Pneumokokk nasofaryngeal kolonisering som prediktor for fellesskapservervet lungebetennelse (CAP) hos voksne med kroniske sykdommer. (CAP)

Streptococcus pneumoniae (pneumokokken) er ansvarlig for mer enn 5 millioner dødsfall i året globalt (Aliberti et al., 2016; Reyes et al., 2017). Denne opportunistiske Gram-positive bakterien er den hyppigst identifiserte bakterien hos pasienter med CAP, akutt meningitt og otitt hos barn og voksne (Paterson et al., 2010; Hinojosa et al., 2014).

Pneumokokksykdommen har endret seg i løpet av det siste tiåret på grunn av universelle pneumokokkvaksinasjonsprogrammer, spesielt hos barn, pasienter med kroniske lungesykdommer og pasienter eldre enn 65 år. Nå identifiseres serotyper som antas å ikke være klinisk signifikante ofte hos pasienter med pneumokokksykdommer (Imohl et al., 2015; Vlachopoulos et al., 2015; Cilloniz et al., 2016; Diao et al., 2016; Suzuki et al. , 2017).

Imidlertid har dødelighet og sykelighet assosiert med pneumokokkinfeksjon hos voksne holdt seg relativt stabil de siste tiårene (Jain et al., 2015; Bellew et al., 2018; Wunderink et al., 2018). Flere hypoteser har blitt generert for å forklare dette fenomenet. Blant de mest studerte har forskere dokumentert at sirkulerende pneumokokkserotyper er forskjellige nå, og at tilgjengelige vaksiner derfor kanskje ikke er like nyttige for å forhindre invasive pneumokokksykdommer nå (Aliberti et al., 2013; Cilloniz et al., 2016).

Voksne vaksineres dessuten ikke ofte med pneumokokkvaksinen, og kun en svært restriktiv gruppe pasienter får vaksinen. I Colombia er det ikke kjent om selv den restriktive gruppen voksne med indikasjon for pneumokokkvaksine har blitt vaksinert, etter nasjonale og internasjonale retningslinjer. Enda viktigere er det ukjent om andre grupper av pasienter med kroniske medisinske sykdommer kan ha nytte av å motta denne vaksinen.

Viktigere, det er også ukjent, hvilke er de mest utbredte serotypene som forårsaker kolonisering og invasive infeksjoner hos voksne med kroniske sykdommer i Colombia.

Vi har nylig utført en multisenter, multinasjonal, verdensomspennende studie designet for å bedre karakterisere etiologien til CAP (den hyppigste infeksjonen forårsaket av pneumokokken) (Aliberti et al., 2016; Carugati et al., 2016; Gramegna et al., 2018; Restrepo et al., 2018; Radovanovic et al., 2019).

I denne studien registrerte vi mer enn 3700 pasienter på seks kontinenter, og fant at S. pneumoniae fortsetter å være det hyppigste bakterielle patogenet som er identifisert hos pasienter med CAP over hele verden. Men i denne studien dokumenterte vi også at pneumokokkvaksinasjonsraten er lav (data ennå ikke publisert). Derfor er vi overbevist om at det å identifisere om pneumokokkvaksinasjon er tilstrekkelig i vårt land (Colombia), og enda viktigere, som er de mest utbredte pneumokokkserotypene som koloniserer det nasofaryngeale epitelet til pasienter med kroniske medisinske tilstander, kan hjelpe oss med å identifisere nye indikasjoner for pneumokokker. vaksinasjon og for å redusere byrden av pneumokokksykdommer.

Derfor vil vi her forsøke å gi ny informasjon for å karakterisere bedre pneumokokk nasofaryngeal kolonisering av pasienter med kroniske medisinske sykdommer, dens implikasjoner, dens overtidsdynamikk, og hvordan denne koloniseringen kan være assosiert med CPA-utvikling. Dessuten vil vi her kunne karakterisere vaksinasjonsoverholdelse og hvordan denne forrige vaksinasjonen kan endre det naturlige forløpet av pneumokokksykdom (dvs. nasofaryngeal kolonisering går foran pneumokokkpneumoni). Til slutt, her vil vi utføre bevis fra den virkelige verden, prospektive studiebevis som vil gi generaliserbare data for klinikere over hele verden.

Dette er bevis fra den virkelige verden, prospektiv, observasjonsmessig, multisenter, en kohortstudie av påfølgende pasienter.

Inklusjonskriterier

Alle påfølgende ambulerende pasienter som assisterer til 5 poliklinikker med kroniske sykdommer som hjertesvikt, HBP, kroniske hjertearytmier, revmatiske sykdommer, ikke-cystisk fibrose bronkiektasi, KOLS, blant annet, med følgende inklusjonskriterier vil bli inkludert i studien :

• Eldre enn 18 år
• Pasienter som hjelper til kardiologi, lunge, endokrinologi eller revmatologisk klinikk i deltakende sentre
• Pasienter hvor vaksinasjonsinformasjon er tilgjengelig og bekreftet i journalen (denne informasjonen vil også bli bekreftet under pasientens intervju)
• Pasienter som signerer skjema for informert samtykke.

Eksklusjonskriterier

• Pasienter diagnostisert med CAP i løpet av de siste 90 dagene
• Pasienter innlagt på sykehus i løpet av de siste 7 dagene
• Pasienter med begrensning i å gi biologiske prøver

Grunnlinjeprosedyrer

Etter å ha identifisert potensielle studieobjekter, vil informert samtykke innhentes for interesserte pasienter, og et unikt identifikasjonsnummer vil bli tildelt hver studiedeltaker. Under alle omstendigheter vil pasienter motta mer enn ett identifikasjonsnummer. Deretter vil demografiske data, tidligere sykehistorie, komorbide tilstander, nylig sykehusinnleggelse og biologiske prøver samles inn.

Vi vil utføre en nasopharyngeal swap for å identifisere hvilke pasienter som er kolonisert med S. pneumoniae og for å identifisere hvilke som er de mest utbredte pneumokokkserotypene. Vi vil tappe 20 cc blod for å identifisere inflammatoriske biomarkører, og 30 cc urinprøver vil bli samlet inn for laboratorieanalyser.

Behandling av biologiske prøver

Etter å ha samlet inn prøver i ambulerende klinikker under studiebesøk, vil disse bli henvist til vårt sentraliserte forskningslaboratorium lokalisert i Universidad de La Sabana for å utføre laboratorieeksperimenter. Alle nasofaryngeale byttemidler vil være kultur for pneumokokkidentifikasjon; hvis S. pneumoniae blir identifisert, vil vi i vårt laboratorium karakterisere pneumokokkserotyper. Dessuten vil vi utføre rtPCR for bedre å identifisere og kvantifisere pneumokokkkolonisering i nasofaryngeale vattpinner.

Vi vil også kvantifisere serumbiomarkører for betennelse ved å bruke kommersielt tilgjengelige ELISA-sett. Viktigere er at alt laboratoriepersonell vil bli blindet for pasientenes egenskaper og kliniske utfall, for å sikre datakvalitet og unngå observatørskjevhet.

Oppfølging og resultatfastsettelse

Som hovedmålet med denne studien er å bestemme rollen til nasofaryngeal kolonisering i utviklingen av CAP eller IPD; etter å ha identifisert pasienter kolonisert av S. pneumoniae under baseline-eksperimenter, vil pasienter følges hver måned via telefon og hver 6. måned i våre poliklinikker for å identifisere pasienter som utvikler CAP eller IPD.

Pasienter vil bli bedt om å rapportere ethvert sykehusbesøk (ER-besøk, sykehusinnleggelse og ICU-innleggelse) til studiekoordinatoren og ta med utskrivningssammendrag levert av sykehus. Pasientene skal følges opp i 2 år på rad. Under oppfølginger vil det bli utført prøvetaking for å avgjøre om pasienter utvikler nasofaryngeal kolonisering eller endrer dens systemiske inflammatoriske profil. Prøver vil bli samlet inn og analysert som grunnlinjeprosedyrer.