- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT04733456
Pacienti se zánětlivým onemocněním střev (IBD) s mozkovou aktivitou a okysličením
Hodnocení mozkové aktivity a okysličení pomocí blízké infračervené spektroskopie (NIRS) u pacientů se zánětlivým střevním onemocněním (IBD)
Přehled studie
Postavení
Detailní popis
Hypotéza Stavy s akutním systémovým zánětem budou korelovat se změnami v signaturách střevního mikrobiomu, sníženou cerebrální saturací kyslíkem (StO2) a změněnými vzory mikrovaskulární mozkové krevní perfuze (jak bylo stanoveno pomocí blízké infračervené spektroskopie NIRS).
Odůvodnění Výzkumníci zkoumají schopnost blízké infračervené spektroskopie (NIRS) detekovat změněnou funkci mozku a okysličení v řadě klinicky relevantních zdravotních stavů.
NIRS umožňuje neinvazivní měření koncentrací okysličeného (O2Hb) a deoxygenovaného hemoglobinu (HHb) v kortikální mozkové tkáni. Proto lze NIRS použít ke kvantifikaci saturace kortikální tkáně kyslíkem (StO2), která odráží měnící se rychlost metabolismu a perfuzi. Funkční NIRS (fNIRS) lze navíc použít ke zkoumání mozkové aktivity podobným způsobem jako funkční MRI, za předpokladu, že naměřené změny v krevní perfuzi a okysličení jsou způsobeny funkční hyperémií (tj. hemodynamické změny způsobené neurální aktivitou). Při použití NIRS u pacientů bylo prokázáno, že změněné vzorce prokrvení mozku a snížené hladiny okysličení mozku korelují s únavou a zhoršenou kognicí, což spojuje sníženou kortikální perfuzi se symptomy, které byly hlášeny u pacientů s IBD.
Přísná regulace průtoku krve mozkem je zásadní pro zajištění normálního okysličení a funkce mozku. Cerebrovaskulární dysfunkce a hypoxie se podílejí na řadě neurodegenerativních a neurozánětlivých poruch, včetně Alzheimerovy choroby a roztroušené sklerózy (MS). V nedávné studii využívající fNIRS výzkumníci zjistili změněné hemodynamické reakce spojené s úkolem a mozkovou hypoxii u pacientů s imunitně zprostředkovaným onemocněním jater, primární biliární cholangitidou (PBC). Navíc experimentální práce na myších naznačují, že tyto změny mohou být způsobeny působením TNFa na mozkovou vaskulaturu. Ukázalo se také, že pacienti s roztroušenou sklerózou měli sníženou interhemisférickou koherenci a hypoxii. Tato pozorování vedla k otázce, zda by obecný systémový zánět nebo interakce mozek/střevo mohly souviset s abnormální funkcí mozku a hypoxií, jak bylo zjistitelné pomocí NIRS.
Tuto hypotézu podporuje nedávná studie NIRS Fujiwara T et al u pacientů s IBD. Ukázali, že během provádění úkolu byla průměrná koncentrace okysličeného hemoglobinu významně nižší ve frontálním laloku u pacientů s IBD ve srovnání se zdravými kontrolami. Změny v okysličení mozku však nebyly dříve zkoumány během klidového stavu nebo v kontextu markerů periferního zánětu, měření kvality života a zátěže symptomů nebo signatur střevního mikrobiomu u pacientů s IBD.
Tato aktuálně navrhovaná podstudie má zkoumat pacienty se zánětlivým onemocněním střev (IBD) na úroveň hypoxie, funkční odpověď fNIRS a koherenci fNIRS.
Incidence a prevalence IBD celosvětově narůstá. Na vývoji IBD se podílí několik faktorů, včetně dysregulované imunitní reakce na změněnou mikroflóru u geneticky náchylného hostitele vystaveného podněcujícím faktorům prostředí, ale konkrétní příčina IBD zůstává neznámá. U pacientů s IBD20-26 převládá komorbidní maladaptivní chování a bolest. Tyto komorbidity duševního zdraví komplikují léčbu IBD, nepříznivě ovlivňují výsledky a zdraví pacientů a zvyšují zátěž systému zdravotní péče. Komorbidní problémy a symptomy duševního zdraví u pacientů s IBD jsou však špatně pochopeny a nedostatečně léčeny, což je paralelní s nenaplněnými potřebami léčby duševního zdraví v běžné kanadské populaci. Lepší pochopení toho, jak dochází ke změnám mozku ve spojení s IBD, a jejich potenciální roli ve vývoji symptomů a spojení se systémovým zánětem a signaturami střevních mikrobiomů je proto velmi důležité pro zlepšení léčby těchto pacientů.
Gastrointestinální trakt slouží jako dynamický a lokální ekosystém pro střevní mikroflóru. Dysbióza, což je změna složení střevních mikrobů, která přispívá k onemocnění hostitele, se vyskytuje u pacientů s IBD. Konkrétně pacienti s IBD vykazují nižší mikrobiální α-diverzitu a jsou obohaceni o několik skupin bakterií ve srovnání se zdravými kontrolami. Předklinické, translační a klinické studie nedávno ukázaly, že změny ve strukturním složení nebo funkci mikrobiomu mohou přispět k rozvoji duševních chorob, včetně chování podobného depresi, a jsou tedy životně důležitou složkou spojující osu střevo-mozek. . V souladu s tím byly zjištěny silné korelace mezi změnami střevní mikroflóry a rozvojem chronických zánětlivých poruch, jako je IBD, což naznačuje, že dysbióza je důležitým faktorem jak gastrointestinálních poruch, tak duševního zdraví. Přesné mechanismy, kterými může střevní dysbióza u IBD změnit chování, však zůstávají špatně pochopeny.
Jak periferní zánět, jak se vyskytuje u IBD, vede ke vzdáleným změnám ve funkci mozku, zůstává nejasné, a v důsledku toho jsou klinicky dostupné omezené terapeutické možnosti k řešení tohoto problému. Byla popsána řada obecných cest, které spojují systémový zánět se změnami probíhajícími v mozku, které následně vedou ke změněnému chování. Tyto dráhy tradičně zahrnují signalizaci prostřednictvím nervových drah (hlavně aferentní nervy vagu) a imunitní signalizaci (hlavně prostřednictvím cirkulujících cytokinů, jako je TNFα, které buď vstupují přímo do mozku, nebo aktivují endotel mozku). Nedávno výzkumníci z University of Calgary popsali novou signální dráhu zánětu, která zahrnuje zvýšenou produkci periferního TNF-α, která řídí zvýšenou mikrogliální aktivaci, následovanou náborem monocytů do mozkové vaskulatury a mozkového parenchymu, což zase řídí vývoj chorobného chování. TNFα je multifunkční cytokin, který zprostředkovává řadu účinků, které mohou přímo ovlivnit mozkovou funkci (prostřednictvím modulace neurotransmise) a střeva (např. ovlivňující propustnost střevní bariéry) a modulují zánět tkáně (např. aktivovat makrofágy k indukci exprese cytokinů a chemokinů). Zvýšené cirkulující hladiny TNFa a zvýšená produkce cirkulujících leukocytů jsou běžně dokumentovány u pacientů s chronickými zánětlivými stavy spojenými s vysokou prevalencí chorobného chování a poruch nálady, včetně IBD. Blokáda signalizace TNFa byla tedy rozsáhle hodnocena v klinických studiích IBD. Navíc, zlepšení symptomů inhibicí signalizace TNFa je často evidentní u léčených pacientů s chronickými zánětlivými onemocněními před zjevnými změnami v aktivitě onemocnění. U pacientů s IBD byla anti-TNFα terapie spojena s významným zlepšením spánku, deprese a úzkosti brzy po zahájení terapie a tato zlepšení byla trvalá. Kromě toho další studie hodnotila účinek anti-TNFα terapie na interoceptivní signalizaci u pacientů s Crohnovou chorobou a prokázala snížení viscerální citlivosti a zlepšené kognitivně-afektivní zpracování po podání anti-TNFα, paralelně se zlepšeným pocitem pohody. Změny v kognici byly spojeny se změnami nervové aktivity v prefrontálních a limbických oblastech mozku. Navíc pozorované rychlé změny chování a nervů nebyly spojeny s významnými změnami v hladinách fekálního kalprotektinu (marker střevního zánětu), což naznačuje, že pravděpodobně nesouvisely se současným snížením střevního zánětu. Anti-TNFα terapie také mění střevní mikrobiom u pacientů s IBD. Konkrétně anti-TNFα terapie u pacientů s IBD zvýšila bohatost střevních mikrobiálních druhů a fydiverzitu na úrovně podobné zdravým kontrolám. Kromě toho anti-TNF terapie snížila relativní množství prozánětlivých bakterií Escherichia a Enterococcus u pacientů s IBD a zvýšila počet rodů, které produkují mastné kyseliny s krátkým řetězcem, které mají dobře zavedené protizánětlivé účinky ve střevě.
Zdravé cerebrální endoteliální buňky (CEC) jsou kriticky důležité pro regulaci průtoku krve mozkem, stejně jako pro normální funkci hematoencefalické bariéry (BBB). Cytokiny, včetně TNFα, pocházející z centrálního nervového systému nebo přítomné v periferním krevním oběhu, mohou vyvolat dysfunkci CEC a zvýšit permeabilitu BBB, o které je známo, že je spojena s mnoha neurologickými poruchami včetně Alzheimerovy choroby a RS, stejně jako periferně indukovaným neurozánětem. . CEC vystavené TNFa skutečně exprimují méně interendoteliálních proteinů a mají větší tvorbu reaktivních kyslíkových forem, což vede ke zvýšené permeabilitě BBB. Kromě toho mohou být CEC aktivovány cytokiny, které jsou buď přítomny v krvi, nebo uvolňovány cirkulujícími imunitními buňkami v těsném kontaktu s CEC, aby produkovaly sekundární signální molekuly (např. další cytokiny, prostaglandin E2, oxid dusnatý), které interagují s buňkami uvnitř mozku, aby změnil reakce NVC. V souladu s tímto návrhem se na myším modelu periferního zánětu ukázalo, že aktivované monocyty v cerebrální cirkulaci přilnou k CEC a indukují aktivaci CEC prostřednictvím interakcí TNFa-TNF receptor-1. Tato imunitní buňka a aktivace CEC řízená TNFa up-reguluje indukovatelnou expresi syntázy oxidu dusnatého v CEC a byla přímo spojena s aktivací mikroglií v mozku (zejména těch buněk v těsné blízkosti krevních cév) a nakonec se změněným chováním. Tato předchozí zjištění z této skupiny poskytují mechanismus, kterým může periferní zánět ovlivnit funkci CEC, a tím změnit cerebrovaskulární funkci. Blokování přilnutí aktivovaných imunitních buněk v oběhu k CEC zvyšuje úkolově indukovaný kortikální krevní tok (tj. NVC)66, což naznačuje, že adhezivní interakce imunitní buňka-CEC mohou vést k neurovaskulárnímu odpojení. CEC mohou také hrát zásadní roli v regulaci průtoku krve mozkem tím, že pasivně umožňují hladkému svalstvu cév relaxovat a stahovat se. Je zajímavé, že se ukázalo, že aktivované leukocyty podporují vazospasticitu závislou na endoteliálních buňkách a snižují arteriální relaxaci in vitro a in vivo. Dále je vazospasticita závislá na endoteliálních buňkách zvýšena v přítomnosti proteinových agregátů v krvi, což by účinně snížilo dynamický rozsah vazodilatace. To je zvláště zajímavé vzhledem k předchozím zjištěním, že periferní zánět vede ke zvýšené CEC prezentaci adhezní molekuly P-selektinu, která zase podporuje adhezi leukocytů a krevních destiček k CEC. Celkově tato zjištění naznačují, že zvýšené interakce leukocytů a CEC spojené s periferním zánětem mohou významně přispívat ke změněné cerebrovaskulární dynamice a potenciálnímu neurovaskulárnímu uncouplingu v podmínkách periferního zánětlivého onemocnění, které se projevuje jako změněná cerebrální oxygenace.
Změny v kortikální perfuzi a okysličení, uvažované v kontextu neurozánětu spojeného s chronickým periferním zánětem, mohou přispívat, alespoň částečně, k behaviorálním symptomům spojeným s IBD a ke snížení kvality života souvisejícího se zdravím (QoL) souvisejícím s onemocněním.
Klinika IBD běžně testuje nové způsoby léčby IBD. Souhlasili s integrací NIRS do pilotního protokolu, aby se zjistilo, zda existují dostatečné důkazy, které by zaručily delší zkoušku NIRS jako biomarkeru neurologického postižení u IBD.
Vyšetřovatelé navrhují následující sérii experimentů s použitím NIRS ke stanovení (A) zda pacienti s IBD vykazují sníženou kortikální saturaci kyslíkem a změněné vzorce mikrovaskulární mozkové krevní perfuze; (B) zda nálezy NIRS saturace a perfuze kyslíkem korelují s klinickými markery aktivity onemocnění, podpisem střevního mikrobiomu specifického pro onemocnění a/nebo skóre symptomů a kvality života u pacientů s IBD; (C) dopad anti-TNF terapie (podávané podle klinické indikace, jako standardní praxe) na změny NIRS, fekální mikrobiom, markery systémového zánětu a závažnost symptomů.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Mark G Swain, MD
- Telefonní číslo: 403-592-5010
- E-mail: swain@ucalgary.ca
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Pam Crotty
- Telefonní číslo: 403-592-5076
- E-mail: pcrotty@ucalgary.ca
Studijní místa
-
-
Alberta
-
Calgary, Alberta, Kanada, T2N 4Z6
- Nábor
- University of Calgary
-
Kontakt:
- Blessing Odia
- Telefonní číslo: 403-220-5782
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
Oprávněnými pacienty budou:
- > 18 let se středně těžkou až těžkou UC nebo (částečné Mayo skóre [kromě endoskopie] ≥5 s podskóre rektálního krvácení ≥1; nebo celkové Mayo subskóre 6-12 s RBS ≥1) nebo CD (Harvey-Bradshaw index [ HBI] 7 nebo vyšší a aktivní CD potvrzené na POC ultrazvuku střeva (definované tloušťkou střevní stěny > 3 mm a pozitivním barevným dopplerovským signálem a fekálním kalprotektinem > 50 μg/g ).
- na základě stavu aktivního onemocnění pacienti nemohou užívat > 20 mg prednisonu denně a
- musí mít nárok na anti-TNF terapii podle standardní péče (klinické rozhodnutí učiněné specialistou na IBD, který o pacienta pečuje).
Kritéria vyloučení:
- pacienti se závažně aktivní UC (klinické známky fulminantní kolitidy nebo toxického megakolon) nebo CD (HBI > 16), vyžadujících > 20 mg prednisonu denně při indukci, sebevražedných myšlenkách nebo psychóze.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Pacienti s IBD (UC a CD)
Účastníci vyplní Mayo Clinic Score (UC) nebo HBI skóre (CD), krátké IBDQ73, *EQ5D-5L, *GAD-774, *PHQ-975, *PROMIS (gastrointestinální bolest břicha), Multidimenzionální hodnocení interoceptivního povědomí (MAIA) )77, *Pain Catastrophizing Scale, Pittsburg Sleep Quality Index (PSQI) a Fatigue Severity Scale (FSS) na začátku a 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie (*dotazníky dostupné prostřednictvím grantu CIHR IMAGINE). Stolice bude odebrána na začátku a po 16 týdnech pro posouzení známého biomarkeru fekálního kalprotektinu, kromě fekálního bakteriálního a plísňového mikrobiomu (prostřednictvím International Microbiome Center [IMC], U of C). Na začátku a po 16 týdnech bude odebrána krev a odebrána moč pro zánětlivé markery a metabolomickou [IMC] analýzu |
Mayo Clinic Score (UC) nebo HBI skóre (CD), krátké IBDQ73, *EQ5D-5L, *GAD-774, *PHQ-975, *PROMIS (gastrointestinální bolest břicha), Multidimenzionální hodnocení interoceptivního povědomí (MAIA)77, * Škála katastrofizující bolesti, Pittsburgský index kvality spánku (PSQI) a stupnice závažnosti únavy (FSS) na začátku a 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie
Systém TechEn NIRSOptix s kontinuální vlnou fNIRS bude použit k záznamu změn v okysličení mozku při vzorkovací frekvenci 25 Hz.
Pro hodnocení známého biomarkeru fekálního kalprotektinu, kromě fekálního bakteriálního a plísňového mikrobiomu
pro zánětlivé markery a metabolomickou [IMC] analýzu
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
a) Klinicky: CD (pokles o >3 body v modifikovaném Harvey-Bradshawově indexu); UC (pokles o >2 body v částečném skóre Mayo)
Časové okno: 16 týdnů
|
Definování rozdílů ve změnách nálezů NIRS mozku v klidovém stavu vyskytujících se u pacientů s IBD, mezi výchozí hodnotou a 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie, u anti-TNF respondérů vs. a) Klinicky: CD (pokles o >3 body v modifikovaném Harvey-Bradshawově indexu); UC (pokles o >2 body v částečném skóre Mayo) |
16 týdnů
|
|
b) Radiograficky: snížení tloušťky stěny střeva ≥ 25 % v nejvíce postiženém segmentu s 2-bodovým snížením skóre barevného dopplerovského signálu nebo normalizací
Časové okno: 16 týdnů
|
Definování rozdílů ve změnách nálezů NIRS mozku v klidovém stavu vyskytujících se u pacientů s IBD, mezi výchozí hodnotou a 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie, u anti-TNF respondérů vs. b) Radiograficky: snížení tloušťky stěny střeva ≥ 25 % v nejvíce postiženém segmentu s 2-bodovým snížením skóre barevného dopplerovského signálu nebo normalizací |
16 týdnů
|
|
c) Biomarker: snížení fekálního kalprotektinu >50 % oproti výchozí hodnotě nebo ≤250 ug/g
Časové okno: 16 týdnů
|
Definování rozdílů ve změnách nálezů NIRS mozku v klidovém stavu vyskytujících se u pacientů s IBD, mezi výchozí hodnotou a 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie, u anti-TNF respondérů vs. c) Biomarker: snížení fekálního kalprotektinu >50 % oproti výchozí hodnotě nebo ≤250 ug/g |
16 týdnů
|
|
d) Endoskopicky (pokud je k dispozici): CD (pokles jednoduchého endoskopického skóre pro CD ≥50 % od výchozí hodnoty); UC (pokles endoskopického subskóre Mayo ≥ 1 bod od výchozí hodnoty)
Časové okno: 16 týdnů
|
Definování rozdílů ve změnách nálezů NIRS mozku v klidovém stavu vyskytujících se u pacientů s IBD, mezi výchozí hodnotou a 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie, u anti-TNF respondérů vs. d) Endoskopicky (pokud je k dispozici): CD (pokles jednoduchého endoskopického skóre pro CD ≥50 % od výchozí hodnoty); UC (pokles endoskopického subskóre Mayo ≥ 1 bod od výchozí hodnoty) |
16 týdnů
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
(i) změny v markerech střeva (definované ultrazvukem střev) a systémový zánět.
Časové okno: 16 týdnů
|
Zjištění, zda výchozí nálezy NIRS mozku a změny v nálezech NIRS od výchozího stavu do 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie korelují s: (i) změny v markerech střeva (definované ultrazvukem střev) a systémový zánět. |
16 týdnů
|
|
(ii) snížení hladiny fekálního kalprotektinu oproti základnímu měření.
Časové okno: 16 týdnů
|
Zjištění, zda výchozí nálezy NIRS mozku a změny v nálezech NIRS od výchozího stavu do 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie korelují s: (ii) snížení hladiny fekálního kalprotektinu oproti základnímu měření. |
16 týdnů
|
|
(iii) specifické střevní mikrobiom a metabolomické signatury.
Časové okno: 16 týdnů
|
Zjištění, zda výchozí nálezy NIRS mozku a změny v nálezech NIRS od výchozího stavu do 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie korelují s: (iii) specifické střevní mikrobiom a metabolomické signatury. |
16 týdnů
|
|
(iv) změny v závažnosti symptomů u pacientů s IBD, kteří reagují (definováno výše) nebo nereagují na anti-TNF terapii.
Časové okno: 16 týdnů
|
Zjištění, zda výchozí nálezy NIRS mozku a změny v nálezech NIRS od výchozího stavu do 16 týdnů po zahájení anti-TNF terapie korelují s: (iv) změny v závažnosti symptomů u pacientů s IBD, kteří reagují (definováno výše) nebo nereagují na anti-TNF terapii. |
16 týdnů
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Mark Swain, MD, University of Calgary
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Fox MD, Raichle ME. Spontaneous fluctuations in brain activity observed with functional magnetic resonance imaging. Nat Rev Neurosci. 2007 Sep;8(9):700-11. doi: 10.1038/nrn2201.
- Kroenke K, Spitzer RL, Williams JB. The PHQ-9: validity of a brief depression severity measure. J Gen Intern Med. 2001 Sep;16(9):606-13. doi: 10.1046/j.1525-1497.2001.016009606.x.
- Spitzer RL, Kroenke K, Williams JB, Lowe B. A brief measure for assessing generalized anxiety disorder: the GAD-7. Arch Intern Med. 2006 May 22;166(10):1092-7. doi: 10.1001/archinte.166.10.1092.
- Buysse DJ, Reynolds CF 3rd, Monk TH, Berman SR, Kupfer DJ. The Pittsburgh Sleep Quality Index: a new instrument for psychiatric practice and research. Psychiatry Res. 1989 May;28(2):193-213. doi: 10.1016/0165-1781(89)90047-4.
- Ni J, Wu GD, Albenberg L, Tomov VT. Gut microbiota and IBD: causation or correlation? Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2017 Oct;14(10):573-584. doi: 10.1038/nrgastro.2017.88. Epub 2017 Jul 19.
- Love MI, Huber W, Anders S. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biol. 2014;15(12):550. doi: 10.1186/s13059-014-0550-8.
- Krupp LB, LaRocca NG, Muir-Nash J, Steinberg AD. The fatigue severity scale. Application to patients with multiple sclerosis and systemic lupus erythematosus. Arch Neurol. 1989 Oct;46(10):1121-3. doi: 10.1001/archneur.1989.00520460115022.
- Cohen J. A power primer. Psychol Bull. 1992 Jul;112(1):155-9. doi: 10.1037//0033-2909.112.1.155.
- Scholkmann F, Kleiser S, Metz AJ, Zimmermann R, Mata Pavia J, Wolf U, Wolf M. A review on continuous wave functional near-infrared spectroscopy and imaging instrumentation and methodology. Neuroimage. 2014 Jan 15;85 Pt 1:6-27. doi: 10.1016/j.neuroimage.2013.05.004. Epub 2013 May 16.
- Sokoloff L. Local cerebral energy metabolism: its relationships to local functional activity and blood flow. Ciba Found Symp. 1978 Mar;(56):171-97. doi: 10.1002/9780470720370.ch10.
- Nippert AR, Biesecker KR, Newman EA. Mechanisms Mediating Functional Hyperemia in the Brain. Neuroscientist. 2018 Feb;24(1):73-83. doi: 10.1177/1073858417703033. Epub 2017 Apr 12.
- Nippert AR, Mishra A, Newman EA. Keeping the Brain Well Fed: The Role of Capillaries and Arterioles in Orchestrating Functional Hyperemia. Neuron. 2018 Jul 25;99(2):248-250. doi: 10.1016/j.neuron.2018.07.011.
- Bu L, Zhang M, Li J, Li F, Liu H, Li Z. Effects of Sleep Deprivation on Phase Synchronization as Assessed by Wavelet Phase Coherence Analysis of Prefrontal Tissue Oxyhemoglobin Signals. PLoS One. 2017 Jan 3;12(1):e0169279. doi: 10.1371/journal.pone.0169279. eCollection 2017.
- Tarumi T, Dunsky DI, Khan MA, Liu J, Hill C, Armstrong K, Martin-Cook K, Cullum CM, Zhang R. Dynamic cerebral autoregulation and tissue oxygenation in amnestic mild cognitive impairment. J Alzheimers Dis. 2014;41(3):765-78. doi: 10.3233/JAD-132018.
- Uemura K, Shimada H, Doi T, Makizako H, Tsutsumimoto K, Park H, Suzuki T. Reduced prefrontal oxygenation in mild cognitive impairment during memory retrieval. Int J Geriatr Psychiatry. 2016 Jun;31(6):583-91. doi: 10.1002/gps.4363. Epub 2015 Sep 21.
- Shang J, Yamashita T, Zhai Y, Nakano Y, Morihara R, Fukui Y, Hishikawa N, Ohta Y, Abe K. Strong Impact of Chronic Cerebral Hypoperfusion on Neurovascular Unit, Cerebrovascular Remodeling, and Neurovascular Trophic Coupling in Alzheimer's Disease Model Mouse. J Alzheimers Dis. 2016 Mar 5;52(1):113-26. doi: 10.3233/JAD-151126.
- Yang R, Dunn JF. Reduced cortical microvascular oxygenation in multiple sclerosis: a blinded, case-controlled study using a novel quantitative near-infrared spectroscopy method. Sci Rep. 2015 Nov 13;5:16477. doi: 10.1038/srep16477.
- Duszynski CC, Avati V, Lapointe AP, Scholkmann F, Dunn JF, Swain MG. Near-Infrared Spectroscopy Reveals Brain Hypoxia and Cerebrovascular Dysregulation in Primary Biliary Cholangitis. Hepatology. 2020 Apr;71(4):1408-1420. doi: 10.1002/hep.30920. Epub 2019 Dec 31.
- D'Mello C, Le T, Swain MG. Cerebral microglia recruit monocytes into the brain in response to tumor necrosis factoralpha signaling during peripheral organ inflammation. J Neurosci. 2009 Feb 18;29(7):2089-102. doi: 10.1523/JNEUROSCI.3567-08.2009.
- Fujiwara T, Kono S, Katakura K, Abe K, Takahashi A, Gunji N, Yokokawa A, Kawashima K, Suzuki R, Wada A, Miura I, Yabe H, Ohira H. Evaluation of Brain Activity Using Near-infrared Spectroscopy in Inflammatory Bowel Disease Patients. Sci Rep. 2018 Jan 10;8(1):402. doi: 10.1038/s41598-017-18897-4.
- Kaplan GG. The global burden of IBD: from 2015 to 2025. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2015 Dec;12(12):720-7. doi: 10.1038/nrgastro.2015.150. Epub 2015 Sep 1.
- Kaplan GG, Bernstein CN, Coward S, Bitton A, Murthy SK, Nguyen GC, Lee K, Cooke-Lauder J, Benchimol EI. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Epidemiology. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S6-S16. doi: 10.1093/jcag/gwy054. Epub 2018 Nov 2.
- Khor B, Gardet A, Xavier RJ. Genetics and pathogenesis of inflammatory bowel disease. Nature. 2011 Jun 15;474(7351):307-17. doi: 10.1038/nature10209.
- Halfvarson J, Brislawn CJ, Lamendella R, Vazquez-Baeza Y, Walters WA, Bramer LM, D'Amato M, Bonfiglio F, McDonald D, Gonzalez A, McClure EE, Dunklebarger MF, Knight R, Jansson JK. Dynamics of the human gut microbiome in inflammatory bowel disease. Nat Microbiol. 2017 Feb 13;2:17004. doi: 10.1038/nmicrobiol.2017.4.
- Lavelle A, Sokol H. Gut microbiota: Beyond metagenomics, metatranscriptomics illuminates microbiome functionality in IBD. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2018 Apr;15(4):193-194. doi: 10.1038/nrgastro.2018.15. Epub 2018 Feb 21. No abstract available.
- Knights D, Lassen KG, Xavier RJ. Advances in inflammatory bowel disease pathogenesis: linking host genetics and the microbiome. Gut. 2013 Oct;62(10):1505-10. doi: 10.1136/gutjnl-2012-303954.
- Moradkhani A, Beckman LJ, Tabibian JH. Health-related quality of life in inflammatory bowel disease: psychosocial, clinical, socioeconomic, and demographic predictors. J Crohns Colitis. 2013 Jul;7(6):467-73. doi: 10.1016/j.crohns.2012.07.012. Epub 2012 Aug 10.
- Nocerino A, Nguyen A, Agrawal M, Mone A, Lakhani K, Swaminath A. Fatigue in Inflammatory Bowel Diseases: Etiologies and Management. Adv Ther. 2020 Jan;37(1):97-112. doi: 10.1007/s12325-019-01151-w. Epub 2019 Nov 23.
- Graff LA, Walker JR, Lix L, Clara I, Rawsthorne P, Rogala L, Miller N, Jakul L, McPhail C, Ediger J, Bernstein CN. The relationship of inflammatory bowel disease type and activity to psychological functioning and quality of life. Clin Gastroenterol Hepatol. 2006 Dec;4(12):1491-1501. doi: 10.1016/j.cgh.2006.09.027.
- Bonaz BL, Bernstein CN. Brain-gut interactions in inflammatory bowel disease. Gastroenterology. 2013 Jan;144(1):36-49. doi: 10.1053/j.gastro.2012.10.003. Epub 2012 Oct 12.
- Szigethy E. Pain Management in Patients With Inflammatory Bowel Disease. Gastroenterol Hepatol (N Y). 2018 Jan;14(1):53-56. No abstract available.
- Hashash JG, Ramos-Rivers C, Youk A, Chiu WK, Duff K, Regueiro M, Binion DG, Koutroubakis I, Vachon A, Benhayon D, Dunn MA, Szigethy EM. Quality of Sleep and Coexistent Psychopathology Have Significant Impact on Fatigue Burden in Patients With Inflammatory Bowel Disease. J Clin Gastroenterol. 2018 May/Jun;52(5):423-430. doi: 10.1097/MCG.0000000000000729.
- Jones JL, Nguyen GC, Benchimol EI, Bernstein CN, Bitton A, Kaplan GG, Murthy SK, Lee K, Cooke-Lauder J, Otley AR. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Quality of Life. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S42-S48. doi: 10.1093/jcag/gwy048. Epub 2018 Nov 2.
- Kuenzig ME, Benchimol EI, Lee L, Targownik LE, Singh H, Kaplan GG, Bernstein CN, Bitton A, Nguyen GC, Lee K, Cooke-Lauder J, Murthy SK. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Direct Costs and Health Services Utilization. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S17-S33. doi: 10.1093/jcag/gwy055. Epub 2018 Nov 2.
- Kuenzig ME, Lee L, El-Matary W, Weizman AV, Benchimol EI, Kaplan GG, Nguyen GC, Bernstein CN, Bitton A, Lee K, Cooke-Lauder J, Murthy SK. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Indirect Costs of IBD Care. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S34-S41. doi: 10.1093/jcag/gwy050. Epub 2018 Nov 2.
- Cryan JF, O'Riordan KJ, Cowan CSM, Sandhu KV, Bastiaanssen TFS, Boehme M, Codagnone MG, Cussotto S, Fulling C, Golubeva AV, Guzzetta KE, Jaggar M, Long-Smith CM, Lyte JM, Martin JA, Molinero-Perez A, Moloney G, Morelli E, Morillas E, O'Connor R, Cruz-Pereira JS, Peterson VL, Rea K, Ritz NL, Sherwin E, Spichak S, Teichman EM, van de Wouw M, Ventura-Silva AP, Wallace-Fitzsimons SE, Hyland N, Clarke G, Dinan TG. The Microbiota-Gut-Brain Axis. Physiol Rev. 2019 Oct 1;99(4):1877-2013. doi: 10.1152/physrev.00018.2018.
- Somineni HK, Kugathasan S. The Microbiome in Patients With Inflammatory Diseases. Clin Gastroenterol Hepatol. 2019 Jan;17(2):243-255. doi: 10.1016/j.cgh.2018.08.078. Epub 2018 Sep 7.
- Ott SJ, Musfeldt M, Wenderoth DF, Hampe J, Brant O, Folsch UR, Timmis KN, Schreiber S. Reduction in diversity of the colonic mucosa associated bacterial microflora in patients with active inflammatory bowel disease. Gut. 2004 May;53(5):685-93. doi: 10.1136/gut.2003.025403.
- Pascal V, Pozuelo M, Borruel N, Casellas F, Campos D, Santiago A, Martinez X, Varela E, Sarrabayrouse G, Machiels K, Vermeire S, Sokol H, Guarner F, Manichanh C. A microbial signature for Crohn's disease. Gut. 2017 May;66(5):813-822. doi: 10.1136/gutjnl-2016-313235. Epub 2017 Feb 7.
- Guida F, Turco F, Iannotta M, De Gregorio D, Palumbo I, Sarnelli G, Furiano A, Napolitano F, Boccella S, Luongo L, Mazzitelli M, Usiello A, De Filippis F, Iannotti FA, Piscitelli F, Ercolini D, de Novellis V, Di Marzo V, Cuomo R, Maione S. Antibiotic-induced microbiota perturbation causes gut endocannabinoidome changes, hippocampal neuroglial reorganization and depression in mice. Brain Behav Immun. 2018 Jan;67:230-245. doi: 10.1016/j.bbi.2017.09.001. Epub 2017 Sep 7.
- Zheng P, Zeng B, Zhou C, Liu M, Fang Z, Xu X, Zeng L, Chen J, Fan S, Du X, Zhang X, Yang D, Yang Y, Meng H, Li W, Melgiri ND, Licinio J, Wei H, Xie P. Gut microbiome remodeling induces depressive-like behaviors through a pathway mediated by the host's metabolism. Mol Psychiatry. 2016 Jun;21(6):786-96. doi: 10.1038/mp.2016.44. Epub 2016 Apr 12.
- Mi GL, Zhao L, Qiao DD, Kang WQ, Tang MQ, Xu JK. Effectiveness of Lactobacillus reuteri in infantile colic and colicky induced maternal depression: a prospective single blind randomized trial. Antonie Van Leeuwenhoek. 2015 Jun;107(6):1547-53. doi: 10.1007/s10482-015-0448-9. Epub 2015 Apr 16.
- Cryan JF, Dinan TG. Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour. Nat Rev Neurosci. 2012 Oct;13(10):701-12. doi: 10.1038/nrn3346. Epub 2012 Sep 12.
- Bravo JA, Julio-Pieper M, Forsythe P, Kunze W, Dinan TG, Bienenstock J, Cryan JF. Communication between gastrointestinal bacteria and the nervous system. Curr Opin Pharmacol. 2012 Dec;12(6):667-72. doi: 10.1016/j.coph.2012.09.010. Epub 2012 Oct 4.
- Zhang M, Sun K, Wu Y, Yang Y, Tso P, Wu Z. Interactions between Intestinal Microbiota and Host Immune Response in Inflammatory Bowel Disease. Front Immunol. 2017 Aug 14;8:942. doi: 10.3389/fimmu.2017.00942. eCollection 2017.
- Collins SM. Interrogating the Gut-Brain Axis in the Context of Inflammatory Bowel Disease: A Translational Approach. Inflamm Bowel Dis. 2020 Mar 4;26(4):493-501. doi: 10.1093/ibd/izaa004.
- Thomann AK, Mak JWY, Zhang JW, Wuestenberg T, Ebert MP, Sung JJY, Bernstein CN, Reindl W, Ng SC. Review article: bugs, inflammation and mood-a microbiota-based approach to psychiatric symptoms in inflammatory bowel diseases. Aliment Pharmacol Ther. 2020 Jul;52(2):247-266. doi: 10.1111/apt.15787. Epub 2020 Jun 11.
- Capuron L, Miller AH. Immune system to brain signaling: neuropsychopharmacological implications. Pharmacol Ther. 2011 May;130(2):226-38. doi: 10.1016/j.pharmthera.2011.01.014. Epub 2011 Feb 17.
- D'Mello C, Swain MG. Liver-brain interactions in inflammatory liver diseases: implications for fatigue and mood disorders. Brain Behav Immun. 2014 Jan;35:9-20. doi: 10.1016/j.bbi.2013.10.009. Epub 2013 Oct 16.
- D'Mello C, Swain MG. Immune-to-Brain Communication Pathways in Inflammation-Associated Sickness and Depression. Curr Top Behav Neurosci. 2017;31:73-94. doi: 10.1007/7854_2016_37.
- D'Mello C, Riazi K, Le T, Stevens KM, Wang A, McKay DM, Pittman QJ, Swain MG. P-selectin-mediated monocyte-cerebral endothelium adhesive interactions link peripheral organ inflammation to sickness behaviors. J Neurosci. 2013 Sep 11;33(37):14878-88. doi: 10.1523/JNEUROSCI.1329-13.2013.
- Chu WM. Tumor necrosis factor. Cancer Lett. 2013 Jan 28;328(2):222-5. doi: 10.1016/j.canlet.2012.10.014. Epub 2012 Oct 22.
- Sedger LM, McDermott MF. TNF and TNF-receptors: From mediators of cell death and inflammation to therapeutic giants - past, present and future. Cytokine Growth Factor Rev. 2014 Aug;25(4):453-72. doi: 10.1016/j.cytogfr.2014.07.016. Epub 2014 Aug 1.
- Padmos RC, Hillegers MH, Knijff EM, Vonk R, Bouvy A, Staal FJ, de Ridder D, Kupka RW, Nolen WA, Drexhage HA. A discriminating messenger RNA signature for bipolar disorder formed by an aberrant expression of inflammatory genes in monocytes. Arch Gen Psychiatry. 2008 Apr;65(4):395-407. doi: 10.1001/archpsyc.65.4.395.
- Slebioda TJ, Kmiec Z. Tumour necrosis factor superfamily members in the pathogenesis of inflammatory bowel disease. Mediators Inflamm. 2014;2014:325129. doi: 10.1155/2014/325129. Epub 2014 Jun 17.
- Singh UP, Singh NP, Murphy EA, Price RL, Fayad R, Nagarkatti M, Nagarkatti PS. Chemokine and cytokine levels in inflammatory bowel disease patients. Cytokine. 2016 Jan;77:44-9. doi: 10.1016/j.cyto.2015.10.008. Epub 2015 Oct 29.
- Muzes G, Molnar B, Tulassay Z, Sipos F. Changes of the cytokine profile in inflammatory bowel diseases. World J Gastroenterol. 2012 Nov 7;18(41):5848-61. doi: 10.3748/wjg.v18.i41.5848.
- Lichtenstein GR. Comprehensive review: antitumor necrosis factor agents in inflammatory bowel disease and factors implicated in treatment response. Therap Adv Gastroenterol. 2013 Jul;6(4):269-93. doi: 10.1177/1756283X13479826.
- Gray MA, Chao CY, Staudacher HM, Kolosky NA, Talley NJ, Holtmann G. Anti-TNFalpha therapy in IBD alters brain activity reflecting visceral sensory function and cognitive-affective biases. PLoS One. 2018 Mar 8;13(3):e0193542. doi: 10.1371/journal.pone.0193542. eCollection 2018.
- Lichtenstein GR, Bala M, Han C, DeWoody K, Schaible T. Infliximab improves quality of life in patients with Crohn's disease. Inflamm Bowel Dis. 2002 Jul;8(4):237-43. doi: 10.1097/00054725-200207000-00001.
- Horst S, Chao A, Rosen M, Nohl A, Duley C, Wagnon JH, Beaulieu DB, Taylor W, Gaines L, Schwartz DA. Treatment with immunosuppressive therapy may improve depressive symptoms in patients with inflammatory bowel disease. Dig Dis Sci. 2015 Feb;60(2):465-70. doi: 10.1007/s10620-014-3375-0. Epub 2014 Oct 2.
- Stevens BW, Borren NZ, Velonias G, Conway G, Cleland T, Andrews E, Khalili H, Garber JG, Xavier RJ, Yajnik V, Ananthakrishnan AN. Vedolizumab Therapy Is Associated with an Improvement in Sleep Quality and Mood in Inflammatory Bowel Diseases. Dig Dis Sci. 2017 Jan;62(1):197-206. doi: 10.1007/s10620-016-4356-2. Epub 2016 Oct 28. Erratum In: Dig Dis Sci. 2017 Feb;62(2):552.
- Wang F, Lin X, Zhao Q, Li J. Adverse symptoms with anti-TNF-alpha therapy in inflammatory bowel disease: systematic review and duration-response meta-analysis. Eur J Clin Pharmacol. 2015 Aug;71(8):911-9. doi: 10.1007/s00228-015-1877-0. Epub 2015 May 30.
- Aden K, Rehman A, Waschina S, Pan WH, Walker A, Lucio M, Nunez AM, Bharti R, Zimmerman J, Bethge J, Schulte B, Schulte D, Franke A, Nikolaus S, Schroeder JO, Vandeputte D, Raes J, Szymczak S, Waetzig GH, Zeuner R, Schmitt-Kopplin P, Kaleta C, Schreiber S, Rosenstiel P. Metabolic Functions of Gut Microbes Associate With Efficacy of Tumor Necrosis Factor Antagonists in Patients With Inflammatory Bowel Diseases. Gastroenterology. 2019 Nov;157(5):1279-1292.e11. doi: 10.1053/j.gastro.2019.07.025. Epub 2019 Jul 18.
- Estevinho MM, Rocha C, Correia L, Lago P, Ministro P, Portela F, Trindade E, Afonso J, Peyrin-Biroulet L, Magro F; GEDII (Portuguese IBD Group). Features of Fecal and Colon Microbiomes Associate With Responses to Biologic Therapies for Inflammatory Bowel Diseases: A Systematic Review. Clin Gastroenterol Hepatol. 2020 May;18(5):1054-1069. doi: 10.1016/j.cgh.2019.08.063. Epub 2019 Sep 14.
- Kisler K, Nelson AR, Montagne A, Zlokovic BV. Cerebral blood flow regulation and neurovascular dysfunction in Alzheimer disease. Nat Rev Neurosci. 2017 Jul;18(7):419-434. doi: 10.1038/nrn.2017.48. Epub 2017 May 18.
- Correale J, Villa A. The blood-brain-barrier in multiple sclerosis: functional roles and therapeutic targeting. Autoimmunity. 2007 Mar;40(2):148-60. doi: 10.1080/08916930601183522.
- Rochfort KD, Collins LE, Murphy RP, Cummins PM. Downregulation of blood-brain barrier phenotype by proinflammatory cytokines involves NADPH oxidase-dependent ROS generation: consequences for interendothelial adherens and tight junctions. PLoS One. 2014 Jul 3;9(7):e101815. doi: 10.1371/journal.pone.0101815. eCollection 2014.
- Akopov S, Sercombe R, Seylaz J. Cerebrovascular reactivity: role of endothelium/platelet/leukocyte interactions. Cerebrovasc Brain Metab Rev. 1996 Spring;8(1):11-94.
- Tohidpour A, Morgun AV, Boitsova EB, Malinovskaya NA, Martynova GP, Khilazheva ED, Kopylevich NV, Gertsog GE, Salmina AB. Neuroinflammation and Infection: Molecular Mechanisms Associated with Dysfunction of Neurovascular Unit. Front Cell Infect Microbiol. 2017 Jun 20;7:276. doi: 10.3389/fcimb.2017.00276. eCollection 2017.
- Kerfoot SM, D'Mello C, Nguyen H, Ajuebor MN, Kubes P, Le T, Swain MG. TNF-alpha-secreting monocytes are recruited into the brain of cholestatic mice. Hepatology. 2006 Jan;43(1):154-62. doi: 10.1002/hep.21003.
- D'Mello C, Almishri W, Liu H, Swain MG. Interactions Between Platelets and Inflammatory Monocytes Affect Sickness Behavior in Mice With Liver Inflammation. Gastroenterology. 2017 Nov;153(5):1416-1428.e2. doi: 10.1053/j.gastro.2017.08.011. Epub 2017 Aug 9.
- Reinhard M, Rosengarten B, Kirchhoff L, Hetzel A, Rauer S. Natalizumab and regulation of cerebral blood flow: results from an observational study. Eur Neurol. 2010;64(2):124-8. doi: 10.1159/000316765. Epub 2010 Jul 22.
- Rutgeerts P, Sandborn WJ, Feagan BG, Reinisch W, Olson A, Johanns J, Travers S, Rachmilewitz D, Hanauer SB, Lichtenstein GR, de Villiers WJ, Present D, Sands BE, Colombel JF. Infliximab for induction and maintenance therapy for ulcerative colitis. N Engl J Med. 2005 Dec 8;353(23):2462-76. doi: 10.1056/NEJMoa050516. Erratum In: N Engl J Med. 2006 May 18;354(20):2200.
- Moskovitz DN, Daperno M, Van Assche GA, et al. Defining and validating cut-offs for the simple endoscopic score for Crohn's disease. Gastroenterology 2007;132:A173-A173.
- Limberg B. [Diagnosis of chronic inflammatory bowel disease by ultrasonography]. Z Gastroenterol. 1999 Jun;37(6):495-508. German.
- Walsham NE, Sherwood RA. Fecal calprotectin in inflammatory bowel disease. Clin Exp Gastroenterol. 2016 Jan 28;9:21-9. doi: 10.2147/CEG.S51902. eCollection 2016.
- Walmsley RS, Ayres RC, Pounder RE, Allan RN. A simple clinical colitis activity index. Gut. 1998 Jul;43(1):29-32. doi: 10.1136/gut.43.1.29.
- Harvey RF, Bradshaw JM. A simple index of Crohn's-disease activity. Lancet. 1980 Mar 8;1(8167):514. doi: 10.1016/s0140-6736(80)92767-1. No abstract available.
- Irvine EJ, Zhou Q, Thompson AK. The Short Inflammatory Bowel Disease Questionnaire: a quality of life instrument for community physicians managing inflammatory bowel disease. CCRPT Investigators. Canadian Crohn's Relapse Prevention Trial. Am J Gastroenterol. 1996 Aug;91(8):1571-8.
- Spiegel BM, Hays RD, Bolus R, Melmed GY, Chang L, Whitman C, Khanna PP, Paz SH, Hays T, Reise S, Khanna D. Development of the NIH Patient-Reported Outcomes Measurement Information System (PROMIS) gastrointestinal symptom scales. Am J Gastroenterol. 2014 Nov;109(11):1804-14. doi: 10.1038/ajg.2014.237. Epub 2014 Sep 9. Erratum In: Am J Gastroenterol. 2015 Apr;110(4):608.
- Mehling WE, Acree M, Stewart A, Silas J, Jones A. The Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness, Version 2 (MAIA-2). PLoS One. 2018 Dec 4;13(12):e0208034. doi: 10.1371/journal.pone.0208034. eCollection 2018.
- Osman A, Barrios FX, Gutierrez PM, Kopper BA, Merrifield T, Grittmann L. The Pain Catastrophizing Scale: further psychometric evaluation with adult samples. J Behav Med. 2000 Aug;23(4):351-65. doi: 10.1023/a:1005548801037.
- van Tilburg Bernardes E, Pettersen VK, Gutierrez MW, Laforest-Lapointe I, Jendzjowsky NG, Cavin JB, Vicentini FA, Keenan CM, Ramay HR, Samara J, MacNaughton WK, Wilson RJA, Kelly MM, McCoy KD, Sharkey KA, Arrieta MC. Intestinal fungi are causally implicated in microbiome assembly and immune development in mice. Nat Commun. 2020 May 22;11(1):2577. doi: 10.1038/s41467-020-16431-1.
- Arrieta MC, Arevalo A, Stiemsma L, Dimitriu P, Chico ME, Loor S, Vaca M, Boutin RCT, Morien E, Jin M, Turvey SE, Walter J, Parfrey LW, Cooper PJ, Finlay B. Associations between infant fungal and bacterial dysbiosis and childhood atopic wheeze in a nonindustrialized setting. J Allergy Clin Immunol. 2018 Aug;142(2):424-434.e10. doi: 10.1016/j.jaci.2017.08.041. Epub 2017 Dec 11.
- Tan Q, Zhang M, Wang Y, Zhang M, Wang Y, Xin Q, Wang B, Li Z. Frequency-specific functional connectivity revealed by wavelet-based coherence analysis in elderly subjects with cerebral infarction using NIRS method. Med Phys. 2015 Sep;42(9):5391-403. doi: 10.1118/1.4928672.
- Chang C, Glover GH. Time-frequency dynamics of resting-state brain connectivity measured with fMRI. Neuroimage. 2010 Mar;50(1):81-98. doi: 10.1016/j.neuroimage.2009.12.011. Epub 2009 Dec 16.
- Julien C. The enigma of Mayer waves: Facts and models. Cardiovasc Res. 2006 Apr 1;70(1):12-21. doi: 10.1016/j.cardiores.2005.11.008. Epub 2005 Dec 19.
- Birn RM, Diamond JB, Smith MA, Bandettini PA. Separating respiratory-variation-related fluctuations from neuronal-activity-related fluctuations in fMRI. Neuroimage. 2006 Jul 15;31(4):1536-48. doi: 10.1016/j.neuroimage.2006.02.048. Epub 2006 Apr 24.
- Wise RG, Ide K, Poulin MJ, Tracey I. Resting fluctuations in arterial carbon dioxide induce significant low frequency variations in BOLD signal. Neuroimage. 2004 Apr;21(4):1652-64. doi: 10.1016/j.neuroimage.2003.11.025.
- Gatto R, Hoffman W, Mueller M, Flores A, Valyi-Nagy T, Charbel FT. Frequency domain near-infrared spectroscopy technique in the assessment of brain oxygenation: a validation study in live subjects and cadavers. J Neurosci Methods. 2006 Oct 30;157(2):274-7. doi: 10.1016/j.jneumeth.2006.04.013. Epub 2006 May 24.
- Novak KL, Kaplan GG, Panaccione R, Afshar EE, Tanyingoh D, Swain M, Kellar A, Wilson S. A Simple Ultrasound Score for the Accurate Detection of Inflammatory Activity in Crohn's Disease. Inflamm Bowel Dis. 2017 Nov;23(11):2001-2010. doi: 10.1097/MIB.0000000000001174.
- WILCOXON F. Individual comparisons of grouped data by ranking methods. J Econ Entomol. 1946 Apr;39:269. doi: 10.1093/jee/39.2.269. No abstract available.
- Bartram AK, Lynch MD, Stearns JC, Moreno-Hagelsieb G, Neufeld JD. Generation of multimillion-sequence 16S rRNA gene libraries from complex microbial communities by assembling paired-end illumina reads. Appl Environ Microbiol. 2011 Jun;77(11):3846-52. doi: 10.1128/AEM.02772-10. Epub 2011 Apr 1. Erratum In: Appl Environ Microbiol. 2011 Aug;77(15):5569.
- Schloss PD, Westcott SL, Ryabin T, Hall JR, Hartmann M, Hollister EB, Lesniewski RA, Oakley BB, Parks DH, Robinson CJ, Sahl JW, Stres B, Thallinger GG, Van Horn DJ, Weber CF. Introducing mothur: open-source, platform-independent, community-supported software for describing and comparing microbial communities. Appl Environ Microbiol. 2009 Dec;75(23):7537-41. doi: 10.1128/AEM.01541-09. Epub 2009 Oct 2.
- DeSantis TZ, Hugenholtz P, Larsen N, Rojas M, Brodie EL, Keller K, Huber T, Dalevi D, Hu P, Andersen GL. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006 Jul;72(7):5069-72. doi: 10.1128/AEM.03006-05.
- McMurdie PJ, Holmes S. phyloseq: an R package for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data. PLoS One. 2013 Apr 22;8(4):e61217. doi: 10.1371/journal.pone.0061217. Print 2013.
- McMurdie PJ, Holmes S. Waste not, want not: why rarefying microbiome data is inadmissible. PLoS Comput Biol. 2014 Apr 3;10(4):e1003531. doi: 10.1371/journal.pcbi.1003531. eCollection 2014 Apr.
- Morgan XC, Tickle TL, Sokol H, Gevers D, Devaney KL, Ward DV, Reyes JA, Shah SA, LeLeiko N, Snapper SB, Bousvaros A, Korzenik J, Sands BE, Xavier RJ, Huttenhower C. Dysfunction of the intestinal microbiome in inflammatory bowel disease and treatment. Genome Biol. 2012 Apr 16;13(9):R79. doi: 10.1186/gb-2012-13-9-r79.
- B Sohn M, Li H. A GLM-based latent variable ordination method for microbiome samples. Biometrics. 2018 Jun;74(2):448-457. doi: 10.1111/biom.12775. Epub 2017 Oct 9.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (OČEKÁVANÝ)
Primární dokončení (OČEKÁVANÝ)
Dokončení studie (OČEKÁVANÝ)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (AKTUÁLNÍ)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- REB20-1873
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na IBD
-
London North West Healthcare NHS TrustNábor
-
Nationwide Children's HospitalUkončeno
-
Cedars-Sinai Medical CenterDokončeno
-
Assiut UniversityNeznámý
-
Atlantic Pharmaceuticals LtdDokončeno
-
Aerpio TherapeuticsDokončeno
-
Assiut UniversityZatím nenabíráme