Molekulární reklasifikace za účelem nalezení klinicky užitečných biomarkerů pro systémová autoimunitní onemocnění: (PRECISESADS)
22. května 2018 aktualizováno: Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud
Molekulární reklasifikace za účelem nalezení klinicky užitečných biomarkerů pro systémová autoimunitní onemocnění: průřezová kohorta
Onemocnění pojivové tkáně (CTD) nebo systémová autoimunitní onemocnění (SAD), jak jsou dnes známy, jsou skupinou chronických zánětlivých stavů s autoimunitní etiologií s omezenými možnostmi léčby a obtížnou diagnózou. Brest tým přispívá k provedení nové klasifikace následujících systémových autoimunitních onemocnění v sedmém rámcovém programu Evropské unie.
Cílem tohoto výzkumu je reklasifikovat jedince postižené SAD do molekulárních shluků namísto klinických entit prostřednictvím stanovení molekulárních profilů pomocí několika technik "Omics".
Přehled studie
Postavení
Dokončeno
Podmínky
Detailní popis
Hlavním cílem projektu PRECISESADS je reklasifikace jedinců postižených SAD do molekulárních shluků namísto klinických entit prostřednictvím stanovení molekulárních profilů pomocí několika technik „-omics“.
Konkrétní cíle této průřezové studie a dílčí studie jsou:
- Identifikovat systémovou taxonomii pro pacienty s SAD vytvořením následujících údajů u jedinců s SAD a kontrol: genetické, epigenomické, transkriptomické, průtokové cytometrické (z mononukleárních a polymorfonukleárních buněk periferní krve (PBMC)), metabolomické a proteomické v plazmě a moči, analýza exosomů, klasická sérologie (protilátky a autoprotilátky) a klinická data.
- Pro lepší charakterizaci jednotlivých SAD na úrovni omics.
- Provádět shlukovací analýzy k určení skupin jedinců, kteří na rozdíl od jiných skupin sdílejí specifické molekulární rysy (přesná medicína).
- K identifikaci genové exprese, metylačních profilů pomocí dekonvolučních metod srovnávajících směs buněk se subpopulacemi určenými průtokovou cytometrií se separovanými buňkami, cytokinovými profily a plazmatickou metabolomikou pomocí hmotnostní spektrometrie, v dílčí studii 288 jedinců.
Proces shlukování bude řízen daty s cílem nalézt co nejvíce homogenní a diferencované shluky onemocnění, které jasně oddělují jedince na základě sérologického, genetického, epigenomického, buněčného (proporce buněk), metabolomického, proteomického (cytokiny, autoprotilátky) a transkriptomové charakteristiky a odlišit je od kontrol a jiných skupin pacientů.
Do studie bude zahrnuto celkem 2 000 pacientů a 666 kontrol, upravených na následující rozdělení:
- Celkem 400 pacientů s diagnózou systémový lupus erythematodes (SLE)
- Celkem 400 pacientů s diagnostikovanou revmatoidní artritidou (RA)
- Celkem 400 pacientů s diagnózou sklerodermie nebo systémové sklerózy (SSc)
- Celkem 400 pacientů s diagnózou Sjögrenův syndrom (SjS)
- Celkem 400 pacientů s diagnostikovaným primárním antifosfolipidovým syndromem (PAPS) nebo smíšeným onemocněním pojivových tkání (MCTD) nebo s nediferencovaným onemocněním • Všichni pacienti budou vybráni z 18 míst v Evropě (Rakousko, Belgie, Francie, Německo, Itálie, Portugalsko, Španělsko , Maďarsko a Švýcarsko).
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Aktuální)
2006
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní místa
-
-
-
Brussels, Belgie
- Université catholique de Louvain - Cliniques universitaires Saint-Luc
-
Leuven, Belgie
- UZ Leuven - KU Leuven, Department of Rheumatology (KU LEUVEN)
-
-
-
-
-
Brest, Francie, 29609
- CHRU de Brest
-
-
-
-
-
Milan, Itálie
- Fondazione IRCCS Ca Granda Ospedale Maggiore Policlinico (IRCCS)
-
Milan, Itálie
- UNIMI, Istituto Ortopedico Getano Pini
-
-
-
-
-
Szeged, Maďarsko
- University of Szeged
-
-
-
-
-
Berlin, Německo
- Deutsches Rheuma-Forschungszentrum Berlin (DRFZ)
-
Cologne, Německo
- University of Cologne
-
Hannover, Německo
- Medizinische Hochschule Hannover
-
-
-
-
-
Porto, Portugalsko
- Centro Hospitalar do Porto
-
-
-
-
-
Vienna, Rakousko
- Medical University of Vienna
-
-
-
-
-
Barcelona, Španělsko
- Hospital Clinic I Provicia- Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)
-
Cordoba, Španělsko
- Hospital Universitario Reina Sofía Andaluz de Salud
-
Granada, Španělsko
- Hospital Universitario San Cecilio Servicio Andaluz de Salud
-
Granada, Španělsko
- Hospital Virgen de las Nieves Granada
-
Malaga, Španělsko
- Hospital Regional de Málaga Servicio Andaluz de Salud
-
Santander, Španělsko
- Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Servicio Cántabro de Salud
-
-
-
-
-
Geneve, Švýcarsko
- Hospitaux Universitaires de Geneve
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
18 let a starší (DOSPĚLÝ, OLDER_ADULT)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Metoda odběru vzorků
Ukázka pravděpodobnosti
Studijní populace
Pacient se systémovými autoimunitními chorobami
Popis
Kritéria pro zařazení:
· Věk 18 let nebo starší v době udělení souhlasu
Diagnostikováno podle převažujících kritérií pro jedno z následujících systémových autoimunitních onemocnění (viz příloha 2)
- Revmatoidní artritida (RA)
- Sklerodermie nebo systémová skleróza (SSc)
- Primární Sjögrenův syndrom (SjS)
- Systémový lupus erythematodes (SLE)
- Primární antifosfolipidový syndrom (PAPS)
- Smíšené onemocnění pojivové tkáně (MCTD)
- Pacienti s nediferencovaným onemocněním pojivové tkáně (UCTD) déle než 1 rok, kteří nesplňují diagnózu žádného z výše uvedených onemocnění.
- Podepsal formulář informovaného souhlasu
Kritéria vyloučení:
Pacienti, kteří nejsou schopni porozumět postupům souvisejícím s protokolem, by neměli být zahrnuti. Studie je dobrovolná a pacienti musí mít možnost dát svůj informovaný souhlas.
- Těhotná žena
- Novorozenecký lupus
- Lupus vyvolaný léky
- Pacienti, jejichž stav je natolik vážný, že se nemohou studie zúčastnit
- Těžký nefrotický syndrom s proteinurií >=3,5 g/den
- Pacienti se stabilními dávkami steroidů >15 mg/den v posledních 3 měsících nebo s IV kortikosteroidy v posledních 3 měsících
Pacienti užívající imunosupresiva poslední 3 měsíce před náborem s:
- Methotrexát ≥25 mg/týden
- Azathioprin ≥2,5 mg/kg/den
- Cyklosporin A > 3 mg/kg/den
- Mykofenolát mofetil > 2 g/den
- Léčba cyklofosfamidem (jakákoli dávka nebo způsob podání) nebo Belimumab v posledních 6 měsících
- Pacienti s kombinovanou terapií dvěma nebo více imunosupresivy
- Pacienti na depleční terapii, jako je Rituximab v posledním roce
- Pacienti podstupující experimentální terapii.
- Chronická infekce HBV nebo HCV
- Překryvné syndromy
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Genová exprese v celkové krvi
Časové okno: 2 roky
|
Genová exprese bude provedena pomocí komerčních mikročipů pro expresi genů v celkové krvi ze všech vzorků pomocí zkumavky RNA Paxgene.
|
2 roky
|
|
Analýza průtokovou cytometrií ke stanovení podílů buněk v celkové krevní směsi u všech jedinců.
Časové okno: 24 hodin
|
9 optimalizovaných panelů protilátek bude použito ke stanovení buněčných subpopulací v periferní krvi (včetně velmi malých buněčných populací).
|
24 hodin
|
|
Stanovení metabolitů
Časové okno: 2 roky
|
Stanovení metabolitů v plazmě a moči pomocí nukleární magnetické rezonance
|
2 roky
|
|
Izolace exosomu z plazmy a moči
Časové okno: 2 roky
|
vytvoření metodiky pro izolaci exozomů v těchto tělesných tekutinách pro analýzu genové exprese
|
2 roky
|
|
Stanovení cytokinového profilu
Časové okno: 2 roky
|
Pomocí Luminexu bude hodnoceno 88 různých cytokinů
|
2 roky
|
|
Metylace genů v celkové krvi
Časové okno: 2 roky
|
Methylační analýza bude provedena pomocí methylomového 450k čipu s použitím DNA získané z celkové krve.
MikroRNA genové expresní čipy pomocí celkové krve.
|
2 roky
|
|
rutinní autoprotilátky v séru
Časové okno: 2 roky
|
sada sérových autoprotilátek bude stanovena v evropské validované laboratoři.
Provedou také detekci protilátek proti malým lipidovým skupinám, tj. antifosforylcholinu), lupus antikoagulantu a proteinům komplementu v plazmě.
|
2 roky
|
|
Genotypizace
Časové okno: 2 roky
|
Genotypování bude provedeno pomocí celého genomového pole
|
2 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Spolupracovníci
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (AKTUÁLNÍ)
1. prosince 2014
Primární dokončení (AKTUÁLNÍ)
1. října 2017
Dokončení studie (AKTUÁLNÍ)
1. října 2017
Termíny zápisu do studia
První předloženo
22. srpna 2016
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
31. srpna 2016
První zveřejněno (ODHAD)
7. září 2016
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)
23. května 2018
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
22. května 2018
Naposledy ověřeno
1. dubna 2018
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- PRECISESADS CS (RB 14.106)
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NEROZHODNÝ
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .