Undersøgelse af faktorer, der påvirker dynamikken i kolonisering og dekolonisering af fordøjelseskanalen med Clostridioides difficile hos spædbørn (BBDIFF)

Clostridioides difficile (tidligere C. difficile) er en bakterie, der findes i form af sporer (en modstandsdygtig form), som patienter kan blive udsat for i et hospitalsmiljø. Når de er indtaget, kan sporen spire i fordøjelseskanalen i sin vegetative form (bakteriens aktive form) og tager derefter udseendet af en grampositiv bacil, der koloniserer den digestive mikrobiota. Dette indledende stadium af digestiv kolonisering af bakterien understøttes af visse faktorer, især eksponering for antibiotika, som forstyrrer sammensætningen af den digestive mikrobiota (dysbiose) og dermed letter etableringen af C. difficile efter fjernelse af barrieren fra den digestive mikrobiota. Visse stammer (kendt som "toksinproducerende") er derefter i stand til at producere de vigtigste virulensfaktorer (toksin A (TcdA) og B (TcdB)), hvilket forårsager de vigtigste kliniske tegn på digestiv infektion, især hos patienter med risikofaktorer for C. difficile-infektion (ældre mennesker, progressiv kræft, immundepression osv.). Behandlingen af CDI er hovedsageligt baseret på oral administration af anti-Clostridioides difficile-antibiotika såsom Fidaxomicin (FDX) eller Vancomycin (VAN) i en periode på 10 dage, i henhold til de europæiske anbefalinger fra ESCMID og de amerikanske anbefalinger fra IDSA. På trods af effektiv behandling er CDI kendetegnet ved en høj recidivrate på op til 25% af tilfældene, med flere recidiver, der kan være særligt invalidiserende for patienterne. Effekten af forstyrrelse af tarmmikrobiotaen (dysbiose) efter eksponering for antibiotika kan forklares af flere ikke-udelukkende hypoteser, såsom forsvinden af beskyttende bakteriearter i tarmmikrobiotaen eller omvendt fremkomsten af bakteriearter, der favoriserer koloniseringen af C. difficile.

Indlæggelse på hospital, og mere generelt sundhedspleje, er ofte blevet identificeret som en risikofaktor for CDI. Faktisk findes C. difficile allestedsnærværende i miljøet og kontaminerer fødevareprodukter. Det er stadig svært at vurdere hyppigheden af kontaminering gennem indtagelse af kontamineret mad og den potentielle kolonisering af værten.

Kun sammensætningen af tarmmikrobiotaen synes at være en interessant vej at udforske, især da den ændrer sig markant i løbet af det første leveår, når vigtige begivenheder indtræffer, herunder kostdiversificering med introduktionen af de første faste fødevarer.