Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

NCCR AntiResist:: nieuwe benaderingen om antibioticaresistente bacteriën te bestrijden (AntiResist)

27 februari 2025 bijgewerkt door: University Hospital, Basel, Switzerland

NCCR AntiResist: Mono-center studie om nieuwe benaderingen te identificeren om antibioticaresistente bacteriën te bestrijden.

Dit is een verkennend, monocentrisch onderzoek met prospectief verzamelde patiëntmonsters van het Universitair Ziekenhuis van Basel. Het is bedoeld om antimicrobiële resistentie (AMR) te onderzoeken, waaronder drie klinische manifestaties van infectieziekten: urineweginfectie, longontsteking en diepgewortelde infecties. De focus ligt op vier bacteriën (E. coli, Klebsiella species, S. aureus, P. aeruginosa) die deel uitmaken van de hoge prioriteitslijst van de Wereldgezondheidsorganisatie (WHO). Resterende patiëntmonsters worden geanalyseerd voor proteomische, metabolomische en transcriptomische analyse, immunocytochemische of fluorescentie in-situ hybridisatie (FISH) analyse, flowcytometrie-analyse (FACS) en immunofenotypering en verkenning van bacteriële eigenschappen.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

Het National Centre of Competence in Research (NCCR) AntiResist heeft tot doel monsters van patiënten te gebruiken om de fysiologie van bacteriële pathogenen bij menselijke patiënten te onderzoeken en een uniek multidisciplinair netwerk op te zetten van clinici, biologen, ingenieurs, chemici, computationele wetenschappers en medicijnontwikkelaars.

Het doel van dit project is om de fysiologische eigenschappen van bacteriële pathogenen bij geïnfecteerde menselijke patiënten op te helderen om nieuwe manieren te vinden om superbacteriën te bestrijden. Deze klinische gegevens zullen worden gebruikt om de ontwikkeling van patiënt-nabootsende en in-vitro-modellen te begeleiden en te benchmarken, om de zoektocht naar nieuwe bacteriële doelwitten, antibacteriële verbindingen en niet-conventionele strategieën te versnellen.

In detail zal de focus liggen op drie klinische manifestaties van infectieziekten veroorzaakt door vier kritische bacteriële pathogenen die behoren tot de WHO-lijst "prioritaire pathogenen": E. coli, Klebsiella-soorten, S. aureus en P. aeruginosa:

A) Urineweginfectie B) Longontsteking C) Diepgewortelde infecties D) Controles voor A), B) en C) E) Klinische controles voor A), B) en C) zonder verkregen stalen F) Analyse of de toepassing van art. . 34 HFV (Weiterverwendung biologischen Materials und/oder gesundheitsbezogener Personendaten für die Forschung bei fehlender Einwilligung und Information) kan een vooroordeel voorkomen.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

8000

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Contact Back-up

  • Naam: Christoph Dehio, Prof.

Studie Locaties

  • Zwitserland
      • Basel, Zwitserland, 4031
        • Werving
        • University Hospital Basel
        • Contact:
        • Contact:
        • Hoofdonderzoeker:
          • Nina Khanna, Prof.
        • Onderonderzoeker:
          • Richard Kühl, Dr.
        • Onderonderzoeker:
          • Adrian Egli, Prof.
        • Onderonderzoeker:
          • Christoph Dehio, Prof.
        • Onderonderzoeker:
          • Mario Morgenstern, PD
        • Onderonderzoeker:
          • Martin Siegemund, Prof.
        • Onderonderzoeker:
          • Daiana Stolz, Prof.
        • Onderonderzoeker:
          • Sarah Tschudin Sutter, Prof.
        • Onderonderzoeker:
          • Bram Stieltjes, Dr.
        • Onderonderzoeker:
          • Dirk Buman, Prof.
        • Onderonderzoeker:
          • Urs Jenal, Prof.

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar en ouder (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Ja

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Patiëntmonsters tijdens routinematige verzameling in het Universitair Ziekenhuis van Basel van november 2020 tot ongeveer december 2024.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Patiënten met bevestigde (i) urineweginfectie, (ii) longontsteking (inclusief patiënten na longtransplantatie, cystische fibrose) of (iii) diepgewortelde infectie met focuspathogeen:

    • E coli
    • Klebsiella-soorten
    • S. aureus
    • P. aeruginosa
  • Controles: geen detecteerbare bacteriën in routinematig microbiologisch laboratorium en geen andere infectieplaats bij opname van het monster en follow-up gedurende 10 dagen, ondertekende algemene toestemming

  • Klinische controles zonder verkregen monsters, maar met bevestigde (i) urineweginfectie, (ii) longontsteking (inclusief patiënten na longtransplantatie, cystische fibrose) of (iii) diepgewortelde infectie met focuspathogeen:

    • E coli
    • Klebsiella-soorten
    • S. aureus
    • P. aeruginosa

Uitsluitingscriteria:

  • Patiënten die onderzoek en hergebruik van hun data/monsters hebben geweigerd (bijv. algemene toestemming) of enige andere weigering (bijv. Patientenverfügung).
  • anders dan een van de focusbacteriën in het routinemicrobiologische laboratorium
  • Leeftijd: <18 jaar
  • Beheert zonder ondertekende algemene toestemming

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
A) Urineweginfectie
Verwerking van resturine voor proteomische, metabolomische en transcriptomische analyse, immunocytochemische of fluorescentie in-situ hybridisatie (FISH) analyse, flowcytometrie-analyse (FACS), immunofenotypering. Indien positief voor doelbacteriën: monster opgeslagen bij biobank. Bij eerdere behandeling met antibiotica: opslag van plasmamonsters. Verkenning van bacteriële eigenschappen (zeer gevoelige massaspectrometrie, sequentiebepaling van het hele genoom), expressie van virulentiefactoren, genomische veranderingen van bacteriesoorten, metabolisme, expressie van oppervlaktemoleculen, genexpressieniveaus, cytokineniveaus, immuuncelbiologie, antibioticumconcentratie (chromatografie/massaspectrometrie ). Demografische, klinische, microbiologische, laboratorium-, epidemiologische en ziekenhuisgegevens zullen worden geanalyseerd. 500 monsters per doelbacterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-soorten) inbegrepen. Eerst wordt een pilootstudie uitgevoerd bij willekeurig geselecteerde patiënten binnen elke bacteriesoortgroep (n=50, elk).
Ander: analyse van antimicrobiële resistentie

In monsters van patiënten die zijn geïnfecteerd met een van de focuspathogenen (E. coli, Klebsiella-soorten, S. aureus, P. aeruginosa) zijn:

(i) geïsoleerde en pathogene bacteriën gekarakteriseerd; (ii) pathogene in-situ-eigenschappen bij eencellige en bulkgemiddelde bepaald; (iii) humane metabolieten, eiwitten en cellen bepaald (iv) antibioticumconcentratie bepaald (v) bacteriegroei gevolgd

Van de gegevens wordt afgetrokken:

  1. relevante menselijke componenten en pathogene eigenschappen die de meeste patiënten met een vergelijkbare indicatie gemeen hebben
  2. onderliggende regulerende netwerken en triggers in pathogene cellen en menselijke weefsels.

Klinische uitkomsten (overleving/mortaliteit) en behandelingsrespons (respons of falen) zullen worden gecorreleerd met de in vitro verkregen gastheer- en bacteriële gegevens.
B) Longontsteking
Verwerking van restmonsters (tracheale secretie, bronchio-alveolaire lavage (BAL)) voor proteomische, metabolomische, transcriptomische en cytologische analyse. Indien positief voor doelbacteriën: monster opgeslagen bij biobank. Bij eerdere behandeling met antibiotica: opslag van plasmamonsters. Onderzoek naar bacteriële eigenschappen. Demografische, klinische, microbiologische, laboratorium-, epidemiologische en ziekenhuisgegevens zullen worden geanalyseerd. 500 monsters per doelbacterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-soorten) inbegrepen.
Ander: analyse van antimicrobiële resistentie

In monsters van patiënten die zijn geïnfecteerd met een van de focuspathogenen (E. coli, Klebsiella-soorten, S. aureus, P. aeruginosa) zijn:

(i) geïsoleerde en pathogene bacteriën gekarakteriseerd; (ii) pathogene in-situ-eigenschappen bij eencellige en bulkgemiddelde bepaald; (iii) humane metabolieten, eiwitten en cellen bepaald (iv) antibioticumconcentratie bepaald (v) bacteriegroei gevolgd

Van de gegevens wordt afgetrokken:

  1. relevante menselijke componenten en pathogene eigenschappen die de meeste patiënten met een vergelijkbare indicatie gemeen hebben
  2. onderliggende regulerende netwerken en triggers in pathogene cellen en menselijke weefsels.

Klinische uitkomsten (overleving/mortaliteit) en behandelingsrespons (respons of falen) zullen worden gecorreleerd met de in vitro verkregen gastheer- en bacteriële gegevens.
C) Diepgewortelde infecties
Verwerking van intraoperatieve materiaalresten voor proteomische, metabolomische, transcriptomische en cytologische analyse. Indien positief voor doelbacteriën: monster opgeslagen bij biobank. Onderzoek naar bacteriële eigenschappen. Demografische, klinische, microbiologische, laboratorium-, epidemiologische en ziekenhuisgegevens zullen worden geanalyseerd. 500 monsters per doelbacterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-soorten) inbegrepen.
Ander: analyse van antimicrobiële resistentie

In monsters van patiënten die zijn geïnfecteerd met een van de focuspathogenen (E. coli, Klebsiella-soorten, S. aureus, P. aeruginosa) zijn:

(i) geïsoleerde en pathogene bacteriën gekarakteriseerd; (ii) pathogene in-situ-eigenschappen bij eencellige en bulkgemiddelde bepaald; (iii) humane metabolieten, eiwitten en cellen bepaald (iv) antibioticumconcentratie bepaald (v) bacteriegroei gevolgd

Van de gegevens wordt afgetrokken:

  1. relevante menselijke componenten en pathogene eigenschappen die de meeste patiënten met een vergelijkbare indicatie gemeen hebben
  2. onderliggende regulerende netwerken en triggers in pathogene cellen en menselijke weefsels.

Klinische uitkomsten (overleving/mortaliteit) en behandelingsrespons (respons of falen) zullen worden gecorreleerd met de in vitro verkregen gastheer- en bacteriële gegevens.
D) Regelaars voor A), B) en C)
Controlemonsters zijn afkomstig van patiënten met een vermoedelijke infectie (infectieplaatsen A), B) of C), bij wie geen microbiologisch bevestigde infectie is vastgesteld. Opslag bij biobank
Ander: analyse van antimicrobiële resistentie

In monsters van patiënten die zijn geïnfecteerd met een van de focuspathogenen (E. coli, Klebsiella-soorten, S. aureus, P. aeruginosa) zijn:

(i) geïsoleerde en pathogene bacteriën gekarakteriseerd; (ii) pathogene in-situ-eigenschappen bij eencellige en bulkgemiddelde bepaald; (iii) humane metabolieten, eiwitten en cellen bepaald (iv) antibioticumconcentratie bepaald (v) bacteriegroei gevolgd

Van de gegevens wordt afgetrokken:

  1. relevante menselijke componenten en pathogene eigenschappen die de meeste patiënten met een vergelijkbare indicatie gemeen hebben
  2. onderliggende regulerende netwerken en triggers in pathogene cellen en menselijke weefsels.

Klinische uitkomsten (overleving/mortaliteit) en behandelingsrespons (respons of falen) zullen worden gecorreleerd met de in vitro verkregen gastheer- en bacteriële gegevens.
E) Klinische controles voor A), B) en C) zonder verkregen monsters
Voor klinische controles zullen de klinische kenmerken van patiënten met detectie van doelpathogenen in hun routinemonsters (maar die niet konden worden opgenomen voor monsteranalyse in dit onderzoek) worden beoordeeld.
Ander: analyse van antimicrobiële resistentie

In monsters van patiënten die zijn geïnfecteerd met een van de focuspathogenen (E. coli, Klebsiella-soorten, S. aureus, P. aeruginosa) zijn:

(i) geïsoleerde en pathogene bacteriën gekarakteriseerd; (ii) pathogene in-situ-eigenschappen bij eencellige en bulkgemiddelde bepaald; (iii) humane metabolieten, eiwitten en cellen bepaald (iv) antibioticumconcentratie bepaald (v) bacteriegroei gevolgd

Van de gegevens wordt afgetrokken:

  1. relevante menselijke componenten en pathogene eigenschappen die de meeste patiënten met een vergelijkbare indicatie gemeen hebben
  2. onderliggende regulerende netwerken en triggers in pathogene cellen en menselijke weefsels.

Klinische uitkomsten (overleving/mortaliteit) en behandelingsrespons (respons of falen) zullen worden gecorreleerd met de in vitro verkregen gastheer- en bacteriële gegevens.
F) Cohort met analyse of toepassing van artikel (Art) 34 HFV vertekening kan voorkomen
Aangezien een deel van de gegevens en steekproeven in deze studie wordt verzameld met de representatieve toestemming van de ethische commissies, wordt onderzocht of de toepassing van art. 34 HFV voorkomt selectiebias met betrekking tot de onderzoekspopulatie. Hierbij worden verschillen tussen de daadwerkelijke onderzoekspopulatie aan de hand van art. 34 HFV en de studiepopulatie waarvoor onderzoekstoestemming is verleend, zullen beschrijvend worden onderzocht in termen van de prevalentie van multiresistente ziektekiemen en andere beschikbare populatiekenmerken.
Ander: analyse van antimicrobiële resistentie

In monsters van patiënten die zijn geïnfecteerd met een van de focuspathogenen (E. coli, Klebsiella-soorten, S. aureus, P. aeruginosa) zijn:

(i) geïsoleerde en pathogene bacteriën gekarakteriseerd; (ii) pathogene in-situ-eigenschappen bij eencellige en bulkgemiddelde bepaald; (iii) humane metabolieten, eiwitten en cellen bepaald (iv) antibioticumconcentratie bepaald (v) bacteriegroei gevolgd

Van de gegevens wordt afgetrokken:

  1. relevante menselijke componenten en pathogene eigenschappen die de meeste patiënten met een vergelijkbare indicatie gemeen hebben
  2. onderliggende regulerende netwerken en triggers in pathogene cellen en menselijke weefsels.

Klinische uitkomsten (overleving/mortaliteit) en behandelingsrespons (respons of falen) zullen worden gecorreleerd met de in vitro verkregen gastheer- en bacteriële gegevens.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Klinische uitkomst: overlevingspercentage
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
Overlevingspercentage (gecorreleerd aan de in vitro opgehaalde gastheer- en bacteriële gegevens. In vitro opgehaalde gastheer- en bacteriegegevens omvatten: proteomica, metabolomica, FISH, histologie, PCR/microbiële genoomsequencing, microbieel transcriptoom, antibioticaconcentratie, timelapse-onderzoeken, fenotypische karakteriseringen, moleculaire typering, karakterisering van aangeboren immuunrespons, testen van antibioticatolerantie, microfluïdische systemen, 3D-modellen, Transcriptomics, Flowcytometrie (FACS))
eenmalige beoordeling bij baseline
Klinische uitkomst: sterftecijfer
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
Sterftecijfer (gecorreleerd met de in vitro opgehaalde gastheer- en bacteriële gegevens. In vitro opgehaalde gastheer- en bacteriegegevens omvatten: proteomica, metabolomica, FISH, histologie, PCR/microbiële genoomsequencing, microbieel transcriptoom, antibioticaconcentratie, timelapse-onderzoeken, fenotypische karakteriseringen, moleculaire typering, karakterisering van aangeboren immuunrespons, testen van antibioticatolerantie, microfluïdische systemen, 3D-modellen, Transcriptomics, Flowcytometrie (FACS))
eenmalige beoordeling bij baseline
Behandelingsrespons (binair: ja/nee)
Tijdsspanne: eenmalige beoordeling bij baseline
Behandelingsrespons (gecorreleerd met de in vitro opgehaalde gastheer- en bacteriële gegevens. In vitro opgehaalde gastheer- en bacteriegegevens omvatten: proteomica, metabolomica, FISH, histologie, PCR/microbiële genoomsequencing, microbieel transcriptoom, antibioticaconcentratie, timelapse-onderzoeken, fenotypische karakteriseringen, moleculaire typering, karakterisering van aangeboren immuunrespons, testen van antibioticatolerantie, microfluïdische systemen, 3D-modellen, Transcriptomics, Flowcytometrie (FACS))
eenmalige beoordeling bij baseline

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Medewerkers

Swiss National Science Foundation

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Nina Khanna, Prof., University Hospital Basel, Division of Infectiology

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

3 december 2020

Primaire voltooiing (Geschat)

1 december 2028

Studie voltooiing (Geschat)

1 december 2028

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

26 juli 2021

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

18 augustus 2021

Eerst geplaatst (Werkelijk)

24 augustus 2021

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

25 maart 2025

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

27 februari 2025

Laatst geverifieerd

1 februari 2025

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • 2020-02588; pe20Khanna

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren