Badanie czynników wpływających na dynamikę kolonizacji i dekolonizacji przewodu pokarmowego przez Clostridioides difficile u niemowląt (BBDIFF)

Clostridioides difficile (dawniej C. difficile) to bakteria występująca w postaci zarodników (formy opornej), na które pacjenci mogą być narażeni w środowisku szpitalnym. Po spożyciu zarodnik może wykiełkować w przewodzie pokarmowym w swojej formie wegetatywnej (aktywnej formie bakterii), a następnie przybiera postać Gram-dodatniej pałeczki, która kolonizuje mikrobiotę jelitową. Ten wstępny etap kolonizacji jelit przez bakterię jest ułatwiany przez pewne czynniki, w szczególności ekspozycję na antybiotyki, które zaburzają skład mikrobioty jelitowej (dysbioza), a tym samym ułatwiają zasiedlenie przez C. difficile po usunięciu efektu barierowego mikrobioty jelitowej. Niektóre szczepy (zwane "toksynotwórczymi") są wówczas zdolne do wytwarzania głównych czynników wirulencji (toksyn A (TcdA) i B (TcdB)), powodując w ten sposób główne objawy kliniczne infekcji jelitowej, szczególnie u pacjentów z czynnikami ryzyka zakażenia C. difficile (osoby starsze, postępujący nowotwór, niedobór odporności itp.). Leczenie CDI opiera się głównie na doustnym podawaniu antybiotyków przeciwko Clostridioides difficile, takich jak fidaksomycyna (FDX) lub wankomycyna (VAN), przez okres 10 dni, zgodnie z europejskimi zaleceniami ESCMID oraz amerykańskimi zaleceniami IDSA. Pomimo skutecznego leczenia, CDI charakteryzuje się wysokim wskaźnikiem nawrotów, sięgającym nawet 25% przypadków, z wielokrotnymi nawrotami, które mogą być szczególnie wyniszczające dla pacjentów. Efekt zaburzenia mikrobioty jelitowej (dysbioza) po ekspozycji na antybiotyki można wyjaśnić kilkoma nie wykluczającymi się hipotezami, takimi jak zanik ochronnych gatunków bakterii w mikrobioicie jelitowej lub, przeciwnie, pojawienie się gatunków bakterii sprzyjających kolonizacji C. difficile.

Hospitalizacja, a ogólniej opieka zdrowotna, często była identyfikowana jako czynnik ryzyka CDI. Rzeczywiście, C. difficile występuje wszechobecnie w środowisku i zanieczyszcza produkty spożywcze. Wciąż trudno jest ocenić częstotliwość zakażeń poprzez spożycie skażonej żywności i potencjalną kolonizację gospodarza.

Tylko skład mikrobioty jelitowej wydaje się interesującą ścieżką do zbadania, zwłaszcza że zmienia się on znacząco w pierwszym roku życia, gdy mają miejsce ważne wydarzenia, w tym różnicowanie diety wraz z wprowadzaniem pierwszych stałych pokarmów.