Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

NCCR AntiResist:: Nya metoder för att bekämpa antibiotikaresistenta bakterier (AntiResist)

27 februari 2025 uppdaterad av: University Hospital, Basel, Switzerland

NCCR AntiResist: Monocenterstudie för att identifiera nya tillvägagångssätt för att bekämpa antibiotikaresistenta bakterier.

Detta är en explorativ, mono-center studie som inkluderar prospektivt insamlade patientprover från universitetssjukhuset i Basel. Den ska undersöka antimikrobiell resistens (AMR) inklusive tre kliniska manifestationer av infektionssjukdomar: urinvägsinfektion, lunginflammation och djupt sittande infektioner. Fokus ligger på fyra bakterier (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) som ingår i Världshälsoorganisationens (WHO) högprioriterade lista. Resterande patientprover analyseras för proteomisk, metabolomisk och transkriptomisk analys, immuncytokemisk eller fluorescens in-situ hybridisering (FISH) analys, flödescytometrianalys (FACS) och immunfenotypning och utforskning av bakteriella egenskaper.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

National Center of Competence in Research (NCCR) AntiResist syftar till att använda patientprover för att undersöka fysiologin hos bakteriella patogener hos mänskliga patienter och etablera ett unikt multidisciplinärt nätverk av kliniker, biologer, ingenjörer, kemister, beräkningsforskare och läkemedelsutvecklare.

Målet med detta projekt är att belysa de fysiologiska egenskaperna hos bakteriella patogener hos infekterade mänskliga patienter för att tillhandahålla nya sätt att bekämpa superbugs. Dessa kliniska data kommer att användas för att vägleda och jämföra utvecklingen av patienthärmare och in vitro-modeller, påskynda sökandet efter nya bakteriella mål, antibakteriella föreningar och icke-konventionella strategier.

I detalj kommer fokus att ligga på tre kliniska manifestationer av infektionssjukdomar orsakade av fyra kritiska bakteriella patogener som tillhör WHO:s lista över "prioriterade patogener": E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus och P. aeruginosa:

A) Urinvägsinfektion B) Lunginflammation C) Djupliggande infektioner D) Kontroller för A), B) och C) E) Kliniska kontroller för A), B) och C) utan erhållna prover F) Analys om tillämpningen av art. . 34 HFV (Weiterverwendung biologischen Materials und/oder gesundheitsbezogener Personendaten für die Forschung bei fehlender Einwilligung und Information) kan undvika en partiskhet.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Beräknad)

8000

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studera Kontakt Backup

  • Namn: Christoph Dehio, Prof.

Studieorter

  • Schweiz
      • Basel, Schweiz, 4031
        • Rekrytering
        • University Hospital Basel
        • Kontakt:
        • Kontakt:
        • Huvudutredare:
          • Nina Khanna, Prof.
        • Underutredare:
          • Richard Kühl, Dr.
        • Underutredare:
          • Adrian Egli, Prof.
        • Underutredare:
          • Christoph Dehio, Prof.
        • Underutredare:
          • Mario Morgenstern, PD
        • Underutredare:
          • Martin Siegemund, Prof.
        • Underutredare:
          • Daiana Stolz, Prof.
        • Underutredare:
          • Sarah Tschudin Sutter, Prof.
        • Underutredare:
          • Bram Stieltjes, Dr.
        • Underutredare:
          • Dirk Buman, Prof.
        • Underutredare:
          • Urs Jenal, Prof.

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år och äldre (Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Ja

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Patientprover under rutininsamling på universitetssjukhuset i Basel från november 2020 till ungefär december 2024.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Patienter med bekräftad (i) urinvägsinfektion, (ii) lunginflammation (inklusive patienter efter lungtransplantation, cystisk fibros) eller (iii) djupt sittande infektion med fokuspatogen:

    • E coli
    • Klebsiella art
    • S. aureus
    • P. aeruginosa
  • Kontroller: inga detekterbara bakterier i rutinmikrobiologilaboratoriet och ingen annan infektionsplats vid inkludering av provet och uppföljning i 10 dagar, undertecknat allmänt medgivande

  • Kliniska kontroller utan erhållna prover, men med bekräftad (i) urinvägsinfektion, (ii) lunginflammation (inklusive patienter efter lungtransplantation, cystisk fibros) eller (iii) djupt sittande infektion med fokuspatogen:

    • E coli
    • Klebsiella art
    • S. aureus
    • P. aeruginosa

Exklusions kriterier:

  • Patienter som har vägrat forskning och återanvändning av sina data/prover (t.ex. allmänt samtycke) eller någon annan avvisning (t.ex. Patientensverfügung).
  • annat än en av fokusbakterierna i rutinmikrobiologilabbet
  • Ålder: <18 år
  • Kontroller utan undertecknat allmänt samtycke

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
A) Urinvägsinfektion
Bearbetning av resturin för proteomisk, metabolomisk och transkriptomisk analys, immuncytokemisk eller fluorescens in-situ hybridiseringsanalys (FISH), flödescytometrianalys (FACS), immunfenotypning. Om positivt för målbakterier: prov lagras i biobank. Vid tidigare antibiotikabehandling: plasmaprovförvaring. Utforskning av bakteriella egenskaper (högkänslig masspektrometri, helgenomsekvensering), uttryck av virulensfaktorer, genomiska förändringar av bakteriearter, metabolism, ytmolekyluttryck, genuttrycksnivåer, cytokinnivåer, immuncellsbiologi, antibiotikakoncentration (kromatografi/masspektrometri). ). Demografiska, kliniska, mikrobiologiska, laboratorie-, epidemiologiska och sjukhusrelaterade data kommer att analyseras. 500 prover per målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) ingår. Först görs en pilotstudie från slumpmässigt utvalda patienter inom varje bakterieartgrupp (n=50, vardera).
Övrig: analys av antimikrobiell resistens

I prover från patienter infekterade med en av fokuspatogenerna (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) kommer att vara:

(i) isolerade och patogena bakterier karakteriserade; (ii) patogener in situ-egenskaper vid encells- och bulkmedelvärde bestämt; (iii) mänskliga metaboliter, proteiner och celler bestäms (iv) bestäms antibiotikakoncentration (v) bakteriell tillväxt övervakas

Avdraget från uppgifterna kommer att vara:

  1. relevanta mänskliga komponenter och patogenegenskaper som är gemensamma för de flesta patienter med liknande indikation
  2. underliggande regulatoriska nätverk och triggers i patogena celler och mänskliga vävnader.

Kliniska utfall (överlevnad/dödlighet) och behandlingssvar (svar eller misslyckande) kommer att korreleras med in vitro-inhämtade värd- och bakteriedata.
B) Lunginflammation
Bearbetning av restprover (trakeal sekretion, bronkioalveolär sköljning (BAL)) för proteomisk, metabolomisk, transkriptomisk och cytologisk analys. Om positivt för målbakterier: prov lagras i biobank. Vid tidigare antibiotikabehandling: plasmaprovförvaring. Utforskning av bakteriella egenskaper. Demografiska, kliniska, mikrobiologiska, laboratorie-, epidemiologiska och sjukhusrelaterade data kommer att analyseras. 500 prover per målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) ingår.
Övrig: analys av antimikrobiell resistens

I prover från patienter infekterade med en av fokuspatogenerna (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) kommer att vara:

(i) isolerade och patogena bakterier karakteriserade; (ii) patogener in situ-egenskaper vid encells- och bulkmedelvärde bestämt; (iii) mänskliga metaboliter, proteiner och celler bestäms (iv) bestäms antibiotikakoncentration (v) bakteriell tillväxt övervakas

Avdraget från uppgifterna kommer att vara:

  1. relevanta mänskliga komponenter och patogenegenskaper som är gemensamma för de flesta patienter med liknande indikation
  2. underliggande regulatoriska nätverk och triggers i patogena celler och mänskliga vävnader.

Kliniska utfall (överlevnad/dödlighet) och behandlingssvar (svar eller misslyckande) kommer att korreleras med in vitro-inhämtade värd- och bakteriedata.
C) Djupt liggande infektioner
Bearbetning av intraoperativa materialrestprover för proteomisk, metabolomisk, transkriptomisk och cytologisk analys. Om positivt för målbakterier: prov lagras i biobank. Utforskning av bakteriella egenskaper. Demografiska, kliniska, mikrobiologiska, laboratorie-, epidemiologiska och sjukhusrelaterade data kommer att analyseras. 500 prover per målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) ingår.
Övrig: analys av antimikrobiell resistens

I prover från patienter infekterade med en av fokuspatogenerna (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) kommer att vara:

(i) isolerade och patogena bakterier karakteriserade; (ii) patogener in situ-egenskaper vid encells- och bulkmedelvärde bestämt; (iii) mänskliga metaboliter, proteiner och celler bestäms (iv) bestäms antibiotikakoncentration (v) bakteriell tillväxt övervakas

Avdraget från uppgifterna kommer att vara:

  1. relevanta mänskliga komponenter och patogenegenskaper som är gemensamma för de flesta patienter med liknande indikation
  2. underliggande regulatoriska nätverk och triggers i patogena celler och mänskliga vävnader.

Kliniska utfall (överlevnad/dödlighet) och behandlingssvar (svar eller misslyckande) kommer att korreleras med in vitro-inhämtade värd- och bakteriedata.
D) Kontroller för A), B) och C)
Kontrollprover kommer från patienter med en misstänkt infektion (infektionsställen A), B) eller C), där ingen mikrobiologisk bekräftad infektion har diagnostiserats. Förvaring på biobank
Övrig: analys av antimikrobiell resistens

I prover från patienter infekterade med en av fokuspatogenerna (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) kommer att vara:

(i) isolerade och patogena bakterier karakteriserade; (ii) patogener in situ-egenskaper vid encells- och bulkmedelvärde bestämt; (iii) mänskliga metaboliter, proteiner och celler bestäms (iv) bestäms antibiotikakoncentration (v) bakteriell tillväxt övervakas

Avdraget från uppgifterna kommer att vara:

  1. relevanta mänskliga komponenter och patogenegenskaper som är gemensamma för de flesta patienter med liknande indikation
  2. underliggande regulatoriska nätverk och triggers i patogena celler och mänskliga vävnader.

Kliniska utfall (överlevnad/dödlighet) och behandlingssvar (svar eller misslyckande) kommer att korreleras med in vitro-inhämtade värd- och bakteriedata.
E) Kliniska kontroller för A), B) och C) utan erhållna prover
För kliniska kontroller kommer kliniska egenskaper hos patienter med upptäckt av målpatogener i sina rutinprover (men som inte kunde inkluderas för provanalys i denna studie) att bedömas.
Övrig: analys av antimikrobiell resistens

I prover från patienter infekterade med en av fokuspatogenerna (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) kommer att vara:

(i) isolerade och patogena bakterier karakteriserade; (ii) patogener in situ-egenskaper vid encells- och bulkmedelvärde bestämt; (iii) mänskliga metaboliter, proteiner och celler bestäms (iv) bestäms antibiotikakoncentration (v) bakteriell tillväxt övervakas

Avdraget från uppgifterna kommer att vara:

  1. relevanta mänskliga komponenter och patogenegenskaper som är gemensamma för de flesta patienter med liknande indikation
  2. underliggande regulatoriska nätverk och triggers i patogena celler och mänskliga vävnader.

Kliniska utfall (överlevnad/dödlighet) och behandlingssvar (svar eller misslyckande) kommer att korreleras med in vitro-inhämtade värd- och bakteriedata.
F) Kohort med analys om tillämpningen av artikel (art) 34 HFV kan undvika en partiskhet
Eftersom en del av uppgifterna och proverna i denna studie samlas in med representativt samtycke från de etiska kommittéerna, utreds om tillämpningen av art. 34 HFV förhindrar selektionsbias med avseende på studiepopulationen. För detta ändamål, skillnader mellan den faktiska studiepopulationen med hjälp av art. 34 HFV och studiepopulationen med lämnat forskningssamtycke kommer att undersökas beskrivande i termer av förekomsten av multiresistenta bakterier och andra tillgängliga populationsegenskaper.
Övrig: analys av antimikrobiell resistens

I prover från patienter infekterade med en av fokuspatogenerna (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) kommer att vara:

(i) isolerade och patogena bakterier karakteriserade; (ii) patogener in situ-egenskaper vid encells- och bulkmedelvärde bestämt; (iii) mänskliga metaboliter, proteiner och celler bestäms (iv) bestäms antibiotikakoncentration (v) bakteriell tillväxt övervakas

Avdraget från uppgifterna kommer att vara:

  1. relevanta mänskliga komponenter och patogenegenskaper som är gemensamma för de flesta patienter med liknande indikation
  2. underliggande regulatoriska nätverk och triggers i patogena celler och mänskliga vävnader.

Kliniska utfall (överlevnad/dödlighet) och behandlingssvar (svar eller misslyckande) kommer att korreleras med in vitro-inhämtade värd- och bakteriedata.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Kliniskt utfall: överlevnadsgrad
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
Överlevnadshastighet (korrelerad till in vitro-hämtade värd- och bakteriedata. In vitro hämtade värd- och bakteriedata inkluderar: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histology, PCR/Microbial genome sequences, Mikrobiell transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-studier, fenotypiska karakteriseringar, molekylär typning, medfödd immunsvarskarakterisering, Antibiotikatoleranstestsystem, 3D-modeller, transkriptomik, flödescytometri (FACS))
engångsbedömning vid baslinjen
Kliniskt utfall: dödlighet
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
Dödlighet (korrelerad till in vitro hämtade värd- och bakteriedata. In vitro hämtade värd- och bakteriedata inkluderar: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histology, PCR/Microbial genome sequences, Mikrobiell transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-studier, fenotypiska karakteriseringar, molekylär typning, medfödd immunsvarskarakterisering, Antibiotikatoleranstestsystem, 3D-modeller, transkriptomik, flödescytometri (FACS))
engångsbedömning vid baslinjen
Behandlingssvar (binärt: ja/nej)
Tidsram: engångsbedömning vid baslinjen
Behandlingssvar (korrelerat till in vitro hämtade värd- och bakteriedata. In vitro hämtade värd- och bakteriedata inkluderar: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histology, PCR/Microbial genome sequences, Mikrobiell transkriptom, Antibiotikakoncentration, Timelapse-studier, fenotypiska karakteriseringar, molekylär typning, medfödd immunsvarskarakterisering, Antibiotikatoleranstestsystem, 3D-modeller, transkriptomik, flödescytometri (FACS))
engångsbedömning vid baslinjen

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Samarbetspartners

Swiss National Science Foundation

Utredare

  • Huvudutredare: Nina Khanna, Prof., University Hospital Basel, Division of Infectiology

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

3 december 2020

Primärt slutförande (Beräknad)

1 december 2028

Avslutad studie (Beräknad)

1 december 2028

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

26 juli 2021

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

18 augusti 2021

Första postat (Faktisk)

24 augusti 2021

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

25 mars 2025

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

27 februari 2025

Senast verifierad

1 februari 2025

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Nyckelord

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • 2020-02588; pe20Khanna

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera