Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

NCCR AntiResist:: Nové přístupy k boji proti bakteriím odolným vůči antibiotikům (AntiResist)

27. února 2025 aktualizováno: University Hospital, Basel, Switzerland

NCCR AntiResist: Monocentrická studie k identifikaci nových přístupů k boji proti bakteriím odolným vůči antibiotikům.

Toto je explorativní monocentrická studie zahrnující prospektivně odebrané vzorky pacientů z univerzitní nemocnice v Basileji. Má zkoumat antimikrobiální rezistenci (AMR) včetně tří klinických projevů infekčních onemocnění: infekce močových cest, zápal plic a hluboce uložené infekce. Důraz je kladen na čtyři bakterie (E. coli, Klebsiella species, S. aureus, P. aeruginosa), které jsou součástí seznamu s vysokou prioritou Světové zdravotnické organizace (WHO). Zbytkové vzorky pacientů jsou analyzovány pro proteomickou, metabolomickou a transkriptomickou analýzu, imunocytochemickou nebo fluorescenční in-situ hybridizační (FISH) analýzu, průtokovou cytometrickou analýzu (FACS) a imunofenotypizaci a zkoumání bakteriálních vlastností.

Přehled studie

Postavení

Nábor

Podmínky

Intervence / Léčba

Detailní popis

Národní centrum kompetence ve výzkumu (NCCR) AntiResist se zaměřuje na využití vzorků pacientů ke zkoumání fyziologie bakteriálních patogenů u lidských pacientů a vytvoření jedinečné multidisciplinární sítě klinických lékařů, biologů, inženýrů, chemiků, počítačových vědců a vývojářů léků.

Cílem tohoto projektu je objasnit fyziologické vlastnosti bakteriálních patogenů u infikovaných lidských pacientů s cílem poskytnout nové způsoby boje proti superbakteriím. Tato klinická data budou použita k vedení a srovnávání vývoje pacientů napodobujících a in-vitro modelů, urychlení hledání nových bakteriálních cílů, antibakteriálních sloučenin a nekonvenčních strategií.

Detailně se zaměříme na tři klinické projevy infekčních onemocnění způsobených čtyřmi kritickými bakteriálními patogeny patřícími do seznamu „prioritních patogenů“ WHO: E. coli, Klebsiella species, S. aureus a P. aeruginosa:

A) Infekce močových cest B) Pneumonie C) Hluboce uložené infekce D) Kontroly pro A), B) a C) E) Klinické kontroly pro A), B) a C) bez získaných vzorků F) Analýza, zda aplikace Čl. . 34 HFV (Weiterverwendung biologischen Materials und/oder gesundheitsbezogener Personendaten für die Forschung bei fehlender Einwilligung und Information) se může vyhnout zkreslení.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Odhadovaný)

8000

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

  • Jméno: Nina Khanna, Prof.
  • Telefonní číslo: +41 61 328 73 25
  • E-mail: nina.khanna@usb.ch

Studijní záloha kontaktů

  • Jméno: Christoph Dehio, Prof.

Studijní místa

  • Švýcarsko
      • Basel, Švýcarsko, 4031
        • Nábor
        • University Hospital Basel
        • Kontakt:
          • Nina Khanna, Prof. Dr. med.
          • Telefonní číslo: +41 61 328 73 25
          • E-mail: nina.khanna@usb.ch
        • Kontakt:
        • Vrchní vyšetřovatel:
          • Nina Khanna, Prof.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Richard Kühl, Dr.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Adrian Egli, Prof.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Christoph Dehio, Prof.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Mario Morgenstern, PD
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Martin Siegemund, Prof.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Daiana Stolz, Prof.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Sarah Tschudin Sutter, Prof.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Bram Stieltjes, Dr.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Dirk Buman, Prof.
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Urs Jenal, Prof.

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Vzorky pacientů během rutinního odběru v Univerzitní nemocnici v Basileji od listopadu 2020 do přibližně prosince 2024.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Pacienti s potvrzenou (i) infekcí močových cest, (ii) pneumonií (včetně pacientů po transplantaci plic, cystickou fibrózou) nebo (iii) hlubokou infekcí s ohniskovým patogenem:

    • E-coli
    • druh Klebsiella
    • S. aureus
    • P. aeruginosa
  • Kontroly: žádné detekovatelné bakterie v rutinní mikrobiologické laboratoři a žádné jiné místo infekce při zařazení vzorku a sledování po dobu 10 dnů, podepsaný všeobecný souhlas

  • Klinické kontroly bez odebraných vzorků, ale s potvrzenou (i) infekcí močových cest, (ii) pneumonií (včetně pacientů po transplantaci plic, cystickou fibrózou) nebo (iii) hlubokou infekcí s ohniskovým patogenem:

    • E-coli
    • druh Klebsiella
    • S. aureus
    • P. aeruginosa

Kritéria vyloučení:

  • Pacienti, kteří odmítli výzkum a opětovné použití svých dat/vzorků (např. obecný souhlas) nebo jakékoli jiné odmítnutí (např. Patientenverfügung).
  • jiná než jedna z ohniskových bakterií v rutinní mikrobiologické laboratoři
  • Věk: <18 let
  • Kontroly bez podepsaného obecného souhlasu

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
A) Infekce močových cest
Zpracování reziduální moči pro proteomickou, metabolomickou a transkriptomickou analýzu, imunocytochemickou nebo fluorescenční in-situ hybridizační (FISH) analýzu, průtokovou cytometrickou analýzu (FACS), imunofenotypizaci. Pokud je pozitivní na cílové bakterie: vzorek uložen v biobance. Při předchozí léčbě antibiotiky: uchování vzorku plazmy. Zkoumání bakteriálních vlastností (vysoce citlivá hmotnostní spektrometrie, sekvenování celého genomu), exprese faktorů virulence, genomové změny bakteriálních druhů, metabolismus, exprese povrchových molekul, hladiny genové exprese, hladiny cytokinů, biologie imunitních buněk, koncentrace antibiotik (chromatografie/hmotnostní spektrometrie ). Budou analyzovány demografické, klinické, mikrobiologické, laboratorní, epidemiologické a nemocniční údaje. Zahrnuto 500 vzorků na cílové bakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella species). Nejprve je provedena pilotní studie s náhodně vybranými pacienty v rámci každé skupiny bakteriálních druhů (n=50, každý).
Jiný: analýza antimikrobiální rezistence

Ve vzorcích od pacientů infikovaných jedním z ohniskových patogenů (E. coli, druhy Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) budou:

i) charakterizované izolované a patogenní bakterie; (ii) vlastnosti patogenu in-situ stanoveny v průměru jedné buňky a objemu; (iii) stanoveny lidské metabolity, proteiny a buňky (iv) stanovena koncentrace antibiotik (v) monitorován bakteriální růst

Z údajů bude odečteno:

  1. relevantní lidské složky a vlastnosti patogenu, které jsou společné většině pacientů s podobnou indikací
  2. základní regulační sítě a spouštěče v buňkách patogenů a lidských tkáních.

Klinické výsledky (přežití/úmrtnost) a odpověď na léčbu (reakce nebo selhání) budou korelovat s in vitro získanými údaji o hostiteli a bakteriích.
B) Zápal plic
Zpracování reziduálních vzorků (tracheální sekrece, bronchioalveolární laváž (BAL)) pro proteomickou, metabolomickou, transkriptomickou a cytologickou analýzu. Pokud je pozitivní na cílové bakterie: vzorek uložen v biobance. Při předchozí léčbě antibiotiky: uchování vzorku plazmy. Zkoumání vlastností bakterií. Budou analyzovány demografické, klinické, mikrobiologické, laboratorní, epidemiologické a nemocniční údaje. Zahrnuto 500 vzorků na cílové bakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella species).
Jiný: analýza antimikrobiální rezistence

Ve vzorcích od pacientů infikovaných jedním z ohniskových patogenů (E. coli, druhy Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) budou:

i) charakterizované izolované a patogenní bakterie; (ii) vlastnosti patogenu in-situ stanoveny v průměru jedné buňky a objemu; (iii) stanoveny lidské metabolity, proteiny a buňky (iv) stanovena koncentrace antibiotik (v) monitorován bakteriální růst

Z údajů bude odečteno:

  1. relevantní lidské složky a vlastnosti patogenu, které jsou společné většině pacientů s podobnou indikací
  2. základní regulační sítě a spouštěče v buňkách patogenů a lidských tkáních.

Klinické výsledky (přežití/úmrtnost) a odpověď na léčbu (reakce nebo selhání) budou korelovat s in vitro získanými údaji o hostiteli a bakteriích.
C) Hluboce uložené infekce
Zpracování intraoperačních materiálových reziduálních vzorků pro proteomickou, metabolomickou, transkriptomickou a cytologickou analýzu. Pokud je pozitivní na cílové bakterie: vzorek uložen v biobance. Zkoumání vlastností bakterií. Budou analyzovány demografické, klinické, mikrobiologické, laboratorní, epidemiologické a nemocniční údaje. Zahrnuto 500 vzorků na cílové bakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella species).
Jiný: analýza antimikrobiální rezistence

Ve vzorcích od pacientů infikovaných jedním z ohniskových patogenů (E. coli, druhy Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) budou:

i) charakterizované izolované a patogenní bakterie; (ii) vlastnosti patogenu in-situ stanoveny v průměru jedné buňky a objemu; (iii) stanoveny lidské metabolity, proteiny a buňky (iv) stanovena koncentrace antibiotik (v) monitorován bakteriální růst

Z údajů bude odečteno:

  1. relevantní lidské složky a vlastnosti patogenu, které jsou společné většině pacientů s podobnou indikací
  2. základní regulační sítě a spouštěče v buňkách patogenů a lidských tkáních.

Klinické výsledky (přežití/úmrtnost) a odpověď na léčbu (reakce nebo selhání) budou korelovat s in vitro získanými údaji o hostiteli a bakteriích.
D) Ovládací prvky pro A), B) a C)
Kontrolní vzorky pocházejí od pacientů s podezřením na infekci (místa infekce A), B) nebo C), u kterých nebyla diagnostikována žádná mikrobiologicky potvrzená infekce. Skladování v biobance
Jiný: analýza antimikrobiální rezistence

Ve vzorcích od pacientů infikovaných jedním z ohniskových patogenů (E. coli, druhy Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) budou:

i) charakterizované izolované a patogenní bakterie; (ii) vlastnosti patogenu in-situ stanoveny v průměru jedné buňky a objemu; (iii) stanoveny lidské metabolity, proteiny a buňky (iv) stanovena koncentrace antibiotik (v) monitorován bakteriální růst

Z údajů bude odečteno:

  1. relevantní lidské složky a vlastnosti patogenu, které jsou společné většině pacientů s podobnou indikací
  2. základní regulační sítě a spouštěče v buňkách patogenů a lidských tkáních.

Klinické výsledky (přežití/úmrtnost) a odpověď na léčbu (reakce nebo selhání) budou korelovat s in vitro získanými údaji o hostiteli a bakteriích.
E) Klinické kontroly pro A), B) a C) bez získaných vzorků
U klinických kontrol budou hodnoceny klinické charakteristiky pacientů s detekcí cílových patogenů v jejich rutinních vzorcích (které však nemohly být zahrnuty do analýzy vzorků v této studii).
Jiný: analýza antimikrobiální rezistence

Ve vzorcích od pacientů infikovaných jedním z ohniskových patogenů (E. coli, druhy Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) budou:

i) charakterizované izolované a patogenní bakterie; (ii) vlastnosti patogenu in-situ stanoveny v průměru jedné buňky a objemu; (iii) stanoveny lidské metabolity, proteiny a buňky (iv) stanovena koncentrace antibiotik (v) monitorován bakteriální růst

Z údajů bude odečteno:

  1. relevantní lidské složky a vlastnosti patogenu, které jsou společné většině pacientů s podobnou indikací
  2. základní regulační sítě a spouštěče v buňkách patogenů a lidských tkáních.

Klinické výsledky (přežití/úmrtnost) a odpověď na léčbu (reakce nebo selhání) budou korelovat s in vitro získanými údaji o hostiteli a bakteriích.
F) Proveďte analýzu, zda použití článku (čl.) 34 HFV může zabránit zkreslení
Protože část dat a vzorků v této studii je shromažďována s reprezentativním souhlasem etických komisí, je zkoumáno, zda aplikace čl. 34 HFV zabraňuje zkreslení selekce s ohledem na studovanou populaci. Pro tento účel byly rozdíly mezi skutečnou studovanou populací s použitím čl. 34 HFV a studovaná populace s poskytnutým souhlasem k výzkumu budou deskriptivně zkoumány z hlediska prevalence multirezistentních zárodků a dalších dostupných charakteristik populace.
Jiný: analýza antimikrobiální rezistence

Ve vzorcích od pacientů infikovaných jedním z ohniskových patogenů (E. coli, druhy Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) budou:

i) charakterizované izolované a patogenní bakterie; (ii) vlastnosti patogenu in-situ stanoveny v průměru jedné buňky a objemu; (iii) stanoveny lidské metabolity, proteiny a buňky (iv) stanovena koncentrace antibiotik (v) monitorován bakteriální růst

Z údajů bude odečteno:

  1. relevantní lidské složky a vlastnosti patogenu, které jsou společné většině pacientů s podobnou indikací
  2. základní regulační sítě a spouštěče v buňkách patogenů a lidských tkáních.

Klinické výsledky (přežití/úmrtnost) a odpověď na léčbu (reakce nebo selhání) budou korelovat s in vitro získanými údaji o hostiteli a bakteriích.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Klinický výsledek: míra přežití
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku
Míra přežití (korelovaná s údaji o hostiteli a bakteriích získaných in vitro. In vitro získaná data o hostiteli a bakteriích zahrnují: Proteomiku, Metabolomiku, FISH, Histologii, PCR/sekvenování mikrobiálního genomu, Mikrobiální transkriptom, Koncentraci antibiotik, Časosběrné studie, fenotypové charakterizace, molekulární typizaci, charakterizaci vrozené imunitní odpovědi, Testování tolerance antibiotik, Mikrofluidní systémy, 3-D modely, transkriptomika, průtoková cytometrie (FACS))
jednorázové hodnocení na začátku
Klinický výsledek: úmrtnost
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku
Míra úmrtnosti (korelovaná s údaji o hostiteli a bakteriích získaných in vitro. In vitro získaná data o hostiteli a bakteriích zahrnují: Proteomiku, Metabolomiku, FISH, Histologii, PCR/sekvenování mikrobiálního genomu, Mikrobiální transkriptom, Koncentraci antibiotik, Časosběrné studie, fenotypové charakterizace, molekulární typizaci, charakterizaci vrozené imunitní odpovědi, Testování tolerance antibiotik, Mikrofluidní systémy, 3-D modely, transkriptomika, průtoková cytometrie (FACS))
jednorázové hodnocení na začátku
Odpověď na léčbu (binární: ano/ne)
Časové okno: jednorázové hodnocení na začátku
Odpověď na léčbu (korelovaná s údaji o hostiteli a bakteriích získaných in vitro. In vitro získaná data o hostiteli a bakteriích zahrnují: Proteomiku, Metabolomiku, FISH, Histologii, PCR/sekvenování mikrobiálního genomu, Mikrobiální transkriptom, Koncentraci antibiotik, Časosběrné studie, fenotypové charakterizace, molekulární typizaci, charakterizaci vrozené imunitní odpovědi, Testování tolerance antibiotik, Mikrofluidní systémy, 3-D modely, transkriptomika, průtoková cytometrie (FACS))
jednorázové hodnocení na začátku

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

University Hospital, Basel, Switzerland

Spolupracovníci

Swiss National Science Foundation

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Nina Khanna, Prof., University Hospital Basel, Division of Infectiology

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

3. prosince 2020

Primární dokončení (Odhadovaný)

1. prosince 2028

Dokončení studie (Odhadovaný)

1. prosince 2028

Termíny zápisu do studia

První předloženo

26. července 2021

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

18. srpna 2021

První zveřejněno (Aktuální)

24. srpna 2021

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

25. března 2025

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

27. února 2025

Naposledy ověřeno

1. února 2025

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 2020-02588; pe20Khanna

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Antimikrobiální odolnost (AMR)

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Kenya

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

Předplatit