Обнаружение метилирования ДНК мочи для оценки гематурии

Методы

Дизайн исследования:

Это проспективное пилотное исследование, направленное на оценку эффективности биомаркеров метилирования ДНК при выявлении уротелиальной карциномы у пациентов с гематурией.

Расчет размера выборки:

По нашим предыдущим наблюдениям, частота уротелиальной карциномы у пациентов с гематурией составляет 20-30%, что несколько выше, чем сообщается в другой литературе. Таким образом, мы предполагаем, что 25% пациентов в когорте гематурии имеют ЯК. Коэффициент группового распределения (R): N-/N+ = 75%/25% = 3.

Предположения:

Площадь под кривой (AUC) при H0: 0,5 AUC при H1: 0,8 Мощность: 0,95 Уровень значимости (Альфа): 0,05 Тип данных: Непрерывный диапазон FPR: от 0,00 до 1,00

Результаты: Использование программного обеспечения PASS 15.0 для расчета размера выборки для обеспечения достаточной статистической мощности. Расчетный размер выборки составляет:

N+ (количество пациентов с ЯК): 14 N- (количество пациентов без ЯК): 42 Общий размер выборки (N): 56

Учитывая уровень отсева в 20%, скорректированный размер выборки составит:

N+': 18 N-': 53 Общий размер выборки (N'): 71

Критерии включения и исключения:

Критерии включения:

Возраст от 18 до 99 лет, с макро- или микроскопической гематурией (>5/HP). Перед операцией можно сдать 50 мл мочи на анализ. Согласие на участие в исследовании и подписание формы информированного согласия.

Критерий исключения:

Со злокачественными новообразованиями в анамнезе или сопутствующими злокачественными новообразованиями, кроме ЯК. Тяжелая инфекция мочевыводящих путей, приводящая к сепсису. Пациенты с постоянными катетерами, нефростомой или цистостомой. Тяжелая печеночная или почечная недостаточность или другие состояния, которые считаются неподходящими для исследования.

Пациенты, не подвергшиеся хирургическому лечению по разным причинам. Образцы с недостаточным содержанием ДНК или другими нарушениями контроля качества.

Сбор образцов:

Клиницисты будут собирать свежие образцы мочи у зарегистрированных пациентов с гематурией и записывать их основную информацию, клиническую информацию и историю болезни.

Образцы будут пронумерованы случайным образом и предоставлены персоналу, проводящему тестирование на метилирование ДНК, для обеспечения ослепления.

Метод тестирования:

Персонал, проводящий тестирование, будет анализировать образцы мочи, используя методы тестирования метилирования ДНК на основе MSRE-qPCR, чтобы оценить уровни метилирования ДНК.

Раскрытие информации и организация данных:

После того, как последний образец будет успешно зарегистрирован и протестирован, ненабираемый персонал и персонал, занимающийся тестированием, раскроет образцы и систематизирует клиническую и патологоанатомическую информацию.

Анализ данных:

Использование патологических результатов в качестве золотого стандарта. Рассчитайте чувствительность, специфичность, положительную прогностическую ценность и отрицательную прогностическую ценность биомаркеров метилирования ДНК.

Используйте статистические методы (например, кривые ROC) для оценки диагностической эффективности биомаркеров метилирования ДНК и расчета AUROC.

Этика и информированное согласие:

Это исследование было одобрено комитетом по этике больницы, и все участники должны подписать форму информированного согласия.