aktiverade monocyter i hjärncirkulationen fäster vid CEC och inducerar CEC-aktivering genom TNFa-TNF-receptor-1-interaktioner. Denna immuncells- och TNFa-drivna CEC-aktivering uppreglerar inducerbart kväveoxidsyntasexpression inom CECs och var direkt kopplad till aktivering av mikroglia i hjärnan (särskilt de celler i närheten av blodkärl) och slutligen till förändrat beteende. Dessa tidigare fynd från denna grupp tillhandahåller en mekanism genom vilken perifer inflammation kan påverka funktionen hos CEC och därigenom förändra cerebrovaskulär funktion. Blockering av aktiverade immunceller i cirkulationen från att fästa vid CEC ökar uppgiftsinducerat kortikalt blodflöde (dvs NVC)66, vilket tyder på att immuncell-CEC adhesiva interaktioner kan leda till neurovaskulär frikoppling. CEC kan också spela en viktig roll i regleringen av cerebralt blodflöde genom att passivt tillåta kärlens glatta muskulatur att slappna av och dra ihop sig. Intressant nog har aktiverade leukocyter visats främja endotelcellsberoende vasospasticitet och minska arteriell avslappning in vitro och in vivo. Vidare är endotelcellsberoende vasospasticitet förhöjd i närvaro av proteinaggregat i blodet, vilket effektivt skulle minska det dynamiska området för vasodilatation. Detta är särskilt intressant med tanke på tidigare fynd att perifer inflammation leder till ökad CEC-presentation av adhesionsmolekylen P-selektin, vilket i sin tur främjar leukocyt- och trombocytvidhäftning till CEC. Sammantaget tyder dessa fynd på att ökade leukocyt-CEC-interaktioner associerade med perifer inflammation avsevärt kan bidra till förändrad cerebrovaskulär dynamik och potentiell neurovaskulär frånkoppling vid perifer inflammatorisk sjukdom, vilket visar sig som förändrad cerebral syresättning.
Betraktad i samband med neuroinflammation associerad med kronisk perifer inflammation, kan förändringar i kortikal perfusion och syresättning bidra, åtminstone delvis, till de beteendesymtom som är associerade med IBD och sjukdomsrelaterade minskningar av hälsorelaterad livskvalitet (QoL).
IBD-kliniken testar rutinmässigt nya behandlingar för IBD. De har kommit överens om att integrera NIRS i ett pilotprotokoll för att avgöra om det finns tillräckliga bevis för att motivera en längre prövning av NIRS som en biomarkör för neurologisk inblandning i IBD.
Utredarna föreslår följande serie experiment, med användning av NIRS, för att bestämma (A) om patienter med IBD uppvisar minskad kortikal syremättnad och förändrade mönster av mikrovaskulär cerebral blodperfusion; (B) om NIRS-fynd av syremättnad och perfusion korrelerar med kliniska sjukdomsaktivitetsmarkörer, en sjukdomsspecifik tarmmikrobiomsignatur och/eller symptom och livskvalitetspoäng hos patienter med IBD; (C) effekten av anti-TNF-terapi (administrerad enligt klinisk indikation, som standard) på NIRS-förändringar, det fekala mikrobiomet, markörer för systemisk inflammation och symtomens svårighetsgrad.
Studietyp
Inskrivning (Förväntat)
Kontakter och platser
Studiekontakt
- Namn: Mark G Swain, MD
- Telefonnummer: 403-592-5010
- E-post: swain@ucalgary.ca
Studera Kontakt Backup
- Namn: Pam Crotty
- Telefonnummer: 403-592-5076
- E-post: pcrotty@ucalgary.ca
Studieorter
-
-
Alberta
-
Calgary, Alberta, Kanada, T2N 4Z6
- Rekrytering
- University Of Calgary
-
Kontakt:
- Blessing Odia
- Telefonnummer: 403-220-5782
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inklusionskriterier:
Kvalificerade patienter kommer att vara:
- > 18 år med måttlig till svår UC eller (partiell Mayo-poäng [exklusive endoskopi] ≥5 med rektal blödning subscore ≥1; eller total Mayo subscore 6-12 med RBS ≥1) eller CD (Harvey-Bradshaw index [ HBI] på 7 eller högre, och aktiv CD bekräftad på POC tarm-ultraljud (definierad av tarmväggtjocklek >3 mm och positiv färgdopplersignal och ett fekalt kalprotektin > 50 μg/g).
- baserat på deras aktiva sjukdomsstatus kan patienter inte ta > 20 mg prednison dagligen och
- måste vara berättigad till anti-TNF-terapi enligt standardvård (kliniskt beslut fattat av IBD-specialist som tar hand om patienten).
Exklusions kriterier:
- patienter med allvarligt aktiv UC (kliniska tecken på fulminant kolit eller toxisk megakolon) eller CD (HBI > 16), som kräver > 20 mg prednison dagligen vid induktion, självmordstankar eller psykos.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
IBD-patienter (UC och CD)
Deltagarna kommer att slutföra ett Mayo Clinic Score (UC) eller HBI-poäng (CD), kort IBDQ73, *EQ5D-5L, *GAD-774, *PHQ-975, *PROMIS (Gastrointestinal Belly Pain), Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness (MAIA) )77, *Pain Catastrophizing Scale, Pittsburg Sleep Quality Index (PSQI) och Fatigue Severity Scale (FSS) vid baslinjen och 16 veckor efter starten av anti-TNF-terapi (*frågeformulär tillgängliga via CIHR IMAGINE-anslaget). Avföring kommer att samlas in vid baslinjen och efter 16 veckor för bedömning av den kända biomarkören fekalt kalprotektin, förutom fekal bakteriell och svampmikrobiom (genom International Microbiome Center [IMC], U av C). Blod kommer att tas och urin samlas in vid baslinjen och efter 16 veckor för inflammatoriska markörer och metabolomisk [IMC] analys |
Mayo Clinic Score (UC) eller HBI-poäng (CD), kort IBDQ73, *EQ5D-5L, *GAD-774, *PHQ-975, *PROMIS (Gastrointestinal Belly Pain), Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness (MAIA)77, * Pain Catastrophizing Scale, Pittsburg Sleep Quality Index (PSQI) och Fatigue Severity Scale (FSS) vid baslinjen och 16 veckor efter starten av anti-TNF-behandling
Ett TechEn NIRSOptix kontinuerligt vågigt fNIRS-system kommer att användas för att registrera förändringar i cerebral syresättning, med en samplingshastighet på 25 Hz
För bedömning av den kända biomarkören fekalt kalprotektin, förutom fekal bakteriell och svampmikrobiom
för inflammatoriska markörer och metabolomisk [IMC] analys
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
a) Kliniskt: CD (minskning med >3 poäng i det modifierade Harvey-Bradshaw Index); UC (minskning med >2 poäng i det partiella Mayo-resultatet)
Tidsram: 16 veckor
|
Definiera skillnader i förändringar av NIRS-fynd i vilotillstånd som inträffar hos IBD-patienter, mellan baslinjen och 16 veckor efter start av anti-TNF-behandling, hos anti-TNF-svarare jämfört med icke-svarare, definierade: a) Kliniskt: CD (minskning med >3 poäng i det modifierade Harvey-Bradshaw Index); UC (minskning med >2 poäng i det partiella Mayo-resultatet) |
16 veckor
|
|
b) Radiografiskt: minskning av tarmväggstjocklek ≥25 % i det mest drabbade segmentet med 2 poängs minskning i färgdopplersignalpoäng eller normalisering
Tidsram: 16 veckor
|
Definiera skillnader i förändringar av NIRS-fynd i vilotillstånd som inträffar hos IBD-patienter, mellan baslinjen och 16 veckor efter start av anti-TNF-behandling, hos anti-TNF-svarare jämfört med icke-svarare, definierade: b) Radiografiskt: minskning av tarmväggstjocklek ≥25 % i det mest drabbade segmentet med 2 poängs minskning i färgdopplersignalpoäng eller normalisering |
16 veckor
|
|
c) Biomarkör: minskning av fekalt kalprotektin >50 % från baslinjen eller ≤250 ug/g
Tidsram: 16 veckor
|
Definiera skillnader i förändringar av NIRS-fynd i vilotillstånd som inträffar hos IBD-patienter, mellan baslinjen och 16 veckor efter start av anti-TNF-behandling, hos anti-TNF-svarare jämfört med icke-svarare, definierade: c) Biomarkör: minskning av fekalt kalprotektin >50 % från baslinjen eller ≤250 ug/g |
16 veckor
|
|
d) Endoskopiskt (där tillgängligt): CD (minskning i Simple Endoscopic Score för CD ≥50 % från baslinjen); UC (minskning i Mayo endoskopisk subpoäng ≥1 poäng från baslinjen)
Tidsram: 16 veckor
|
Definiera skillnader i förändringar av NIRS-fynd i vilotillstånd som inträffar hos IBD-patienter, mellan baslinjen och 16 veckor efter start av anti-TNF-behandling, hos anti-TNF-svarare jämfört med icke-svarare, definierade: d) Endoskopiskt (där tillgängligt): CD (minskning i Simple Endoscopic Score för CD ≥50 % från baslinjen); UC (minskning i Mayo endoskopisk subpoäng ≥1 poäng från baslinjen) |
16 veckor
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
(i) förändringar i markörer för tarm (definierad av tarm-ultraljud) och systemisk inflammation.
Tidsram: 16 veckor
|
Att avgränsa huruvida NIRS-fynd i hjärnan vid utgångsläget och förändringar i NIRS-fynd från utgångsläget till 16 veckor efter start av anti-TNF-behandling, korrelerar med: (i) förändringar i markörer för tarm (definierad av tarm-ultraljud) och systemisk inflammation. |
16 veckor
|
|
(ii) minskning från baslinjemätning av fekal kalprotektinnivå.
Tidsram: 16 veckor
|
Att avgränsa huruvida NIRS-fynd i hjärnan vid utgångsläget och förändringar i NIRS-fynd från utgångsläget till 16 veckor efter start av anti-TNF-behandling, korrelerar med: (ii) minskning från baslinjemätning av fekal kalprotektinnivå. |
16 veckor
|
|
(iii) specifika tarmmikrobiom och metabolomiska signaturer.
Tidsram: 16 veckor
|
Att avgränsa huruvida NIRS-fynd i hjärnan vid utgångsläget och förändringar i NIRS-fynd från utgångsläget till 16 veckor efter start av anti-TNF-behandling, korrelerar med: (iii) specifika tarmmikrobiom och metabolomiska signaturer. |
16 veckor
|
|
(iv) förändringar i symtomens svårighetsgrad hos IBD-patienter som svarar (definierad enligt ovan), eller som inte svarar på anti-TNF-terapi.
Tidsram: 16 veckor
|
Att avgränsa huruvida NIRS-fynd i hjärnan vid utgångsläget och förändringar i NIRS-fynd från utgångsläget till 16 veckor efter start av anti-TNF-behandling, korrelerar med: (iv) förändringar i symtomens svårighetsgrad hos IBD-patienter som svarar (definierad enligt ovan), eller som inte svarar på anti-TNF-terapi. |
16 veckor
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Utredare
- Huvudutredare: Mark Swain, MD, University Of Calgary
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Fox MD, Raichle ME. Spontaneous fluctuations in brain activity observed with functional magnetic resonance imaging. Nat Rev Neurosci. 2007 Sep;8(9):700-11. doi: 10.1038/nrn2201.
- Kroenke K, Spitzer RL, Williams JB. The PHQ-9: validity of a brief depression severity measure. J Gen Intern Med. 2001 Sep;16(9):606-13. doi: 10.1046/j.1525-1497.2001.016009606.x.
- Spitzer RL, Kroenke K, Williams JB, Lowe B. A brief measure for assessing generalized anxiety disorder: the GAD-7. Arch Intern Med. 2006 May 22;166(10):1092-7. doi: 10.1001/archinte.166.10.1092.
- Buysse DJ, Reynolds CF 3rd, Monk TH, Berman SR, Kupfer DJ. The Pittsburgh Sleep Quality Index: a new instrument for psychiatric practice and research. Psychiatry Res. 1989 May;28(2):193-213. doi: 10.1016/0165-1781(89)90047-4.
- Ni J, Wu GD, Albenberg L, Tomov VT. Gut microbiota and IBD: causation or correlation? Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2017 Oct;14(10):573-584. doi: 10.1038/nrgastro.2017.88. Epub 2017 Jul 19.
- Love MI, Huber W, Anders S. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biol. 2014;15(12):550. doi: 10.1186/s13059-014-0550-8.
- Krupp LB, LaRocca NG, Muir-Nash J, Steinberg AD. The fatigue severity scale. Application to patients with multiple sclerosis and systemic lupus erythematosus. Arch Neurol. 1989 Oct;46(10):1121-3. doi: 10.1001/archneur.1989.00520460115022.
- Cohen J. A power primer. Psychol Bull. 1992 Jul;112(1):155-9. doi: 10.1037//0033-2909.112.1.155.
- Scholkmann F, Kleiser S, Metz AJ, Zimmermann R, Mata Pavia J, Wolf U, Wolf M. A review on continuous wave functional near-infrared spectroscopy and imaging instrumentation and methodology. Neuroimage. 2014 Jan 15;85 Pt 1:6-27. doi: 10.1016/j.neuroimage.2013.05.004. Epub 2013 May 16.
- Sokoloff L. Local cerebral energy metabolism: its relationships to local functional activity and blood flow. Ciba Found Symp. 1978 Mar;(56):171-97. doi: 10.1002/9780470720370.ch10.
- Nippert AR, Biesecker KR, Newman EA. Mechanisms Mediating Functional Hyperemia in the Brain. Neuroscientist. 2018 Feb;24(1):73-83. doi: 10.1177/1073858417703033. Epub 2017 Apr 12.
- Nippert AR, Mishra A, Newman EA. Keeping the Brain Well Fed: The Role of Capillaries and Arterioles in Orchestrating Functional Hyperemia. Neuron. 2018 Jul 25;99(2):248-250. doi: 10.1016/j.neuron.2018.07.011.
- Bu L, Zhang M, Li J, Li F, Liu H, Li Z. Effects of Sleep Deprivation on Phase Synchronization as Assessed by Wavelet Phase Coherence Analysis of Prefrontal Tissue Oxyhemoglobin Signals. PLoS One. 2017 Jan 3;12(1):e0169279. doi: 10.1371/journal.pone.0169279. eCollection 2017.
- Tarumi T, Dunsky DI, Khan MA, Liu J, Hill C, Armstrong K, Martin-Cook K, Cullum CM, Zhang R. Dynamic cerebral autoregulation and tissue oxygenation in amnestic mild cognitive impairment. J Alzheimers Dis. 2014;41(3):765-78. doi: 10.3233/JAD-132018.
- Uemura K, Shimada H, Doi T, Makizako H, Tsutsumimoto K, Park H, Suzuki T. Reduced prefrontal oxygenation in mild cognitive impairment during memory retrieval. Int J Geriatr Psychiatry. 2016 Jun;31(6):583-91. doi: 10.1002/gps.4363. Epub 2015 Sep 21.
- Shang J, Yamashita T, Zhai Y, Nakano Y, Morihara R, Fukui Y, Hishikawa N, Ohta Y, Abe K. Strong Impact of Chronic Cerebral Hypoperfusion on Neurovascular Unit, Cerebrovascular Remodeling, and Neurovascular Trophic Coupling in Alzheimer's Disease Model Mouse. J Alzheimers Dis. 2016 Mar 5;52(1):113-26. doi: 10.3233/JAD-151126.
- Yang R, Dunn JF. Reduced cortical microvascular oxygenation in multiple sclerosis: a blinded, case-controlled study using a novel quantitative near-infrared spectroscopy method. Sci Rep. 2015 Nov 13;5:16477. doi: 10.1038/srep16477.
- Duszynski CC, Avati V, Lapointe AP, Scholkmann F, Dunn JF, Swain MG. Near-Infrared Spectroscopy Reveals Brain Hypoxia and Cerebrovascular Dysregulation in Primary Biliary Cholangitis. Hepatology. 2020 Apr;71(4):1408-1420. doi: 10.1002/hep.30920. Epub 2019 Dec 31.
- D'Mello C, Le T, Swain MG. Cerebral microglia recruit monocytes into the brain in response to tumor necrosis factoralpha signaling during peripheral organ inflammation. J Neurosci. 2009 Feb 18;29(7):2089-102. doi: 10.1523/JNEUROSCI.3567-08.2009.
- Fujiwara T, Kono S, Katakura K, Abe K, Takahashi A, Gunji N, Yokokawa A, Kawashima K, Suzuki R, Wada A, Miura I, Yabe H, Ohira H. Evaluation of Brain Activity Using Near-infrared Spectroscopy in Inflammatory Bowel Disease Patients. Sci Rep. 2018 Jan 10;8(1):402. doi: 10.1038/s41598-017-18897-4.
- Kaplan GG. The global burden of IBD: from 2015 to 2025. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2015 Dec;12(12):720-7. doi: 10.1038/nrgastro.2015.150. Epub 2015 Sep 1.
- Kaplan GG, Bernstein CN, Coward S, Bitton A, Murthy SK, Nguyen GC, Lee K, Cooke-Lauder J, Benchimol EI. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Epidemiology. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S6-S16. doi: 10.1093/jcag/gwy054. Epub 2018 Nov 2.
- Khor B, Gardet A, Xavier RJ. Genetics and pathogenesis of inflammatory bowel disease. Nature. 2011 Jun 15;474(7351):307-17. doi: 10.1038/nature10209.
- Halfvarson J, Brislawn CJ, Lamendella R, Vazquez-Baeza Y, Walters WA, Bramer LM, D'Amato M, Bonfiglio F, McDonald D, Gonzalez A, McClure EE, Dunklebarger MF, Knight R, Jansson JK. Dynamics of the human gut microbiome in inflammatory bowel disease. Nat Microbiol. 2017 Feb 13;2:17004. doi: 10.1038/nmicrobiol.2017.4.
- Lavelle A, Sokol H. Gut microbiota: Beyond metagenomics, metatranscriptomics illuminates microbiome functionality in IBD. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2018 Apr;15(4):193-194. doi: 10.1038/nrgastro.2018.15. Epub 2018 Feb 21. No abstract available.
- Knights D, Lassen KG, Xavier RJ. Advances in inflammatory bowel disease pathogenesis: linking host genetics and the microbiome. Gut. 2013 Oct;62(10):1505-10. doi: 10.1136/gutjnl-2012-303954.
- Moradkhani A, Beckman LJ, Tabibian JH. Health-related quality of life in inflammatory bowel disease: psychosocial, clinical, socioeconomic, and demographic predictors. J Crohns Colitis. 2013 Jul;7(6):467-73. doi: 10.1016/j.crohns.2012.07.012. Epub 2012 Aug 10.
- Nocerino A, Nguyen A, Agrawal M, Mone A, Lakhani K, Swaminath A. Fatigue in Inflammatory Bowel Diseases: Etiologies and Management. Adv Ther. 2020 Jan;37(1):97-112. doi: 10.1007/s12325-019-01151-w. Epub 2019 Nov 23.
- Graff LA, Walker JR, Lix L, Clara I, Rawsthorne P, Rogala L, Miller N, Jakul L, McPhail C, Ediger J, Bernstein CN. The relationship of inflammatory bowel disease type and activity to psychological functioning and quality of life. Clin Gastroenterol Hepatol. 2006 Dec;4(12):1491-1501. doi: 10.1016/j.cgh.2006.09.027.
- Bonaz BL, Bernstein CN. Brain-gut interactions in inflammatory bowel disease. Gastroenterology. 2013 Jan;144(1):36-49. doi: 10.1053/j.gastro.2012.10.003. Epub 2012 Oct 12.
- Szigethy E. Pain Management in Patients With Inflammatory Bowel Disease. Gastroenterol Hepatol (N Y). 2018 Jan;14(1):53-56. No abstract available.
- Hashash JG, Ramos-Rivers C, Youk A, Chiu WK, Duff K, Regueiro M, Binion DG, Koutroubakis I, Vachon A, Benhayon D, Dunn MA, Szigethy EM. Quality of Sleep and Coexistent Psychopathology Have Significant Impact on Fatigue Burden in Patients With Inflammatory Bowel Disease. J Clin Gastroenterol. 2018 May/Jun;52(5):423-430. doi: 10.1097/MCG.0000000000000729.
- Jones JL, Nguyen GC, Benchimol EI, Bernstein CN, Bitton A, Kaplan GG, Murthy SK, Lee K, Cooke-Lauder J, Otley AR. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Quality of Life. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S42-S48. doi: 10.1093/jcag/gwy048. Epub 2018 Nov 2.
- Kuenzig ME, Benchimol EI, Lee L, Targownik LE, Singh H, Kaplan GG, Bernstein CN, Bitton A, Nguyen GC, Lee K, Cooke-Lauder J, Murthy SK. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Direct Costs and Health Services Utilization. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S17-S33. doi: 10.1093/jcag/gwy055. Epub 2018 Nov 2.
- Kuenzig ME, Lee L, El-Matary W, Weizman AV, Benchimol EI, Kaplan GG, Nguyen GC, Bernstein CN, Bitton A, Lee K, Cooke-Lauder J, Murthy SK. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Indirect Costs of IBD Care. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S34-S41. doi: 10.1093/jcag/gwy050. Epub 2018 Nov 2.
- Cryan JF, O'Riordan KJ, Cowan CSM, Sandhu KV, Bastiaanssen TFS, Boehme M, Codagnone MG, Cussotto S, Fulling C, Golubeva AV, Guzzetta KE, Jaggar M, Long-Smith CM, Lyte JM, Martin JA, Molinero-Perez A, Moloney G, Morelli E, Morillas E, O'Connor R, Cruz-Pereira JS, Peterson VL, Rea K, Ritz NL, Sherwin E, Spichak S, Teichman EM, van de Wouw M, Ventura-Silva AP, Wallace-Fitzsimons SE, Hyland N, Clarke G, Dinan TG. The Microbiota-Gut-Brain Axis. Physiol Rev. 2019 Oct 1;99(4):1877-2013. doi: 10.1152/physrev.00018.2018.
- Somineni HK, Kugathasan S. The Microbiome in Patients With Inflammatory Diseases. Clin Gastroenterol Hepatol. 2019 Jan;17(2):243-255. doi: 10.1016/j.cgh.2018.08.078. Epub 2018 Sep 7.
- Ott SJ, Musfeldt M, Wenderoth DF, Hampe J, Brant O, Folsch UR, Timmis KN, Schreiber S. Reduction in diversity of the colonic mucosa associated bacterial microflora in patients with active inflammatory bowel disease. Gut. 2004 May;53(5):685-93. doi: 10.1136/gut.2003.025403.
- Pascal V, Pozuelo M, Borruel N, Casellas F, Campos D, Santiago A, Martinez X, Varela E, Sarrabayrouse G, Machiels K, Vermeire S, Sokol H, Guarner F, Manichanh C. A microbial signature for Crohn's disease. Gut. 2017 May;66(5):813-822. doi: 10.1136/gutjnl-2016-313235. Epub 2017 Feb 7.
- Guida F, Turco F, Iannotta M, De Gregorio D, Palumbo I, Sarnelli G, Furiano A, Napolitano F, Boccella S, Luongo L, Mazzitelli M, Usiello A, De Filippis F, Iannotti FA, Piscitelli F, Ercolini D, de Novellis V, Di Marzo V, Cuomo R, Maione S. Antibiotic-induced microbiota perturbation causes gut endocannabinoidome changes, hippocampal neuroglial reorganization and depression in mice. Brain Behav Immun. 2018 Jan;67:230-245. doi: 10.1016/j.bbi.2017.09.001. Epub 2017 Sep 7.
- Zheng P, Zeng B, Zhou C, Liu M, Fang Z, Xu X, Zeng L, Chen J, Fan S, Du X, Zhang X, Yang D, Yang Y, Meng H, Li W, Melgiri ND, Licinio J, Wei H, Xie P. Gut microbiome remodeling induces depressive-like behaviors through a pathway mediated by the host's metabolism. Mol Psychiatry. 2016 Jun;21(6):786-96. doi: 10.1038/mp.2016.44. Epub 2016 Apr 12.
- Mi GL, Zhao L, Qiao DD, Kang WQ, Tang MQ, Xu JK. Effectiveness of Lactobacillus reuteri in infantile colic and colicky induced maternal depression: a prospective single blind randomized trial. Antonie Van Leeuwenhoek. 2015 Jun;107(6):1547-53. doi: 10.1007/s10482-015-0448-9. Epub 2015 Apr 16.
- Cryan JF, Dinan TG. Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour. Nat Rev Neurosci. 2012 Oct;13(10):701-12. doi: 10.1038/nrn3346. Epub 2012 Sep 12.
- Bravo JA, Julio-Pieper M, Forsythe P, Kunze W, Dinan TG, Bienenstock J, Cryan JF. Communication between gastrointestinal bacteria and the nervous system. Curr Opin Pharmacol. 2012 Dec;12(6):667-72. doi: 10.1016/j.coph.2012.09.010. Epub 2012 Oct 4.
- Zhang M, Sun K, Wu Y, Yang Y, Tso P, Wu Z. Interactions between Intestinal Microbiota and Host Immune Response in Inflammatory Bowel Disease. Front Immunol. 2017 Aug 14;8:942. doi: 10.3389/fimmu.2017.00942. eCollection 2017.
- Collins SM. Interrogating the Gut-Brain Axis in the Context of Inflammatory Bowel Disease: A Translational Approach. Inflamm Bowel Dis. 2020 Mar 4;26(4):493-501. doi: 10.1093/ibd/izaa004.
- Thomann AK, Mak JWY, Zhang JW, Wuestenberg T, Ebert MP, Sung JJY, Bernstein CN, Reindl W, Ng SC. Review article: bugs, inflammation and mood-a microbiota-based approach to psychiatric symptoms in inflammatory bowel diseases. Aliment Pharmacol Ther. 2020 Jul;52(2):247-266. doi: 10.1111/apt.15787. Epub 2020 Jun 11.
- Capuron L, Miller AH. Immune system to brain signaling: neuropsychopharmacological implications. Pharmacol Ther. 2011 May;130(2):226-38. doi: 10.1016/j.pharmthera.2011.01.014. Epub 2011 Feb 17.
- D'Mello C, Swain MG. Liver-brain interactions in inflammatory liver diseases: implications for fatigue and mood disorders. Brain Behav Immun. 2014 Jan;35:9-20. doi: 10.1016/j.bbi.2013.10.009. Epub 2013 Oct 16.
- D'Mello C, Swain MG. Immune-to-Brain Communication Pathways in Inflammation-Associated Sickness and Depression. Curr Top Behav Neurosci. 2017;31:73-94. doi: 10.1007/7854_2016_37.
- D'Mello C, Riazi K, Le T, Stevens KM, Wang A, McKay DM, Pittman QJ, Swain MG. P-selectin-mediated monocyte-cerebral endothelium adhesive interactions link peripheral organ inflammation to sickness behaviors. J Neurosci. 2013 Sep 11;33(37):14878-88. doi: 10.1523/JNEUROSCI.1329-13.2013.
- Chu WM. Tumor necrosis factor. Cancer Lett. 2013 Jan 28;328(2):222-5. doi: 10.1016/j.canlet.2012.10.014. Epub 2012 Oct 22.
- Sedger LM, McDermott MF. TNF and TNF-receptors: From mediators of cell death and inflammation to therapeutic giants - past, present and future. Cytokine Growth Factor Rev. 2014 Aug;25(4):453-72. doi: 10.1016/j.cytogfr.2014.07.016. Epub 2014 Aug 1.
- Padmos RC, Hillegers MH, Knijff EM, Vonk R, Bouvy A, Staal FJ, de Ridder D, Kupka RW, Nolen WA, Drexhage HA. A discriminating messenger RNA signature for bipolar disorder formed by an aberrant expression of inflammatory genes in monocytes. Arch Gen Psychiatry. 2008 Apr;65(4):395-407. doi: 10.1001/archpsyc.65.4.395.
- Slebioda TJ, Kmiec Z. Tumour necrosis factor superfamily members in the pathogenesis of inflammatory bowel disease. Mediators Inflamm. 2014;2014:325129. doi: 10.1155/2014/325129. Epub 2014 Jun 17.
- Singh UP, Singh NP, Murphy EA, Price RL, Fayad R, Nagarkatti M, Nagarkatti PS. Chemokine and cytokine levels in inflammatory bowel disease patients. Cytokine. 2016 Jan;77:44-9. doi: 10.1016/j.cyto.2015.10.008. Epub 2015 Oct 29.
- Muzes G, Molnar B, Tulassay Z, Sipos F. Changes of the cytokine profile in inflammatory bowel diseases. World J Gastroenterol. 2012 Nov 7;18(41):5848-61. doi: 10.3748/wjg.v18.i41.5848.
- Lichtenstein GR. Comprehensive review: antitumor necrosis factor agents in inflammatory bowel disease and factors implicated in treatment response. Therap Adv Gastroenterol. 2013 Jul;6(4):269-93. doi: 10.1177/1756283X13479826.
- Gray MA, Chao CY, Staudacher HM, Kolosky NA, Talley NJ, Holtmann G. Anti-TNFalpha therapy in IBD alters brain activity reflecting visceral sensory function and cognitive-affective biases. PLoS One. 2018 Mar 8;13(3):e0193542. doi: 10.1371/journal.pone.0193542. eCollection 2018.
- Lichtenstein GR, Bala M, Han C, DeWoody K, Schaible T. Infliximab improves quality of life in patients with Crohn's disease. Inflamm Bowel Dis. 2002 Jul;8(4):237-43. doi: 10.1097/00054725-200207000-00001.
- Horst S, Chao A, Rosen M, Nohl A, Duley C, Wagnon JH, Beaulieu DB, Taylor W, Gaines L, Schwartz DA. Treatment with immunosuppressive therapy may improve depressive symptoms in patients with inflammatory bowel disease. Dig Dis Sci. 2015 Feb;60(2):465-70. doi: 10.1007/s10620-014-3375-0. Epub 2014 Oct 2.
- Stevens BW, Borren NZ, Velonias G, Conway G, Cleland T, Andrews E, Khalili H, Garber JG, Xavier RJ, Yajnik V, Ananthakrishnan AN. Vedolizumab Therapy Is Associated with an Improvement in Sleep Quality and Mood in Inflammatory Bowel Diseases. Dig Dis Sci. 2017 Jan;62(1):197-206. doi: 10.1007/s10620-016-4356-2. Epub 2016 Oct 28. Erratum In: Dig Dis Sci. 2017 Feb;62(2):552.
- Wang F, Lin X, Zhao Q, Li J. Adverse symptoms with anti-TNF-alpha therapy in inflammatory bowel disease: systematic review and duration-response meta-analysis. Eur J Clin Pharmacol. 2015 Aug;71(8):911-9. doi: 10.1007/s00228-015-1877-0. Epub 2015 May 30.
- Aden K, Rehman A, Waschina S, Pan WH, Walker A, Lucio M, Nunez AM, Bharti R, Zimmerman J, Bethge J, Schulte B, Schulte D, Franke A, Nikolaus S, Schroeder JO, Vandeputte D, Raes J, Szymczak S, Waetzig GH, Zeuner R, Schmitt-Kopplin P, Kaleta C, Schreiber S, Rosenstiel P. Metabolic Functions of Gut Microbes Associate With Efficacy of Tumor Necrosis Factor Antagonists in Patients With Inflammatory Bowel Diseases. Gastroenterology. 2019 Nov;157(5):1279-1292.e11. doi: 10.1053/j.gastro.2019.07.025. Epub 2019 Jul 18.
- Estevinho MM, Rocha C, Correia L, Lago P, Ministro P, Portela F, Trindade E, Afonso J, Peyrin-Biroulet L, Magro F; GEDII (Portuguese IBD Group). Features of Fecal and Colon Microbiomes Associate With Responses to Biologic Therapies for Inflammatory Bowel Diseases: A Systematic Review. Clin Gastroenterol Hepatol. 2020 May;18(5):1054-1069. doi: 10.1016/j.cgh.2019.08.063. Epub 2019 Sep 14.
- Kisler K, Nelson AR, Montagne A, Zlokovic BV. Cerebral blood flow regulation and neurovascular dysfunction in Alzheimer disease. Nat Rev Neurosci. 2017 Jul;18(7):419-434. doi: 10.1038/nrn.2017.48. Epub 2017 May 18.
- Correale J, Villa A. The blood-brain-barrier in multiple sclerosis: functional roles and therapeutic targeting. Autoimmunity. 2007 Mar;40(2):148-60. doi: 10.1080/08916930601183522.
- Rochfort KD, Collins LE, Murphy RP, Cummins PM. Downregulation of blood-brain barrier phenotype by proinflammatory cytokines involves NADPH oxidase-dependent ROS generation: consequences for interendothelial adherens and tight junctions. PLoS One. 2014 Jul 3;9(7):e101815. doi: 10.1371/journal.pone.0101815. eCollection 2014.
- Akopov S, Sercombe R, Seylaz J. Cerebrovascular reactivity: role of endothelium/platelet/leukocyte interactions. Cerebrovasc Brain Metab Rev. 1996 Spring;8(1):11-94.
- Tohidpour A, Morgun AV, Boitsova EB, Malinovskaya NA, Martynova GP, Khilazheva ED, Kopylevich NV, Gertsog GE, Salmina AB. Neuroinflammation and Infection: Molecular Mechanisms Associated with Dysfunction of Neurovascular Unit. Front Cell Infect Microbiol. 2017 Jun 20;7:276. doi: 10.3389/fcimb.2017.00276. eCollection 2017.
- Kerfoot SM, D'Mello C, Nguyen H, Ajuebor MN, Kubes P, Le T, Swain MG. TNF-alpha-secreting monocytes are recruited into the brain of cholestatic mice. Hepatology. 2006 Jan;43(1):154-62. doi: 10.1002/hep.21003.
- D'Mello C, Almishri W, Liu H, Swain MG. Interactions Between Platelets and Inflammatory Monocytes Affect Sickness Behavior in Mice With Liver Inflammation. Gastroenterology. 2017 Nov;153(5):1416-1428.e2. doi: 10.1053/j.gastro.2017.08.011. Epub 2017 Aug 9.
- Reinhard M, Rosengarten B, Kirchhoff L, Hetzel A, Rauer S. Natalizumab and regulation of cerebral blood flow: results from an observational study. Eur Neurol. 2010;64(2):124-8. doi: 10.1159/000316765. Epub 2010 Jul 22.
- Rutgeerts P, Sandborn WJ, Feagan BG, Reinisch W, Olson A, Johanns J, Travers S, Rachmilewitz D, Hanauer SB, Lichtenstein GR, de Villiers WJ, Present D, Sands BE, Colombel JF. Infliximab for induction and maintenance therapy for ulcerative colitis. N Engl J Med. 2005 Dec 8;353(23):2462-76. doi: 10.1056/NEJMoa050516. Erratum In: N Engl J Med. 2006 May 18;354(20):2200.
- Moskovitz DN, Daperno M, Van Assche GA, et al. Defining and validating cut-offs for the simple endoscopic score for Crohn's disease. Gastroenterology 2007;132:A173-A173.
- Limberg B. [Diagnosis of chronic inflammatory bowel disease by ultrasonography]. Z Gastroenterol. 1999 Jun;37(6):495-508. German.
- Walsham NE, Sherwood RA. Fecal calprotectin in inflammatory bowel disease. Clin Exp Gastroenterol. 2016 Jan 28;9:21-9. doi: 10.2147/CEG.S51902. eCollection 2016.
- Walmsley RS, Ayres RC, Pounder RE, Allan RN. A simple clinical colitis activity index. Gut. 1998 Jul;43(1):29-32. doi: 10.1136/gut.43.1.29.
- Harvey RF, Bradshaw JM. A simple index of Crohn's-disease activity. Lancet. 1980 Mar 8;1(8167):514. doi: 10.1016/s0140-6736(80)92767-1. No abstract available.
- Irvine EJ, Zhou Q, Thompson AK. The Short Inflammatory Bowel Disease Questionnaire: a quality of life instrument for community physicians managing inflammatory bowel disease. CCRPT Investigators. Canadian Crohn's Relapse Prevention Trial. Am J Gastroenterol. 1996 Aug;91(8):1571-8.
- Spiegel BM, Hays RD, Bolus R, Melmed GY, Chang L, Whitman C, Khanna PP, Paz SH, Hays T, Reise S, Khanna D. Development of the NIH Patient-Reported Outcomes Measurement Information System (PROMIS) gastrointestinal symptom scales. Am J Gastroenterol. 2014 Nov;109(11):1804-14. doi: 10.1038/ajg.2014.237. Epub 2014 Sep 9. Erratum In: Am J Gastroenterol. 2015 Apr;110(4):608.
- Mehling WE, Acree M, Stewart A, Silas J, Jones A. The Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness, Version 2 (MAIA-2). PLoS One. 2018 Dec 4;13(12):e0208034. doi: 10.1371/journal.pone.0208034. eCollection 2018.
- Osman A, Barrios FX, Gutierrez PM, Kopper BA, Merrifield T, Grittmann L. The Pain Catastrophizing Scale: further psychometric evaluation with adult samples. J Behav Med. 2000 Aug;23(4):351-65. doi: 10.1023/a:1005548801037.
- van Tilburg Bernardes E, Pettersen VK, Gutierrez MW, Laforest-Lapointe I, Jendzjowsky NG, Cavin JB, Vicentini FA, Keenan CM, Ramay HR, Samara J, MacNaughton WK, Wilson RJA, Kelly MM, McCoy KD, Sharkey KA, Arrieta MC. Intestinal fungi are causally implicated in microbiome assembly and immune development in mice. Nat Commun. 2020 May 22;11(1):2577. doi: 10.1038/s41467-020-16431-1.
- Arrieta MC, Arevalo A, Stiemsma L, Dimitriu P, Chico ME, Loor S, Vaca M, Boutin RCT, Morien E, Jin M, Turvey SE, Walter J, Parfrey LW, Cooper PJ, Finlay B. Associations between infant fungal and bacterial dysbiosis and childhood atopic wheeze in a nonindustrialized setting. J Allergy Clin Immunol. 2018 Aug;142(2):424-434.e10. doi: 10.1016/j.jaci.2017.08.041. Epub 2017 Dec 11.
- Tan Q, Zhang M, Wang Y, Zhang M, Wang Y, Xin Q, Wang B, Li Z. Frequency-specific functional connectivity revealed by wavelet-based coherence analysis in elderly subjects with cerebral infarction using NIRS method. Med Phys. 2015 Sep;42(9):5391-403. doi: 10.1118/1.4928672.
- Chang C, Glover GH. Time-frequency dynamics of resting-state brain connectivity measured with fMRI. Neuroimage. 2010 Mar;50(1):81-98. doi: 10.1016/j.neuroimage.2009.12.011. Epub 2009 Dec 16.
- Julien C. The enigma of Mayer waves: Facts and models. Cardiovasc Res. 2006 Apr 1;70(1):12-21. doi: 10.1016/j.cardiores.2005.11.008. Epub 2005 Dec 19.
- Birn RM, Diamond JB, Smith MA, Bandettini PA. Separating respiratory-variation-related fluctuations from neuronal-activity-related fluctuations in fMRI. Neuroimage. 2006 Jul 15;31(4):1536-48. doi: 10.1016/j.neuroimage.2006.02.048. Epub 2006 Apr 24.
- Wise RG, Ide K, Poulin MJ, Tracey I. Resting fluctuations in arterial carbon dioxide induce significant low frequency variations in BOLD signal. Neuroimage. 2004 Apr;21(4):1652-64. doi: 10.1016/j.neuroimage.2003.11.025.
- Gatto R, Hoffman W, Mueller M, Flores A, Valyi-Nagy T, Charbel FT. Frequency domain near-infrared spectroscopy technique in the assessment of brain oxygenation: a validation study in live subjects and cadavers. J Neurosci Methods. 2006 Oct 30;157(2):274-7. doi: 10.1016/j.jneumeth.2006.04.013. Epub 2006 May 24.
- Novak KL, Kaplan GG, Panaccione R, Afshar EE, Tanyingoh D, Swain M, Kellar A, Wilson S. A Simple Ultrasound Score for the Accurate Detection of Inflammatory Activity in Crohn's Disease. Inflamm Bowel Dis. 2017 Nov;23(11):2001-2010. doi: 10.1097/MIB.0000000000001174.
- WILCOXON F. Individual comparisons of grouped data by ranking methods. J Econ Entomol. 1946 Apr;39:269. doi: 10.1093/jee/39.2.269. No abstract available.
- Bartram AK, Lynch MD, Stearns JC, Moreno-Hagelsieb G, Neufeld JD. Generation of multimillion-sequence 16S rRNA gene libraries from complex microbial communities by assembling paired-end illumina reads. Appl Environ Microbiol. 2011 Jun;77(11):3846-52. doi: 10.1128/AEM.02772-10. Epub 2011 Apr 1. Erratum In: Appl Environ Microbiol. 2011 Aug;77(15):5569.
- Schloss PD, Westcott SL, Ryabin T, Hall JR, Hartmann M, Hollister EB, Lesniewski RA, Oakley BB, Parks DH, Robinson CJ, Sahl JW, Stres B, Thallinger GG, Van Horn DJ, Weber CF. Introducing mothur: open-source, platform-independent, community-supported software for describing and comparing microbial communities. Appl Environ Microbiol. 2009 Dec;75(23):7537-41. doi: 10.1128/AEM.01541-09. Epub 2009 Oct 2.
- DeSantis TZ, Hugenholtz P, Larsen N, Rojas M, Brodie EL, Keller K, Huber T, Dalevi D, Hu P, Andersen GL. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006 Jul;72(7):5069-72. doi: 10.1128/AEM.03006-05.
- McMurdie PJ, Holmes S. phyloseq: an R package for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data. PLoS One. 2013 Apr 22;8(4):e61217. doi: 10.1371/journal.pone.0061217. Print 2013.
- McMurdie PJ, Holmes S. Waste not, want not: why rarefying microbiome data is inadmissible. PLoS Comput Biol. 2014 Apr 3;10(4):e1003531. doi: 10.1371/journal.pcbi.1003531. eCollection 2014 Apr.
- Morgan XC, Tickle TL, Sokol H, Gevers D, Devaney KL, Ward DV, Reyes JA, Shah SA, LeLeiko N, Snapper SB, Bousvaros A, Korzenik J, Sands BE, Xavier RJ, Huttenhower C. Dysfunction of the intestinal microbiome in inflammatory bowel disease and treatment. Genome Biol. 2012 Apr 16;13(9):R79. doi: 10.1186/gb-2012-13-9-r79.
- B Sohn M, Li H. A GLM-based latent variable ordination method for microbiome samples. Biometrics. 2018 Jun;74(2):448-457. doi: 10.1111/biom.12775. Epub 2017 Oct 9.
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (FÖRVÄNTAT)
Primärt slutförande (FÖRVÄNTAT)
Avslutad studie (FÖRVÄNTAT)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (FAKTISK)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (FAKTISK)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- REB20-1873
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .