Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

NCCR AntiResist: Nye tilnærminger for å bekjempe antibiotikaresistente bakterier (AntiResist)

23. februar 2024 oppdatert av: University Hospital, Basel, Switzerland

NCCR AntiResist: Monosenterstudie for å identifisere nye tilnærminger for å bekjempe antibiotikaresistente bakterier.

Dette er en utforskende, mono-senter studie som inkluderer prospektivt innsamlede pasientprøver fra universitetssykehuset i Basel. Den skal undersøke antimikrobiell resistens (AMR) inkludert tre kliniske manifestasjoner av infeksjonssykdommer: urinveisinfeksjon, lungebetennelse og dyptliggende infeksjoner. Fokuset er på fire bakterier (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) som er en del av den høyprioriterte listen til Verdens helseorganisasjon (WHO). Resterende pasientprøver analyseres for proteomisk, metabolomisk og transkriptomisk analyse, immuncytokjemisk eller fluorescens in-situ hybridisering (FISH) analyse, flowcytometri analyse (FACS) og immunfenotyping og utforskning av bakterielle egenskaper.

Studieoversikt

Status

Rekruttering

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

National Center of Competence in Research (NCCR) AntiResist tar sikte på å bruke pasientprøver for å undersøke fysiologien til bakterielle patogener hos menneskelige pasienter og etablere et unikt tverrfaglig nettverk av klinikere, biologer, ingeniører, kjemikere, beregningsforskere og medikamentutviklere.

Målet med dette prosjektet er å belyse de fysiologiske egenskapene til bakterielle patogener hos infiserte menneskelige pasienter for å gi nye måter å bekjempe superbugs på. Disse kliniske dataene vil bli brukt til å veilede og benchmarke utviklingen av pasient-etterlignende og in vitro-modeller, akselerere søket etter nye bakterielle mål, antibakterielle forbindelser og ikke-konvensjonelle strategier.

I detalj vil fokuset være på tre kliniske manifestasjoner av infeksjonssykdommer forårsaket av fire kritiske bakterielle patogener som tilhører WHOs liste over "prioriterte patogener": E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus og P. aeruginosa:

A) Urinveisinfeksjon B) Lungebetennelse C) Dypliggende infeksjoner D) Kontroller for A), B) og C) E) Kliniske kontroller for A), B) og C) uten innhentede prøver F) Analyse om anvendelse av art. . 34 HFV (Weiterverwendung biologischen Materials und/oder gesundheitsbezogener Personendaten für die Forschung bei fehlender Einwilligung und Information) kan unngå en skjevhet.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

8000

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

  • Navn: Christoph Dehio, Prof.

Studiesteder

  • Sveits
      • Basel, Sveits, 4031
        • Rekruttering
        • University Hospital Basel
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:
        • Hovedetterforsker:
          • Nina Khanna, Prof.
        • Underetterforsker:
          • Richard Kühl, Dr.
        • Underetterforsker:
          • Adrian Egli, Prof.
        • Underetterforsker:
          • Christoph Dehio, Prof.
        • Underetterforsker:
          • Mario Morgenstern, PD
        • Underetterforsker:
          • Martin Siegemund, Prof.
        • Underetterforsker:
          • Daiana Stolz, Prof.
        • Underetterforsker:
          • Sarah Tschudin Sutter, Prof.
        • Underetterforsker:
          • Bram Stieltjes, Dr.
        • Underetterforsker:
          • Dirk Buman, Prof.
        • Underetterforsker:
          • Urs Jenal, Prof.

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Ja

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasientprøver under rutinemessig innsamling ved universitetssykehuset i Basel fra november 2020 til omtrent desember 2024.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Pasienter med bekreftet (i) urinveisinfeksjon, (ii) lungebetennelse (inkludert pasienter etter lungetransplantasjon, cystisk fibrose) eller (iii) dyptliggende infeksjon med fokuspatogen:

    • E coli
    • Klebsiella-art
    • S. aureus
    • P. aeruginosa
  • Kontroller: ingen påvisbare bakterier i rutinemessig mikrobiologisk laboratorium og ingen andre infeksjonssteder ved inkludering av prøven og oppfølging i 10 dager, signert generelt samtykke

  • Kliniske kontroller uten innhentede prøver, men med bekreftet (i) urinveisinfeksjon, (ii) lungebetennelse (inkludert pasienter etter lungetransplantasjon, cystisk fibrose) eller (iii) dyptliggende infeksjon med fokuspatogen:

    • E coli
    • Klebsiella-art
    • S. aureus
    • P. aeruginosa

Ekskluderingskriterier:

  • Pasienter som har nektet forskning og gjenbruk av data/prøver (f. generelt samtykke) eller annen avvisning (f.eks. Patientenverfügung).
  • annet enn en av fokusbakteriene i rutinemessig mikrobiologilaboratorium
  • Alder: <18 år
  • Kontroller uten signert generelt samtykke

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
A) Urinveisinfeksjon
Behandling av resturin for proteomisk, metabolomisk og transkriptomisk analyse, immuncytokjemisk eller fluorescens in-situ hybridisering (FISH) analyse, flowcytometri analyse (FACS), immunfenotyping. Ved positiv for målbakterier: prøve lagret i biobank. Ved tidligere antibiotikabehandling: oppbevaring av plasmaprøver. Utforskning av bakterielle egenskaper (Høysensitiv massespektrometri, helgenomsekvensering), ekspresjon av virulensfaktorer, genomiske endringer av bakteriearter, metabolisme, overflatemolekyluttrykk, genuttrykksnivåer, cytokinnivåer, immuncellebiologi, antibiotikakonsentrasjon (kromatografi/massespektrometri). ). Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og sykehustilknyttede data vil bli analysert. 500 prøver per målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkludert. Først gjøres en pilotstudie fra tilfeldig utvalgte pasienter innenfor hver bakterieart gruppe (n=50, hver).
Annen: analyse av antimikrobiell resistens

I prøver fra pasienter infisert med en av fokuspatogenene (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerte og patogene bakterier karakterisert; (ii) patogen in situ-egenskaper ved enkeltcelle- og bulk-gjennomsnitt bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakonsentrasjon bestemt (v) bakterievekst overvåket

Trekket fra dataene vil være:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaper som er felles for de fleste pasienter med lignende indikasjon
  2. underliggende regulatoriske nettverk og triggere i patogenceller og humant vev.

Kliniske utfall (overlevelse/dødelighet) og behandlingsrespons (respons eller svikt) vil være korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata.
B) Lungebetennelse
Behandling av restprøver (trakeal sekresjon, bronkioalveolær lavage (BAL)) for proteomisk, metabolomisk, transkriptomisk og cytologisk analyse. Ved positiv for målbakterier: prøve lagret i biobank. Ved tidligere antibiotikabehandling: oppbevaring av plasmaprøver. Utforskning av bakterielle egenskaper. Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og sykehustilknyttede data vil bli analysert. 500 prøver per målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkludert.
Annen: analyse av antimikrobiell resistens

I prøver fra pasienter infisert med en av fokuspatogenene (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerte og patogene bakterier karakterisert; (ii) patogen in situ-egenskaper ved enkeltcelle- og bulk-gjennomsnitt bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakonsentrasjon bestemt (v) bakterievekst overvåket

Trekket fra dataene vil være:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaper som er felles for de fleste pasienter med lignende indikasjon
  2. underliggende regulatoriske nettverk og triggere i patogenceller og humant vev.

Kliniske utfall (overlevelse/dødelighet) og behandlingsrespons (respons eller svikt) vil være korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata.
C) Dypliggende infeksjoner
Behandling av intraoperative materialrestprøver for proteomisk, metabolomisk, transkriptomisk og cytologisk analyse. Ved positiv for målbakterier: prøve lagret i biobank. Utforskning av bakterielle egenskaper. Demografiske, kliniske, mikrobiologiske, laboratorie-, epidemiologiske og sykehustilknyttede data vil bli analysert. 500 prøver per målbakterie (S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, Klebsiella-arter) inkludert.
Annen: analyse av antimikrobiell resistens

I prøver fra pasienter infisert med en av fokuspatogenene (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerte og patogene bakterier karakterisert; (ii) patogen in situ-egenskaper ved enkeltcelle- og bulk-gjennomsnitt bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakonsentrasjon bestemt (v) bakterievekst overvåket

Trekket fra dataene vil være:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaper som er felles for de fleste pasienter med lignende indikasjon
  2. underliggende regulatoriske nettverk og triggere i patogenceller og humant vev.

Kliniske utfall (overlevelse/dødelighet) og behandlingsrespons (respons eller svikt) vil være korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata.
D) Kontroller for A), B) og C)
Kontrollprøver stammer fra pasienter med mistanke om infeksjon (infeksjonssted A), B) eller C), hvor det ikke er påvist mikrobiologisk bekreftet infeksjon. Oppbevaring i biobank
Annen: analyse av antimikrobiell resistens

I prøver fra pasienter infisert med en av fokuspatogenene (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerte og patogene bakterier karakterisert; (ii) patogen in situ-egenskaper ved enkeltcelle- og bulk-gjennomsnitt bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakonsentrasjon bestemt (v) bakterievekst overvåket

Trekket fra dataene vil være:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaper som er felles for de fleste pasienter med lignende indikasjon
  2. underliggende regulatoriske nettverk og triggere i patogenceller og humant vev.

Kliniske utfall (overlevelse/dødelighet) og behandlingsrespons (respons eller svikt) vil være korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata.
E) Kliniske kontroller for A), B) og C) uten innhentede prøver
For kliniske kontroller vil kliniske egenskaper hos pasienter med påvisning av målpatogener i sine rutineprøver (men som ikke kunne inkluderes for prøveanalyse i denne studien) bli vurdert.
Annen: analyse av antimikrobiell resistens

I prøver fra pasienter infisert med en av fokuspatogenene (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerte og patogene bakterier karakterisert; (ii) patogen in situ-egenskaper ved enkeltcelle- og bulk-gjennomsnitt bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakonsentrasjon bestemt (v) bakterievekst overvåket

Trekket fra dataene vil være:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaper som er felles for de fleste pasienter med lignende indikasjon
  2. underliggende regulatoriske nettverk og triggere i patogenceller og humant vev.

Kliniske utfall (overlevelse/dødelighet) og behandlingsrespons (respons eller svikt) vil være korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata.
F) Kohort med analyse om anvendelsen av artikkel (art) 34 HFV kan unngå en skjevhet
Siden en del av dataene og prøvene i denne studien er samlet inn med representativt samtykke fra de etiske komiteene, undersøkes det om anvendelsen av art. 34 HFV forhindrer seleksjonsskjevhet med hensyn til studiepopulasjonen. For dette formål vil forskjeller mellom den faktiske studiepopulasjonen ved bruk av art. 34 HFV og studiepopulasjonen med gitt forskningssamtykke vil bli undersøkt beskrivende med tanke på forekomsten av multiresistente bakterier og andre tilgjengelige populasjonsegenskaper.
Annen: analyse av antimikrobiell resistens

I prøver fra pasienter infisert med en av fokuspatogenene (E. coli, Klebsiella-arter, S. aureus, P. aeruginosa) vil være:

(i) isolerte og patogene bakterier karakterisert; (ii) patogen in situ-egenskaper ved enkeltcelle- og bulk-gjennomsnitt bestemt; (iii) humane metabolitter, proteiner og celler bestemt (iv) antibiotikakonsentrasjon bestemt (v) bakterievekst overvåket

Trekket fra dataene vil være:

  1. relevante menneskelige komponenter og patogenegenskaper som er felles for de fleste pasienter med lignende indikasjon
  2. underliggende regulatoriske nettverk og triggere i patogenceller og humant vev.

Kliniske utfall (overlevelse/dødelighet) og behandlingsrespons (respons eller svikt) vil være korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Klinisk utfall: overlevelsesrate
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Overlevelsesrate (korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata. In vitro-innhentede verts- og bakteriedata inkluderer: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histology, PCR/Microbial genom-sekvensering, Mikrobiell transkriptom, Antibiotikakonsentrasjon, Timelapse-studier, fenotypiske karakteriseringer, molekylær typing, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatoleranse-testing, 3D-modeller, transkriptomikk, flytcytometri (FACS))
engangsvurdering ved baseline
Klinisk utfall: dødelighet
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Dødelighet (korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata. In vitro-innhentede verts- og bakteriedata inkluderer: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histology, PCR/Microbial genom-sekvensering, Mikrobiell transkriptom, Antibiotikakonsentrasjon, Timelapse-studier, fenotypiske karakteriseringer, molekylær typing, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatoleranse-testing, 3D-modeller, transkriptomikk, flytcytometri (FACS))
engangsvurdering ved baseline
Behandlingsrespons (binær: ja/nei)
Tidsramme: engangsvurdering ved baseline
Behandlingsrespons (korrelert til in vitro-innhentede verts- og bakteriedata. In vitro-innhentede verts- og bakteriedata inkluderer: Proteomics, Metabolomics, FISH, Histology, PCR/Microbial genom-sekvensering, Mikrobiell transkriptom, Antibiotikakonsentrasjon, Timelapse-studier, fenotypiske karakteriseringer, molekylær typing, medfødt immunresponskarakterisering, Antibiotikatoleranse-testing, 3D-modeller, transkriptomikk, flytcytometri (FACS))
engangsvurdering ved baseline

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Samarbeidspartnere

Swiss National Science Foundation

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Nina Khanna, Prof., University Hospital Basel, Division of Infectiology

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

24. november 2020

Primær fullføring (Antatt)

1. desember 2024

Studiet fullført (Antatt)

1. desember 2024

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

26. juli 2021

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

18. august 2021

Først lagt ut (Faktiske)

24. august 2021

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Antatt)

26. februar 2024

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

23. februar 2024

Sist bekreftet

1. februar 2024

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • 2020-02588; pe20Khanna

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Antimikrobiell motstand (AMR)

Søk i lignende forsøk

Sponsorer og samarbeidspartnere

Medisinsk tilstand

Legemiddelintervensjoner

CROs by country

CROs in Bosnia & Herzegovina

Forhold

Sjeldne sykdommer

Legemiddelintervensjoner

Kosttilskudd

Sponsor / samarbeidspartnere

Steder

3
Abonnere