- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT04733456
Hjerneaktivitet og oksygenering Pasienter med inflammatorisk tarmsykdom (IBD).
Evaluering av hjerneaktivitet og oksygenering ved bruk av nær-infrarød spektroskopi (NIRS) hos pasienter med inflammatorisk tarmsykdom (IBD)
Studieoversikt
Status
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Hypotese Tilstander med akutt systemisk inflammasjon vil korrelere med endringer i tarmmikrobiomets signaturer, redusert cerebral oksygenmetning (StO2) og endrede mønstre av mikrovaskulær cerebral blodperfusjon (som bestemt ved nær-infrarød spektroskopi NIRS).
Begrunnelse Etterforskerne undersøker evnen til nær-infrarød spektroskopi (NIRS) til å oppdage endret hjernefunksjon og oksygenering under en rekke klinisk relevante medisinske tilstander.
NIRS tillater ikke-invasiv måling av oksygenert (O2Hb) og deoksygenert hemoglobin (HHb) konsentrasjoner i kortikalt hjernevev. Derfor kan NIRS brukes til å kvantifisere kortikalt vevs oksygenmetning (StO2), som gjenspeiler endret metabolsk hastighet og perfusjon. Videre kan funksjonell NIRS (fNIRS) brukes til å undersøke hjerneaktivitet på en lignende måte som funksjonell MR, ved å anta at de målte endringene i blodperfusjon og oksygenering skyldes funksjonell hyperemi (dvs. hemodynamiske endringer forårsaket av nevral aktivitet). Ved bruk av NIRS hos pasienter, har endrede mønstre av hjerneblodperfusjon og redusert oksygeneringsnivå i hjernen vist seg å korrelere med tretthet og nedsatt kognisjon, og knytter redusert kortikal perfusjon til symptomer som er rapportert å oppstå hos pasienter med IBD.
Tett regulering av cerebral blodstrøm er avgjørende for å sikre normal oksygenering og funksjon av hjernen. Cerebrovaskulær dysfunksjon og hypoksi har vært implisert i en rekke nevrodegenerative og nevroinflammatoriske lidelser, inkludert Alzheimers sykdom og multippel sklerose (MS). I en nylig studie med fNIRS fant etterforskerne endrede oppgaveassosierte hemodynamiske responser og hjernehypoksi hos pasienter med den immunmedierte leversykdommen, primær biliær kolangitt (PBC). Dessuten antyder det eksperimentelle arbeidet med mus at disse endringene kan skyldes virkningene av TNFα på den cerebrale vaskulaturen. Den viste også at pasienter med multippel sklerose hadde redusert inter-hemisfærisk koherens og hypoksi. Disse observasjonene førte til spørsmålet om generell systemisk betennelse eller hjerne/tarm interaksjoner kunne kobles til unormal hjernefunksjon og hypoksi, som kan påvises av NIRS.
Støtter denne hypotesen er en fersk NIRS-studie av Fujiwara T et al på pasienter med IBD. De viste at under utførelsen av en oppgave var gjennomsnittlig oksygenert hemoglobinkonsentrasjon signifikant lavere i frontallappen hos IBD-pasienter sammenlignet med friske kontroller. Imidlertid har endringer i hjerneoksygenering ikke tidligere blitt undersøkt under hviletilstand eller i sammenheng med markører for perifer betennelse, livskvalitetsmål og symptombyrde, eller tarmmikrobiomsignaturer hos IBD-pasienter.
Denne for tiden foreslåtte delstudien er å undersøke pasienter med inflammatorisk tarmsykdom (IBD) for deres nivå av hypoksi, fNIRS funksjonell respons og fNIRS-koherens.
IBD øker i forekomst og prevalens over hele verden. Flere faktorer har vært involvert i utviklingen av IBD, inkludert en dysregulert immunrespons på endret mikrobiota i en genetisk mottakelig vert utsatt for inciterende miljøfaktorer, men den spesifikke årsaken til IBD er fortsatt ukjent. Komorbid maladaptiv atferd og smerte er utbredt hos pasienter med IBD20-26. Disse psykiske komorbiditetene kompliserer håndteringen av IBD, påvirker pasientresultater og helse negativt, og øker ressursbyrden for helsevesenet. Imidlertid er komorbide psykiske helseproblemer og symptomer hos IBD-pasienter dårlig forstått og underbehandlet, parallelt med udekkede behov for psykisk helsebehandling i den generelle kanadiske befolkningen. Derfor er en forbedret forståelse av hvordan hjerneforandringer oppstår i forbindelse med IBD, og deres potensielle rolle i symptomutvikling og kobling til systemisk betennelse og tarmmikrobiomer signaturer av betydelig betydning for å forbedre behandlingen av disse pasientene.
Mage-tarmkanalen fungerer som et dynamisk og lokalt økosystem for tarmmikrobiota. Dysbiose, som er en endring av tarmens mikrobielle sammensetning som bidrar til vertssykdom, forekommer hos IBD-pasienter. Spesielt viser IBD-pasienter et lavere mikrobiell α-diversitet og er beriket i flere grupper av bakterier sammenlignet med friske kontroller. Nylig har prekliniske, translasjonelle og kliniske studier indikert at endringer i den strukturelle sammensetningen eller funksjonen til mikrobiomet kan bidra til utvikling av psykisk sykdom, inkludert depresjonslignende atferd, og er derfor en viktig komponent som forbinder tarm-hjerne-aksen. . I samsvar med dette har det blitt identifisert sterke korrelasjoner mellom endringer i tarmmikrobiota og utvikling av kroniske inflammatoriske lidelser, slik som IBD, noe som tyder på at dysbiose er en viktig faktor i både gastrointestinale lidelser og mental helse. Imidlertid er de nøyaktige mekanismene som tarmdysbiose i IBD kan endre atferd med fortsatt dårlig forstått.
Hvordan perifer betennelse, som forekommer ved IBD, fører til fjerntliggende endringer i hjernefunksjonen er fortsatt uklart, og som et resultat er det begrensede terapeutiske alternativer tilgjengelig klinisk for å løse dette problemet. Det er beskrevet en rekke generelle veier som knytter systemisk betennelse til endringer som skjer i hjernen, som igjen gir opphav til endret atferd. Disse banene har tradisjonelt inkludert signalering via nevrale veier (hovedsakelig vagale nerveafferenter) og immunsignalering (hovedsakelig via sirkulerende cytokiner som TNFα, som enten kommer direkte inn i hjernen eller aktiverer cerebralt endotel). Nylig beskrev forskere fra University of Calgary en ny signalvei for betennelse som involverer økt perifer TNF-α-produksjon som driver økt mikroglial aktivering, etterfulgt av monocyttrekruttering til hjernevaskulatur og hjerneparenkym, som igjen driver utviklingen av sykdomsatferd. TNFα er et multifunksjonelt cytokin som medierer en rekke effekter som direkte kan påvirke hjernefunksjonen (via modulerende nevrotransmisjon) og tarmen (f.eks. påvirker tarmbarrierepermeabiliteten) og modulerer vevsbetennelse (f.eks. aktivere makrofager for å indusere cytokin- og kjemokinekspresjon). Økte sirkulerende nivåer av TNFα og økt produksjon av sirkulerende leukocytter er ofte dokumentert hos pasienter med kroniske inflammatoriske tilstander assosiert med en høy forekomst av sykdomsadferd og humørsykdommer, inkludert IBD. Derfor har blokkering av TNFα-signalering blitt omfattende evaluert i kliniske studier av IBD. I tillegg er forbedring av symptomer ved TNFα-signalhemming ofte tydelig hos behandlede pasienter med kroniske inflammatoriske sykdommer, før åpenbare endringer i sykdomsaktivitet. Hos pasienter med IBD var anti-TNFα-terapi assosiert med signifikante forbedringer i søvn, depresjon og angst tidlig etter oppstart av behandlingen, og disse forbedringene ble vedvarende. I tillegg vurderte en annen studie effekten av anti-TNFα-terapi på interoceptiv signalering hos pasienter med Crohns sykdom og viste reduksjoner i visceral sensitivitet og forbedret kognitiv-affektiv prosessering etter anti-TNFα-administrasjon, parallelt med forbedret følelse av velvære. Endringer i kognisjon var knyttet til endringer i nevral aktivitet i prefrontale og limbiske hjerneområder. Dessuten var de raske atferds- og nevrale endringene som ble observert ikke assosiert med signifikante endringer i fekale kalprotektinnivåer (markør for tarmbetennelse), noe som tyder på at de var usannsynlig relatert til en samtidig reduksjon i tarmbetennelse. Anti-TNFα-terapi endrer også tarmmikrobiomet hos pasienter med IBD. Spesielt økte anti-TNFα-terapi hos IBD-pasienter tarmmikrobielle artsrikdom og fylodiversitet til nivåer som ligner på friske kontroller. I tillegg reduserte anti-TNF-terapi den relative forekomsten av proinflammatoriske bakterier Escherichia og Enterococcus hos IBD-pasienter, og økende slekter som produserer kortkjedede fettsyrer, som har veletablerte antiinflammatoriske effekter i tarmen.
Sunne cerebrale endotelceller (CECs) er kritisk viktige for hjernens blodstrømregulering, så vel som den normale funksjonen til blod-hjerne-barrieren (BBB). Cytokiner, inkludert TNFα, som stammer fra sentralnervesystemet eller er tilstede i den perifere blodsirkulasjonen, kan indusere CEC-dysfunksjon og øke BBB-permeabilitet, som er kjent for å være assosiert med mange nevrologiske lidelser inkludert Alzheimers og MS, samt perifert indusert nevroinflammasjon . Faktisk uttrykker CEC-er utsatt for TNFa færre interendotelproteiner og har større reaktive oksygenarter, noe som fører til økt BBB-permeabilitet. Videre kan CEC-er aktiveres av cytokiner som enten finnes i blodet eller frigjøres av sirkulerende immunceller i intim kontakt med CEC-er, for å produsere sekundære signalmolekyler (f.eks. ekstra cytokiner, prostaglandin E2, nitrogenoksid) som interagerer med celler i hjernen for å endre NVC-responser. I samsvar med dette forslaget, i en musemodell av perifer betennelse, ble det vist at aktiverte monocytter i den cerebrale sirkulasjonen fester seg til CEC og induserer CEC-aktivering gjennom TNFα-TNF reseptor-1-interaksjoner. Denne immuncelle- og TNFα-drevne CEC-aktiveringen oppregulerer induserbar nitrogenoksidsyntaseuttrykk i CEC-er og var direkte knyttet til aktivering av mikroglia i hjernen (spesielt de cellene i nærheten av blodkar), og til slutt til endret atferd. Disse tidligere funnene fra denne gruppen gir en mekanisme som perifer betennelse kan påvirke funksjonen til CEC, og dermed endre cerebrovaskulær funksjon. Blokkering av aktiverte immunceller i sirkulasjonen fra å feste seg til CEC øker oppgaveindusert kortikal blodstrøm (dvs. NVC)66, noe som antyder at immuncelle-CEC adhesive interaksjoner kan føre til nevrovaskulær frakobling. CEC kan også spille en viktig rolle i reguleringen av cerebral blodstrøm ved passivt å la glattmuskulaturen slappe av og trekke seg sammen. Interessant nok har aktiverte leukocytter vist seg å fremme endotelcelleavhengig vasospastisitet og redusere arteriell avslapning in vitro og in vivo. Videre økes endotelcelleavhengig vasospastisitet i nærvær av proteinaggregater i blodet, noe som effektivt vil redusere det dynamiske området for vasodilatasjon. Dette er spesielt interessant med tanke på tidligere funn om at perifer betennelse fører til økt CEC-presentasjon av adhesjonsmolekylet P-selektin, som igjen fremmer leukocytt- og blodplateadhesjon til CEC. Til sammen antyder disse funnene at økte leukocytt-CEC-interaksjoner assosiert med perifer betennelse kan bidra betydelig til endret cerebrovaskulær dynamikk og potensiell nevrovaskulær frakobling i setting av perifer inflammatorisk sykdom, som er manifestert som endret cerebral oksygenering.
Betraktet i sammenheng med nevroinflammasjon assosiert med kronisk perifer betennelse, kan endringer i kortikal perfusjon og oksygenering bidra, i det minste delvis, til atferdssymptomer assosiert med IBD og sykdomsassosiert reduksjon i helserelatert livskvalitet (QoL).
IBD-klinikken tester rutinemessig ut nye behandlinger for IBD. De har blitt enige om å integrere NIRS i en pilotprotokoll for å avgjøre om det er tilstrekkelig bevis til å rettferdiggjøre en lengre utprøving av NIRS som en biomarkør for nevrologisk involvering i IBD.
Etterforskerne foreslår følgende serie eksperimenter, ved bruk av NIRS, for å bestemme (A) om pasienter med IBD viser redusert kortikal oksygenmetning og endrede mønstre av mikrovaskulær cerebral blodperfusjon; (B) om NIRS-funn av oksygenmetning og perfusjon korrelerer med kliniske sykdomsaktivitetsmarkører, en sykdomsspesifikk tarmmikrobiomsignatur og/eller symptom- og livskvalitetsscore hos pasienter med IBD; (C) virkningen av anti-TNF-terapi (administrert som klinisk indisert, som standard for praksis) på NIRS-endringer, avføringsmikrobiomet, markører for systemisk betennelse og alvorlighetsgrad av symptomer.
Studietype
Registrering (Forventet)
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Mark G Swain, MD
- Telefonnummer: 403-592-5010
- E-post: swain@ucalgary.ca
Studer Kontakt Backup
- Navn: Pam Crotty
- Telefonnummer: 403-592-5076
- E-post: pcrotty@ucalgary.ca
Studiesteder
-
-
Alberta
-
Calgary, Alberta, Canada, T2N 4Z6
- Rekruttering
- University of Calgary
-
Ta kontakt med:
- Blessing Odia
- Telefonnummer: 403-220-5782
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
Kvalifiserte pasienter vil være:
- > 18 år med moderat til alvorlig UC eller (delvis Mayo-score [unntatt endoskopi] ≥5 med rektal blødning-subscore ≥1; eller total Mayo-subscore 6-12 med RBS ≥1) eller CD (Harvey-Bradshaw-indeks [ HBI] på 7 eller høyere, og aktiv CD bekreftet på POC tarm-ultralyd (definert av tarmveggtykkelse >3 mm og positivt fargedopplersignal og et fekalt kalprotektin > 50 μg/g).
- basert på deres aktive sykdomsstatus kan pasienter ikke ta > 20 mg prednison daglig og
- må være kvalifisert for anti-TNF-behandling i henhold til standard behandling (klinisk avgjørelse tatt av IBD-spesialist som tar seg av pasienten).
Ekskluderingskriterier:
- pasienter med alvorlig aktiv UC (kliniske tegn på fulminant kolitt eller toksisk megacolon) eller CD (HBI > 16), som krever > 20 mg prednison daglig ved induksjon, selvmordstanker eller psykose.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
IBD-pasienter (UC og CD)
Deltakerne vil fullføre en Mayo Clinic Score (UC) eller HBI score (CD), kort IBDQ73, *EQ5D-5L, *GAD-774, *PHQ-975, *PROMIS (Gastrointestinal Belly Pain), Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness (MAIA) )77, *Pain Catastrophizing Scale, Pittsburg Sleep Quality Index (PSQI) og Fatigue Severity Scale (FSS) ved baseline og 16 uker etter starten av anti-TNF-terapi (*spørreskjemaer tilgjengelig gjennom CIHR IMAGINE-stipendet). Avføring vil bli samlet ved baseline og etter 16 uker for vurdering av den kjente biomarkøren fecal calprotectin, i tillegg til fecal bakteriell og fungal mikrobiom (gjennom International Microbiome Center [IMC], U av C). Blod vil bli tappet og urin samlet ved baseline og etter 16 uker for inflammatoriske markører og metabolomisk [IMC] analyse |
Mayo Clinic Score (UC) eller HBI score (CD), kort IBDQ73, *EQ5D-5L, *GAD-774, *PHQ-975, *PROMIS (Gastrointestinal Belly Pain), Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness (MAIA)77, * Pain Catastrophizing Scale, Pittsburg Sleep Quality Index (PSQI) og Fatigue Severity Scale (FSS) ved baseline og 16 uker etter oppstart av anti-TNF-behandling
Et TechEn NIRSOptix kontinuerlig bølge fNIRS-system vil bli brukt til å registrere endringer i cerebral oksygenering, med en samplingshastighet på 25 Hz
For vurdering av den kjente biomarkøren fecal calprotectin, i tillegg til fecal bakteriell og soppmikrobiom
for inflammatoriske markører og metabolomisk [IMC] analyse
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
a) Klinisk: CD (reduksjon på >3 poeng i den modifiserte Harvey-Bradshaw-indeksen); UC (reduksjon på >2 poeng i den delvise Mayo-poengsummen)
Tidsramme: 16 uker
|
Definere forskjeller i endringer av NIRS-funn i hviletilstand som forekommer hos IBD-pasienter, mellom baseline og 16 uker etter oppstart av anti-TNF-terapi, hos anti-TNF-respondere vs. ikke-respondere, definert: a) Klinisk: CD (reduksjon på >3 poeng i den modifiserte Harvey-Bradshaw-indeksen); UC (reduksjon på >2 poeng i den delvise Mayo-poengsummen) |
16 uker
|
|
b) Radiografisk: reduksjon i tarmveggtykkelse ≥25 % i det mest berørte segmentet med 2 poeng reduksjon i fargedopplersignalscore eller normalisering
Tidsramme: 16 uker
|
Definere forskjeller i endringer av NIRS-funn i hviletilstand som forekommer hos IBD-pasienter, mellom baseline og 16 uker etter oppstart av anti-TNF-terapi, hos anti-TNF-respondere vs. ikke-respondere, definert: b) Radiografisk: reduksjon i tarmveggtykkelse ≥25 % i det mest berørte segmentet med 2 poeng reduksjon i fargedopplersignalscore eller normalisering |
16 uker
|
|
c) Biomarkør: reduksjon i fekalt kalprotektin >50 % fra baseline eller ≤250 ug/g
Tidsramme: 16 uker
|
Definere forskjeller i endringer av NIRS-funn i hviletilstand som forekommer hos IBD-pasienter, mellom baseline og 16 uker etter oppstart av anti-TNF-terapi, hos anti-TNF-respondere vs. ikke-respondere, definert: c) Biomarkør: reduksjon i fekalt kalprotektin >50 % fra baseline eller ≤250 ug/g |
16 uker
|
|
d) Endoskopisk (der tilgjengelig): CD (reduksjon i Simple Endoscopic Score for CD ≥50 % fra baseline); UC (nedgang i Mayo endoskopisk subscore ≥1 poeng fra baseline)
Tidsramme: 16 uker
|
Definere forskjeller i endringer av NIRS-funn i hviletilstand som forekommer hos IBD-pasienter, mellom baseline og 16 uker etter oppstart av anti-TNF-terapi, hos anti-TNF-respondere vs. ikke-respondere, definert: d) Endoskopisk (der tilgjengelig): CD (reduksjon i Simple Endoscopic Score for CD ≥50 % fra baseline); UC (nedgang i Mayo endoskopisk subscore ≥1 poeng fra baseline) |
16 uker
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
(i) endringer i markører for tarm (definert av tarm-ultralyd) og systemisk betennelse.
Tidsramme: 16 uker
|
Avgrense om baseline hjerne NIRS funn, og endringer i NIRS funn fra baseline til 16 uker etter oppstart av anti-TNF terapi, korrelerer med: (i) endringer i markører for tarm (definert av tarm-ultralyd) og systemisk betennelse. |
16 uker
|
|
(ii) reduksjon fra baseline-måling av fekalt kalprotektinnivå.
Tidsramme: 16 uker
|
Avgrense om baseline hjerne NIRS funn, og endringer i NIRS funn fra baseline til 16 uker etter oppstart av anti-TNF terapi, korrelerer med: (ii) reduksjon fra baseline-måling av fekalt kalprotektinnivå. |
16 uker
|
|
(iii) spesifikke tarmmikrobiom og metabolomiske signaturer.
Tidsramme: 16 uker
|
Avgrense om baseline hjerne NIRS funn, og endringer i NIRS funn fra baseline til 16 uker etter oppstart av anti-TNF terapi, korrelerer med: (iii) spesifikke tarmmikrobiom og metabolomiske signaturer. |
16 uker
|
|
(iv) endringer i alvorlighetsgrad av symptomer hos IBD-pasienter som reagerer (definert som ovenfor), eller som ikke reagerer på anti-TNF-terapi.
Tidsramme: 16 uker
|
Avgrense om baseline hjerne NIRS funn, og endringer i NIRS funn fra baseline til 16 uker etter oppstart av anti-TNF terapi, korrelerer med: (iv) endringer i alvorlighetsgrad av symptomer hos IBD-pasienter som reagerer (definert som ovenfor), eller som ikke reagerer på anti-TNF-terapi. |
16 uker
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Mark Swain, MD, University of Calgary
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Fox MD, Raichle ME. Spontaneous fluctuations in brain activity observed with functional magnetic resonance imaging. Nat Rev Neurosci. 2007 Sep;8(9):700-11. doi: 10.1038/nrn2201.
- Kroenke K, Spitzer RL, Williams JB. The PHQ-9: validity of a brief depression severity measure. J Gen Intern Med. 2001 Sep;16(9):606-13. doi: 10.1046/j.1525-1497.2001.016009606.x.
- Spitzer RL, Kroenke K, Williams JB, Lowe B. A brief measure for assessing generalized anxiety disorder: the GAD-7. Arch Intern Med. 2006 May 22;166(10):1092-7. doi: 10.1001/archinte.166.10.1092.
- Buysse DJ, Reynolds CF 3rd, Monk TH, Berman SR, Kupfer DJ. The Pittsburgh Sleep Quality Index: a new instrument for psychiatric practice and research. Psychiatry Res. 1989 May;28(2):193-213. doi: 10.1016/0165-1781(89)90047-4.
- Ni J, Wu GD, Albenberg L, Tomov VT. Gut microbiota and IBD: causation or correlation? Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2017 Oct;14(10):573-584. doi: 10.1038/nrgastro.2017.88. Epub 2017 Jul 19.
- Love MI, Huber W, Anders S. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biol. 2014;15(12):550. doi: 10.1186/s13059-014-0550-8.
- Krupp LB, LaRocca NG, Muir-Nash J, Steinberg AD. The fatigue severity scale. Application to patients with multiple sclerosis and systemic lupus erythematosus. Arch Neurol. 1989 Oct;46(10):1121-3. doi: 10.1001/archneur.1989.00520460115022.
- Cohen J. A power primer. Psychol Bull. 1992 Jul;112(1):155-9. doi: 10.1037//0033-2909.112.1.155.
- Scholkmann F, Kleiser S, Metz AJ, Zimmermann R, Mata Pavia J, Wolf U, Wolf M. A review on continuous wave functional near-infrared spectroscopy and imaging instrumentation and methodology. Neuroimage. 2014 Jan 15;85 Pt 1:6-27. doi: 10.1016/j.neuroimage.2013.05.004. Epub 2013 May 16.
- Sokoloff L. Local cerebral energy metabolism: its relationships to local functional activity and blood flow. Ciba Found Symp. 1978 Mar;(56):171-97. doi: 10.1002/9780470720370.ch10.
- Nippert AR, Biesecker KR, Newman EA. Mechanisms Mediating Functional Hyperemia in the Brain. Neuroscientist. 2018 Feb;24(1):73-83. doi: 10.1177/1073858417703033. Epub 2017 Apr 12.
- Nippert AR, Mishra A, Newman EA. Keeping the Brain Well Fed: The Role of Capillaries and Arterioles in Orchestrating Functional Hyperemia. Neuron. 2018 Jul 25;99(2):248-250. doi: 10.1016/j.neuron.2018.07.011.
- Bu L, Zhang M, Li J, Li F, Liu H, Li Z. Effects of Sleep Deprivation on Phase Synchronization as Assessed by Wavelet Phase Coherence Analysis of Prefrontal Tissue Oxyhemoglobin Signals. PLoS One. 2017 Jan 3;12(1):e0169279. doi: 10.1371/journal.pone.0169279. eCollection 2017.
- Tarumi T, Dunsky DI, Khan MA, Liu J, Hill C, Armstrong K, Martin-Cook K, Cullum CM, Zhang R. Dynamic cerebral autoregulation and tissue oxygenation in amnestic mild cognitive impairment. J Alzheimers Dis. 2014;41(3):765-78. doi: 10.3233/JAD-132018.
- Uemura K, Shimada H, Doi T, Makizako H, Tsutsumimoto K, Park H, Suzuki T. Reduced prefrontal oxygenation in mild cognitive impairment during memory retrieval. Int J Geriatr Psychiatry. 2016 Jun;31(6):583-91. doi: 10.1002/gps.4363. Epub 2015 Sep 21.
- Shang J, Yamashita T, Zhai Y, Nakano Y, Morihara R, Fukui Y, Hishikawa N, Ohta Y, Abe K. Strong Impact of Chronic Cerebral Hypoperfusion on Neurovascular Unit, Cerebrovascular Remodeling, and Neurovascular Trophic Coupling in Alzheimer's Disease Model Mouse. J Alzheimers Dis. 2016 Mar 5;52(1):113-26. doi: 10.3233/JAD-151126.
- Yang R, Dunn JF. Reduced cortical microvascular oxygenation in multiple sclerosis: a blinded, case-controlled study using a novel quantitative near-infrared spectroscopy method. Sci Rep. 2015 Nov 13;5:16477. doi: 10.1038/srep16477.
- Duszynski CC, Avati V, Lapointe AP, Scholkmann F, Dunn JF, Swain MG. Near-Infrared Spectroscopy Reveals Brain Hypoxia and Cerebrovascular Dysregulation in Primary Biliary Cholangitis. Hepatology. 2020 Apr;71(4):1408-1420. doi: 10.1002/hep.30920. Epub 2019 Dec 31.
- D'Mello C, Le T, Swain MG. Cerebral microglia recruit monocytes into the brain in response to tumor necrosis factoralpha signaling during peripheral organ inflammation. J Neurosci. 2009 Feb 18;29(7):2089-102. doi: 10.1523/JNEUROSCI.3567-08.2009.
- Fujiwara T, Kono S, Katakura K, Abe K, Takahashi A, Gunji N, Yokokawa A, Kawashima K, Suzuki R, Wada A, Miura I, Yabe H, Ohira H. Evaluation of Brain Activity Using Near-infrared Spectroscopy in Inflammatory Bowel Disease Patients. Sci Rep. 2018 Jan 10;8(1):402. doi: 10.1038/s41598-017-18897-4.
- Kaplan GG. The global burden of IBD: from 2015 to 2025. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2015 Dec;12(12):720-7. doi: 10.1038/nrgastro.2015.150. Epub 2015 Sep 1.
- Kaplan GG, Bernstein CN, Coward S, Bitton A, Murthy SK, Nguyen GC, Lee K, Cooke-Lauder J, Benchimol EI. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Epidemiology. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S6-S16. doi: 10.1093/jcag/gwy054. Epub 2018 Nov 2.
- Khor B, Gardet A, Xavier RJ. Genetics and pathogenesis of inflammatory bowel disease. Nature. 2011 Jun 15;474(7351):307-17. doi: 10.1038/nature10209.
- Halfvarson J, Brislawn CJ, Lamendella R, Vazquez-Baeza Y, Walters WA, Bramer LM, D'Amato M, Bonfiglio F, McDonald D, Gonzalez A, McClure EE, Dunklebarger MF, Knight R, Jansson JK. Dynamics of the human gut microbiome in inflammatory bowel disease. Nat Microbiol. 2017 Feb 13;2:17004. doi: 10.1038/nmicrobiol.2017.4.
- Lavelle A, Sokol H. Gut microbiota: Beyond metagenomics, metatranscriptomics illuminates microbiome functionality in IBD. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2018 Apr;15(4):193-194. doi: 10.1038/nrgastro.2018.15. Epub 2018 Feb 21. No abstract available.
- Knights D, Lassen KG, Xavier RJ. Advances in inflammatory bowel disease pathogenesis: linking host genetics and the microbiome. Gut. 2013 Oct;62(10):1505-10. doi: 10.1136/gutjnl-2012-303954.
- Moradkhani A, Beckman LJ, Tabibian JH. Health-related quality of life in inflammatory bowel disease: psychosocial, clinical, socioeconomic, and demographic predictors. J Crohns Colitis. 2013 Jul;7(6):467-73. doi: 10.1016/j.crohns.2012.07.012. Epub 2012 Aug 10.
- Nocerino A, Nguyen A, Agrawal M, Mone A, Lakhani K, Swaminath A. Fatigue in Inflammatory Bowel Diseases: Etiologies and Management. Adv Ther. 2020 Jan;37(1):97-112. doi: 10.1007/s12325-019-01151-w. Epub 2019 Nov 23.
- Graff LA, Walker JR, Lix L, Clara I, Rawsthorne P, Rogala L, Miller N, Jakul L, McPhail C, Ediger J, Bernstein CN. The relationship of inflammatory bowel disease type and activity to psychological functioning and quality of life. Clin Gastroenterol Hepatol. 2006 Dec;4(12):1491-1501. doi: 10.1016/j.cgh.2006.09.027.
- Bonaz BL, Bernstein CN. Brain-gut interactions in inflammatory bowel disease. Gastroenterology. 2013 Jan;144(1):36-49. doi: 10.1053/j.gastro.2012.10.003. Epub 2012 Oct 12.
- Szigethy E. Pain Management in Patients With Inflammatory Bowel Disease. Gastroenterol Hepatol (N Y). 2018 Jan;14(1):53-56. No abstract available.
- Hashash JG, Ramos-Rivers C, Youk A, Chiu WK, Duff K, Regueiro M, Binion DG, Koutroubakis I, Vachon A, Benhayon D, Dunn MA, Szigethy EM. Quality of Sleep and Coexistent Psychopathology Have Significant Impact on Fatigue Burden in Patients With Inflammatory Bowel Disease. J Clin Gastroenterol. 2018 May/Jun;52(5):423-430. doi: 10.1097/MCG.0000000000000729.
- Jones JL, Nguyen GC, Benchimol EI, Bernstein CN, Bitton A, Kaplan GG, Murthy SK, Lee K, Cooke-Lauder J, Otley AR. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Quality of Life. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S42-S48. doi: 10.1093/jcag/gwy048. Epub 2018 Nov 2.
- Kuenzig ME, Benchimol EI, Lee L, Targownik LE, Singh H, Kaplan GG, Bernstein CN, Bitton A, Nguyen GC, Lee K, Cooke-Lauder J, Murthy SK. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Direct Costs and Health Services Utilization. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S17-S33. doi: 10.1093/jcag/gwy055. Epub 2018 Nov 2.
- Kuenzig ME, Lee L, El-Matary W, Weizman AV, Benchimol EI, Kaplan GG, Nguyen GC, Bernstein CN, Bitton A, Lee K, Cooke-Lauder J, Murthy SK. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Indirect Costs of IBD Care. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S34-S41. doi: 10.1093/jcag/gwy050. Epub 2018 Nov 2.
- Cryan JF, O'Riordan KJ, Cowan CSM, Sandhu KV, Bastiaanssen TFS, Boehme M, Codagnone MG, Cussotto S, Fulling C, Golubeva AV, Guzzetta KE, Jaggar M, Long-Smith CM, Lyte JM, Martin JA, Molinero-Perez A, Moloney G, Morelli E, Morillas E, O'Connor R, Cruz-Pereira JS, Peterson VL, Rea K, Ritz NL, Sherwin E, Spichak S, Teichman EM, van de Wouw M, Ventura-Silva AP, Wallace-Fitzsimons SE, Hyland N, Clarke G, Dinan TG. The Microbiota-Gut-Brain Axis. Physiol Rev. 2019 Oct 1;99(4):1877-2013. doi: 10.1152/physrev.00018.2018.
- Somineni HK, Kugathasan S. The Microbiome in Patients With Inflammatory Diseases. Clin Gastroenterol Hepatol. 2019 Jan;17(2):243-255. doi: 10.1016/j.cgh.2018.08.078. Epub 2018 Sep 7.
- Ott SJ, Musfeldt M, Wenderoth DF, Hampe J, Brant O, Folsch UR, Timmis KN, Schreiber S. Reduction in diversity of the colonic mucosa associated bacterial microflora in patients with active inflammatory bowel disease. Gut. 2004 May;53(5):685-93. doi: 10.1136/gut.2003.025403.
- Pascal V, Pozuelo M, Borruel N, Casellas F, Campos D, Santiago A, Martinez X, Varela E, Sarrabayrouse G, Machiels K, Vermeire S, Sokol H, Guarner F, Manichanh C. A microbial signature for Crohn's disease. Gut. 2017 May;66(5):813-822. doi: 10.1136/gutjnl-2016-313235. Epub 2017 Feb 7.
- Guida F, Turco F, Iannotta M, De Gregorio D, Palumbo I, Sarnelli G, Furiano A, Napolitano F, Boccella S, Luongo L, Mazzitelli M, Usiello A, De Filippis F, Iannotti FA, Piscitelli F, Ercolini D, de Novellis V, Di Marzo V, Cuomo R, Maione S. Antibiotic-induced microbiota perturbation causes gut endocannabinoidome changes, hippocampal neuroglial reorganization and depression in mice. Brain Behav Immun. 2018 Jan;67:230-245. doi: 10.1016/j.bbi.2017.09.001. Epub 2017 Sep 7.
- Zheng P, Zeng B, Zhou C, Liu M, Fang Z, Xu X, Zeng L, Chen J, Fan S, Du X, Zhang X, Yang D, Yang Y, Meng H, Li W, Melgiri ND, Licinio J, Wei H, Xie P. Gut microbiome remodeling induces depressive-like behaviors through a pathway mediated by the host's metabolism. Mol Psychiatry. 2016 Jun;21(6):786-96. doi: 10.1038/mp.2016.44. Epub 2016 Apr 12.
- Mi GL, Zhao L, Qiao DD, Kang WQ, Tang MQ, Xu JK. Effectiveness of Lactobacillus reuteri in infantile colic and colicky induced maternal depression: a prospective single blind randomized trial. Antonie Van Leeuwenhoek. 2015 Jun;107(6):1547-53. doi: 10.1007/s10482-015-0448-9. Epub 2015 Apr 16.
- Cryan JF, Dinan TG. Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour. Nat Rev Neurosci. 2012 Oct;13(10):701-12. doi: 10.1038/nrn3346. Epub 2012 Sep 12.
- Bravo JA, Julio-Pieper M, Forsythe P, Kunze W, Dinan TG, Bienenstock J, Cryan JF. Communication between gastrointestinal bacteria and the nervous system. Curr Opin Pharmacol. 2012 Dec;12(6):667-72. doi: 10.1016/j.coph.2012.09.010. Epub 2012 Oct 4.
- Zhang M, Sun K, Wu Y, Yang Y, Tso P, Wu Z. Interactions between Intestinal Microbiota and Host Immune Response in Inflammatory Bowel Disease. Front Immunol. 2017 Aug 14;8:942. doi: 10.3389/fimmu.2017.00942. eCollection 2017.
- Collins SM. Interrogating the Gut-Brain Axis in the Context of Inflammatory Bowel Disease: A Translational Approach. Inflamm Bowel Dis. 2020 Mar 4;26(4):493-501. doi: 10.1093/ibd/izaa004.
- Thomann AK, Mak JWY, Zhang JW, Wuestenberg T, Ebert MP, Sung JJY, Bernstein CN, Reindl W, Ng SC. Review article: bugs, inflammation and mood-a microbiota-based approach to psychiatric symptoms in inflammatory bowel diseases. Aliment Pharmacol Ther. 2020 Jul;52(2):247-266. doi: 10.1111/apt.15787. Epub 2020 Jun 11.
- Capuron L, Miller AH. Immune system to brain signaling: neuropsychopharmacological implications. Pharmacol Ther. 2011 May;130(2):226-38. doi: 10.1016/j.pharmthera.2011.01.014. Epub 2011 Feb 17.
- D'Mello C, Swain MG. Liver-brain interactions in inflammatory liver diseases: implications for fatigue and mood disorders. Brain Behav Immun. 2014 Jan;35:9-20. doi: 10.1016/j.bbi.2013.10.009. Epub 2013 Oct 16.
- D'Mello C, Swain MG. Immune-to-Brain Communication Pathways in Inflammation-Associated Sickness and Depression. Curr Top Behav Neurosci. 2017;31:73-94. doi: 10.1007/7854_2016_37.
- D'Mello C, Riazi K, Le T, Stevens KM, Wang A, McKay DM, Pittman QJ, Swain MG. P-selectin-mediated monocyte-cerebral endothelium adhesive interactions link peripheral organ inflammation to sickness behaviors. J Neurosci. 2013 Sep 11;33(37):14878-88. doi: 10.1523/JNEUROSCI.1329-13.2013.
- Chu WM. Tumor necrosis factor. Cancer Lett. 2013 Jan 28;328(2):222-5. doi: 10.1016/j.canlet.2012.10.014. Epub 2012 Oct 22.
- Sedger LM, McDermott MF. TNF and TNF-receptors: From mediators of cell death and inflammation to therapeutic giants - past, present and future. Cytokine Growth Factor Rev. 2014 Aug;25(4):453-72. doi: 10.1016/j.cytogfr.2014.07.016. Epub 2014 Aug 1.
- Padmos RC, Hillegers MH, Knijff EM, Vonk R, Bouvy A, Staal FJ, de Ridder D, Kupka RW, Nolen WA, Drexhage HA. A discriminating messenger RNA signature for bipolar disorder formed by an aberrant expression of inflammatory genes in monocytes. Arch Gen Psychiatry. 2008 Apr;65(4):395-407. doi: 10.1001/archpsyc.65.4.395.
- Slebioda TJ, Kmiec Z. Tumour necrosis factor superfamily members in the pathogenesis of inflammatory bowel disease. Mediators Inflamm. 2014;2014:325129. doi: 10.1155/2014/325129. Epub 2014 Jun 17.
- Singh UP, Singh NP, Murphy EA, Price RL, Fayad R, Nagarkatti M, Nagarkatti PS. Chemokine and cytokine levels in inflammatory bowel disease patients. Cytokine. 2016 Jan;77:44-9. doi: 10.1016/j.cyto.2015.10.008. Epub 2015 Oct 29.
- Muzes G, Molnar B, Tulassay Z, Sipos F. Changes of the cytokine profile in inflammatory bowel diseases. World J Gastroenterol. 2012 Nov 7;18(41):5848-61. doi: 10.3748/wjg.v18.i41.5848.
- Lichtenstein GR. Comprehensive review: antitumor necrosis factor agents in inflammatory bowel disease and factors implicated in treatment response. Therap Adv Gastroenterol. 2013 Jul;6(4):269-93. doi: 10.1177/1756283X13479826.
- Gray MA, Chao CY, Staudacher HM, Kolosky NA, Talley NJ, Holtmann G. Anti-TNFalpha therapy in IBD alters brain activity reflecting visceral sensory function and cognitive-affective biases. PLoS One. 2018 Mar 8;13(3):e0193542. doi: 10.1371/journal.pone.0193542. eCollection 2018.
- Lichtenstein GR, Bala M, Han C, DeWoody K, Schaible T. Infliximab improves quality of life in patients with Crohn's disease. Inflamm Bowel Dis. 2002 Jul;8(4):237-43. doi: 10.1097/00054725-200207000-00001.
- Horst S, Chao A, Rosen M, Nohl A, Duley C, Wagnon JH, Beaulieu DB, Taylor W, Gaines L, Schwartz DA. Treatment with immunosuppressive therapy may improve depressive symptoms in patients with inflammatory bowel disease. Dig Dis Sci. 2015 Feb;60(2):465-70. doi: 10.1007/s10620-014-3375-0. Epub 2014 Oct 2.
- Stevens BW, Borren NZ, Velonias G, Conway G, Cleland T, Andrews E, Khalili H, Garber JG, Xavier RJ, Yajnik V, Ananthakrishnan AN. Vedolizumab Therapy Is Associated with an Improvement in Sleep Quality and Mood in Inflammatory Bowel Diseases. Dig Dis Sci. 2017 Jan;62(1):197-206. doi: 10.1007/s10620-016-4356-2. Epub 2016 Oct 28. Erratum In: Dig Dis Sci. 2017 Feb;62(2):552.
- Wang F, Lin X, Zhao Q, Li J. Adverse symptoms with anti-TNF-alpha therapy in inflammatory bowel disease: systematic review and duration-response meta-analysis. Eur J Clin Pharmacol. 2015 Aug;71(8):911-9. doi: 10.1007/s00228-015-1877-0. Epub 2015 May 30.
- Aden K, Rehman A, Waschina S, Pan WH, Walker A, Lucio M, Nunez AM, Bharti R, Zimmerman J, Bethge J, Schulte B, Schulte D, Franke A, Nikolaus S, Schroeder JO, Vandeputte D, Raes J, Szymczak S, Waetzig GH, Zeuner R, Schmitt-Kopplin P, Kaleta C, Schreiber S, Rosenstiel P. Metabolic Functions of Gut Microbes Associate With Efficacy of Tumor Necrosis Factor Antagonists in Patients With Inflammatory Bowel Diseases. Gastroenterology. 2019 Nov;157(5):1279-1292.e11. doi: 10.1053/j.gastro.2019.07.025. Epub 2019 Jul 18.
- Estevinho MM, Rocha C, Correia L, Lago P, Ministro P, Portela F, Trindade E, Afonso J, Peyrin-Biroulet L, Magro F; GEDII (Portuguese IBD Group). Features of Fecal and Colon Microbiomes Associate With Responses to Biologic Therapies for Inflammatory Bowel Diseases: A Systematic Review. Clin Gastroenterol Hepatol. 2020 May;18(5):1054-1069. doi: 10.1016/j.cgh.2019.08.063. Epub 2019 Sep 14.
- Kisler K, Nelson AR, Montagne A, Zlokovic BV. Cerebral blood flow regulation and neurovascular dysfunction in Alzheimer disease. Nat Rev Neurosci. 2017 Jul;18(7):419-434. doi: 10.1038/nrn.2017.48. Epub 2017 May 18.
- Correale J, Villa A. The blood-brain-barrier in multiple sclerosis: functional roles and therapeutic targeting. Autoimmunity. 2007 Mar;40(2):148-60. doi: 10.1080/08916930601183522.
- Rochfort KD, Collins LE, Murphy RP, Cummins PM. Downregulation of blood-brain barrier phenotype by proinflammatory cytokines involves NADPH oxidase-dependent ROS generation: consequences for interendothelial adherens and tight junctions. PLoS One. 2014 Jul 3;9(7):e101815. doi: 10.1371/journal.pone.0101815. eCollection 2014.
- Akopov S, Sercombe R, Seylaz J. Cerebrovascular reactivity: role of endothelium/platelet/leukocyte interactions. Cerebrovasc Brain Metab Rev. 1996 Spring;8(1):11-94.
- Tohidpour A, Morgun AV, Boitsova EB, Malinovskaya NA, Martynova GP, Khilazheva ED, Kopylevich NV, Gertsog GE, Salmina AB. Neuroinflammation and Infection: Molecular Mechanisms Associated with Dysfunction of Neurovascular Unit. Front Cell Infect Microbiol. 2017 Jun 20;7:276. doi: 10.3389/fcimb.2017.00276. eCollection 2017.
- Kerfoot SM, D'Mello C, Nguyen H, Ajuebor MN, Kubes P, Le T, Swain MG. TNF-alpha-secreting monocytes are recruited into the brain of cholestatic mice. Hepatology. 2006 Jan;43(1):154-62. doi: 10.1002/hep.21003.
- D'Mello C, Almishri W, Liu H, Swain MG. Interactions Between Platelets and Inflammatory Monocytes Affect Sickness Behavior in Mice With Liver Inflammation. Gastroenterology. 2017 Nov;153(5):1416-1428.e2. doi: 10.1053/j.gastro.2017.08.011. Epub 2017 Aug 9.
- Reinhard M, Rosengarten B, Kirchhoff L, Hetzel A, Rauer S. Natalizumab and regulation of cerebral blood flow: results from an observational study. Eur Neurol. 2010;64(2):124-8. doi: 10.1159/000316765. Epub 2010 Jul 22.
- Rutgeerts P, Sandborn WJ, Feagan BG, Reinisch W, Olson A, Johanns J, Travers S, Rachmilewitz D, Hanauer SB, Lichtenstein GR, de Villiers WJ, Present D, Sands BE, Colombel JF. Infliximab for induction and maintenance therapy for ulcerative colitis. N Engl J Med. 2005 Dec 8;353(23):2462-76. doi: 10.1056/NEJMoa050516. Erratum In: N Engl J Med. 2006 May 18;354(20):2200.
- Moskovitz DN, Daperno M, Van Assche GA, et al. Defining and validating cut-offs for the simple endoscopic score for Crohn's disease. Gastroenterology 2007;132:A173-A173.
- Limberg B. [Diagnosis of chronic inflammatory bowel disease by ultrasonography]. Z Gastroenterol. 1999 Jun;37(6):495-508. German.
- Walsham NE, Sherwood RA. Fecal calprotectin in inflammatory bowel disease. Clin Exp Gastroenterol. 2016 Jan 28;9:21-9. doi: 10.2147/CEG.S51902. eCollection 2016.
- Walmsley RS, Ayres RC, Pounder RE, Allan RN. A simple clinical colitis activity index. Gut. 1998 Jul;43(1):29-32. doi: 10.1136/gut.43.1.29.
- Harvey RF, Bradshaw JM. A simple index of Crohn's-disease activity. Lancet. 1980 Mar 8;1(8167):514. doi: 10.1016/s0140-6736(80)92767-1. No abstract available.
- Irvine EJ, Zhou Q, Thompson AK. The Short Inflammatory Bowel Disease Questionnaire: a quality of life instrument for community physicians managing inflammatory bowel disease. CCRPT Investigators. Canadian Crohn's Relapse Prevention Trial. Am J Gastroenterol. 1996 Aug;91(8):1571-8.
- Spiegel BM, Hays RD, Bolus R, Melmed GY, Chang L, Whitman C, Khanna PP, Paz SH, Hays T, Reise S, Khanna D. Development of the NIH Patient-Reported Outcomes Measurement Information System (PROMIS) gastrointestinal symptom scales. Am J Gastroenterol. 2014 Nov;109(11):1804-14. doi: 10.1038/ajg.2014.237. Epub 2014 Sep 9. Erratum In: Am J Gastroenterol. 2015 Apr;110(4):608.
- Mehling WE, Acree M, Stewart A, Silas J, Jones A. The Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness, Version 2 (MAIA-2). PLoS One. 2018 Dec 4;13(12):e0208034. doi: 10.1371/journal.pone.0208034. eCollection 2018.
- Osman A, Barrios FX, Gutierrez PM, Kopper BA, Merrifield T, Grittmann L. The Pain Catastrophizing Scale: further psychometric evaluation with adult samples. J Behav Med. 2000 Aug;23(4):351-65. doi: 10.1023/a:1005548801037.
- van Tilburg Bernardes E, Pettersen VK, Gutierrez MW, Laforest-Lapointe I, Jendzjowsky NG, Cavin JB, Vicentini FA, Keenan CM, Ramay HR, Samara J, MacNaughton WK, Wilson RJA, Kelly MM, McCoy KD, Sharkey KA, Arrieta MC. Intestinal fungi are causally implicated in microbiome assembly and immune development in mice. Nat Commun. 2020 May 22;11(1):2577. doi: 10.1038/s41467-020-16431-1.
- Arrieta MC, Arevalo A, Stiemsma L, Dimitriu P, Chico ME, Loor S, Vaca M, Boutin RCT, Morien E, Jin M, Turvey SE, Walter J, Parfrey LW, Cooper PJ, Finlay B. Associations between infant fungal and bacterial dysbiosis and childhood atopic wheeze in a nonindustrialized setting. J Allergy Clin Immunol. 2018 Aug;142(2):424-434.e10. doi: 10.1016/j.jaci.2017.08.041. Epub 2017 Dec 11.
- Tan Q, Zhang M, Wang Y, Zhang M, Wang Y, Xin Q, Wang B, Li Z. Frequency-specific functional connectivity revealed by wavelet-based coherence analysis in elderly subjects with cerebral infarction using NIRS method. Med Phys. 2015 Sep;42(9):5391-403. doi: 10.1118/1.4928672.
- Chang C, Glover GH. Time-frequency dynamics of resting-state brain connectivity measured with fMRI. Neuroimage. 2010 Mar;50(1):81-98. doi: 10.1016/j.neuroimage.2009.12.011. Epub 2009 Dec 16.
- Julien C. The enigma of Mayer waves: Facts and models. Cardiovasc Res. 2006 Apr 1;70(1):12-21. doi: 10.1016/j.cardiores.2005.11.008. Epub 2005 Dec 19.
- Birn RM, Diamond JB, Smith MA, Bandettini PA. Separating respiratory-variation-related fluctuations from neuronal-activity-related fluctuations in fMRI. Neuroimage. 2006 Jul 15;31(4):1536-48. doi: 10.1016/j.neuroimage.2006.02.048. Epub 2006 Apr 24.
- Wise RG, Ide K, Poulin MJ, Tracey I. Resting fluctuations in arterial carbon dioxide induce significant low frequency variations in BOLD signal. Neuroimage. 2004 Apr;21(4):1652-64. doi: 10.1016/j.neuroimage.2003.11.025.
- Gatto R, Hoffman W, Mueller M, Flores A, Valyi-Nagy T, Charbel FT. Frequency domain near-infrared spectroscopy technique in the assessment of brain oxygenation: a validation study in live subjects and cadavers. J Neurosci Methods. 2006 Oct 30;157(2):274-7. doi: 10.1016/j.jneumeth.2006.04.013. Epub 2006 May 24.
- Novak KL, Kaplan GG, Panaccione R, Afshar EE, Tanyingoh D, Swain M, Kellar A, Wilson S. A Simple Ultrasound Score for the Accurate Detection of Inflammatory Activity in Crohn's Disease. Inflamm Bowel Dis. 2017 Nov;23(11):2001-2010. doi: 10.1097/MIB.0000000000001174.
- WILCOXON F. Individual comparisons of grouped data by ranking methods. J Econ Entomol. 1946 Apr;39:269. doi: 10.1093/jee/39.2.269. No abstract available.
- Bartram AK, Lynch MD, Stearns JC, Moreno-Hagelsieb G, Neufeld JD. Generation of multimillion-sequence 16S rRNA gene libraries from complex microbial communities by assembling paired-end illumina reads. Appl Environ Microbiol. 2011 Jun;77(11):3846-52. doi: 10.1128/AEM.02772-10. Epub 2011 Apr 1. Erratum In: Appl Environ Microbiol. 2011 Aug;77(15):5569.
- Schloss PD, Westcott SL, Ryabin T, Hall JR, Hartmann M, Hollister EB, Lesniewski RA, Oakley BB, Parks DH, Robinson CJ, Sahl JW, Stres B, Thallinger GG, Van Horn DJ, Weber CF. Introducing mothur: open-source, platform-independent, community-supported software for describing and comparing microbial communities. Appl Environ Microbiol. 2009 Dec;75(23):7537-41. doi: 10.1128/AEM.01541-09. Epub 2009 Oct 2.
- DeSantis TZ, Hugenholtz P, Larsen N, Rojas M, Brodie EL, Keller K, Huber T, Dalevi D, Hu P, Andersen GL. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006 Jul;72(7):5069-72. doi: 10.1128/AEM.03006-05.
- McMurdie PJ, Holmes S. phyloseq: an R package for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data. PLoS One. 2013 Apr 22;8(4):e61217. doi: 10.1371/journal.pone.0061217. Print 2013.
- McMurdie PJ, Holmes S. Waste not, want not: why rarefying microbiome data is inadmissible. PLoS Comput Biol. 2014 Apr 3;10(4):e1003531. doi: 10.1371/journal.pcbi.1003531. eCollection 2014 Apr.
- Morgan XC, Tickle TL, Sokol H, Gevers D, Devaney KL, Ward DV, Reyes JA, Shah SA, LeLeiko N, Snapper SB, Bousvaros A, Korzenik J, Sands BE, Xavier RJ, Huttenhower C. Dysfunction of the intestinal microbiome in inflammatory bowel disease and treatment. Genome Biol. 2012 Apr 16;13(9):R79. doi: 10.1186/gb-2012-13-9-r79.
- B Sohn M, Li H. A GLM-based latent variable ordination method for microbiome samples. Biometrics. 2018 Jun;74(2):448-457. doi: 10.1111/biom.12775. Epub 2017 Oct 9.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (FORVENTES)
Primær fullføring (FORVENTES)
Studiet fullført (FORVENTES)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (FAKTISKE)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (FAKTISKE)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- REB20-1873
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .