Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

NCCR AntiResist:: Новые подходы к борьбе с антибиотикорезистентными бактериями (AntiResist)

23 февраля 2024 г. обновлено: University Hospital, Basel, Switzerland

NCCR AntiResist: моноцентровое исследование для выявления новых подходов к борьбе с устойчивыми к антибиотикам бактериями.

Это предварительное моноцентровое исследование, включающее проспективно собранные образцы пациентов из университетской больницы Базеля. Он предназначен для изучения устойчивости к противомикробным препаратам (УПП), включая три клинических проявления инфекционных заболеваний: инфекцию мочевыводящих путей, пневмонию и глубокие инфекции. Основное внимание уделяется четырем бактериям (E. coli, виды Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa), которые входят в список высокого приоритета Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ). Остаточные образцы пациентов анализируют для протеомного, метаболомного и транскриптомного анализа, иммуноцитохимического анализа или анализа флуоресцентной гибридизации in situ (FISH), анализа проточной цитометрии (FACS), а также иммунофенотипирования и исследования свойств бактерий.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Национальный центр компетентности в области исследований (NCCR) AntiResist стремится использовать образцы пациентов для изучения физиологии бактериальных патогенов у пациентов и создания уникальной междисциплинарной сети клиницистов, биологов, инженеров, химиков, ученых-вычислителей и разработчиков лекарств.

Цель этого проекта — выяснить физиологические свойства бактериальных патогенов у инфицированных пациентов-людей, чтобы найти новые способы борьбы с супербактериями. Эти клинические данные будут использоваться для руководства и сравнения разработки моделей, имитирующих пациентов, и моделей in vitro, ускорения поиска новых бактериальных мишеней, антибактериальных соединений и нетрадиционных стратегий.

В частности, основное внимание будет уделено трем клиническим проявлениям инфекционных заболеваний, вызванных четырьмя критическими бактериальными патогенами, входящими в список «приоритетных патогенов» ВОЗ: E. coli, виды Klebsiella, S. aureus и P. aeruginosa:

А) Инфекция мочевыводящих путей Б) Пневмония С) Глубокие инфекции Г) Контроль для А), В) и С) Е) Клинический контроль для А), Б) и С) без полученных образцов Е) Анализ целесообразности применения ст. . 34 HFV (Weiterverwendung biologischen Materials und/oder gesundheitsbezogener Personendaten für die Forschung bei fehlender Einwilligung und Information) может избежать предвзятости.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Оцененный)

8000

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

  • Имя: Nina Khanna, Prof.
  • Номер телефона: +41 61 328 73 25
  • Электронная почта: nina.khanna@usb.ch

Учебное резервное копирование контактов

  • Имя: Christoph Dehio, Prof.

Места учебы

  • Швейцария
      • Basel, Швейцария, 4031
        • Рекрутинг
        • University Hospital Basel
        • Контакт:
          • Nina Khanna, Prof. Dr. med.
          • Номер телефона: +41 61 328 73 25
          • Электронная почта: nina.khanna@usb.ch
        • Контакт:
          • Richard Kühl, Dr. med.
          • Номер телефона: +41 61 328 65 45
          • Электронная почта: richard.kuehl@usb.ch
        • Главный следователь:
          • Nina Khanna, Prof.
        • Младший исследователь:
          • Richard Kühl, Dr.
        • Младший исследователь:
          • Adrian Egli, Prof.
        • Младший исследователь:
          • Christoph Dehio, Prof.
        • Младший исследователь:
          • Mario Morgenstern, PD
        • Младший исследователь:
          • Martin Siegemund, Prof.
        • Младший исследователь:
          • Daiana Stolz, Prof.
        • Младший исследователь:
          • Sarah Tschudin Sutter, Prof.
        • Младший исследователь:
          • Bram Stieltjes, Dr.
        • Младший исследователь:
          • Dirk Buman, Prof.
        • Младший исследователь:
          • Urs Jenal, Prof.

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

18 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Да

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Образцы пациентов во время планового сбора в университетской больнице Базеля с ноября 2020 г. по декабрь 2024 г.

Описание

Критерии включения:

  • Пациенты с подтвержденной (i) инфекцией мочевыводящих путей, (ii) пневмонией (включая пациентов после трансплантации легких, муковисцидозом) или (iii) глубокой инфекцией с очаговым возбудителем:

    • кишечная палочка
    • виды клебсиеллы
    • С. золотистый
    • П. палочка
  • Контроль: отсутствие обнаруживаемых бактерий в обычной микробиологической лаборатории и отсутствие других очагов инфекции при включении образца и последующем наблюдении в течение 10 дней, подписанное общее согласие.

  • Клинические контроли без полученных образцов, но с подтвержденной (i) инфекцией мочевыводящих путей, (ii) пневмонией (в том числе у пациентов после трансплантации легких, муковисцидозом) или (iii) глубокой инфекцией с очаговым возбудителем:

    • кишечная палочка
    • виды клебсиеллы
    • С. золотистый
    • П. палочка

Критерий исключения:

  • Пациенты, отказавшиеся от исследований и повторного использования своих данных/образцов (например, общее согласие) или любой другой отказ (например, Patientenverfügung).
  • кроме одной из основных бактерий в обычной лаборатории микробиологии
  • Возраст: <18 лет
  • Контроль без подписанного общего согласия

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
А) инфекции мочевыводящих путей
Обработка остаточной мочи для протеомного, метаболомного и транскриптомного анализа, иммуноцитохимического или флуоресцентного анализа гибридизации in situ (FISH), анализа проточной цитометрии (FACS), иммунофенотипирования. При положительном результате на целевые бактерии: образец хранится в биобанке. Если предыдущее лечение антибиотиками: хранение образца плазмы. Изучение свойств бактерий (высокочувствительная масс-спектрометрия, секвенирование всего генома), экспрессии факторов вирулентности, геномных изменений видов бактерий, метаболизма, экспрессии поверхностных молекул, уровней экспрессии генов, уровней цитокинов, биологии иммунных клеток, концентрации антибиотиков (хроматография/масс-спектрометрия). ). Будут проанализированы демографические, клинические, микробиологические, лабораторные, эпидемиологические и больничные данные. Включены 500 образцов на каждую целевую бактерию (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, виды Klebsiella). Во-первых, проводится пилотное исследование среди случайно выбранных пациентов в каждой группе видов бактерий (n = 50, каждая).
Другой: анализ устойчивости к противомикробным препаратам

В образцах от больных, инфицированных одним из очаговых возбудителей (E. coli, виды Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) будет:

(i) изолированные и охарактеризованные патогенные бактерии; (ii) свойства патогена in situ при определении средних показателей отдельных клеток и объемов; (iii) определение метаболитов, белков и клеток человека (iv) определение концентрации антибиотика (v) мониторинг роста бактерий

Из данных будет вычитаться:

  1. соответствующие человеческие компоненты и свойства патогенов, которые являются общими для большинства пациентов с аналогичными показаниями
  2. основные регуляторные сети и триггеры в клетках патогенов и тканях человека.

Клинические результаты (выживаемость/смертность) и ответ на лечение (ответ или неудача) будут коррелировать с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях.
Б) Пневмония
Обработка остаточных образцов (трахеальный секрет, бронхиоальвеолярный лаваж (БАЛ)) для протеомного, метаболомного, транскриптомного и цитологического анализа. При положительном результате на целевые бактерии: образец хранится в биобанке. Если предыдущее лечение антибиотиками: хранение образца плазмы. Изучение свойств бактерий. Будут проанализированы демографические, клинические, микробиологические, лабораторные, эпидемиологические и больничные данные. Включены 500 образцов на каждую целевую бактерию (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, виды Klebsiella).
Другой: анализ устойчивости к противомикробным препаратам

В образцах от больных, инфицированных одним из очаговых возбудителей (E. coli, виды Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) будет:

(i) изолированные и охарактеризованные патогенные бактерии; (ii) свойства патогена in situ при определении средних показателей отдельных клеток и объемов; (iii) определение метаболитов, белков и клеток человека (iv) определение концентрации антибиотика (v) мониторинг роста бактерий

Из данных будет вычитаться:

  1. соответствующие человеческие компоненты и свойства патогенов, которые являются общими для большинства пациентов с аналогичными показаниями
  2. основные регуляторные сети и триггеры в клетках патогенов и тканях человека.

Клинические результаты (выживаемость/смертность) и ответ на лечение (ответ или неудача) будут коррелировать с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях.
В) глубокие инфекции
Обработка остаточных образцов интраоперационного материала для протеомного, метаболомного, транскриптомного и цитологического анализа. При положительном результате на целевые бактерии: образец хранится в биобанке. Изучение свойств бактерий. Будут проанализированы демографические, клинические, микробиологические, лабораторные, эпидемиологические и больничные данные. Включены 500 образцов на каждую целевую бактерию (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, виды Klebsiella).
Другой: анализ устойчивости к противомикробным препаратам

В образцах от больных, инфицированных одним из очаговых возбудителей (E. coli, виды Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) будет:

(i) изолированные и охарактеризованные патогенные бактерии; (ii) свойства патогена in situ при определении средних показателей отдельных клеток и объемов; (iii) определение метаболитов, белков и клеток человека (iv) определение концентрации антибиотика (v) мониторинг роста бактерий

Из данных будет вычитаться:

  1. соответствующие человеческие компоненты и свойства патогенов, которые являются общими для большинства пациентов с аналогичными показаниями
  2. основные регуляторные сети и триггеры в клетках патогенов и тканях человека.

Клинические результаты (выживаемость/смертность) и ответ на лечение (ответ или неудача) будут коррелировать с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях.
D) Элементы управления для A), B) и C)
Контрольные образцы получают от пациентов с подозрением на инфекцию (очаги инфекции A), B) или C), у которых микробиологически подтвержденная инфекция не была диагностирована. Хранение в биобанке
Другой: анализ устойчивости к противомикробным препаратам

В образцах от больных, инфицированных одним из очаговых возбудителей (E. coli, виды Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) будет:

(i) изолированные и охарактеризованные патогенные бактерии; (ii) свойства патогена in situ при определении средних показателей отдельных клеток и объемов; (iii) определение метаболитов, белков и клеток человека (iv) определение концентрации антибиотика (v) мониторинг роста бактерий

Из данных будет вычитаться:

  1. соответствующие человеческие компоненты и свойства патогенов, которые являются общими для большинства пациентов с аналогичными показаниями
  2. основные регуляторные сети и триггеры в клетках патогенов и тканях человека.

Клинические результаты (выживаемость/смертность) и ответ на лечение (ответ или неудача) будут коррелировать с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях.
E) Клинические контроли для A), B) и C) без полученных образцов
Для клинического контроля будут оцениваться клинические характеристики пациентов с обнаружением целевых патогенов в их обычных образцах (но которые не могут быть включены для анализа образцов в этом исследовании).
Другой: анализ устойчивости к противомикробным препаратам

В образцах от больных, инфицированных одним из очаговых возбудителей (E. coli, виды Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) будет:

(i) изолированные и охарактеризованные патогенные бактерии; (ii) свойства патогена in situ при определении средних показателей отдельных клеток и объемов; (iii) определение метаболитов, белков и клеток человека (iv) определение концентрации антибиотика (v) мониторинг роста бактерий

Из данных будет вычитаться:

  1. соответствующие человеческие компоненты и свойства патогенов, которые являются общими для большинства пациентов с аналогичными показаниями
  2. основные регуляторные сети и триггеры в клетках патогенов и тканях человека.

Клинические результаты (выживаемость/смертность) и ответ на лечение (ответ или неудача) будут коррелировать с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях.
F) Когорта с анализом того, может ли применение статьи (Art) 34 HFV избежать систематической ошибки
Поскольку часть данных и образцов в этом исследовании собрана с согласия представителей комитетов по этике, выясняется, применимо ли ст. 34 HFV предотвращает систематическую ошибку отбора по отношению к изучаемой популяции. Для этой цели различия между фактической исследуемой популяцией с использованием ст. 34 ВПЧ и исследуемая популяция с согласия на исследование будут описательно исследованы с точки зрения распространенности полирезистентных микробов и других доступных характеристик популяции.
Другой: анализ устойчивости к противомикробным препаратам

В образцах от больных, инфицированных одним из очаговых возбудителей (E. coli, виды Klebsiella, S. aureus, P. aeruginosa) будет:

(i) изолированные и охарактеризованные патогенные бактерии; (ii) свойства патогена in situ при определении средних показателей отдельных клеток и объемов; (iii) определение метаболитов, белков и клеток человека (iv) определение концентрации антибиотика (v) мониторинг роста бактерий

Из данных будет вычитаться:

  1. соответствующие человеческие компоненты и свойства патогенов, которые являются общими для большинства пациентов с аналогичными показаниями
  2. основные регуляторные сети и триггеры в клетках патогенов и тканях человека.

Клинические результаты (выживаемость/смертность) и ответ на лечение (ответ или неудача) будут коррелировать с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Клинический результат: выживаемость
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
Коэффициент выживаемости (коррелирует с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях. Данные о хозяине и бактериях, полученные in vitro, включают: протеомику, метаболомику, FISH, гистологию, ПЦР/секвенирование микробного генома, микробный транскриптом, концентрацию антибиотика, исследования с интервальной съемкой, фенотипические характеристики, молекулярное типирование, характеристику врожденного иммунного ответа, тестирование толерантности к антибиотикам, микрожидкостные системы, 3-D модели, транскриптомика, проточная цитометрия (FACS))
однократная оценка на исходном уровне
Клинический результат: уровень смертности
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
Смертность (коррелирует с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях. Данные о хозяине и бактериях, полученные in vitro, включают: протеомику, метаболомику, FISH, гистологию, ПЦР/секвенирование микробного генома, микробный транскриптом, концентрацию антибиотика, исследования с интервальной съемкой, фенотипические характеристики, молекулярное типирование, характеристику врожденного иммунного ответа, тестирование толерантности к антибиотикам, микрожидкостные системы, 3-D модели, транскриптомика, проточная цитометрия (FACS))
однократная оценка на исходном уровне
Ответ на лечение (бинарный: да/нет)
Временное ограничение: однократная оценка на исходном уровне
Реакция на лечение (коррелирует с полученными in vitro данными о хозяине и бактериях. Данные о хозяине и бактериях, полученные in vitro, включают: протеомику, метаболомику, FISH, гистологию, ПЦР/секвенирование микробного генома, микробный транскриптом, концентрацию антибиотика, исследования с интервальной съемкой, фенотипические характеристики, молекулярное типирование, характеристику врожденного иммунного ответа, тестирование толерантности к антибиотикам, микрожидкостные системы, 3-D модели, транскриптомика, проточная цитометрия (FACS))
однократная оценка на исходном уровне

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

University Hospital, Basel, Switzerland

Соавторы

Swiss National Science Foundation

Следователи

  • Главный следователь: Nina Khanna, Prof., University Hospital Basel, Division of Infectiology

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

24 ноября 2020 г.

Первичное завершение (Оцененный)

1 декабря 2024 г.

Завершение исследования (Оцененный)

1 декабря 2024 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

26 июля 2021 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

18 августа 2021 г.

Первый опубликованный (Действительный)

24 августа 2021 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Оцененный)

26 февраля 2024 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

23 февраля 2024 г.

Последняя проверка

1 февраля 2024 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • 2020-02588; pe20Khanna

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Клинические исследования Устойчивость к противомикробным препаратам (AMR)

Искать похожие исследования

Спонсоры и соавторы

Заболевания

Медикаментозные вмешательства

CROs by country

CROs in Philippines

Заболевания

Редкие заболевания

Медикаментозные вмешательства

Пищевые добавки

Спонсор / Соавторы

Места

Подписаться