Молекулярная реклассификация для поиска клинически полезных биомаркеров системных аутоиммунных заболеваний: (PRECISESADS)
22 мая 2018 г. обновлено: Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud
Молекулярная реклассификация для поиска клинически полезных биомаркеров системных аутоиммунных заболеваний: перекрестная когорта
Заболевания соединительной ткани (ЗСТ) или системные аутоиммунные заболевания (САЗ), как они известны сегодня, представляют собой группу хронических воспалительных состояний аутоиммунной этиологии с небольшим количеством вариантов лечения и сложной диагностикой. Брестская команда вносит свой вклад в создание новой классификации следующих системных аутоиммунных заболеваний. в Седьмой рамочной программе Европейского союза.
Целью этого исследования является переклассификация лиц, страдающих САР, в молекулярные кластеры, а не в клинические единицы, путем определения молекулярных профилей с использованием нескольких методов «омики».
Обзор исследования
Статус
Завершенный
Подробное описание
Основная цель проекта PRECISESADS состоит в том, чтобы переклассифицировать людей, страдающих САР, в молекулярные кластеры, а не в клинические сущности, путем определения молекулярных профилей с использованием нескольких методов «омики».
Конкретными целями этого поперечного исследования и дополнительного исследования являются:
- Определить системную таксономию для пациентов с САР путем получения следующих данных по лицам с СТР и контрольной группе: генетические, эпигеномные, транскриптомные, проточные цитометрические (из мононуклеарных и полиморфноядерных клеток периферической крови (РВМС)), метаболические и протеомные данные в плазме и моче. анализ экзосом, классическая серология (антитела и аутоантитела) и клинические данные.
- Чтобы лучше охарактеризовать отдельные SAD на уровне омики.
- Выполнение кластерного анализа для определения групп лиц, которые, в отличие от других групп, обладают общими специфическими молекулярными характеристиками (точная медицина).
- Чтобы идентифицировать экспрессию генов, профили метилирования с помощью методов деконволюции сравнивают смесь клеток с субпопуляциями, определенными с помощью проточной цитометрии, с разделенными клетками, профилями цитокинов и метаболомикой плазмы с использованием масс-спектрометрии в субисследовании 288 человек.
Процесс кластеризации будет управляться данными с целью поиска наиболее однородных и дифференцированных кластеров заболеваний, которые четко разделяют людей на основе серологических, генетических, эпигеномных, клеточных (клеточные пропорции), метаболических, протеомных (цитокины, аутоантитела) и характеристики транскриптома и дифференцировать их от контролей и других кластеров пациентов.
Всего в исследование будет включено 2000 пациентов и 666 человек из контрольной группы, с поправкой на следующее распределение:
- В общей сложности 400 пациентов с диагнозом системная красная волчанка (СКВ)
- Всего 400 пациентов с диагнозом ревматоидный артрит (РА)
- В общей сложности 400 пациентов с диагнозом склеродермия или системный склероз (ССД)
- Всего у 400 пациентов диагностирован синдром Шегрена (СШ).
- В общей сложности 400 пациентов с диагнозом первичного антифосфолипидного синдрома (PAPS) или смешанного заболевания соединительной ткани (MCTD) или с недифференцированным заболеванием • Все пациенты будут набраны из 18 центров в Европе (Австрия, Бельгия, Франция, Германия, Италия, Португалия, Испания). , Венгрия и Швейцария).
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Действительный)
2006
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
-
Vienna, Австрия
- Medical University of Vienna
-
-
-
-
-
Brussels, Бельгия
- Université catholique de Louvain - Cliniques universitaires Saint-Luc
-
Leuven, Бельгия
- UZ Leuven - KU Leuven, Department of Rheumatology (KU LEUVEN)
-
-
-
-
-
Szeged, Венгрия
- University of Szeged
-
-
-
-
-
Berlin, Германия
- Deutsches Rheuma-Forschungszentrum Berlin (DRFZ)
-
Cologne, Германия
- University of Cologne
-
Hannover, Германия
- Medizinische Hochschule Hannover
-
-
-
-
-
Barcelona, Испания
- Hospital Clinic I Provicia- Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)
-
Cordoba, Испания
- Hospital Universitario Reina Sofía Andaluz de Salud
-
Granada, Испания
- Hospital Universitario San Cecilio Servicio Andaluz de Salud
-
Granada, Испания
- Hospital Virgen de las Nieves Granada
-
Malaga, Испания
- Hospital Regional de Málaga Servicio Andaluz de Salud
-
Santander, Испания
- Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Servicio Cántabro de Salud
-
-
-
-
-
Milan, Италия
- Fondazione IRCCS Ca Granda Ospedale Maggiore Policlinico (IRCCS)
-
Milan, Италия
- UNIMI, Istituto Ortopedico Getano Pini
-
-
-
-
-
Porto, Португалия
- Centro Hospitalar do Porto
-
-
-
-
-
Brest, Франция, 29609
- CHRU de Brest
-
-
-
-
-
Geneve, Швейцария
- Hospitaux Universitaires de Geneve
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
18 лет и старше (ВЗРОСЛЫЙ, OLDER_ADULT)
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Полы, имеющие право на обучение
Все
Метод выборки
Вероятностная выборка
Исследуемая популяция
Пациенты с системными аутоиммунными заболеваниями
Описание
Критерии включения:
· Возраст 18 лет и старше на момент согласия
Диагноз в соответствии с преобладающими критериями для одного из следующих системных аутоиммунных заболеваний (см. Приложение 2)
- Ревматоидный артрит (РА)
- Склеродермия или системный склероз (ССД)
- Первичный синдром Шегрена (SjS)
- Системная красная волчанка (СКВ)
- Первичный антифосфолипидный синдром (ПАФС)
- Смешанное заболевание соединительной ткани (СЗСТ)
- Пациенты с недифференцированным заболеванием соединительной ткани (НДСТ) в течение более 1 года, которым не соответствует диагноз ни одного из вышеперечисленных заболеваний.
- Подписал форму информированного согласия
Критерий исключения:
· Пациенты, которые не могут понять процедуры, связанные с протоколом, не должны быть включены. Исследование является добровольным, и пациенты должны быть в состоянии дать свое информированное согласие.
- Беременные женщины
- Неонатальная волчанка
- Медикаментозная волчанка
- Пациенты, состояние которых настолько тяжелое, что они не могут принимать участие в исследовании
- Тяжелый нефротический синдром с протеинурией >=3,5 г/сут.
- Пациенты со стабильными дозами стероидов > 15 мг/сут в течение последних 3 месяцев или с внутривенными кортикостероидами в течение последних 3 месяцев.
Пациенты, получавшие иммунодепрессанты в течение последних 3 месяцев до набора, с:
- Метотрексат ≥25 мг/нед.
- Азатиоприн ≥2,5 мг/кг/день
- Циклоспорин А > 3 мг/кг/день
- Микофенолят мофетил > 2 г/день
- Лечение циклофосфамидом (любая доза или способ введения) или белимумабом в течение последних 6 месяцев
- Пациенты с комбинированной терапией двумя и более иммунодепрессантами
- Пациенты, получавшие истощающую терапию, такую как ритуксимаб, в течение последнего года.
- Пациенты, получающие экспериментальную терапию.
- Хроническая инфекция HBV или HCV
- Перекрывающиеся синдромы
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Экспрессия генов в общей крови
Временное ограничение: 2 года
|
Экспрессия генов будет осуществляться с использованием коммерческих микрочипов экспрессии генов в общей крови из всех образцов с использованием пробирки Paxgene для РНК.
|
2 года
|
|
Анализ проточной цитометрии для определения доли клеток в общей смеси крови у всех людей.
Временное ограничение: 24 часа
|
9 оптимизированных панелей антител будут использоваться для определения клеточных субпопуляций в периферической крови (включая очень незначительные клеточные популяции).
|
24 часа
|
|
Определение метаболита
Временное ограничение: 2 года
|
Определение метаболитов в плазме и моче с помощью ЯМР
|
2 года
|
|
Выделение экзосом из плазмы и мочи
Временное ограничение: 2 года
|
создание методологии выделения экзосом в этих жидкостях организма для анализа экспрессии генов
|
2 года
|
|
Определение цитокинового профиля
Временное ограничение: 2 года
|
88 различных цитокинов будут оцениваться с помощью Luminex
|
2 года
|
|
Метилирование генов в общей крови
Временное ограничение: 2 года
|
Анализ метилирования будет проводиться с использованием массива метилом 450k с использованием ДНК, полученной из общей крови.
Массивы экспрессии генов микроРНК с использованием общей крови.
|
2 года
|
|
рутинные аутоантитела в сыворотке
Временное ограничение: 2 года
|
набор сывороточных аутоантител будет определяться в европейской валидированной лаборатории.
Кроме того, они будут выполнять обнаружение антител против небольших фрагментов липидов, например антифосфорилхолина), волчаночного антикоагулянта и белков комплемента в плазме.
|
2 года
|
|
Генотипирование
Временное ограничение: 2 года
|
Генотипирование будет проводиться с использованием массива всего генома.
|
2 года
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Соавторы
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
1 декабря 2014 г.
Первичное завершение (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
1 октября 2017 г.
Завершение исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
1 октября 2017 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
22 августа 2016 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
31 августа 2016 г.
Первый опубликованный (ОЦЕНИВАТЬ)
7 сентября 2016 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
23 мая 2018 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
22 мая 2018 г.
Последняя проверка
1 апреля 2018 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- PRECISESADS CS (RB 14.106)
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕ РЕШЕНО
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .