Urin DNA-metyleringsdetektion för hematuriutvärdering

Metoder

Studera design:

Detta är en prospektiv pilotstudie som syftar till att utvärdera effektiviteten av DNA-metyleringsbiomarkörer för att upptäcka urotelialt karcinom hos patienter med hematuri.

Beräkning av provstorlek:

Baserat på våra tidigare observationer är incidensen av urotelialt karcinom hos patienter med hematuri 20%-30%, något högre än vad som rapporterats i annan litteratur. Därför antar vi att 25% av patienterna i hematuri-kohorten har UC. Grupptilldelningskvoten (R): N-/N+ = 75 %/25 % = 3.

Antaganden:

Area under kurvan (AUC) under H0: 0,5 AUC under H1: 0,8 Effekt: 0,95 Signifikansnivå (Alfa): 0,05 Typ av data: Kontinuerligt FPR-intervall: 0,00 till 1,00

Resultat: Användning av programvaran PASS 15.0 för beräkning av provstorlek för att säkerställa tillräcklig statistisk kraft. Den beräknade provstorleken är:

N+ (antal patienter med UC): 14 N- (antal patienter utan UC): 42 Total provstorlek (N): 56

Med tanke på en bortfallsfrekvens på 20 % är den justerade urvalsstorleken:

N+': 18 N-': 53 Total provstorlek (N'): 71

Inklusions- och uteslutningskriterier:

Inklusionskriterier:

Ålder mellan 18 och 99 år, med grov eller mikroskopisk hematuri (>5/HP). Kan ge 50 ml urin för testning före operation. Samtycke till att delta i studien och underteckna formuläret för informerat samtycke.

Exklusions kriterier:

Med tidigare malignitet eller samtidiga maligniteter andra än UC. Allvarlig urinvägsinfektion som leder till sepsis. Patienter med innestående katetrar, nefrostomi eller cystostomi. Allvarlig lever- eller njursvikt eller andra tillstånd som anses olämpliga för studien.

Patienter som av olika anledningar inte genomgått kirurgisk behandling. Prover med otillräckligt DNA-innehåll eller andra kvalitetskontrollfel.

Provsamling:

Kliniker kommer att samla in färska urinprover från inskrivna hematuripatienter och registrera deras grundläggande information, klinisk information och medicinsk historia.

Proverna kommer att slumpmässigt numreras och tillhandahållas till personal som testar DNA-metylering för att säkerställa blindning.

Testmetod:

Testpersonal kommer att analysera urinprover med hjälp av MSRE-qPCR-baserade DNA-metyleringstestmetoder för att utvärdera DNA-metyleringsnivåer.

Avblindning och dataorganisation:

Efter att det sista provet framgångsrikt har registrerats och testats kommer icke-rekryterande personal och testpersonal att avblinda proverna och organisera klinisk och patologisk information.

Dataanalys:

Att använda patologiska resultat som guldstandard. Beräkna känsligheten, specificiteten, positivt prediktivt värde och negativt prediktivt värde för DNA-metyleringsbiomarkörer.

Använd statistiska metoder (som ROC-kurvor) för att utvärdera den diagnostiska prestandan för biomarkörer för DNA-metylering och beräkna AUROC.

Etik och informerat samtycke:

Denna studie har godkänts av sjukhusets etiska kommitté och alla deltagare måste underteckna ett informerat samtycke.