- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT04733456
Hersenactiviteit en oxygenatie Patiënten met inflammatoire darmaandoeningen (IBD).
Evaluatie van hersenactiviteit en oxygenatie met behulp van nabij-infraroodspectroscopie (NIRS) bij patiënten met inflammatoire darmaandoeningen (IBD)
Studie Overzicht
Toestand
Gedetailleerde beschrijving
Hypothese Aandoeningen met acute systemische ontsteking zullen correleren met veranderingen in de kenmerken van het darmmicrobioom, verminderde cerebrale zuurstofverzadiging (StO2) en veranderde patronen van microvasculaire cerebrale bloedperfusie (zoals bepaald door nabij-infraroodspectroscopie NIRS).
Achtergrond De onderzoekers onderzoeken het vermogen van nabij-infraroodspectroscopie (NIRS) om veranderde hersenfunctie en oxygenatie te detecteren onder een reeks klinisch relevante medische aandoeningen.
NIRS maakt niet-invasieve meting van geoxygeneerde (O2Hb) en gedeoxygeneerde hemoglobine (HHb)-concentraties in corticaal hersenweefsel mogelijk. Daarom kan NIRS worden gebruikt om de zuurstofverzadiging van corticaal weefsel (StO2) te kwantificeren, die een veranderende stofwisseling en perfusie weerspiegelt. Bovendien kan functionele NIRS (fNIRS) worden gebruikt om de hersenactiviteit te meten op een vergelijkbare manier als functionele MRI, door aan te nemen dat de gemeten veranderingen in bloedperfusie en oxygenatie het gevolg zijn van functionele hyperemie (d.w.z. hemodynamische veranderingen veroorzaakt door neurale activiteit). Bij gebruik van NIRS bij patiënten is aangetoond dat veranderde patronen van hersenbloedperfusie en verminderde hersenoxygenatieniveaus correleren met vermoeidheid en verminderde cognitie, waardoor verminderde corticale perfusie wordt gekoppeld aan symptomen waarvan is gemeld dat ze optreden bij patiënten met IBD.
Strakke regulering van de cerebrale bloedstroom is van cruciaal belang om een normale zuurstofvoorziening en functie van de hersenen te garanderen. Cerebrovasculaire disfunctie en hypoxie zijn betrokken bij een reeks neurodegeneratieve en neuro-inflammatoire aandoeningen, waaronder de ziekte van Alzheimer en multiple sclerose (MS). In een recent onderzoek met fNIRS vonden de onderzoekers veranderde taakgerelateerde hemodynamische responsen en hersenhypoxie bij patiënten met de immuungemedieerde leverziekte, primaire biliaire cholangitis (PBC). Bovendien suggereert het experimentele werk bij muizen dat deze veranderingen het gevolg kunnen zijn van de werking van TNFα op de cerebrale vasculatuur. Het toonde ook aan dat patiënten met multiple sclerose een verminderde interhemisferische coherentie en hypoxie hadden. Deze waarnemingen leidden tot de vraag of algemene systemische ontsteking of interacties tussen hersenen en darmen kunnen worden gekoppeld aan abnormale hersenfunctie en hypoxie, zoals detecteerbaar door NIRS.
Deze hypothese wordt ondersteund door een recent NIRS-onderzoek door Fujiwara T et al bij patiënten met IBD. Ze toonden aan dat tijdens het uitvoeren van een taak de gemiddelde geoxygeneerde hemoglobineconcentratie significant lager was in de frontale kwab bij IBD-patiënten in vergelijking met gezonde controles. Veranderingen in hersenoxygenatie zijn echter niet eerder onderzocht tijdens rusttoestand of in de context van markers van perifere ontsteking, maatregelen voor kwaliteit van leven en symptoombelasting, of handtekeningen van het darmmicrobioom bij IBD-patiënten.
Deze momenteel voorgestelde substudie is bedoeld om patiënten met inflammatoire darmaandoeningen (IBD) te onderzoeken op hun niveau van hypoxie, functionele fNIRS-respons en fNIRS-coherentie.
IBD neemt wereldwijd toe in incidentie en prevalentie. Verschillende factoren zijn betrokken bij de ontwikkeling van IBD, waaronder een ontregelde immuunrespons op veranderde microbiota in een genetisch gevoelige gastheer die is blootgesteld aan opruiende omgevingsfactoren, maar de specifieke oorzaak van IBD blijft onbekend. Comorbide onaangepast gedrag en pijn komen veel voor bij patiënten met IBD20-26. Deze comorbiditeiten op het gebied van de geestelijke gezondheid bemoeilijken het beheer van IBD, hebben een negatieve invloed op de resultaten en de gezondheid van de patiënt en verhogen de belasting van de middelen voor het gezondheidszorgsysteem. Comorbide psychische problemen en symptomen bij IBD-patiënten worden echter slecht begrepen en onvoldoende behandeld, wat parallel loopt met de onvervulde behoeften aan geestelijke gezondheidszorg in de algemene Canadese bevolking. Daarom is een beter begrip van hoe hersenveranderingen optreden in verband met IBD, en hun potentiële rol bij de ontwikkeling van symptomen en de link met systemische ontsteking en handtekeningen in het darmmicrobioom, van groot belang om het beheer van deze patiënten te verbeteren.
Het maagdarmkanaal dient als een dynamisch en lokaal ecosysteem voor de darmmicrobiota. Dysbiose, een verandering van de microbiële samenstelling van de darm die bijdraagt aan de gastheerziekte, komt voor bij IBD-patiënten. In het bijzonder vertonen IBD-patiënten een lagere microbiële α-diversiteit en zijn ze verrijkt met verschillende groepen bacteriën in vergelijking met gezonde controles. Onlangs hebben preklinische, translationele en klinische studies aangetoond dat veranderingen in de structurele samenstelling of functie van het microbioom kunnen bijdragen aan de ontwikkeling van psychische aandoeningen, waaronder depressie-achtig gedrag, en dus een essentieel onderdeel is dat de darm-hersenas met elkaar verbindt. . In overeenstemming hiermee zijn er sterke correlaties geïdentificeerd tussen veranderingen in de darmmicrobiota en de ontwikkeling van chronische ontstekingsaandoeningen, zoals IBD, wat suggereert dat dysbiose een belangrijke factor is bij zowel gastro-intestinale stoornissen als geestelijke gezondheid. De precieze mechanismen waardoor darmdysbiose bij IBD het gedrag kan veranderen, blijven echter slecht begrepen.
Hoe perifere ontsteking, zoals die voorkomt bij IBD, leidt tot veranderingen op afstand in de hersenfunctie blijft onduidelijk en als gevolg daarvan zijn er klinisch beperkte therapeutische opties beschikbaar om dit probleem aan te pakken. Er zijn een aantal algemene routes beschreven die systemische ontsteking koppelen aan veranderingen in de hersenen, die op hun beurt aanleiding geven tot veranderd gedrag. Deze routes omvatten traditioneel signalering via neurale paden (voornamelijk afferenten van de nervus vagus) en immuunsignalering (voornamelijk via circulerende cytokines zoals TNFα, die ofwel rechtstreeks de hersenen binnendringen of cerebraal endotheel activeren). Onlangs beschreven onderzoekers van de Universiteit van Calgary een nieuwe ontstekingssignaleringsroute waarbij verhoogde perifere TNF-α-productie een verhoogde microgliale activering stimuleert, gevolgd door rekrutering van monocyten in hersenvasculatuur en hersenparenchym, wat op zijn beurt de ontwikkeling van ziektegedrag stimuleert. TNFα is een multifunctioneel cytokine dat een reeks effecten medieert die een directe invloed kunnen hebben op de hersenfunctie (via modulerende neurotransmissie) en de darm (bijv. die de doorlaatbaarheid van de darmbarrière beïnvloeden) en weefselontsteking moduleren (bijv. macrofagen activeren om cytokine- en chemokine-expressie te induceren). Verhoogde circulerende niveaus van TNFα en verhoogde productie door circulerende leukocyten worden vaak gedocumenteerd bij patiënten met chronische ontstekingsaandoeningen die gepaard gaan met een hoge prevalentie van ziektegedrag en stemmingsstoornissen, waaronder IBD. Daarom is blokkade van TNFα-signalering uitgebreid geëvalueerd in klinische onderzoeken naar IBD. Bovendien is verbetering van de symptomen door remming van TNFa-signalering vaak duidelijk bij behandelde patiënten met chronische ontstekingsziekten, voorafgaand aan openlijke veranderingen in ziekteactiviteit. Bij patiënten met IBD werd anti-TNFα-therapie geassocieerd met significante verbeteringen in slaap, depressie en angst vroeg na aanvang van de therapie, en deze verbeteringen hielden aan. Bovendien beoordeelde een andere studie het effect van anti-TNFα-therapie op interoceptieve signalering bij patiënten met de ziekte van Crohn en toonde vermindering van viscerale gevoeligheid en verbeterde cognitief-affectieve verwerking na anti-TNFα-toediening, parallel aan een verbeterd gevoel van welzijn. Veranderingen in cognitie waren gekoppeld aan veranderingen in neurale activiteit in prefrontale en limbische hersengebieden. Bovendien waren de waargenomen snelle gedrags- en neurale veranderingen niet geassocieerd met significante veranderingen in fecale calprotectinespiegels (marker van darmontsteking), wat suggereert dat het onwaarschijnlijk was dat ze verband hielden met een gelijktijdige vermindering van darmontsteking. Anti-TNFα-therapie verandert ook het darmmicrobioom bij patiënten met IBD. In het bijzonder verhoogde anti-TNFα-therapie bij IBD-patiënten de rijkdom aan microbiële soorten in de darm en de phylodiversiteit tot niveaus die vergelijkbaar zijn met die van gezonde controles. Bovendien verminderde anti-TNF-therapie de relatieve hoeveelheden pro-inflammatoire bacteriën Escherichia en Enterococcus bij IBD-patiënten, en nam het aantal geslachten toe die vetzuren met een korte keten produceren, die gevestigde ontstekingsremmende effecten in de darm hebben.
Gezonde cerebrale endotheelcellen (CEC's) zijn van cruciaal belang voor de regulering van de bloedstroom in de hersenen, evenals voor de normale functie van de bloed-hersenbarrière (BBB). Cytokines, waaronder TNFα, die afkomstig zijn uit het centrale zenuwstelsel of aanwezig zijn in de perifere bloedcirculatie, kunnen CEC-disfunctie veroorzaken en de doorlaatbaarheid van de BBB verhogen, waarvan bekend is dat deze geassocieerd is met veel neurologische aandoeningen, waaronder de ziekte van Alzheimer en MS, evenals perifere geïnduceerde neuro-inflammatie . CEC's die zijn blootgesteld aan TNFα brengen inderdaad minder interendotheliale eiwitten tot expressie en hebben een grotere vorming van reactieve zuurstofsoorten, wat leidt tot een verhoogde BBB-permeabiliteit. Bovendien kunnen CEC's worden geactiveerd door cytokines die in het bloed aanwezig zijn of vrijkomen door circulerende immuuncellen die in nauw contact staan met CEC's, om secundaire signaalmoleculen te produceren (bijv. hersenen om NVC-reacties te veranderen. In overeenstemming met deze suggestie werd in een muismodel van perifere ontsteking aangetoond dat geactiveerde monocyten in de cerebrale circulatie zich hechten aan CEC's en CEC-activering induceren via TNFα-TNF-receptor-1-interacties. Deze immuuncel en TNFα-aangedreven CEC-activering reguleert de induceerbare stikstofoxidesynthase-expressie binnen CEC's en was direct gekoppeld aan activering van microglia in de hersenen (vooral die cellen in de nabijheid van bloedvaten), en uiteindelijk aan veranderd gedrag. Deze eerdere bevindingen van deze groep bieden een mechanisme waardoor perifere ontsteking de functie van CEC's kan beïnvloeden, waardoor de cerebrovasculaire functie verandert. Het blokkeren van geactiveerde immuuncellen in de bloedsomloop om zich aan CEC's te hechten, verhoogt de taak-geïnduceerde corticale bloedstroom (d.w.z. NVC)66, wat suggereert dat immuuncel-CEC adhesieve interacties kunnen leiden tot neurovasculaire ontkoppeling. CEC's kunnen ook een essentiële rol spelen bij de regulatie van de cerebrale bloedstroom door de gladde spieren van het vat passief te laten ontspannen en samentrekken. Interessant is dat is aangetoond dat geactiveerde leukocyten endotheelcelafhankelijke vasospasticiteit bevorderen en arteriële relaxatie in vitro en in vivo verminderen. Verder wordt endotheelcelafhankelijke vasospasticiteit verhoogd in aanwezigheid van eiwitaggregaten in het bloed, wat het dynamische bereik van vasodilatatie effectief zou verminderen. Dit is vooral interessant gezien eerdere bevindingen dat perifere ontsteking leidt tot een verhoogde CEC-presentatie van het adhesiemolecuul P-selectine, dat op zijn beurt de adhesie van leukocyten en bloedplaatjes aan CEC's bevordert. Alles bij elkaar genomen suggereren deze bevindingen dat verhoogde leukocyten-CEC-interacties geassocieerd met perifere ontsteking aanzienlijk kunnen bijdragen aan veranderde cerebrovasculaire dynamiek en mogelijke neurovasculaire ontkoppeling in de setting van perifere ontstekingsziekte, die zich manifesteert als veranderde cerebrale oxygenatie.
Beschouwd in de context van neuro-inflammatie geassocieerd met chronische perifere ontsteking, kunnen veranderingen in corticale perfusie en oxygenatie, althans gedeeltelijk, bijdragen aan de gedragssymptomen geassocieerd met IBD en ziektegerelateerde reducties in gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven (QoL).
De IBD-kliniek test routinematig nieuwe behandelingen voor IBD. Ze zijn overeengekomen om NIRS te integreren in een pilotprotocol om te bepalen of er voldoende bewijs is om een langere proef met NIRS als biomarker van neurologische betrokkenheid bij IBD te rechtvaardigen.
De onderzoekers stellen de volgende reeks experimenten voor, met behulp van NIRS, om te bepalen (A) of patiënten met IBD een verminderde corticale zuurstofverzadiging en veranderde patronen van microvasculaire cerebrale bloedperfusie vertonen; (B) of NIRS-bevindingen van zuurstofverzadiging en -perfusie correleren met klinische ziekteactiviteitsmarkers, een ziektespecifieke handtekening van het darmmicrobioom en/of symptoom- en kwaliteit van leven-scores bij patiënten met IBD; (C) de impact van anti-TNF-therapie (toegediend zoals klinisch geïndiceerd, als standaardpraktijk) op NIRS-veranderingen, het fecale microbioom, markers van systemische ontsteking en de ernst van de symptomen.
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Mark G Swain, MD
- Telefoonnummer: 403-592-5010
- E-mail: swain@ucalgary.ca
Studie Contact Back-up
- Naam: Pam Crotty
- Telefoonnummer: 403-592-5076
- E-mail: pcrotty@ucalgary.ca
Studie Locaties
-
-
Alberta
-
Calgary, Alberta, Canada, T2N 4Z6
- Werving
- University of Calgary
-
Contact:
- Blessing Odia
- Telefoonnummer: 403-220-5782
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
In aanmerking komende patiënten zijn:
- > 18 jaar met matige tot ernstige CU of (partiële Mayo-score [exclusief endoscopie] ≥5 met subscore rectale bloeding ≥1; of totale Mayo-subscore 6-12 met RBS ≥1) of CD (Harvey-Bradshaw-index [ HBI] van 7 of hoger, en actieve CD bevestigd op POC-darmechografie (gedefinieerd door darmwanddikte > 3 mm en positief kleurendopplersignaal en een fecaal calprotectine > 50 μg/g).
- op basis van hun actieve ziektestatus kunnen patiënten niet > 20 mg prednison per dag innemen en
- moet in aanmerking komen voor anti-TNF-therapie volgens de zorgstandaard (klinische beslissing genomen door IBD-specialist die voor de patiënt zorgt).
Uitsluitingscriteria:
- patiënten met ernstig actieve CU (klinische tekenen van fulminante colitis of toxisch megacolon) of CD (HBI > 16), die > 20 mg prednison per dag nodig hebben bij inductie, zelfmoordgedachten of psychose.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
IBD-patiënten (UC en CD)
Deelnemers zullen een Mayo Clinic Score (UC) of HBI-score (CD), korte IBDQ73, *EQ5D-5L, *GAD-774, *PHQ-975, *PROMIS (Gastrointestinal Belly Pain), Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness (MAIA) invullen )77, *Pain Catastrophizing Scale, Pittsburg Sleep Quality Index (PSQI) en Fatigue Severity Scale (FSS) bij baseline en 16 weken na de start van anti-TNF-therapie (*vragenlijsten beschikbaar via de CIHR IMAGINE-subsidie). Ontlasting zal bij aanvang en na 16 weken worden verzameld voor beoordeling van de bekende biomarker fecale calprotectine, naast fecaal bacterieel en schimmelmicrobioom (via het International Microbiome Centre [IMC], U of C). Bij baseline en na 16 weken wordt bloed afgenomen en urine verzameld voor ontstekingsmarkers en metabolomische [IMC] analyse |
Mayo Clinic Score (UC) of HBI-score (CD), korte IBDQ73, *EQ5D-5L, *GAD-774, *PHQ-975, *PROMIS (Gastrointestinal Belly Pain), Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness (MAIA)77, * Pain Catastrophizing Scale, Pittsburg Sleep Quality Index (PSQI) en Fatigue Severity Scale (FSS) bij baseline en 16 weken na de start van anti-TNF-therapie
Een TechEn NIRSOptix continuous-wave fNIRS-systeem zal worden gebruikt om veranderingen in cerebrale oxygenatie vast te leggen, met een bemonsteringsfrequentie van 25 Hz
Voor beoordeling van de bekende biomarker fecaal calprotectine, naast fecaal bacterieel en schimmelmicrobioom
voor inflammatoire markers en metabolomische [IMC] analyse
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
a) Klinisch: CD (daling van >3 punten in de gemodificeerde Harvey-Bradshaw Index); UC (daling van> 2 punten in de gedeeltelijke Mayo-score)
Tijdsspanne: 16 weken
|
Definiëren van verschillen in veranderingen van de hersenen in rusttoestand NIRS-bevindingen die optreden bij IBD-patiënten, tussen baseline en 16 weken na het starten van anti-TNF-therapie, bij anti-TNF-responders vs. non-responders, gedefinieerd: a) Klinisch: CD (daling van >3 punten in de gemodificeerde Harvey-Bradshaw Index); UC (daling van> 2 punten in de gedeeltelijke Mayo-score) |
16 weken
|
|
b) Radiografisch: afname van de dikte van de darmwand ≥25% in het meest aangedane segment met 2 punten afname van de kleur Doppler-signaalscore of normalisatie
Tijdsspanne: 16 weken
|
Definiëren van verschillen in veranderingen van de hersenen in rusttoestand NIRS-bevindingen die optreden bij IBD-patiënten, tussen baseline en 16 weken na het starten van anti-TNF-therapie, bij anti-TNF-responders vs. non-responders, gedefinieerd: b) Radiografisch: afname van de dikte van de darmwand ≥25% in het meest aangedane segment met 2 punten afname van de kleur Doppler-signaalscore of normalisatie |
16 weken
|
|
c) Biomarker: afname van fecaal calprotectine >50% ten opzichte van baseline of ≤250 ug/g
Tijdsspanne: 16 weken
|
Definiëren van verschillen in veranderingen van de hersenen in rusttoestand NIRS-bevindingen die optreden bij IBD-patiënten, tussen baseline en 16 weken na het starten van anti-TNF-therapie, bij anti-TNF-responders vs. non-responders, gedefinieerd: c) Biomarker: afname van fecaal calprotectine >50% ten opzichte van baseline of ≤250 ug/g |
16 weken
|
|
d) Endoscopisch (waar beschikbaar): CD (afname in eenvoudige endoscopische score voor CD ≥50% ten opzichte van baseline); UC (afname van Mayo endoscopische subscore ≥1 punt vanaf baseline)
Tijdsspanne: 16 weken
|
Definiëren van verschillen in veranderingen van de hersenen in rusttoestand NIRS-bevindingen die optreden bij IBD-patiënten, tussen baseline en 16 weken na het starten van anti-TNF-therapie, bij anti-TNF-responders vs. non-responders, gedefinieerd: d) Endoscopisch (waar beschikbaar): CD (afname in eenvoudige endoscopische score voor CD ≥50% ten opzichte van baseline); UC (afname van Mayo endoscopische subscore ≥1 punt vanaf baseline) |
16 weken
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
(i) veranderingen in markers van de darm (gedefinieerd door echografie van de darm) en systemische ontsteking.
Tijdsspanne: 16 weken
|
Afbakenen of baseline hersen-NIRS-bevindingen en veranderingen in NIRS-bevindingen vanaf baseline tot 16 weken na het starten van anti-TNF-therapie, correleren met: (i) veranderingen in markers van de darm (gedefinieerd door echografie van de darm) en systemische ontsteking. |
16 weken
|
|
(ii) verlaging van de basislijnmeting van het fecale calprotectinegehalte.
Tijdsspanne: 16 weken
|
Afbakenen of baseline hersen-NIRS-bevindingen en veranderingen in NIRS-bevindingen vanaf baseline tot 16 weken na het starten van anti-TNF-therapie, correleren met: (ii) verlaging van de basislijnmeting van het fecale calprotectinegehalte. |
16 weken
|
|
(iii) specifieke kenmerken van het darmmicrobioom en metabolomics.
Tijdsspanne: 16 weken
|
Afbakenen of baseline hersen-NIRS-bevindingen en veranderingen in NIRS-bevindingen vanaf baseline tot 16 weken na het starten van anti-TNF-therapie, correleren met: (iii) specifieke kenmerken van het darmmicrobioom en metabolomics. |
16 weken
|
|
(iv) veranderingen in de ernst van de symptomen bij IBD-patiënten die reageren (gedefinieerd zoals hierboven) of niet reageren op anti-TNF-therapie.
Tijdsspanne: 16 weken
|
Afbakenen of baseline hersen-NIRS-bevindingen en veranderingen in NIRS-bevindingen vanaf baseline tot 16 weken na het starten van anti-TNF-therapie, correleren met: (iv) veranderingen in de ernst van de symptomen bij IBD-patiënten die reageren (gedefinieerd zoals hierboven) of niet reageren op anti-TNF-therapie. |
16 weken
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Mark Swain, MD, University of Calgary
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Fox MD, Raichle ME. Spontaneous fluctuations in brain activity observed with functional magnetic resonance imaging. Nat Rev Neurosci. 2007 Sep;8(9):700-11. doi: 10.1038/nrn2201.
- Kroenke K, Spitzer RL, Williams JB. The PHQ-9: validity of a brief depression severity measure. J Gen Intern Med. 2001 Sep;16(9):606-13. doi: 10.1046/j.1525-1497.2001.016009606.x.
- Spitzer RL, Kroenke K, Williams JB, Lowe B. A brief measure for assessing generalized anxiety disorder: the GAD-7. Arch Intern Med. 2006 May 22;166(10):1092-7. doi: 10.1001/archinte.166.10.1092.
- Buysse DJ, Reynolds CF 3rd, Monk TH, Berman SR, Kupfer DJ. The Pittsburgh Sleep Quality Index: a new instrument for psychiatric practice and research. Psychiatry Res. 1989 May;28(2):193-213. doi: 10.1016/0165-1781(89)90047-4.
- Ni J, Wu GD, Albenberg L, Tomov VT. Gut microbiota and IBD: causation or correlation? Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2017 Oct;14(10):573-584. doi: 10.1038/nrgastro.2017.88. Epub 2017 Jul 19.
- Love MI, Huber W, Anders S. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biol. 2014;15(12):550. doi: 10.1186/s13059-014-0550-8.
- Krupp LB, LaRocca NG, Muir-Nash J, Steinberg AD. The fatigue severity scale. Application to patients with multiple sclerosis and systemic lupus erythematosus. Arch Neurol. 1989 Oct;46(10):1121-3. doi: 10.1001/archneur.1989.00520460115022.
- Cohen J. A power primer. Psychol Bull. 1992 Jul;112(1):155-9. doi: 10.1037//0033-2909.112.1.155.
- Scholkmann F, Kleiser S, Metz AJ, Zimmermann R, Mata Pavia J, Wolf U, Wolf M. A review on continuous wave functional near-infrared spectroscopy and imaging instrumentation and methodology. Neuroimage. 2014 Jan 15;85 Pt 1:6-27. doi: 10.1016/j.neuroimage.2013.05.004. Epub 2013 May 16.
- Sokoloff L. Local cerebral energy metabolism: its relationships to local functional activity and blood flow. Ciba Found Symp. 1978 Mar;(56):171-97. doi: 10.1002/9780470720370.ch10.
- Nippert AR, Biesecker KR, Newman EA. Mechanisms Mediating Functional Hyperemia in the Brain. Neuroscientist. 2018 Feb;24(1):73-83. doi: 10.1177/1073858417703033. Epub 2017 Apr 12.
- Nippert AR, Mishra A, Newman EA. Keeping the Brain Well Fed: The Role of Capillaries and Arterioles in Orchestrating Functional Hyperemia. Neuron. 2018 Jul 25;99(2):248-250. doi: 10.1016/j.neuron.2018.07.011.
- Bu L, Zhang M, Li J, Li F, Liu H, Li Z. Effects of Sleep Deprivation on Phase Synchronization as Assessed by Wavelet Phase Coherence Analysis of Prefrontal Tissue Oxyhemoglobin Signals. PLoS One. 2017 Jan 3;12(1):e0169279. doi: 10.1371/journal.pone.0169279. eCollection 2017.
- Tarumi T, Dunsky DI, Khan MA, Liu J, Hill C, Armstrong K, Martin-Cook K, Cullum CM, Zhang R. Dynamic cerebral autoregulation and tissue oxygenation in amnestic mild cognitive impairment. J Alzheimers Dis. 2014;41(3):765-78. doi: 10.3233/JAD-132018.
- Uemura K, Shimada H, Doi T, Makizako H, Tsutsumimoto K, Park H, Suzuki T. Reduced prefrontal oxygenation in mild cognitive impairment during memory retrieval. Int J Geriatr Psychiatry. 2016 Jun;31(6):583-91. doi: 10.1002/gps.4363. Epub 2015 Sep 21.
- Shang J, Yamashita T, Zhai Y, Nakano Y, Morihara R, Fukui Y, Hishikawa N, Ohta Y, Abe K. Strong Impact of Chronic Cerebral Hypoperfusion on Neurovascular Unit, Cerebrovascular Remodeling, and Neurovascular Trophic Coupling in Alzheimer's Disease Model Mouse. J Alzheimers Dis. 2016 Mar 5;52(1):113-26. doi: 10.3233/JAD-151126.
- Yang R, Dunn JF. Reduced cortical microvascular oxygenation in multiple sclerosis: a blinded, case-controlled study using a novel quantitative near-infrared spectroscopy method. Sci Rep. 2015 Nov 13;5:16477. doi: 10.1038/srep16477.
- Duszynski CC, Avati V, Lapointe AP, Scholkmann F, Dunn JF, Swain MG. Near-Infrared Spectroscopy Reveals Brain Hypoxia and Cerebrovascular Dysregulation in Primary Biliary Cholangitis. Hepatology. 2020 Apr;71(4):1408-1420. doi: 10.1002/hep.30920. Epub 2019 Dec 31.
- D'Mello C, Le T, Swain MG. Cerebral microglia recruit monocytes into the brain in response to tumor necrosis factoralpha signaling during peripheral organ inflammation. J Neurosci. 2009 Feb 18;29(7):2089-102. doi: 10.1523/JNEUROSCI.3567-08.2009.
- Fujiwara T, Kono S, Katakura K, Abe K, Takahashi A, Gunji N, Yokokawa A, Kawashima K, Suzuki R, Wada A, Miura I, Yabe H, Ohira H. Evaluation of Brain Activity Using Near-infrared Spectroscopy in Inflammatory Bowel Disease Patients. Sci Rep. 2018 Jan 10;8(1):402. doi: 10.1038/s41598-017-18897-4.
- Kaplan GG. The global burden of IBD: from 2015 to 2025. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2015 Dec;12(12):720-7. doi: 10.1038/nrgastro.2015.150. Epub 2015 Sep 1.
- Kaplan GG, Bernstein CN, Coward S, Bitton A, Murthy SK, Nguyen GC, Lee K, Cooke-Lauder J, Benchimol EI. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Epidemiology. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S6-S16. doi: 10.1093/jcag/gwy054. Epub 2018 Nov 2.
- Khor B, Gardet A, Xavier RJ. Genetics and pathogenesis of inflammatory bowel disease. Nature. 2011 Jun 15;474(7351):307-17. doi: 10.1038/nature10209.
- Halfvarson J, Brislawn CJ, Lamendella R, Vazquez-Baeza Y, Walters WA, Bramer LM, D'Amato M, Bonfiglio F, McDonald D, Gonzalez A, McClure EE, Dunklebarger MF, Knight R, Jansson JK. Dynamics of the human gut microbiome in inflammatory bowel disease. Nat Microbiol. 2017 Feb 13;2:17004. doi: 10.1038/nmicrobiol.2017.4.
- Lavelle A, Sokol H. Gut microbiota: Beyond metagenomics, metatranscriptomics illuminates microbiome functionality in IBD. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2018 Apr;15(4):193-194. doi: 10.1038/nrgastro.2018.15. Epub 2018 Feb 21. No abstract available.
- Knights D, Lassen KG, Xavier RJ. Advances in inflammatory bowel disease pathogenesis: linking host genetics and the microbiome. Gut. 2013 Oct;62(10):1505-10. doi: 10.1136/gutjnl-2012-303954.
- Moradkhani A, Beckman LJ, Tabibian JH. Health-related quality of life in inflammatory bowel disease: psychosocial, clinical, socioeconomic, and demographic predictors. J Crohns Colitis. 2013 Jul;7(6):467-73. doi: 10.1016/j.crohns.2012.07.012. Epub 2012 Aug 10.
- Nocerino A, Nguyen A, Agrawal M, Mone A, Lakhani K, Swaminath A. Fatigue in Inflammatory Bowel Diseases: Etiologies and Management. Adv Ther. 2020 Jan;37(1):97-112. doi: 10.1007/s12325-019-01151-w. Epub 2019 Nov 23.
- Graff LA, Walker JR, Lix L, Clara I, Rawsthorne P, Rogala L, Miller N, Jakul L, McPhail C, Ediger J, Bernstein CN. The relationship of inflammatory bowel disease type and activity to psychological functioning and quality of life. Clin Gastroenterol Hepatol. 2006 Dec;4(12):1491-1501. doi: 10.1016/j.cgh.2006.09.027.
- Bonaz BL, Bernstein CN. Brain-gut interactions in inflammatory bowel disease. Gastroenterology. 2013 Jan;144(1):36-49. doi: 10.1053/j.gastro.2012.10.003. Epub 2012 Oct 12.
- Szigethy E. Pain Management in Patients With Inflammatory Bowel Disease. Gastroenterol Hepatol (N Y). 2018 Jan;14(1):53-56. No abstract available.
- Hashash JG, Ramos-Rivers C, Youk A, Chiu WK, Duff K, Regueiro M, Binion DG, Koutroubakis I, Vachon A, Benhayon D, Dunn MA, Szigethy EM. Quality of Sleep and Coexistent Psychopathology Have Significant Impact on Fatigue Burden in Patients With Inflammatory Bowel Disease. J Clin Gastroenterol. 2018 May/Jun;52(5):423-430. doi: 10.1097/MCG.0000000000000729.
- Jones JL, Nguyen GC, Benchimol EI, Bernstein CN, Bitton A, Kaplan GG, Murthy SK, Lee K, Cooke-Lauder J, Otley AR. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Quality of Life. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S42-S48. doi: 10.1093/jcag/gwy048. Epub 2018 Nov 2.
- Kuenzig ME, Benchimol EI, Lee L, Targownik LE, Singh H, Kaplan GG, Bernstein CN, Bitton A, Nguyen GC, Lee K, Cooke-Lauder J, Murthy SK. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Direct Costs and Health Services Utilization. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S17-S33. doi: 10.1093/jcag/gwy055. Epub 2018 Nov 2.
- Kuenzig ME, Lee L, El-Matary W, Weizman AV, Benchimol EI, Kaplan GG, Nguyen GC, Bernstein CN, Bitton A, Lee K, Cooke-Lauder J, Murthy SK. The Impact of Inflammatory Bowel Disease in Canada 2018: Indirect Costs of IBD Care. J Can Assoc Gastroenterol. 2019 Feb;2(Suppl 1):S34-S41. doi: 10.1093/jcag/gwy050. Epub 2018 Nov 2.
- Cryan JF, O'Riordan KJ, Cowan CSM, Sandhu KV, Bastiaanssen TFS, Boehme M, Codagnone MG, Cussotto S, Fulling C, Golubeva AV, Guzzetta KE, Jaggar M, Long-Smith CM, Lyte JM, Martin JA, Molinero-Perez A, Moloney G, Morelli E, Morillas E, O'Connor R, Cruz-Pereira JS, Peterson VL, Rea K, Ritz NL, Sherwin E, Spichak S, Teichman EM, van de Wouw M, Ventura-Silva AP, Wallace-Fitzsimons SE, Hyland N, Clarke G, Dinan TG. The Microbiota-Gut-Brain Axis. Physiol Rev. 2019 Oct 1;99(4):1877-2013. doi: 10.1152/physrev.00018.2018.
- Somineni HK, Kugathasan S. The Microbiome in Patients With Inflammatory Diseases. Clin Gastroenterol Hepatol. 2019 Jan;17(2):243-255. doi: 10.1016/j.cgh.2018.08.078. Epub 2018 Sep 7.
- Ott SJ, Musfeldt M, Wenderoth DF, Hampe J, Brant O, Folsch UR, Timmis KN, Schreiber S. Reduction in diversity of the colonic mucosa associated bacterial microflora in patients with active inflammatory bowel disease. Gut. 2004 May;53(5):685-93. doi: 10.1136/gut.2003.025403.
- Pascal V, Pozuelo M, Borruel N, Casellas F, Campos D, Santiago A, Martinez X, Varela E, Sarrabayrouse G, Machiels K, Vermeire S, Sokol H, Guarner F, Manichanh C. A microbial signature for Crohn's disease. Gut. 2017 May;66(5):813-822. doi: 10.1136/gutjnl-2016-313235. Epub 2017 Feb 7.
- Guida F, Turco F, Iannotta M, De Gregorio D, Palumbo I, Sarnelli G, Furiano A, Napolitano F, Boccella S, Luongo L, Mazzitelli M, Usiello A, De Filippis F, Iannotti FA, Piscitelli F, Ercolini D, de Novellis V, Di Marzo V, Cuomo R, Maione S. Antibiotic-induced microbiota perturbation causes gut endocannabinoidome changes, hippocampal neuroglial reorganization and depression in mice. Brain Behav Immun. 2018 Jan;67:230-245. doi: 10.1016/j.bbi.2017.09.001. Epub 2017 Sep 7.
- Zheng P, Zeng B, Zhou C, Liu M, Fang Z, Xu X, Zeng L, Chen J, Fan S, Du X, Zhang X, Yang D, Yang Y, Meng H, Li W, Melgiri ND, Licinio J, Wei H, Xie P. Gut microbiome remodeling induces depressive-like behaviors through a pathway mediated by the host's metabolism. Mol Psychiatry. 2016 Jun;21(6):786-96. doi: 10.1038/mp.2016.44. Epub 2016 Apr 12.
- Mi GL, Zhao L, Qiao DD, Kang WQ, Tang MQ, Xu JK. Effectiveness of Lactobacillus reuteri in infantile colic and colicky induced maternal depression: a prospective single blind randomized trial. Antonie Van Leeuwenhoek. 2015 Jun;107(6):1547-53. doi: 10.1007/s10482-015-0448-9. Epub 2015 Apr 16.
- Cryan JF, Dinan TG. Mind-altering microorganisms: the impact of the gut microbiota on brain and behaviour. Nat Rev Neurosci. 2012 Oct;13(10):701-12. doi: 10.1038/nrn3346. Epub 2012 Sep 12.
- Bravo JA, Julio-Pieper M, Forsythe P, Kunze W, Dinan TG, Bienenstock J, Cryan JF. Communication between gastrointestinal bacteria and the nervous system. Curr Opin Pharmacol. 2012 Dec;12(6):667-72. doi: 10.1016/j.coph.2012.09.010. Epub 2012 Oct 4.
- Zhang M, Sun K, Wu Y, Yang Y, Tso P, Wu Z. Interactions between Intestinal Microbiota and Host Immune Response in Inflammatory Bowel Disease. Front Immunol. 2017 Aug 14;8:942. doi: 10.3389/fimmu.2017.00942. eCollection 2017.
- Collins SM. Interrogating the Gut-Brain Axis in the Context of Inflammatory Bowel Disease: A Translational Approach. Inflamm Bowel Dis. 2020 Mar 4;26(4):493-501. doi: 10.1093/ibd/izaa004.
- Thomann AK, Mak JWY, Zhang JW, Wuestenberg T, Ebert MP, Sung JJY, Bernstein CN, Reindl W, Ng SC. Review article: bugs, inflammation and mood-a microbiota-based approach to psychiatric symptoms in inflammatory bowel diseases. Aliment Pharmacol Ther. 2020 Jul;52(2):247-266. doi: 10.1111/apt.15787. Epub 2020 Jun 11.
- Capuron L, Miller AH. Immune system to brain signaling: neuropsychopharmacological implications. Pharmacol Ther. 2011 May;130(2):226-38. doi: 10.1016/j.pharmthera.2011.01.014. Epub 2011 Feb 17.
- D'Mello C, Swain MG. Liver-brain interactions in inflammatory liver diseases: implications for fatigue and mood disorders. Brain Behav Immun. 2014 Jan;35:9-20. doi: 10.1016/j.bbi.2013.10.009. Epub 2013 Oct 16.
- D'Mello C, Swain MG. Immune-to-Brain Communication Pathways in Inflammation-Associated Sickness and Depression. Curr Top Behav Neurosci. 2017;31:73-94. doi: 10.1007/7854_2016_37.
- D'Mello C, Riazi K, Le T, Stevens KM, Wang A, McKay DM, Pittman QJ, Swain MG. P-selectin-mediated monocyte-cerebral endothelium adhesive interactions link peripheral organ inflammation to sickness behaviors. J Neurosci. 2013 Sep 11;33(37):14878-88. doi: 10.1523/JNEUROSCI.1329-13.2013.
- Chu WM. Tumor necrosis factor. Cancer Lett. 2013 Jan 28;328(2):222-5. doi: 10.1016/j.canlet.2012.10.014. Epub 2012 Oct 22.
- Sedger LM, McDermott MF. TNF and TNF-receptors: From mediators of cell death and inflammation to therapeutic giants - past, present and future. Cytokine Growth Factor Rev. 2014 Aug;25(4):453-72. doi: 10.1016/j.cytogfr.2014.07.016. Epub 2014 Aug 1.
- Padmos RC, Hillegers MH, Knijff EM, Vonk R, Bouvy A, Staal FJ, de Ridder D, Kupka RW, Nolen WA, Drexhage HA. A discriminating messenger RNA signature for bipolar disorder formed by an aberrant expression of inflammatory genes in monocytes. Arch Gen Psychiatry. 2008 Apr;65(4):395-407. doi: 10.1001/archpsyc.65.4.395.
- Slebioda TJ, Kmiec Z. Tumour necrosis factor superfamily members in the pathogenesis of inflammatory bowel disease. Mediators Inflamm. 2014;2014:325129. doi: 10.1155/2014/325129. Epub 2014 Jun 17.
- Singh UP, Singh NP, Murphy EA, Price RL, Fayad R, Nagarkatti M, Nagarkatti PS. Chemokine and cytokine levels in inflammatory bowel disease patients. Cytokine. 2016 Jan;77:44-9. doi: 10.1016/j.cyto.2015.10.008. Epub 2015 Oct 29.
- Muzes G, Molnar B, Tulassay Z, Sipos F. Changes of the cytokine profile in inflammatory bowel diseases. World J Gastroenterol. 2012 Nov 7;18(41):5848-61. doi: 10.3748/wjg.v18.i41.5848.
- Lichtenstein GR. Comprehensive review: antitumor necrosis factor agents in inflammatory bowel disease and factors implicated in treatment response. Therap Adv Gastroenterol. 2013 Jul;6(4):269-93. doi: 10.1177/1756283X13479826.
- Gray MA, Chao CY, Staudacher HM, Kolosky NA, Talley NJ, Holtmann G. Anti-TNFalpha therapy in IBD alters brain activity reflecting visceral sensory function and cognitive-affective biases. PLoS One. 2018 Mar 8;13(3):e0193542. doi: 10.1371/journal.pone.0193542. eCollection 2018.
- Lichtenstein GR, Bala M, Han C, DeWoody K, Schaible T. Infliximab improves quality of life in patients with Crohn's disease. Inflamm Bowel Dis. 2002 Jul;8(4):237-43. doi: 10.1097/00054725-200207000-00001.
- Horst S, Chao A, Rosen M, Nohl A, Duley C, Wagnon JH, Beaulieu DB, Taylor W, Gaines L, Schwartz DA. Treatment with immunosuppressive therapy may improve depressive symptoms in patients with inflammatory bowel disease. Dig Dis Sci. 2015 Feb;60(2):465-70. doi: 10.1007/s10620-014-3375-0. Epub 2014 Oct 2.
- Stevens BW, Borren NZ, Velonias G, Conway G, Cleland T, Andrews E, Khalili H, Garber JG, Xavier RJ, Yajnik V, Ananthakrishnan AN. Vedolizumab Therapy Is Associated with an Improvement in Sleep Quality and Mood in Inflammatory Bowel Diseases. Dig Dis Sci. 2017 Jan;62(1):197-206. doi: 10.1007/s10620-016-4356-2. Epub 2016 Oct 28. Erratum In: Dig Dis Sci. 2017 Feb;62(2):552.
- Wang F, Lin X, Zhao Q, Li J. Adverse symptoms with anti-TNF-alpha therapy in inflammatory bowel disease: systematic review and duration-response meta-analysis. Eur J Clin Pharmacol. 2015 Aug;71(8):911-9. doi: 10.1007/s00228-015-1877-0. Epub 2015 May 30.
- Aden K, Rehman A, Waschina S, Pan WH, Walker A, Lucio M, Nunez AM, Bharti R, Zimmerman J, Bethge J, Schulte B, Schulte D, Franke A, Nikolaus S, Schroeder JO, Vandeputte D, Raes J, Szymczak S, Waetzig GH, Zeuner R, Schmitt-Kopplin P, Kaleta C, Schreiber S, Rosenstiel P. Metabolic Functions of Gut Microbes Associate With Efficacy of Tumor Necrosis Factor Antagonists in Patients With Inflammatory Bowel Diseases. Gastroenterology. 2019 Nov;157(5):1279-1292.e11. doi: 10.1053/j.gastro.2019.07.025. Epub 2019 Jul 18.
- Estevinho MM, Rocha C, Correia L, Lago P, Ministro P, Portela F, Trindade E, Afonso J, Peyrin-Biroulet L, Magro F; GEDII (Portuguese IBD Group). Features of Fecal and Colon Microbiomes Associate With Responses to Biologic Therapies for Inflammatory Bowel Diseases: A Systematic Review. Clin Gastroenterol Hepatol. 2020 May;18(5):1054-1069. doi: 10.1016/j.cgh.2019.08.063. Epub 2019 Sep 14.
- Kisler K, Nelson AR, Montagne A, Zlokovic BV. Cerebral blood flow regulation and neurovascular dysfunction in Alzheimer disease. Nat Rev Neurosci. 2017 Jul;18(7):419-434. doi: 10.1038/nrn.2017.48. Epub 2017 May 18.
- Correale J, Villa A. The blood-brain-barrier in multiple sclerosis: functional roles and therapeutic targeting. Autoimmunity. 2007 Mar;40(2):148-60. doi: 10.1080/08916930601183522.
- Rochfort KD, Collins LE, Murphy RP, Cummins PM. Downregulation of blood-brain barrier phenotype by proinflammatory cytokines involves NADPH oxidase-dependent ROS generation: consequences for interendothelial adherens and tight junctions. PLoS One. 2014 Jul 3;9(7):e101815. doi: 10.1371/journal.pone.0101815. eCollection 2014.
- Akopov S, Sercombe R, Seylaz J. Cerebrovascular reactivity: role of endothelium/platelet/leukocyte interactions. Cerebrovasc Brain Metab Rev. 1996 Spring;8(1):11-94.
- Tohidpour A, Morgun AV, Boitsova EB, Malinovskaya NA, Martynova GP, Khilazheva ED, Kopylevich NV, Gertsog GE, Salmina AB. Neuroinflammation and Infection: Molecular Mechanisms Associated with Dysfunction of Neurovascular Unit. Front Cell Infect Microbiol. 2017 Jun 20;7:276. doi: 10.3389/fcimb.2017.00276. eCollection 2017.
- Kerfoot SM, D'Mello C, Nguyen H, Ajuebor MN, Kubes P, Le T, Swain MG. TNF-alpha-secreting monocytes are recruited into the brain of cholestatic mice. Hepatology. 2006 Jan;43(1):154-62. doi: 10.1002/hep.21003.
- D'Mello C, Almishri W, Liu H, Swain MG. Interactions Between Platelets and Inflammatory Monocytes Affect Sickness Behavior in Mice With Liver Inflammation. Gastroenterology. 2017 Nov;153(5):1416-1428.e2. doi: 10.1053/j.gastro.2017.08.011. Epub 2017 Aug 9.
- Reinhard M, Rosengarten B, Kirchhoff L, Hetzel A, Rauer S. Natalizumab and regulation of cerebral blood flow: results from an observational study. Eur Neurol. 2010;64(2):124-8. doi: 10.1159/000316765. Epub 2010 Jul 22.
- Rutgeerts P, Sandborn WJ, Feagan BG, Reinisch W, Olson A, Johanns J, Travers S, Rachmilewitz D, Hanauer SB, Lichtenstein GR, de Villiers WJ, Present D, Sands BE, Colombel JF. Infliximab for induction and maintenance therapy for ulcerative colitis. N Engl J Med. 2005 Dec 8;353(23):2462-76. doi: 10.1056/NEJMoa050516. Erratum In: N Engl J Med. 2006 May 18;354(20):2200.
- Moskovitz DN, Daperno M, Van Assche GA, et al. Defining and validating cut-offs for the simple endoscopic score for Crohn's disease. Gastroenterology 2007;132:A173-A173.
- Limberg B. [Diagnosis of chronic inflammatory bowel disease by ultrasonography]. Z Gastroenterol. 1999 Jun;37(6):495-508. German.
- Walsham NE, Sherwood RA. Fecal calprotectin in inflammatory bowel disease. Clin Exp Gastroenterol. 2016 Jan 28;9:21-9. doi: 10.2147/CEG.S51902. eCollection 2016.
- Walmsley RS, Ayres RC, Pounder RE, Allan RN. A simple clinical colitis activity index. Gut. 1998 Jul;43(1):29-32. doi: 10.1136/gut.43.1.29.
- Harvey RF, Bradshaw JM. A simple index of Crohn's-disease activity. Lancet. 1980 Mar 8;1(8167):514. doi: 10.1016/s0140-6736(80)92767-1. No abstract available.
- Irvine EJ, Zhou Q, Thompson AK. The Short Inflammatory Bowel Disease Questionnaire: a quality of life instrument for community physicians managing inflammatory bowel disease. CCRPT Investigators. Canadian Crohn's Relapse Prevention Trial. Am J Gastroenterol. 1996 Aug;91(8):1571-8.
- Spiegel BM, Hays RD, Bolus R, Melmed GY, Chang L, Whitman C, Khanna PP, Paz SH, Hays T, Reise S, Khanna D. Development of the NIH Patient-Reported Outcomes Measurement Information System (PROMIS) gastrointestinal symptom scales. Am J Gastroenterol. 2014 Nov;109(11):1804-14. doi: 10.1038/ajg.2014.237. Epub 2014 Sep 9. Erratum In: Am J Gastroenterol. 2015 Apr;110(4):608.
- Mehling WE, Acree M, Stewart A, Silas J, Jones A. The Multidimensional Assessment of Interoceptive Awareness, Version 2 (MAIA-2). PLoS One. 2018 Dec 4;13(12):e0208034. doi: 10.1371/journal.pone.0208034. eCollection 2018.
- Osman A, Barrios FX, Gutierrez PM, Kopper BA, Merrifield T, Grittmann L. The Pain Catastrophizing Scale: further psychometric evaluation with adult samples. J Behav Med. 2000 Aug;23(4):351-65. doi: 10.1023/a:1005548801037.
- van Tilburg Bernardes E, Pettersen VK, Gutierrez MW, Laforest-Lapointe I, Jendzjowsky NG, Cavin JB, Vicentini FA, Keenan CM, Ramay HR, Samara J, MacNaughton WK, Wilson RJA, Kelly MM, McCoy KD, Sharkey KA, Arrieta MC. Intestinal fungi are causally implicated in microbiome assembly and immune development in mice. Nat Commun. 2020 May 22;11(1):2577. doi: 10.1038/s41467-020-16431-1.
- Arrieta MC, Arevalo A, Stiemsma L, Dimitriu P, Chico ME, Loor S, Vaca M, Boutin RCT, Morien E, Jin M, Turvey SE, Walter J, Parfrey LW, Cooper PJ, Finlay B. Associations between infant fungal and bacterial dysbiosis and childhood atopic wheeze in a nonindustrialized setting. J Allergy Clin Immunol. 2018 Aug;142(2):424-434.e10. doi: 10.1016/j.jaci.2017.08.041. Epub 2017 Dec 11.
- Tan Q, Zhang M, Wang Y, Zhang M, Wang Y, Xin Q, Wang B, Li Z. Frequency-specific functional connectivity revealed by wavelet-based coherence analysis in elderly subjects with cerebral infarction using NIRS method. Med Phys. 2015 Sep;42(9):5391-403. doi: 10.1118/1.4928672.
- Chang C, Glover GH. Time-frequency dynamics of resting-state brain connectivity measured with fMRI. Neuroimage. 2010 Mar;50(1):81-98. doi: 10.1016/j.neuroimage.2009.12.011. Epub 2009 Dec 16.
- Julien C. The enigma of Mayer waves: Facts and models. Cardiovasc Res. 2006 Apr 1;70(1):12-21. doi: 10.1016/j.cardiores.2005.11.008. Epub 2005 Dec 19.
- Birn RM, Diamond JB, Smith MA, Bandettini PA. Separating respiratory-variation-related fluctuations from neuronal-activity-related fluctuations in fMRI. Neuroimage. 2006 Jul 15;31(4):1536-48. doi: 10.1016/j.neuroimage.2006.02.048. Epub 2006 Apr 24.
- Wise RG, Ide K, Poulin MJ, Tracey I. Resting fluctuations in arterial carbon dioxide induce significant low frequency variations in BOLD signal. Neuroimage. 2004 Apr;21(4):1652-64. doi: 10.1016/j.neuroimage.2003.11.025.
- Gatto R, Hoffman W, Mueller M, Flores A, Valyi-Nagy T, Charbel FT. Frequency domain near-infrared spectroscopy technique in the assessment of brain oxygenation: a validation study in live subjects and cadavers. J Neurosci Methods. 2006 Oct 30;157(2):274-7. doi: 10.1016/j.jneumeth.2006.04.013. Epub 2006 May 24.
- Novak KL, Kaplan GG, Panaccione R, Afshar EE, Tanyingoh D, Swain M, Kellar A, Wilson S. A Simple Ultrasound Score for the Accurate Detection of Inflammatory Activity in Crohn's Disease. Inflamm Bowel Dis. 2017 Nov;23(11):2001-2010. doi: 10.1097/MIB.0000000000001174.
- WILCOXON F. Individual comparisons of grouped data by ranking methods. J Econ Entomol. 1946 Apr;39:269. doi: 10.1093/jee/39.2.269. No abstract available.
- Bartram AK, Lynch MD, Stearns JC, Moreno-Hagelsieb G, Neufeld JD. Generation of multimillion-sequence 16S rRNA gene libraries from complex microbial communities by assembling paired-end illumina reads. Appl Environ Microbiol. 2011 Jun;77(11):3846-52. doi: 10.1128/AEM.02772-10. Epub 2011 Apr 1. Erratum In: Appl Environ Microbiol. 2011 Aug;77(15):5569.
- Schloss PD, Westcott SL, Ryabin T, Hall JR, Hartmann M, Hollister EB, Lesniewski RA, Oakley BB, Parks DH, Robinson CJ, Sahl JW, Stres B, Thallinger GG, Van Horn DJ, Weber CF. Introducing mothur: open-source, platform-independent, community-supported software for describing and comparing microbial communities. Appl Environ Microbiol. 2009 Dec;75(23):7537-41. doi: 10.1128/AEM.01541-09. Epub 2009 Oct 2.
- DeSantis TZ, Hugenholtz P, Larsen N, Rojas M, Brodie EL, Keller K, Huber T, Dalevi D, Hu P, Andersen GL. Greengenes, a chimera-checked 16S rRNA gene database and workbench compatible with ARB. Appl Environ Microbiol. 2006 Jul;72(7):5069-72. doi: 10.1128/AEM.03006-05.
- McMurdie PJ, Holmes S. phyloseq: an R package for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data. PLoS One. 2013 Apr 22;8(4):e61217. doi: 10.1371/journal.pone.0061217. Print 2013.
- McMurdie PJ, Holmes S. Waste not, want not: why rarefying microbiome data is inadmissible. PLoS Comput Biol. 2014 Apr 3;10(4):e1003531. doi: 10.1371/journal.pcbi.1003531. eCollection 2014 Apr.
- Morgan XC, Tickle TL, Sokol H, Gevers D, Devaney KL, Ward DV, Reyes JA, Shah SA, LeLeiko N, Snapper SB, Bousvaros A, Korzenik J, Sands BE, Xavier RJ, Huttenhower C. Dysfunction of the intestinal microbiome in inflammatory bowel disease and treatment. Genome Biol. 2012 Apr 16;13(9):R79. doi: 10.1186/gb-2012-13-9-r79.
- B Sohn M, Li H. A GLM-based latent variable ordination method for microbiome samples. Biometrics. 2018 Jun;74(2):448-457. doi: 10.1111/biom.12775. Epub 2017 Oct 9.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (VERWACHT)
Primaire voltooiing (VERWACHT)
Studie voltooiing (VERWACHT)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (WERKELIJK)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (WERKELIJK)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- REB20-1873
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .