Pankreatit - mikrobiom som prediktor för svårighetsgrad (P-MAPS)

Denna prospektiva translationsstudie syftar till att utvärdera den orointestinala mikrobiomet som en potentiell biomarkör för förloppet, svårighetsgraden och resultatet hos patienter med akut pankreatit. Från varje patient tas en buckal och rektal pinne in inom 72 timmar efter sjukhusinläggning. Mikrobiell sammansättning kommer att bestämmas av 16S och metagenomics Oxford Nanopore Sequencing (ONT) och korreleras med den reviderade Atlanta-klassificeringen som primär endpoint. Sekundära endpoints är korrelationen av mikrobiomsignaturer med sjukhusvistelsens längd, antal ingrepp och dödlighet. För detta ändamål bestäms alfa- och betadiversiteten av mikrobiota och jämförs mellan mild, måttligt svår och svår akut pankreatit.