Studie av faktorer som påverkar dynamiken i kolonisering och avkolonisering av matsmältningskanalen av Clostridioides difficile hos spädbarn (BBDIFF)

Clostridioides difficile (tidigare C. difficile) är en bakterie som finns i form av sporer (en resistent form) som patienter kan utsättas för i en sjukhusmiljö. Efter intag kan sporen gro i matsmältningskanalen i sin vegetativa form (bakteriens aktiva form) och tar sedan utseendet av en grampositiv stav som koloniserar matsmältningskanalens mikrobiota. Detta preliminära stadium av matsmältningskanalens kolonisering av bakterien underlättas av vissa faktorer, särskilt exponering för antibiotika, som stör sammansättningen av matsmältningskanalens mikrobiota (dysbios) och därmed underlättar etableringen av C. difficile efter att barriäreffekten av matsmältningskanalens mikrobiota har tagits bort. Vissa stammar (kända som "toksinogena") kan sedan producera de huvudsakliga virulensfaktorerna (toksin A (TcdA) och B (TcdB)), vilket orsakar de huvudsakliga kliniska tecknen på matsmältningsinfektion, särskilt hos patienter med riskfaktorer för C. difficile-infektion (äldre personer, progressiv cancer, immundepression, etc.). Behandlingen av CDI baseras huvudsakligen på oral administration av anti-Clostridioides difficile-antibiotika som Fidaxomicin (FDX) eller Vancomycin (VAN) under en period av 10 dagar, enligt de europeiska rekommendationerna från ESCMID och de amerikanska rekommendationerna från IDSA. Trots effektiv behandling kännetecknas CDI av en hög återfallsgrad på upp till 25 % av fallen, med flera återfall som kan vara särskilt försvagande för patienter. Effekten av störning av tarmmikrobiotan (dysbios) efter exponering för antibiotika kan förklaras av flera icke-uteslutande hypoteser, såsom försvinnandet av skyddande bakteriearter i tarmmikrobiotan eller, omvänt, uppkomsten av bakteriearter som gynnar koloniseringen av C. difficile.

Inläggning på sjukhus, och mer generellt vård, har ofta identifierats som en riskfaktor för CDI. C. difficile finns allestädes i miljön och förorenar livsmedelsprodukter. Det är fortfarande svårt att bedöma frekvensen av kontaminering genom intag av förorenad mat och den potentiella koloniseringen av värden.

Endast sammansättningen av tarmmikrobiotan verkar vara en intressant väg att utforska, särskilt eftersom den förändras avsevärt under det första levnadsåret när viktiga händelser inträffar, inklusive kostdiversifiering med introduktion av den första fasta maten.