Pneumokoková nasofaryngeální kolonizace jako prediktor komunitně získané pneumonie (CAP) u dospělých s chronickými chorobami. (CAP)

Streptococcus pneumoniae (pneumokok) je celosvětově zodpovědný za více než 5 milionů úmrtí ročně (Aliberti et al., 2016; Reyes et al., 2017). Tato oportunní grampozitivní bakterie je nejčastěji identifikovanou bakterií u pacientů s CAP, akutní meningitidou a otitidou u dětí i dospělých (Paterson et al., 2010; Hinojosa et al., 2014).

Pneumokokové onemocnění se v posledním desetiletí změnilo díky univerzálním očkovacím programům proti pneumokokům, zejména u dětí, pacientů s chronickými plicními chorobami a pacientů starších 65 let. Nyní jsou u pacientů s pneumokokovými onemocněními často identifikovány sérotypy považované za klinicky nevýznamné (Imohl a kol., 2015; Vlachopoulos a kol., 2015; Cilloniz a kol., 2016; Diao a kol., 2016; Suzuki a kol. , 2017).

Úmrtnost a morbidita spojená s pneumokokovou infekcí u dospělých však zůstala v posledních desetiletích relativně stabilní (Jain et al., 2015; Bellew et al., 2018; Wunderink et al., 2018). K vysvětlení tohoto jevu bylo vytvořeno několik hypotéz. Mezi nejvíce studovanými výzkumníky bylo zdokumentováno, že cirkulující pneumokokové sérotypy jsou nyní odlišné, a proto v současnosti dostupné vakcíny nemusí být nyní tak užitečné pro prevenci invazivních pneumokokových onemocnění (Aliberti et al., 2013; Cilloniz et al., 2016).

Dospělí navíc nejsou očkováni pneumokokovou vakcínou často a vakcínu dostává pouze velmi omezená skupina pacientů. V Kolumbii není známo, zda i tato restriktivní skupina dospělých s indikací pneumokokové vakcíny byla očkována podle národních a mezinárodních směrnic. Ještě důležitější je, že není známo, zda by jiné skupiny pacientů s chronickým onemocněním mohly mít prospěch z této vakcíny.

Důležité je, že také není známo, které sérotypy jsou nejrozšířenějšími sérotypy způsobujícími kolonizaci a invazivní infekce u dospělých s chronickými onemocněními v Kolumbii.

Nedávno jsme provedli multicentrickou, nadnárodní, celosvětovou studii, jejímž cílem je lépe charakterizovat etiologii CAP (nejčastější infekce způsobené pneumokokem) (Aliberti et al., 2016; Carugati et al., 2016; Gramegna et al., 2018; Restrepo a kol., 2018; Radovanovic a kol., 2019).

Do této studie jsme zařadili více než 3 700 pacientů na šesti kontinentech a zjistili jsme, že S. pneumoniae je i nadále nejčastějším bakteriálním patogenem identifikovaným u pacientů s CAP na celém světě. V této studii jsme však také zdokumentovali, že proočkovanost proti pneumokokům je mizivá (data dosud nezveřejněna). Pevně ​​tedy věříme, že zjištění, zda je v naší zemi (Kolumbie) adekvátní očkování proti pneumokokům, a co je důležitější, které sérotypy pneumokoků kolonizují epitel nosohltanu u pacientů s chronickým onemocněním, by nám mohlo pomoci identifikovat nové indikace pneumokokové infekce. očkování a pomoci snížit zátěž pneumokokovými onemocněními.

Proto se zde pokusíme poskytnout nové informace k charakterizaci lepší pneumokokové nasofaryngeální kolonizace pacientů s chronickým onemocněním, její důsledky, její přesčasovou dynamiku a jak tato kolonizace může souviset s vývojem CPA. Navíc zde budeme schopni charakterizovat compliance očkování a jak toto předchozí očkování může modifikovat přirozený průběh pneumokokového onemocnění (tj. kolonizace nosohltanu předchází pneumokokové pneumonii). Nakonec zde provedeme důkazy z reálného světa, důkazy prospektivní studie, které poskytnou zobecnitelná data pro klinické lékaře po celém světě.

Toto je důkaz z reálného světa, prospektivní, observační, multicentrická, kohortová studie po sobě jdoucích pacientů.

Kritéria pro zařazení

Do studie budou zahrnuti všichni po sobě jdoucí ambulantní pacienti, kteří asistují 5 ambulancím s chronickými onemocněními, jako je srdeční selhání, HBP, chronické srdeční arytmie, revmatická onemocnění, bronchiektázie bez cystické fibrózy, CHOPN, s následujícími kritérii zařazení :

• Starší než 18 let
• Pacienti asistující na kardiologické, pneumologické, endokrinologické nebo revmatologické klinice v zapojených centrech
• Pacienti, u kterých jsou informace o očkování dostupné a potvrzené ve zdravotnické dokumentaci (tato informace bude potvrzena i při pohovoru s pacientem)
• Pacienti, kteří podepíší informovaný souhlas.

Kritéria vyloučení

• Pacienti s diagnózou CAP během posledních 90 dnů
• Pacienti přijatí do nemocnice během posledních 7 dnů
• Pacienti s omezením poskytování biologických vzorků

Základní postupy

Po identifikaci potenciálních subjektů studie bude od zainteresovaných pacientů získán informovaný souhlas a každému účastníkovi studie bude přiděleno jedinečné identifikační číslo. Za všech okolností pacienti obdrží více než jedno identifikační číslo. Poté budou shromážděna demografická data, minulá lékařská historie, komorbidní stavy, nedávná hospitalizace a biologické vzorky.

Provedeme výměnu nosohltanu, abychom identifikovali, kteří pacienti jsou kolonizováni S. pneumoniae, a abychom identifikovali nejrozšířenější pneumokokové sérotypy. Odebereme 20 ml krve k identifikaci zánětlivých biomarkerů a odebereme 30 ml moči pro laboratorní analýzy.

Zpracování biologických vzorků

Po odběru vzorků na ambulantních klinikách během studijních návštěv budou tyto vzorky odeslány do naší centralizované výzkumné laboratoře lokalizované na Universidad de La Sabana k provedení laboratorních experimentů. Všechny nasofaryngeální swapy budou kultivovány pro identifikaci pneumokoků; pokud je S. pneumoniae identifikován, charakterizujeme v naší laboratoři pneumokokové sérotypy. Kromě toho provedeme rtPCR pro lepší identifikaci a kvantifikaci pneumokokové kolonizace ve výtěrech z nosohltanu.

Budeme také kvantifikovat sérové ​​biomarkery zánětu pomocí komerčně dostupných souprav ELISA. Důležité je, že veškerý laboratorní personál bude zaslepený vůči charakteristikám pacientů a klinickým výsledkům, aby byla zajištěna kvalita dat a zabránilo se zaujatosti pozorovatelů.

Následná opatření a určení výsledku

Primárním cílem této studie je určit roli nasofaryngeální kolonizace při rozvoji CAP nebo IPD; po identifikaci pacientů kolonizovaných S. pneumoniae během základních experimentů budou pacienti sledováni každý měsíc telefonicky a každých 6 měsíců v našich ambulancích za účelem identifikace pacientů, u kterých se rozvine CAP nebo IPD.

Pacienti budou požádáni, aby nahlásili každou návštěvu nemocnice (návštěva na pohotovosti, přijetí do nemocnice a přijetí na JIP) koordinátorovi studie a aby přinesli propouštěcí souhrny poskytnuté nemocnicemi. Pacienti budou sledováni po dobu 2 po sobě jdoucích let. Během sledování bude prováděn odběr vzorků, aby se zjistilo, zda se u pacientů rozvine kolonizace nosohltanu nebo se změní jeho systémový zánětlivý profil. Vzorky budou odebírány a analyzovány jako základní postupy.