Wykrywanie metylacji DNA moczu w celu oceny krwiomoczu

Metody

Projekt badania:

Jest to prospektywne badanie pilotażowe, którego celem jest ocena skuteczności biomarkerów metylacji DNA w wykrywaniu raka nabłonka dróg moczowych u pacjentów z krwiomoczem.

Obliczanie wielkości próbki:

Z naszych wcześniejszych obserwacji wynika, że ​​częstość występowania raka nabłonka dróg moczowych u pacjentów z krwiomoczem wynosi 20–30%, czyli jest nieco wyższa niż podana w innej literaturze. Dlatego postawiliśmy hipotezę, że 25% pacjentów w kohorcie z krwiomoczem ma UC. Współczynnik alokacji grupowej (R): N-/N+ = 75%/25% = 3.

Założenia:

Pole pod krzywą (AUC) pod H0: 0,5 AUC pod H1: 0,8 Moc: 0,95 Poziom istotności (Alfa): 0,05 Typ danych: Ciągły zakres FPR: 0,00 do 1,00

Wyniki: Użycie oprogramowania PASS 15.0 do obliczenia wielkości próby w celu zapewnienia wystarczającej mocy statystycznej. Obliczona wielkość próbki wynosi:

N+ (liczba pacjentów z WZJG): 14 N- (liczba pacjentów bez WZJG): 42 Całkowita wielkość próby (N): 56

Biorąc pod uwagę 20% wskaźnik rezygnacji, skorygowana wielkość próby wynosi:

N+': 18 N-': 53 Całkowita wielkość próbki (N'): 71

Kryteria włączenia i wykluczenia:

Kryteria przyjęcia:

Wiek od 18 do 99 lat, z krwiomoczem dużym lub mikroskopowym (>5/HP). Możliwość oddania 50 ml moczu do badania przed zabiegiem. Zgoda na udział w badaniu i podpisanie formularza świadomej zgody.

Kryteria wyłączenia:

Z nowotworem złośliwym w wywiadzie lub współistniejącymi nowotworami innymi niż wrzodziejące zapalenie jelita grubego. Ciężkie zakażenie dróg moczowych prowadzące do sepsy. Pacjenci z cewnikami założonymi na stałe, nefrostomią lub cystostomią. Ciężka niewydolność wątroby lub nerek lub inne stany uznane za nieodpowiednie do badania.

Pacjenci, którzy z różnych powodów nie byli poddawani leczeniu chirurgicznemu. Próbki z niewystarczającą zawartością DNA lub innymi błędami kontroli jakości.

Kolekcja próbek:

Lekarze będą pobierać świeże próbki moczu od włączonych pacjentów z krwiomoczem i rejestrować ich podstawowe informacje, dane kliniczne i historię medyczną.

Próbki zostaną losowo ponumerowane i przekazane personelowi zajmującemu się badaniem metylacji DNA w celu zapewnienia oślepienia.

Metoda testowania:

Personel przeprowadzający testy przeanalizuje próbki moczu przy użyciu metod badania metylacji DNA opartych na MSRE-qPCR w celu oceny poziomu metylacji DNA.

Odślepianie i organizacja danych:

Po pomyślnym zarejestrowaniu i przetestowaniu ostatniej próbki personel nierekrutujący i personel testujący odślepią próbki i zorganizują informacje kliniczne i patologiczne.

Analiza danych:

Stosowanie wyników patologicznych jako złotego standardu. Oblicz czułość, swoistość, dodatnią i ujemną wartość predykcyjną biomarkerów metylacji DNA.

Użyj metod statystycznych (takich jak krzywe ROC), aby ocenić skuteczność diagnostyczną biomarkerów metylacji DNA i obliczyć AUROC.

Etyka i świadoma zgoda:

Badanie to zostało zatwierdzone przez szpitalną komisję etyczną, a wszyscy uczestnicy muszą podpisać formularz świadomej zgody.