慢性疾患の成人における市中肺炎（CAP）の予測因子としての肺炎球菌鼻咽頭定着。 (CAP)

肺炎連鎖球菌 (肺炎球菌) は、世界中で年間 500 万人以上の死亡の原因となっています (Aliberti et al., 2016; Reyes et al., 2017)。 この日和見グラム陽性菌は、小児および成人の CAP、急性髄膜炎、および中耳炎の患者で最も頻繁に同定される細菌です (Paterson et al., 2010; Hinojosa et al., 2014)。

肺炎球菌感染症は、特に子供、慢性肺疾患の患者、および 65 歳以上の患者において、普遍的な肺炎球菌ワクチン接種プログラムにより、過去 10 年間で変化しました。 現在、臨床的に重要ではないと考えられている血清型が、肺炎球菌疾患の患者で頻繁に特定されています (Imohl et al., 2015; Vlachopoulos et al., 2015; Cilloniz et al., 2016; Diao et al., 2016; Suzuki et al. 、2017）。

ただし、成人の肺炎球菌感染症に関連する死亡率と罹患率は、過去数十年間比較的安定したままでした (Jain et al., 2015; Bellew et al., 2018; Wunderink et al., 2018)。 この現象を説明するために、いくつかの仮説が立てられました。 最も研究されているものの中で、循環している肺炎球菌の血清型は現在異なっているため、現在利用可能なワクチンは侵襲性肺炎球菌疾患を予防するのにそれほど有用ではない可能性があることを研究者が記録しています (Aliberti et al., 2013; Cilloniz et al., 2016)。

さらに、成人は肺炎球菌ワクチンを頻繁に接種されるわけではなく、非常に限定的な患者グループのみがワクチンを受けます。 コロンビアでは、国内および国際的なガイドラインに従って、肺炎球菌ワクチンの適応症を持つ制限された成人のグループでさえ予防接種を受けているかどうかは不明です. さらに重要なことは、慢性疾患を持つ他の患者グループがこのワクチンを接種することで恩恵を受けるかどうかが不明であることです。

重要なことに、コロンビアの慢性疾患の成人に定着と侵襲性感染を引き起こす最も一般的な血清型も不明です。

私たちは最近、CAP（肺炎球菌によって引き起こされる最も頻繁な感染症）の病因をよりよく特徴付けるために設計された多施設、多国籍、世界規模の研究を実施しました（Aliberti et al., 2016; Carugati et al., 2016; Gramegna et al., 2018; Restrepo et al., 2018; Radovanovic et al., 2019)。

この研究では、6 つの大陸で 3,700 人以上の患者を登録し、S. pneumoniae が世界中の CAP 患者で最も頻繁に確認される細菌性病原体であり続けていることを発見しました。 ただし、この研究では、肺炎球菌のワクチン接種率が低いことも記録しました (データはまだ公開されていません)。 したがって、私たちの国（コロンビア）で肺炎球菌ワクチン接種が適切であるかどうか、さらに重要なことに、慢性病状の患者の鼻咽頭上皮にコロニーを形成する最も一般的な肺炎球菌血清型であるかどうかを特定することは、肺炎球菌の新しい適応症を特定するのに役立つと確信しています。予防接種と肺炎球菌疾患の負担を軽減するのに役立ちます。

したがって、ここでは、慢性疾患患者の肺炎球菌鼻咽頭定着、その影響、残業のダイナミクス、およびこの定着がCPAの発生とどのように関連するかを特徴付ける新しい情報を提供しようとします. さらに、ここでは、予防接種のコンプライアンスと、この以前の予防接種が肺炎球菌疾患の自然な経過をどのように変更するかを特徴付けることができます (つまり、鼻咽頭でのコロニー形成が肺炎球菌肺炎に先行します)。 最後に、ここでは、世界中の臨床医に一般化可能なデータを提供する、現実世界の証拠、前向き研究の証拠を実行します。

これは、現実世界の証拠、前向き、観察的、多施設共同、連続した患者のコホート研究です。

包含基準

心不全、HBP、慢性心不整脈、リウマチ性疾患、非嚢胞性線維症気管支拡張症、COPDなどの慢性疾患を有する5つの外来診療所を支援するすべての連続した外来患者は、以下の包含基準で研究に含まれます:

• 18歳以上
• 参加センターの循環器科、呼吸器科、内分泌科、またはリウマチ科の診療所を補助する患者
• 予防接種情報が利用可能であり、医療記録で確認されている患者（この情報は、患者のインタビュー中にも確認されます）
• -インフォームドコンセントフォームに署名する患者。

除外基準

• 過去90日間にCAPと診断された患者
• 過去7日間に入院した患者
• 生体試料の提供に制限のある患者

ベースライン手順

潜在的な研究対象を特定した後、関心のある患者のインフォームドコンセントが得られ、各研究参加者に一意の識別番号が割り当てられます。 いかなる状況においても、患者は複数の識別番号を受け取ります。 次に、人口統計データ、過去の病歴、併存疾患、最近の入院、および生物学的サンプルが収集されます。

鼻咽頭スワップを実行して、肺炎連鎖球菌が定着している患者を特定し、最も一般的な肺炎球菌の血清型を特定します。 炎症性バイオマーカーを特定するために 20cc の血液を採取し、実験室での分析のために 30cc の尿サンプルを採取します。

生体サンプル処理

研究訪問中に外来診療所でサンプルを収集した後、これらはラサバナ大学にある中央研究所に送られ、実験室での実験が行われます。 すべての鼻咽頭スワップは、肺炎球菌の同定のための培養になります。 S. pneumoniae が特定された場合は、研究室で肺炎球菌の血清型を特徴付けます。 さらに、鼻咽頭スワブにおける肺炎球菌のコロニー形成をより適切に識別および定量化するために、rtPCR を実行します。

また、市販の ELISA キットを使用して、炎症の血清バイオマーカーを定量化します。 重要なことは、データの品質を確保し、観察者の偏見を避けるために、すべての検査室の職員が患者の特徴と臨床転帰について知らされていないことです。

フォローアップと結果の決定

この研究の主な目的は、CAPまたはIPDの発症における鼻咽頭のコロニー形成の役割を決定することです。ベースライン実験中に肺炎連鎖球菌が定着した患者を特定した後、患者は毎月電話で追跡され、6か月ごとに外来クリニックでCAPまたはIPDを発症する患者を特定します。

患者は、病院訪問（ER訪問、入院、ICU入院）を研究コーディネーターに報告し、病院から提供された退院概要を持参するよう求められます。 患者は2年連続でフォローアップされます。 フォローアップ中に、患者が鼻咽頭のコロニー形成を発症するか、全身性炎症プロファイルを変化させるかを判断するために、サンプル収集が行われます。 サンプルは、ベースライン手順として収集および分析されます。