- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT01889992
Remodelace srdečního aloštěpu a účinky sirolimu (CAR)
Remodelace srdečního aloštěpu a účinky sirolimu na jeho progresi
Remodelace srdečního aloštěpu způsobuje špatnou kvalitu života, selhání aloštěpu a zvýšenou mortalitu po transplantaci srdce. Rizikové faktory pro remodelaci srdečního aloštěpu a jeho progresi jsou špatně definovány a je zapotřebí účinných intervencí. Jedná se o multifaktoriální fenomén spojený s různými imunologickými i neimunologickými faktory. Studie na zvířatech naznačují, že inhibice M-TOR zeslabuje remodelaci srdečního aloštěpu sekundárně k down-regulaci M-TOR downstream cílů a zvýšené autofagii. Existuje nedostatek údajů o účinku sirolimu, inhibitoru M-TOR, na remodelaci lidského srdce.
Cílem návrhu je identifikovat prevalenci remodelace srdečního aloštěpu na současných imunosupresivních strategiích a určit rizikové faktory jejího rozvoje. Identifikuje také molekulární dráhy spojené s remodelací srdečního aloštěpu a určí dopad sirolimu na tyto dráhy.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Transplantace srdce se stala dobře zavedenou léčebnou možností pro pacienty s konečným stadiem srdečního onemocnění a v současnosti má jednoroční míru přežití 90 %, pětiletou míru přežití 70 % a desetiletou míru přežití 50 %. . Zavedení antirejekční léčby před třiceti lety léky známými jako inhibitory kalcineurinu vedlo k výraznému zlepšení přežití příjemců srdečního transplantátu. K většině tohoto zlepšení však dochází během prvního roku po transplantaci. Po prvním roce se úmrtnost příjemců srdečního transplantátu nezměnila, což naznačuje, že příčiny pozdních komplikací nebyly v posledních třech desetiletích ovlivněny zlepšením potransplantační péče. Ukazuje se, že pro zlepšení pozdních výsledků je třeba zaměření výzkumu transplantace srdce přesunout na prevenci a léčbu pozdních komplikací.
Remodelace srdečního aloštěpu (CAR), neboli změny v geometrickém vzoru srdce, je jednou z častých komplikací po transplantaci srdce a často způsobuje špatnou kvalitu života, srdeční selhání a snížené přežití. Rizikové faktory a mechanismus rozvoje a progrese CAR jsou špatně definovány a pro tento stav neexistuje účinná léčba. V navrhované studii budeme identifikovat prevalenci, rizikové faktory a vliv CAR na fyzickou kapacitu, kardiovaskulární onemocnění a přežití pacientů po transplantaci srdce. Pro posouzení geometrie srdce využijeme zobrazování srdeční magnetickou rezonancí (CMRI), techniku používanou k detailnímu zobrazení vnitřních struktur těla. CMRI je považováno za „zlatý standard“ pro hodnocení struktury a funkce srdce. Budeme také hodnotit molekulární a genetické markery spojené s rozvojem a progresí CAR po transplantaci srdce.
Lék Sirolimus, nové činidlo proti rejekci, lze po transplantaci srdce použít místo inhibitorů kalcineurinu. Nedávné experimentální studie a studie na zvířatech ukazují, že sirolimus může zmírnit změny v geometrii srdce po transplantaci (tj. CAR) a zlepšit srdeční funkci. Posoudíme účinek sirolimu na CAR u lidí a vyhodnotíme molekulární a genetické markery spojené s tímto účinkem.
Naším cílem je poskytnout důležitý pohled na povahu CAR po transplantaci srdce a její reakci na nový lék proti rejekci Sirolimus. Tyto informace budou mít významný dopad na léčbu příjemců srdečního transplantátu a tím zlepší kvalitu života a prodlouží přežití po transplantaci srdce.
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Fáze
- Fáze 1
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Nebraska
-
Omaha, Nebraska, Spojené státy, 68198
- University of Nebraska Medical Center
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Všichni dospělí příjemci srdečního transplantátu podstupující transplantaci srdce v UNMC/TNMC.
Kritéria vyloučení:
- Dospělí příjemci srdečního transplantátu s akutní rejekcí (ISHLT R> stupeň 2) nebo akutní infekcí.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: Léčba
- Přidělení: Randomizované
- Intervenční model: Přiřazení jedné skupiny
- Maskování: Žádné (otevřený štítek)
Zbraně a zásahy
Skupina účastníků / Arm |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Aktivní komparátor: Srdeční biopsie C4D barvení
Postup, který odebere velmi malý vzorek vašeho srdečního svalu, aby jej bylo možné vyhodnotit v laboratoři.
Tento postup lze provést k určení příčiny srdeční myopatie (oslabený srdeční sval) nebo ke kontrole odmítnutí po transplantaci srdce.
|
Dlouhá tenká hadička zvaná bioptický katétr se zavede žilou na krku nebo grionu a vede se krevními cévami do srdce.
Ostatní jména:
|
|
Experimentální: Genetický mechanismus M-TOR
Identifikovat molekulární a genetické mechanismy spojené s rozvojem časné posttransplantační CAR a vyhodnotit dopad mTOR-inhibitoru Sirolimu na tento proces. Dávkování sirolimu je založeno na hladinách v krvi. |
Identifikovat molekulární a genetické mechanismy spojené s rozvojem časné posttransplantační CAR a vyhodnotit dopad mTOR-inhibitoru Sirolimu na tento proces.
|
|
Aktivní komparátor: Srdeční MRI
Srdeční magnetická rezonance (MRI) nevytváří žádné vedlejší účinky magnetických polí a rádiových vln a nenese riziko rakoviny nebo vrozených vad.
Vážné reakce na speciální kontrastní barviva používaná pro MRI jsou velmi vzácné.
Vyšetření magnetickou rezonancí nepředstavuje pro průměrného pacienta při dodržení příslušných bezpečnostních pokynů téměř žádné riziko, jsou však možné vedlejší účinky, mezi které patří bolest hlavy, nevolnost, závratě, změny chuti a alergické reakce.
Takové reakce jsou obvykle mírné a snadno kontrolovatelné léky.
|
1 měsíc po HTx, rok 1 a rok 2 roční příspěvek HTx eval.
CMRI dokončeny pomocí 1,5-Tesla celotělového MRI systému.
Skautské snímky určí pohledy srdce v krátké a dlouhé ose.
Získá se EKG-gated cine MR se 3 dlouhými osami a souvislou krátkou osou orientace.
T1-vážené obrazy zpožděného vylepšení budou získány 10 minut po injekci kontrastní látky na bázi gadolinia.
Měření z každého řezu budou sečtena pomocí metody disků.
Hmotnost myokardu bude odhadnuta vynásobením objemu stěny myokardu na konci diastoly specifickou hmotností svalu (1,05 g/ml) a hypertrofie LK bude definována jako hmotnost LK indexovaná k výšce v metrech 2,7 >/=35,8 g/m 2,7) (18).
Zpožděné vylepšení gadolinia bude definováno jako jakýkoli vzor vylepšení větší než 0 %.
|
|
Aktivní komparátor: Koronární angiografie s IVUS
Koronární angiografie je test, který používá barvivo a speciální rentgenové paprsky k zobrazení vnitřku vašich koronárních tepen. Koronární tepny dodávají vašemu srdci krev bohatou na kyslík. Intravaskulární ultrazvuk je test, který využívá zvukové vlny k vidění uvnitř krevních cév. Tento článek pojednává o intravaskulárním ultrazvuku k vidění uvnitř koronárních tepen, krevních cév, které zásobují srdce. |
Koronární angiografie je test, který používá barvivo a speciální rentgenové paprsky k zobrazení vnitřku vašich koronárních tepen. Koronární tepny dodávají vašemu srdci krev bohatou na kyslík. Intravaskulární ultrazvuk je test, který využívá zvukové vlny k vidění uvnitř krevních cév. Tento článek pojednává o intravaskulárním ultrazvuku k vidění uvnitř koronárních tepen, krevních cév, které zásobují srdce. |
|
Aktivní komparátor: Kardiopulmonální zátěžový test (CPET)
Je vysoce citlivý, neinvazivní zátěžový test.
Je považován za zátěžový test, protože cvičení stresuje systémy vašeho těla tím, že je nutí pracovat rychleji a tvrději.
Onemocnění nebo stav, který postihuje srdce, plíce nebo svaly, omezí, jak rychleji a tvrději mohou tyto systémy pracovat.
CPET hodnotí, jak dobře srdce, plíce a svaly pracují jednotlivě a jak tyto systémy fungují jednotně.
Vaše srdce a plíce spolupracují na dodávání kyslíku do vašich svalů, kde se používá k výrobě energie a k odstraňování oxidu uhličitého z těla.
|
Kardiopulmonální zátěžový test je vysoce citlivý, neinvazivní zátěžový test.
Je považován za zátěžový test, protože cvičení stresuje systémy vašeho těla tím, že je nutí pracovat rychleji a tvrději.
Onemocnění nebo stav, který postihuje srdce, plíce nebo svaly, omezí, jak rychleji a tvrději mohou tyto systémy pracovat.
CPET hodnotí, jak dobře srdce, plíce a svaly pracují jednotlivě a jak tyto systémy fungují jednotně.
Vaše srdce a plíce spolupracují na dodávání kyslíku do vašich svalů, kde se používá k výrobě energie a k odstraňování oxidu uhličitého z těla.
Ostatní jména:
|
|
Experimentální: MTor Imunosuprese
Sirolimus Dávkování sirolimu je založeno na hladinách v krvi. Posoudit potenciál imunosupresiva mTOR Sirolimus v atenuaci CAR u příjemců HTx, a proto zlepšit již existující funkci srdečního aloštěpu, vaskulopatii a zátěžovou kapacitu. |
1 měsíc po HTx, rok 1 a rok 2 roční příspěvek HTx eval.
CMRI dokončeny pomocí 1,5-Tesla celotělového MRI systému.
Skautské snímky určí pohledy srdce v krátké a dlouhé ose.
Získá se EKG-gated cine MR se 3 dlouhými osami a souvislou krátkou osou orientace.
T1-vážené obrazy zpožděného vylepšení budou získány 10 minut po injekci kontrastní látky na bázi gadolinia.
Měření z každého řezu budou sečtena pomocí metody disků.
Hmotnost myokardu bude odhadnuta vynásobením objemu stěny myokardu na konci diastoly specifickou hmotností svalu (1,05 g/ml) a hypertrofie LK bude definována jako hmotnost LK indexovaná k výšce v metrech 2,7 >/=35,8 g/m 2,7) (18).
Zpožděné vylepšení gadolinia bude definováno jako jakýkoli vzor vylepšení větší než 0 %.
Koronární angiografie je test, který používá barvivo a speciální rentgenové paprsky k zobrazení vnitřku vašich koronárních tepen. Koronární tepny dodávají vašemu srdci krev bohatou na kyslík. Intravaskulární ultrazvuk je test, který využívá zvukové vlny k vidění uvnitř krevních cév. Tento článek pojednává o intravaskulárním ultrazvuku k vidění uvnitř koronárních tepen, krevních cév, které zásobují srdce.
Chirurgický zákrok, při kterém je nemocné srdce nahrazeno zdravým srdcem zemřelého člověka.
Ostatní jména:
Sirolimus (INN/USAN), také známý jako rapamycin, je imunosupresivní lék používaný k prevenci rejekce při transplantaci orgánů; je zvláště užitečný při transplantacích ledvin. Zabraňuje aktivaci T lymfocytů a B lymfocytů inhibicí jejich reakce na interleukin-2 (IL-2). Dávkování sirolimu na základě hladin v krvi.
Ostatní jména:
|
|
Experimentální: Remodelace srdečního aloštěpu
Chirurgický zákrok, při kterém je nemocné srdce nahrazeno zdravým srdcem zemřelého člověka.
|
Chirurgický zákrok, při kterém je nemocné srdce nahrazeno zdravým srdcem zemřelého člověka.
Ostatní jména:
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Hodnocení hypertrofie levé komory
Časové okno: Jeden rok
|
Primárním koncovým bodem bude změna od výchozí hodnoty v hmotnosti LK indexované na výšku v metrech 2,7 a soustřednost LK hodnocená pomocí MRI během 12 měsíců léčby.
|
Jeden rok
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Posuďte výsledky
Časové okno: Jeden rok
|
Sekundárními koncovými body budou změny od základní linie ve funkci LV.
|
Jeden rok
|
|
Přístup k výsledkům
Časové okno: Jeden rok
|
Výkon při cvičení (vrchol VO2, ekvivalent pro oxid uhličitý (VE/VCO2) a ztluštění intimy koronární cévy.
|
Jeden rok
|
Další výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Bezpečnostní koncové body
Časové okno: Tři roky
|
Bezpečnostní koncové body budou SRL vedlejší účinky a prevalence akutní buněčné srdeční rejekce (ISHLT ≥ 2R) a AMR.
|
Tři roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Brian Lowes, MD, University of Nebraska
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Grossman E, Messerli FH. Hypertension and diabetes. Adv Cardiol. 2008;45:82-106. doi: 10.1159/000115189.
- Levy D, Garrison RJ, Savage DD, Kannel WB, Castelli WP. Prognostic implications of echocardiographically determined left ventricular mass in the Framingham Heart Study. N Engl J Med. 1990 May 31;322(22):1561-6. doi: 10.1056/NEJM199005313222203.
- Koren MJ, Devereux RB, Casale PN, Savage DD, Laragh JH. Relation of left ventricular mass and geometry to morbidity and mortality in uncomplicated essential hypertension. Ann Intern Med. 1991 Mar 1;114(5):345-52. doi: 10.7326/0003-4819-114-5-345.
- Esposito G, Rapacciuolo A, Naga Prasad SV, Rockman HA. Cardiac hypertrophy: role of G protein-coupled receptors. J Card Fail. 2002 Dec;8(6 Suppl):S409-14. doi: 10.1054/jcaf.2002.129283.
- Goodroe R, Bonnema DD, Lunsford S, Anderson P, Ryan-Baille B, Uber W, Ikonomidis J, Crumbley AJ, VanBakel A, Zile MR, Pereira N. Severe left ventricular hypertrophy 1 year after transplant predicts mortality in cardiac transplant recipients. J Heart Lung Transplant. 2007 Feb;26(2):145-51. doi: 10.1016/j.healun.2006.11.003.
- Tischler MD, Lee RT, Plappert T, Mudge GH, St John Sutton M, Parker JD. Serial assessment of left ventricular function and mass after orthotopic heart transplantation: a 4-year longitudinal study. J Am Coll Cardiol. 1992 Jan;19(1):60-6. doi: 10.1016/0735-1097(92)90052-o. Erratum In: J Am Coll Cardiol 1994 Jan;23(1):281.
- Vigneswaran WT, Rumberger JA, Rodeheffer RJ, Breen JF, McGregor CG. Ventricular remodeling after orthotopic cardiac transplantation. Mayo Clin Proc. 1996 Aug;71(8):735-42. doi: 10.4065/71.8.735.
- Raichlin E, Villarraga HR, Chandrasekaran K, Clavell AL, Frantz RP, Kushwaha SS, Rodeheffer RJ, McGregor CG, Daly RC, Park SJ, Kremers WK, Edwards BS, Pereira NL. Cardiac allograft remodeling after heart transplantation is associated with increased graft vasculopathy and mortality. Am J Transplant. 2009 Jan;9(1):132-9. doi: 10.1111/j.1600-6143.2008.02474.x. Epub 2008 Nov 27.
- Hosenpud JD, Norman DJ, Cobanoglu MA, Floten HS, Conner RM, Starr A. Serial echocardiographic findings early after heart transplantation: evidence for reversible right ventricular dysfunction and myocardial edema. J Heart Transplant. 1987 Nov-Dec;6(6):343-7.
- Raichlin E, Al-Omari MA, Hayes CL, Edwards BS, Frantz RP, Boilson BA, Clavell AL, Rodeheffer RJ, Schirger JA, Kushwaha SS, Allison TG, Pereira NL. Cardiac allograft hypertrophy is associated with impaired exercise tolerance after heart transplantation. J Heart Lung Transplant. 2011 Oct;30(10):1153-60. doi: 10.1016/j.healun.2011.04.012. Epub 2011 May 31.
- Doggrell SA. Is everolimus useful in preventing allograft rejection and vasculopathy after heart transplant? Expert Opin Investig Drugs. 2004 Feb;13(2):161-3. doi: 10.1517/13543784.13.2.161.
- Mancini D, Pinney S, Burkhoff D, LaManca J, Itescu S, Burke E, Edwards N, Oz M, Marks AR. Use of rapamycin slows progression of cardiac transplantation vasculopathy. Circulation. 2003 Jul 8;108(1):48-53. doi: 10.1161/01.CIR.0000070421.38604.2B. Epub 2003 May 12.
- Raichlin E, Bae JH, Khalpey Z, Edwards BS, Kremers WK, Clavell AL, Rodeheffer RJ, Frantz RP, Rihal C, Lerman A, Kushwaha SS. Conversion to sirolimus as primary immunosuppression attenuates the progression of allograft vasculopathy after cardiac transplantation. Circulation. 2007 Dec 4;116(23):2726-33. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.107.692996. Epub 2007 Nov 19.
- Raichlin E, Edwards BS, Kremers WK, Clavell AL, Rodeheffer RJ, Frantz RP, Pereira NL, Daly RC, McGregor CG, Lerman A, Kushwaha SS. Acute cellular rejection and the subsequent development of allograft vasculopathy after cardiac transplantation. J Heart Lung Transplant. 2009 Apr;28(4):320-7. doi: 10.1016/j.healun.2009.01.006.
- Patel PC, Reimold SC, Araj FG, Ayers CR, Kaiser PA, Peshock RM, Yancy CW, Ring WS, Gupta S, Mishkin JD, Mammen PP, Markham DW, Drazner MH. Concentric left ventricular hypertrophy as assessed by cardiac magnetic resonance imaging and risk of death in cardiac transplant recipients. J Heart Lung Transplant. 2010 Dec;29(12):1369-79. doi: 10.1016/j.healun.2010.05.008.
- Kuppahally SS, Valantine HA, Weisshaar D, Parekh H, Hung YY, Haddad F, Fowler M, Vagelos R, Perlroth MG, Robbins RC, Hunt SA. Outcome in cardiac recipients of donor hearts with increased left ventricular wall thickness. Am J Transplant. 2007 Oct;7(10):2388-95. doi: 10.1111/j.1600-6143.2007.01930.x.
- Stewart S, Winters GL, Fishbein MC, Tazelaar HD, Kobashigawa J, Abrams J, Andersen CB, Angelini A, Berry GJ, Burke MM, Demetris AJ, Hammond E, Itescu S, Marboe CC, McManus B, Reed EF, Reinsmoen NL, Rodriguez ER, Rose AG, Rose M, Suciu-Focia N, Zeevi A, Billingham ME. Revision of the 1990 working formulation for the standardization of nomenclature in the diagnosis of heart rejection. J Heart Lung Transplant. 2005 Nov;24(11):1710-20. doi: 10.1016/j.healun.2005.03.019. Epub 2005 Jun 20.
- Billingham M, Kobashigawa JA. The revised ISHLT heart biopsy grading scale. J Heart Lung Transplant. 2005 Nov;24(11):1709. doi: 10.1016/j.healun.2005.03.018. No abstract available.
- Grattan MT, Moreno-Cabral CE, Starnes VA, Oyer PE, Stinson EB, Shumway NE. Eight-year results of cyclosporine-treated patients with cardiac transplants. J Thorac Cardiovasc Surg. 1990 Mar;99(3):500-9.
- Lemstrom K, Sihvola R, Bruggeman C, Hayry P, Koskinen P. Cytomegalovirus infection-enhanced cardiac allograft vasculopathy is abolished by DHPG prophylaxis in the rat. Circulation. 1997 Jun 17;95(12):2614-6. doi: 10.1161/01.cir.95.12.2614.
- McDonald K, Rector TS, Braulin EA, Kubo SH, Olivari MT. Association of coronary artery disease in cardiac transplant recipients with cytomegalovirus infection. Am J Cardiol. 1989 Aug 1;64(5):359-62. doi: 10.1016/0002-9149(89)90535-3.
- Peura JL, Zile MR, Feldman DS, VanBakel AB, McClure C, Uber W, Haynes H, Pereira NL. Effects of conversion from cyclosporine to tacrolimus on left ventricular structure in cardiac allograft recipients. J Heart Lung Transplant. 2005 Nov;24(11):1969-72. doi: 10.1016/j.healun.2005.02.011.
- Karch SB, Billingham ME. Cyclosporine induced myocardial fibrosis: a unique controlled case report. J Heart Transplant. 1985 Feb;4(2):210-2.
- Aziz S, Soine LA, Lewis SL, Kruse AP, Levy WC, Wehe KM, Fishbien DP, Allen MD. Donor left ventricular hypertrophy increases risk for early graft failure. Transpl Int. 1997;10(6):446-50. doi: 10.1007/s001470050084.
- Lips DJ, deWindt LJ, van Kraaij DJ, Doevendans PA. Molecular determinants of myocardial hypertrophy and failure: alternative pathways for beneficial and maladaptive hypertrophy. Eur Heart J. 2003 May;24(10):883-96. doi: 10.1016/s0195-668x(02)00829-1.
- Molkentin JD, Lu JR, Antos CL, Markham B, Richardson J, Robbins J, Grant SR, Olson EN. A calcineurin-dependent transcriptional pathway for cardiac hypertrophy. Cell. 1998 Apr 17;93(2):215-28. doi: 10.1016/s0092-8674(00)81573-1.
- Malik FS, Mehra MR, Ventura HO, Smart FW, Stapleton DD, Ochsner JL. Management of cardiac allograft vasculopathy by transmyocardial laser revascularization. Am J Cardiol. 1997 Jul 15;80(2):224-5. doi: 10.1016/s0002-9149(97)00327-5.
- Costanzo MR, Naftel DC, Pritzker MR, Heilman JK 3rd, Boehmer JP, Brozena SC, Dec GW, Ventura HO, Kirklin JK, Bourge RC, Miller LW. Heart transplant coronary artery disease detected by coronary angiography: a multiinstitutional study of preoperative donor and recipient risk factors. Cardiac Transplant Research Database. J Heart Lung Transplant. 1998 Aug;17(8):744-53.
- Schwitter J, Saeed M, Wendland MF, Sakuma H, Bremerich J, Canet E, Higgins CB. Assessment of myocardial function and perfusion in a canine model of non-occlusive coronary artery stenosis using fast magnetic resonance imaging. J Magn Reson Imaging. 1999 Jan;9(1):101-10. doi: 10.1002/(sici)1522-2586(199901)9:13.0.co;2-9.
- Khanna AK, Cairns VR, Becker CG, Hosenpud JD. Transforming growth factor (TGF)-beta mimics and anti-TGF-beta antibody abrogates the in vivo effects of cyclosporine: demonstration of a direct role of TGF-beta in immunosuppression and nephrotoxicity of cyclosporine. Transplantation. 1999 Mar 27;67(6):882-9. doi: 10.1097/00007890-199903270-00016.
- Hojo M, Morimoto T, Maluccio M, Asano T, Morimoto K, Lagman M, Shimbo T, Suthanthiran M. Cyclosporine induces cancer progression by a cell-autonomous mechanism. Nature. 1999 Feb 11;397(6719):530-4. doi: 10.1038/17401.
- Zhang D, Gaussin V, Taffet GE, Belaguli NS, Yamada M, Schwartz RJ, Michael LH, Overbeek PA, Schneider MD. TAK1 is activated in the myocardium after pressure overload and is sufficient to provoke heart failure in transgenic mice. Nat Med. 2000 May;6(5):556-63. doi: 10.1038/75037.
- Feeley BT, Park AK, Hoyt EG, Robbins RC. Sulfasalazine inhibits reperfusion injury and prolongs allograft survival in rat cardiac transplants. J Heart Lung Transplant. 1999 Nov;18(11):1088-95. doi: 10.1016/s1053-2498(99)00078-9.
- Mijares A, Malecot CO, Peineau N, Argibay JA. In vivo and in vitro inhibition of the L-type calcium current in isolated guinea-pig cardiomyocytes by the immunosuppressive agent cyclosporin A. J Mol Cell Cardiol. 1997 Aug;29(8):2067-76. doi: 10.1006/jmcc.1997.0441.
- Marx SO, Reiken S, Hisamatsu Y, Jayaraman T, Burkhoff D, Rosemblit N, Marks AR. PKA phosphorylation dissociates FKBP12.6 from the calcium release channel (ryanodine receptor): defective regulation in failing hearts. Cell. 2000 May 12;101(4):365-76. doi: 10.1016/s0092-8674(00)80847-8.
- Globits S, De Marco T, Schwitter J, Sakuma H, O'Sullivan M, Rifkin C, Keith F, Chatterjee K, Parmley WW, Higgins CB. Assessment of early left ventricular remodeling in orthotopic heart transplant recipients with cine magnetic resonance imaging: potential mechanisms. J Heart Lung Transplant. 1997 May;16(5):504-10.
- Chareonthaitawee P, Christian TF, Miller TD, Hodge DO, Gibbons RJ. Correlation of resting first-pass left ventricular ejection fraction and resting myocardial infarct size. Am J Cardiol. 1998 Jun 1;81(11):1281-5. doi: 10.1016/s0002-9149(98)00156-8.
- Espino G, Denney J, Furlong T, Fitzsimmons W, Nash RA. Assessment of myocardial hypertrophy by echocardiography in adult patients receiving tacrolimus or cyclosporine therapy for prevention of acute GVHD. Bone Marrow Transplant. 2001 Dec;28(12):1097-103. doi: 10.1038/sj.bmt.1703304.
- Atkison P, Joubert G, Barron A, Grant D, Paradis K, Seidman E, Wall W, Rosenberg H, Howard J, Williams S, et al. Hypertrophic cardiomyopathy associated with tacrolimus in paediatric transplant patients. Lancet. 1995 Apr 8;345(8954):894-6. doi: 10.1016/s0140-6736(95)90011-x.
- Kushwaha SS, Raichlin E, Sheinin Y, Kremers WK, Chandrasekaran K, Brunn GJ, Platt JL. Sirolimus affects cardiomyocytes to reduce left ventricular mass in heart transplant recipients. Eur Heart J. 2008 Nov;29(22):2742-50. doi: 10.1093/eurheartj/ehn407. Epub 2008 Sep 11.
- Frey N, Barrientos T, Shelton JM, Frank D, Rutten H, Gehring D, Kuhn C, Lutz M, Rothermel B, Bassel-Duby R, Richardson JA, Katus HA, Hill JA, Olson EN. Mice lacking calsarcin-1 are sensitized to calcineurin signaling and show accelerated cardiomyopathy in response to pathological biomechanical stress. Nat Med. 2004 Dec;10(12):1336-43. doi: 10.1038/nm1132. Epub 2004 Nov 14.
- Armstrong AT, Binkley PF, Baker PB, Myerowitz PD, Leier CV. Quantitative investigation of cardiomyocyte hypertrophy and myocardial fibrosis over 6 years after cardiac transplantation. J Am Coll Cardiol. 1998 Sep;32(3):704-10. doi: 10.1016/s0735-1097(98)00296-4.
- Rouleau JL, de Champlain J, Klein M, Bichet D, Moye L, Packer M, Dagenais GR, Sussex B, Arnold JM, Sestier F, et al. Activation of neurohumoral systems in postinfarction left ventricular dysfunction. J Am Coll Cardiol. 1993 Aug;22(2):390-8. doi: 10.1016/0735-1097(93)90042-y.
- Soonpaa MH, Kim KK, Pajak L, Franklin M, Field LJ. Cardiomyocyte DNA synthesis and binucleation during murine development. Am J Physiol. 1996 Nov;271(5 Pt 2):H2183-9. doi: 10.1152/ajpheart.1996.271.5.H2183.
- McGill CJ, Brooks G. Cell cycle control mechanisms and their role in cardiac growth. Cardiovasc Res. 1995 Oct;30(4):557-69. No abstract available.
- Brooks G, Poolman RA, McGill CJ, Li JM. Expression and activities of cyclins and cyclin-dependent kinases in developing rat ventricular myocytes. J Mol Cell Cardiol. 1997 Aug;29(8):2261-71. doi: 10.1006/jmcc.1997.0471.
- Poolman RA, Gilchrist R, Brooks G. Cell cycle profiles and expressions of p21CIP1 AND P27KIP1 during myocyte development. Int J Cardiol. 1998 Dec 1;67(2):133-42. doi: 10.1016/s0167-5273(98)00320-9.
- Capasso JM, Bruno S, Cheng W, Li P, Rodgers R, Darzynkiewicz Z, Anversa P. Ventricular loading is coupled with DNA synthesis in adult cardiac myocytes after acute and chronic myocardial infarction in rats. Circ Res. 1992 Dec;71(6):1379-89. doi: 10.1161/01.res.71.6.1379.
- Hannan KM, Brandenburger Y, Jenkins A, Sharkey K, Cavanaugh A, Rothblum L, Moss T, Poortinga G, McArthur GA, Pearson RB, Hannan RD. mTOR-dependent regulation of ribosomal gene transcription requires S6K1 and is mediated by phosphorylation of the carboxy-terminal activation domain of the nucleolar transcription factor UBF. Mol Cell Biol. 2003 Dec;23(23):8862-77. doi: 10.1128/MCB.23.23.8862-8877.2003.
- Molkentin JD. Calcineurin and beyond: cardiac hypertrophic signaling. Circ Res. 2000 Oct 27;87(9):731-8. doi: 10.1161/01.res.87.9.731.
- Schmelzle T, Hall MN. TOR, a central controller of cell growth. Cell. 2000 Oct 13;103(2):253-62. doi: 10.1016/s0092-8674(00)00117-3.
- Sehgal SN, Czerkawski H, Kudelski A, Pandev K, Saucier R, Vezina C. Ravidomycin (AY-25,545), a new antitumor antibiotic. J Antibiot (Tokyo). 1983 Apr;36(4):355-61. doi: 10.7164/antibiotics.36.355.
- Marx SO, Marks AR. Bench to bedside: the development of rapamycin and its application to stent restenosis. Circulation. 2001 Aug 21;104(8):852-5. doi: 10.1161/01.cir.104.8.852. No abstract available.
- Kushwaha SS, Khalpey Z, Frantz RP, Rodeheffer RJ, Clavell AL, Daly RC, McGregor CG, Edwards BS. Sirolimus in cardiac transplantation: use as a primary immunosuppressant in calcineurin inhibitor-induced nephrotoxicity. J Heart Lung Transplant. 2005 Dec;24(12):2129-36. doi: 10.1016/j.healun.2005.08.015.
- Hausleiter J, Kastrati A, Mehilli J, Vogeser M, Zohlnhofer D, Schuhlen H, Goos C, Pache J, Dotzer F, Pogatsa-Murray G, Dirschinger J, Heemann U, Schomig A; OSIRIS Investigators. Randomized, double-blind, placebo-controlled trial of oral sirolimus for restenosis prevention in patients with in-stent restenosis: the Oral Sirolimus to Inhibit Recurrent In-stent Stenosis (OSIRIS) trial. Circulation. 2004 Aug 17;110(7):790-5. doi: 10.1161/01.CIR.0000138935.17503.35. Epub 2004 Aug 9.
- McMullen JR, Shioi T, Zhang L, Tarnavski O, Sherwood MC, Dorfman AL, Longnus S, Pende M, Martin KA, Blenis J, Thomas G, Izumo S. Deletion of ribosomal S6 kinases does not attenuate pathological, physiological, or insulin-like growth factor 1 receptor-phosphoinositide 3-kinase-induced cardiac hypertrophy. Mol Cell Biol. 2004 Jul;24(14):6231-40. doi: 10.1128/MCB.24.14.6231-6240.2004. Erratum In: Mol Cell Biol. 2021 Jan 25;41(2):
- Shioi T, McMullen JR, Tarnavski O, Converso K, Sherwood MC, Manning WJ, Izumo S. Rapamycin attenuates load-induced cardiac hypertrophy in mice. Circulation. 2003 Apr 1;107(12):1664-70. doi: 10.1161/01.CIR.0000057979.36322.88. Epub 2003 Mar 17.
- Buss SJ, Muenz S, Riffel JH, Malekar P, Hagenmueller M, Weiss CS, Bea F, Bekeredjian R, Schinke-Braun M, Izumo S, Katus HA, Hardt SE. Beneficial effects of Mammalian target of rapamycin inhibition on left ventricular remodeling after myocardial infarction. J Am Coll Cardiol. 2009 Dec 15;54(25):2435-46. doi: 10.1016/j.jacc.2009.08.031.
- Li JM, Brooks G. Cell cycle regulatory molecules (cyclins, cyclin-dependent kinases and cyclin-dependent kinase inhibitors) and the cardiovascular system; potential targets for therapy? Eur Heart J. 1999 Mar;20(6):406-20. doi: 10.1053/euhj.1998.1308.
- Nourse J, Firpo E, Flanagan WM, Coats S, Polyak K, Lee MH, Massague J, Crabtree GR, Roberts JM. Interleukin-2-mediated elimination of the p27Kip1 cyclin-dependent kinase inhibitor prevented by rapamycin. Nature. 1994 Dec 8;372(6506):570-3. doi: 10.1038/372570a0.
- Nakayama K, Ishida N, Shirane M, Inomata A, Inoue T, Shishido N, Horii I, Loh DY, Nakayama K. Mice lacking p27(Kip1) display increased body size, multiple organ hyperplasia, retinal dysplasia, and pituitary tumors. Cell. 1996 May 31;85(5):707-20. doi: 10.1016/s0092-8674(00)81237-4.
- Hauck L, Harms C, An J, Rohne J, Gertz K, Dietz R, Endres M, von Harsdorf R. Protein kinase CK2 links extracellular growth factor signaling with the control of p27(Kip1) stability in the heart. Nat Med. 2008 Mar;14(3):315-24. doi: 10.1038/nm1729. Epub 2008 Mar 2. Erratum In: Nat Med. 2008 May;14(5):585. An, Junfeng [added].
- Kato JY, Matsuoka M, Polyak K, Massague J, Sherr CJ. Cyclic AMP-induced G1 phase arrest mediated by an inhibitor (p27Kip1) of cyclin-dependent kinase 4 activation. Cell. 1994 Nov 4;79(3):487-96. doi: 10.1016/0092-8674(94)90257-7.
- Kitsis RN, Peng CF, Cuervo AM. Eat your heart out. Nat Med. 2007 May;13(5):539-41. doi: 10.1038/nm0507-539. No abstract available.
- Nakai A, Yamaguchi O, Takeda T, Higuchi Y, Hikoso S, Taniike M, Omiya S, Mizote I, Matsumura Y, Asahi M, Nishida K, Hori M, Mizushima N, Otsu K. The role of autophagy in cardiomyocytes in the basal state and in response to hemodynamic stress. Nat Med. 2007 May;13(5):619-24. doi: 10.1038/nm1574. Epub 2007 Apr 22.
- Rubinsztein DC, Gestwicki JE, Murphy LO, Klionsky DJ. Potential therapeutic applications of autophagy. Nat Rev Drug Discov. 2007 Apr;6(4):304-12. doi: 10.1038/nrd2272.
- Wang BT, Ducker GS, Barczak AJ, Barbeau R, Erle DJ, Shokat KM. The mammalian target of rapamycin regulates cholesterol biosynthetic gene expression and exhibits a rapamycin-resistant transcriptional profile. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Sep 13;108(37):15201-6. doi: 10.1073/pnas.1103746108. Epub 2011 Aug 29.
- Wang Z, Gerstein M, Snyder M. RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics. Nat Rev Genet. 2009 Jan;10(1):57-63. doi: 10.1038/nrg2484.
- Missouris CG, Forbat SM, Singer DR, Markandu ND, Underwood R, MacGregor GA. Echocardiography overestimates left ventricular mass: a comparative study with magnetic resonance imaging in patients with hypertension. J Hypertens. 1996 Aug;14(8):1005-10.
- Stewart GA, Foster J, Cowan M, Rooney E, McDonagh T, Dargie HJ, Rodger RS, Jardine AG. Echocardiography overestimates left ventricular mass in hemodialysis patients relative to magnetic resonance imaging. Kidney Int. 1999 Dec;56(6):2248-53. doi: 10.1046/j.1523-1755.1999.00786.x.
- Hedeer F, Palmer J, Arheden H, Ugander M. Gated myocardial perfusion SPECT underestimates left ventricular volumes and shows high variability compared to cardiac magnetic resonance imaging -- a comparison of four different commercial automated software packages. BMC Med Imaging. 2010 May 25;10:10. doi: 10.1186/1471-2342-10-10.
- Harel F, Finnerty V, Gregoire J, Thibault B, Marcotte F, Ugolini P, Khairy P. Gated blood-pool SPECT versus cardiac magnetic resonance imaging for the assessment of left ventricular volumes and ejection fraction. J Nucl Cardiol. 2010 Jun;17(3):427-34. doi: 10.1007/s12350-010-9195-5. Epub 2010 Feb 12.
- Bellenger NG, Burgess MI, Ray SG, Lahiri A, Coats AJ, Cleland JG, Pennell DJ. Comparison of left ventricular ejection fraction and volumes in heart failure by echocardiography, radionuclide ventriculography and cardiovascular magnetic resonance; are they interchangeable? Eur Heart J. 2000 Aug;21(16):1387-96. doi: 10.1053/euhj.2000.2011.
- Grothues F, Smith GC, Moon JC, Bellenger NG, Collins P, Klein HU, Pennell DJ. Comparison of interstudy reproducibility of cardiovascular magnetic resonance with two-dimensional echocardiography in normal subjects and in patients with heart failure or left ventricular hypertrophy. Am J Cardiol. 2002 Jul 1;90(1):29-34. doi: 10.1016/s0002-9149(02)02381-0.
- Ciliberto GR, Mascarello M, Gronda E, Bonacina E, Anjos MC, Danzi G, Colombo P, Frigerio M, Alberti A, De Vita C. Acute rejection after heart transplantation: noninvasive echocardiographic evaluation. J Am Coll Cardiol. 1994 Apr;23(5):1156-61. doi: 10.1016/0735-1097(94)90605-x.
- Hudsmith LE, Petersen SE, Tyler DJ, Francis JM, Cheng AS, Clarke K, Selvanayagam JB, Robson MD, Neubauer S. Determination of cardiac volumes and mass with FLASH and SSFP cine sequences at 1.5 vs. 3 Tesla: a validation study. J Magn Reson Imaging. 2006 Aug;24(2):312-8. doi: 10.1002/jmri.20638.
- Malayeri AA, Johnson WC, Macedo R, Bathon J, Lima JA, Bluemke DA. Cardiac cine MRI: Quantification of the relationship between fast gradient echo and steady-state free precession for determination of myocardial mass and volumes. J Magn Reson Imaging. 2008 Jul;28(1):60-6. doi: 10.1002/jmri.21405.
- Carlsson M, Ubachs JF, Hedstrom E, Heiberg E, Jovinge S, Arheden H. Myocardium at risk after acute infarction in humans on cardiac magnetic resonance: quantitative assessment during follow-up and validation with single-photon emission computed tomography. JACC Cardiovasc Imaging. 2009 May;2(5):569-76. doi: 10.1016/j.jcmg.2008.11.018.
- Gallo P, Baroldi G, Thiene G, Agozzino L, Arbustini E, Bartoloni G, Bonacina E, Bosman C, Catani G, Cocco P, et al. When and why do heart transplant recipients die? A 7 year experience of 1068 cardiac transplants. Virchows Arch A Pathol Anat Histopathol. 1993;422(6):453-8. doi: 10.1007/BF01606453.
- Almenar L, Igual B, Martinez-Dolz L, Arnau MA, Osa A, Rueda J, Palencia M. Utility of cardiac magnetic resonance imaging for the diagnosis of heart transplant rejection. Transplant Proc. 2003 Aug;35(5):1962-4. doi: 10.1016/s0041-1345(03)00653-5.
- Aherne T, Tscholakoff D, Finkbeiner W, Sechtem U, Derugin N, Yee E, Higgins CB. Magnetic resonance imaging of cardiac transplants: the evaluation of rejection of cardiac allografts with and without immunosuppression. Circulation. 1986 Jul;74(1):145-56. doi: 10.1161/01.cir.74.1.145.
- Marie PY, Carteaux JP, Escanye JM, Claudon O, David N, Mattei S, Hassan N, Danchin N, Karcher G, Bertrand A, Villemot JP. Detection and prediction of acute heart transplant rejection with the myocardial T2 determination provided by a black-blood magnetic resonance imaging sequence. J Heart Lung Transplant. 2001 Feb;20(2):193-194. doi: 10.1016/s1053-2498(00)00406-x. No abstract available.
- Giri S, Chung YC, Merchant A, Mihai G, Rajagopalan S, Raman SV, Simonetti OP. T2 quantification for improved detection of myocardial edema. J Cardiovasc Magn Reson. 2009 Dec 30;11(1):56. doi: 10.1186/1532-429X-11-56.
- Lund G, Morin RL, Olivari MT, Ring WS. Serial myocardial T2 relaxation time measurements in normal subjects and heart transplant recipients. J Heart Transplant. 1988 Jul-Aug;7(4):274-9.
- Rudolph A, Abdel-Aty H, Bohl S, Boye P, Zagrosek A, Dietz R, Schulz-Menger J. Noninvasive detection of fibrosis applying contrast-enhanced cardiac magnetic resonance in different forms of left ventricular hypertrophy relation to remodeling. J Am Coll Cardiol. 2009 Jan 20;53(3):284-91. doi: 10.1016/j.jacc.2008.08.064.
- Schulz-Menger J, Gross M, Messroghli D, Uhlich F, Dietz R, Friedrich MG. Cardiovascular magnetic resonance of acute myocardial infarction at a very early stage. J Am Coll Cardiol. 2003 Aug 6;42(3):513-8. doi: 10.1016/s0735-1097(03)00717-4.
- Kim RJ, Fieno DS, Parrish TB, Harris K, Chen EL, Simonetti O, Bundy J, Finn JP, Klocke FJ, Judd RM. Relationship of MRI delayed contrast enhancement to irreversible injury, infarct age, and contractile function. Circulation. 1999 Nov 9;100(19):1992-2002. doi: 10.1161/01.cir.100.19.1992.
- Patel MR, Cawley PJ, Heitner JF, Klem I, Parker MA, Jaroudi WA, Meine TJ, White JB, Elliott MD, Kim HW, Judd RM, Kim RJ. Detection of myocardial damage in patients with sarcoidosis. Circulation. 2009 Nov 17;120(20):1969-77. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.109.851352. Epub 2009 Nov 2.
- Steen H, Merten C, Refle S, Klingenberg R, Dengler T, Giannitsis E, Katus HA. Prevalence of different gadolinium enhancement patterns in patients after heart transplantation. J Am Coll Cardiol. 2008 Sep 30;52(14):1160-7. doi: 10.1016/j.jacc.2008.05.059.
- Grady KL. Quality of life after heart transplantation: are things really better? Curr Opin Cardiol. 2003 Mar;18(2):129-35. doi: 10.1097/00001573-200303000-00011.
- Osada N, Chaitman BR, Donohue TJ, Wolford TL, Stelken AM, Miller LW. Long-term cardiopulmonary exercise performance after heart transplantation. Am J Cardiol. 1997 Feb 15;79(4):451-6. doi: 10.1016/s0002-9149(96)00785-0.
- Raichlin E, Chandrasekaran K, Kremers WK, Frantz RP, Clavell AL, Pereira NL, Rodeheffer RJ, Daly RC, McGregor CG, Edwards BS, Kushwaha SS. Sirolimus as primary immunosuppressant reduces left ventricular mass and improves diastolic function of the cardiac allograft. Transplantation. 2008 Nov 27;86(10):1395-400. doi: 10.1097/TP.0b013e318189049a.
- de Simone G, Daniels SR, Kimball TR, Roman MJ, Romano C, Chinali M, Galderisi M, Devereux RB. Evaluation of concentric left ventricular geometry in humans: evidence for age-related systematic underestimation. Hypertension. 2005 Jan;45(1):64-8. doi: 10.1161/01.HYP.0000150108.37527.57. Epub 2004 Nov 22.
- Bae JH, Rihal CS, Edwards BS, Kushwaha SS, Mathew V, Prasad A, Holmes DR Jr, Lerman A. Association of angiotensin-converting enzyme inhibitors and serum lipids with plaque regression in cardiac allograft vasculopathy. Transplantation. 2006 Oct 27;82(8):1108-11. doi: 10.1097/01.tp.0000230378.61437.a5.
- Chaves AJ, Sousa AG, Mattos LA, Abizaid A, Staico R, Feres F, Centemero M, Tanajura LF, Abizaid A, Pinto I, Maldonado G, Seixas A, Costa MA, Paes A, Mintz GS, Sousa JE. Volumetric analysis of in-stent intimal hyperplasia in diabetic patients treated with or without abciximab: results of the Diabetes Abciximab steNT Evaluation (DANTE) randomized trial. Circulation. 2004 Feb 24;109(7):861-6. doi: 10.1161/01.CIR.0000116752.12261.D4. Epub 2004 Feb 2.
- Daida H, Allison TG, Johnson BD, Squires RW, Gau GT. Further increase in oxygen uptake during early active recovery following maximal exercise in chronic heart failure. Chest. 1996 Jan;109(1):47-51. doi: 10.1378/chest.109.1.47.
- Ross RM. ATS/ACCP statement on cardiopulmonary exercise testing. Am J Respir Crit Care Med. 2003 May 15;167(10):1451; author reply 1451. doi: 10.1164/ajrccm.167.10.950. No abstract available.
- Nagalakshmi U, Wang Z, Waern K, Shou C, Raha D, Gerstein M, Snyder M. The transcriptional landscape of the yeast genome defined by RNA sequencing. Science. 2008 Jun 6;320(5881):1344-9. doi: 10.1126/science.1158441. Epub 2008 May 1.
- Lowes BD, Baker ML, Blaxall BC. Gene expression profile of the recovering human heart. Eur Heart J. 2007 Mar;28(5):522-4. doi: 10.1093/eurheartj/ehl555. Epub 2007 Feb 21. No abstract available.
- Heinze G, Puhr R. Bias-reduced and separation-proof conditional logistic regression with small or sparse data sets. Stat Med. 2010 Mar 30;29(7-8):770-7. doi: 10.1002/sim.3794.
- Costanzo MR, Dipchand A, Starling R, Anderson A, Chan M, Desai S, Fedson S, Fisher P, Gonzales-Stawinski G, Martinelli L, McGiffin D, Smith J, Taylor D, Meiser B, Webber S, Baran D, Carboni M, Dengler T, Feldman D, Frigerio M, Kfoury A, Kim D, Kobashigawa J, Shullo M, Stehlik J, Teuteberg J, Uber P, Zuckermann A, Hunt S, Burch M, Bhat G, Canter C, Chinnock R, Crespo-Leiro M, Delgado R, Dobbels F, Grady K, Kao W, Lamour J, Parry G, Patel J, Pini D, Towbin J, Wolfel G, Delgado D, Eisen H, Goldberg L, Hosenpud J, Johnson M, Keogh A, Lewis C, O'Connell J, Rogers J, Ross H, Russell S, Vanhaecke J; International Society of Heart and Lung Transplantation Guidelines. The International Society of Heart and Lung Transplantation Guidelines for the care of heart transplant recipients. J Heart Lung Transplant. 2010 Aug;29(8):914-56. doi: 10.1016/j.healun.2010.05.034. No abstract available.
- Dean PG, Lund WJ, Larson TS, Prieto M, Nyberg SL, Ishitani MB, Kremers WK, Stegall MD. Wound-healing complications after kidney transplantation: a prospective, randomized comparison of sirolimus and tacrolimus. Transplantation. 2004 May 27;77(10):1555-61. doi: 10.1097/01.tp.0000123082.31092.53.
- Kuppahally S, Al-Khaldi A, Weisshaar D, Valantine HA, Oyer P, Robbins RC, Hunt SA. Wound healing complications with de novo sirolimus versus mycophenolate mofetil-based regimen in cardiac transplant recipients. Am J Transplant. 2006 May;6(5 Pt 1):986-92. doi: 10.1111/j.1600-6143.2006.01282.x.
- Trapnell C, Williams BA, Pertea G, Mortazavi A, Kwan G, van Baren MJ, Salzberg SL, Wold BJ, Pachter L. Transcript assembly and quantification by RNA-Seq reveals unannotated transcripts and isoform switching during cell differentiation. Nat Biotechnol. 2010 May;28(5):511-5. doi: 10.1038/nbt.1621. Epub 2010 May 2.
- Trapnell C, Pachter L, Salzberg SL. TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq. Bioinformatics. 2009 May 1;25(9):1105-11. doi: 10.1093/bioinformatics/btp120. Epub 2009 Mar 16.
- Langmead B, Trapnell C, Pop M, Salzberg SL. Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome. Genome Biol. 2009;10(3):R25. doi: 10.1186/gb-2009-10-3-r25. Epub 2009 Mar 4.
- Goecks J, Nekrutenko A, Taylor J; Galaxy Team. Galaxy: a comprehensive approach for supporting accessible, reproducible, and transparent computational research in the life sciences. Genome Biol. 2010;11(8):R86. doi: 10.1186/gb-2010-11-8-r86. Epub 2010 Aug 25.
- Reich M, Liefeld T, Gould J, Lerner J, Tamayo P, Mesirov JP. GenePattern 2.0. Nat Genet. 2006 May;38(5):500-1. doi: 10.1038/ng0506-500. No abstract available.
- Nosal WH, Thompson DW, Yan L, Sarkar S, Subramanian A, Woollam JA. Infrared optical properties and AFM of spin-cast chitosan films chemically modified with 1,2 Epoxy-3-phenoxy-propane. Colloids Surf B Biointerfaces. 2005 Nov 25;46(1):26-31. doi: 10.1016/j.colsurfb.2005.08.006. Epub 2005 Sep 30.
- Li J, Witten DM, Johnstone IM, Tibshirani R. Normalization, testing, and false discovery rate estimation for RNA-sequencing data. Biostatistics. 2012 Jul;13(3):523-38. doi: 10.1093/biostatistics/kxr031. Epub 2011 Oct 14.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhadovaný)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 0339-12-FB
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .