Molekyylien uudelleenluokittelu kliinisesti hyödyllisten biomarkkerien löytämiseksi systeemisille autoimmuunisairauksille: (PRECISESADS)
tiistai 22. toukokuuta 2018 päivittänyt: Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud
Molekyylien uudelleenluokittelu kliinisesti hyödyllisten biomarkkerien löytämiseksi systeemisille autoimmuunisairauksille: poikkileikkauskohortti
Sidekudossairaudet (CTD) tai systeemiset autoimmuunisairaudet (SAD), sellaisina kuin ne nykyään tunnetaan, ovat joukko kroonisia tulehdussairauksia, joilla on autoimmuuninen etiologia ja joilla on vähän hoitovaihtoehtoja ja vaikea diagnoosi. Brestin tiimi osallistuu seuraavien systeemisten autoimmuunisairauksien uuden luokituksen tekemiseen. Euroopan unionin seitsemännessä puiteohjelmassa.
Tämän tutkimuksen tavoitteena on luokitella SAD:ista kärsivät yksilöt uudelleen molekyyliklusteriksi kliinisten kokonaisuuksien sijaan määrittämällä molekyyliprofiilit useilla "Omics"-tekniikoilla.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Yksityiskohtainen kuvaus
PRECISESADS-projektin päätavoitteena on luokitella SAD:ien sairaat yksilöt uudelleen molekyyliklusteriksi kliinisten kokonaisuuksien sijaan määrittämällä molekyyliprofiilit useilla "-omics"-tekniikoilla.
Tämän poikkileikkaustutkimuksen ja osatutkimuksen erityistavoitteet ovat:
- Tunnistaa systeeminen taksonomia SAD-potilaille tuottamalla seuraavat tiedot SAD-potilaista ja verrokkeista: geneettinen, epigenominen, transkriptominen, virtaussytometrinen (perifeerisen veren mononukleaarisista ja polymorfonukleaarisista soluista (PBMC)), metabolomiikka ja proteomiikka plasmassa ja virtsassa, eksosomianalyysi, klassinen serologia (vasta-aineet ja autovasta-aineet) ja kliiniset tiedot.
- Yksittäisten SAD:ien kuvaamiseksi paremmin omiikkatasolla.
- Suorittaa klusterointianalyysejä yksilöiden ryhmien määrittämiseksi, joilla on muista ryhmistä poiketen yhteisiä molekyylipiirteitä (tarkkuuslääketiede).
- Geenin ilmentymisen tunnistamiseksi metylaatioprofiileja dekonvoluutiomenetelmillä vertaamalla soluseosta, jossa on virtaussytometrisesti määritettyjä alapopulaatioita erotettujen solujen kanssa, sytokiiniprofiileja ja plasman metabolomiikkaa käyttäen massaspektrometriaa 288 yksilön alatutkimuksessa.
Klusterointiprosessi on datavetoinen, ja tavoitteena on löytää homogeenisimpia ja erilaisimpia sairauksien klustereita, jotka erottavat yksilöt selkeästi serologisten, geneettisten, epigenomien, solujen (solusuhteet), metabolomisen, proteomisin (sytokiinit, autovasta-aineet) perusteella. ja transkription ominaisuudet ja erottaa ne kontrolleista ja muista potilasryhmistä.
Yhteensä 2000 potilasta ja 666 kontrollia otetaan mukaan tutkimukseen, mukautettuna seuraavaan jakaumaan:
- Yhteensä 400 potilasta, joilla on diagnosoitu systeeminen lupus erythematosus (SLE)
- Yhteensä 400 potilasta, joilla on diagnosoitu nivelreuma (RA)
- Yhteensä 400 potilasta, joilla on diagnosoitu skleroderma tai systeeminen skleroosi (SSc)
- Yhteensä 400 potilasta, joilla on diagnosoitu Sjögrenin oireyhtymä (SjS)
- Yhteensä 400 potilasta, joilla on diagnosoitu primaarinen antifosfolipidisyndrooma (PAPS) tai seka sidekudostauti (MCTD) tai erilaistumaton sairaus • Kaikki potilaat rekrytoidaan 18 paikasta Euroopassa (Itävalta, Belgia, Ranska, Saksa, Italia, Portugali, Espanja) , Unkari ja Sveitsi).
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
2006
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Brussels, Belgia
- Université catholique de Louvain - Cliniques universitaires Saint-Luc
-
Leuven, Belgia
- UZ Leuven - KU Leuven, Department of Rheumatology (KU LEUVEN)
-
-
-
-
-
Barcelona, Espanja
- Hospital Clinic I Provicia- Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)
-
Cordoba, Espanja
- Hospital Universitario Reina Sofía Andaluz de Salud
-
Granada, Espanja
- Hospital Universitario San Cecilio Servicio Andaluz de Salud
-
Granada, Espanja
- Hospital Virgen de las Nieves Granada
-
Malaga, Espanja
- Hospital Regional de Málaga Servicio Andaluz de Salud
-
Santander, Espanja
- Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Servicio Cántabro de Salud
-
-
-
-
-
Milan, Italia
- Fondazione IRCCS Ca Granda Ospedale Maggiore Policlinico (IRCCS)
-
Milan, Italia
- UNIMI, Istituto Ortopedico Getano Pini
-
-
-
-
-
Vienna, Itävalta
- Medical University of Vienna
-
-
-
-
-
Porto, Portugali
- Centro Hospitalar do Porto
-
-
-
-
-
Brest, Ranska, 29609
- CHRU de Brest
-
-
-
-
-
Berlin, Saksa
- Deutsches Rheuma-Forschungszentrum Berlin (DRFZ)
-
Cologne, Saksa
- University of Cologne
-
Hannover, Saksa
- Medizinische Hochschule Hannover
-
-
-
-
-
Geneve, Sveitsi
- Hospitaux Universitaires de Geneve
-
-
-
-
-
Szeged, Unkari
- University of Szeged
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
18 vuotta ja vanhemmat (AIKUINEN, OLDER_ADULT)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Potilas, jolla on systeemisiä autoimmuunisairauksia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
· Suostumushetkellä 18-vuotias tai vanhempi
Diagnosoitu vallitsevien kriteerien mukaan johonkin seuraavista systeemisistä autoimmuunisairauksista (katso liite 2)
- Nivelreuma (RA)
- Skleroderma tai systeeminen skleroosi (SSc)
- Primaarinen Sjögrenin oireyhtymä (SjS)
- Systeeminen lupus erythematosus (SLE)
- Primaarinen antifosfolipidioireyhtymä (PAPS)
- Sekoitettu sidekudostauti (MCTD)
- Potilaat, joilla on erilaistumaton sidekudossairaus (UCTD) yli vuoden ja jotka eivät täytä minkään edellä mainitun sairauden diagnoosia.
- Allekirjoittanut tietoisen suostumuslomakkeen
Poissulkemiskriteerit:
· Potilaita, jotka eivät ymmärrä protokollaan liittyviä toimenpiteitä, ei tulisi ottaa mukaan. Tutkimus on vapaaehtoinen ja potilaiden on voitava antaa tietoinen suostumuksensa.
- Raskaana olevat naiset
- Vastasyntyneen lupus
- Lääkkeiden aiheuttama lupus
- Potilaat, joiden tila on niin vakava, että he eivät voi osallistua tutkimukseen
- Vaikea nefroottinen oireyhtymä, jossa proteinuria >=3,5 g/vrk
- Potilaat, joilla on vakaa steroidiannos > 15 mg/vrk viimeisen 3 kuukauden ajan tai laskimonsisäisiä kortikosteroideja viimeisen 3 kuukauden aikana
Potilaat, jotka ovat saaneet immunosuppressantteja viimeisten 3 kuukauden aikana ennen värväystä:
- Metotreksaatti ≥ 25 mg/viikko
- Atsatiopriini ≥ 2,5 mg/kg/vrk
- Syklosporiini A > 3 mg/kg/vrk
- Mykofenolaattimofetiili > 2g/vrk
- Hoito syklofosfamidilla (mikä tahansa annos tai antotapa) tai belimumabilla viimeisen 6 kuukauden aikana
- Potilaat, jotka saavat kahden tai useamman immunosuppressantin yhdistelmähoitoa
- Potilaat, jotka ovat saaneet depletiivista hoitoa, kuten rituksimabia viimeisen vuoden aikana
- Potilaat, jotka saavat kokeellista hoitoa.
- Krooninen HBV- tai HCV-infektio
- Päällekkäisyysoireyhtymät
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Geenien ilmentyminen kokonaisveressä
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Geeniekspressio suoritetaan käyttämällä kaupallisia geeniekspressiomikrosiruja kaikista näytteistä RNA Paxgene -putkea käyttämällä.
|
2 vuotta
|
|
Virtaussytometrinen analyysi solujen osuuden määrittämiseksi kaikkien yksilöiden veriseoksessa.
Aikaikkuna: 24 tuntia
|
Yhdeksää optimoitua vasta-ainepaneelia käytetään solualapopulaatioiden määrittämiseen ääreisveressä (mukaan lukien hyvin pienet solupopulaatiot).
|
24 tuntia
|
|
Metaboliitin määritys
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Metaboliitin määritys plasmasta ja virtsasta ydinmagneettisella resonanssilla
|
2 vuotta
|
|
Eksosomieristys plasmasta ja virtsasta
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Metodologian laatiminen eksosomien eristämiseksi näistä ruumiinnesteistä geeniekspressioanalyysiä varten
|
2 vuotta
|
|
Sytokiiniprofiilin määritys
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Luminexilla arvioidaan 88 erilaista sytokiinia
|
2 vuotta
|
|
Geenimetylaatio kokonaisveren määrässä
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Metylaatioanalyysi tehdään käyttämällä metylomi 450k -järjestelmää käyttämällä kokonaisverestä saatua DNA:ta.
MicroRNA-geenin ilmentämisjärjestelmät, joissa käytetään kokonaisverta.
|
2 vuotta
|
|
rutiininomaiset autovasta-aineet seerumissa
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
sarja seerumin autovasta-aineita määritetään eurooppalaisessa validoidussa laboratoriossa.
He myös suorittavat vasta-aineiden havaitsemisen pieniä lipidiosia, eli antifosforyylikoliinia, lupusantikoagulanttia ja komplementtiproteiineja vastaan plasmassa.
|
2 vuotta
|
|
Genotyypitys
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Genotyypitys tehdään käyttämällä koko genomiryhmää
|
2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Yhteistyökumppanit
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (TODELLINEN)
Maanantai 1. joulukuuta 2014
Ensisijainen valmistuminen (TODELLINEN)
Sunnuntai 1. lokakuuta 2017
Opintojen valmistuminen (TODELLINEN)
Sunnuntai 1. lokakuuta 2017
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 22. elokuuta 2016
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Keskiviikko 31. elokuuta 2016
Ensimmäinen Lähetetty (ARVIO)
Keskiviikko 7. syyskuuta 2016
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)
Keskiviikko 23. toukokuuta 2018
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 22. toukokuuta 2018
Viimeksi vahvistettu
Sunnuntai 1. huhtikuuta 2018
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- PRECISESADS CS (RB 14.106)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
PÄÄTTÄMÄTÖN
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Systeemiset autoimmuunisairaudet
-
European Society for Blood and Marrow TransplantationEULARPeruutettuTulenkestävä SYSTEMIC LUPUS ERYTHEMATOSUSRanska
-
University Hospital, ToulouseRekrytointiMastocytosis, indolent SystemicRanska
-
University Hospital FreiburgRekrytointiMaksakirroosi | Portahypertensio | Portaalilaskimotromboosi | Ei-kirroottinen portaalihypertensio | Budd Chiarin oireyhtymä | Portaali Systemic ShuntSaksa
-
Adelphi Values LLCBlueprint Medicines CorporationValmisMast Cell Leukemia (MCL) | Aggressiivinen systeeminen mastosytoosi (ASM) | SM w Assoc Clonal Hema Non-mast Cell Lineage Disease (SM-AHNMD) | Kytevä systeeminen mastosytoosi (SSM) | Indolent Systemic Mastocytosis (ISM) ISM-alaryhmä täysin rekrytoituYhdysvallat