Detekce methylace DNA v moči pro hodnocení hematurie

Metody

Studovat design:

Jedná se o prospektivní pilotní studii zaměřenou na hodnocení účinnosti biomarkerů metylace DNA při detekci uroteliálního karcinomu u pacientů s hematurií.

Vzorový výpočet velikosti:

Na základě našich předchozích pozorování je incidence uroteliálního karcinomu u pacientů s hematurií 20–30 %, což je o něco více, než uvádí jiná literatura. Proto předpokládáme, že 25 % pacientů v kohortě s hematurií má UC. Poměr skupinové alokace (R): N-/N+ = 75 %/25 % = 3.

Předpoklady:

Plocha pod křivkou (AUC) pod H0: 0,5 AUC pod H1: 0,8 Výkon: 0,95 Úroveň významnosti (Alfa): 0,05 Typ dat: Kontinuální rozsah FPR: 0,00 až 1,00

Výsledky: Použití softwaru PASS 15.0 pro výpočet velikosti vzorku pro zajištění dostatečné statistické síly. Vypočítaná velikost vzorku je:

N+ (počet pacientů s UC): 14 N- (počet pacientů bez UC): 42 Celková velikost vzorku (N): 56

S ohledem na 20% míru výpadků je upravená velikost vzorku:

N+': 18 N-': 53 Celková velikost vzorku (N'): 71

Kritéria zahrnutí a vyloučení:

Kritéria pro zařazení:

Ve věku mezi 18 a 99 lety, s makroskopickou nebo mikroskopickou hematurií (>5/HP). Schopný poskytnout 50 ml moči pro testování před operací. Souhlas s účastí ve studii a podepsání formuláře informovaného souhlasu.

Kritéria vyloučení:

S malignitou v anamnéze nebo souběžnými malignitami jinými než UC. Těžká infekce močových cest vedoucí k sepsi. Pacienti se zavedenými katetry, nefrostomií nebo cystostomií. Těžké selhání jater nebo ledvin nebo jiné stavy považované za nevhodné pro studii.

Pacienti, kteří z různých důvodů nepodstoupili chirurgickou léčbu. Vzorky s nedostatečným obsahem DNA nebo jiným selháním kontroly kvality.

Kolekce vzorků:

Lékaři odeberou čerstvé vzorky moči od zapsaných pacientů s hematurií a zaznamenají jejich základní informace, klinické informace a anamnézu.

Vzorky budou náhodně očíslovány a poskytnuty pracovníkům pro testování metylace DNA, aby bylo zajištěno zaslepení.

Testovací metoda:

Testující personál bude analyzovat vzorky moči pomocí testovacích metod metylace DNA založených na MSRE-qPCR, aby vyhodnotil úrovně metylace DNA.

Odslepování a organizace dat:

Poté, co je poslední vzorek úspěšně zaregistrován a otestován, nerekrutující personál a testovací personál vzorky odlepí a uspořádají klinické a patologické informace.

Analýza dat:

Použití patologických výsledků jako zlatého standardu. Vypočítejte citlivost, specificitu, pozitivní prediktivní hodnotu a negativní prediktivní hodnotu biomarkerů methylace DNA.

Použijte statistické metody (jako jsou křivky ROC) k vyhodnocení diagnostického výkonu biomarkerů methylace DNA a vypočítejte AUROC.

Etika a informovaný souhlas:

Tato studie byla schválena etickou komisí nemocnice a všichni účastníci musí podepsat informovaný souhlas.