Pneumokok nasopharyngeal kolonisering som prædiktor for samfundserhvervet lungebetændelse (CAP) hos voksne med kroniske sygdomme. (CAP)

Streptococcus pneumoniae (pneumokokken) er ansvarlig for mere end 5 millioner dødsfald om året globalt (Aliberti et al., 2016; Reyes et al., 2017). Denne opportunistiske Gram-positive bakterie er den hyppigst identificerede bakterie hos patienter med CAP, akut meningitis og otitis hos børn og voksne (Paterson et al., 2010; Hinojosa et al., 2014).

Pneumokoksygdommen har ændret sig i løbet af det sidste årti på grund af universelle pneumokokvaccinationsprogrammer, især hos børn, patienter med kroniske lungesygdomme og patienter ældre end 65 år. Nu identificeres serotyper, der menes at være ikke klinisk signifikante, ofte hos patienter med pneumokoksygdomme (Imohl et al., 2015; Vlachopoulos et al., 2015; Cilloniz et al., 2016; Diao et al., 2016; Suzuki et al. , 2017).

Dødelighed og morbiditet forbundet med pneumokokinfektion hos voksne har dog været relativt stabil i løbet af de sidste årtier (Jain et al., 2015; Bellew et al., 2018; Wunderink et al., 2018). Adskillige hypoteser er blevet genereret for at forklare dette fænomen. Blandt de mest undersøgte har forskere dokumenteret, at cirkulerende pneumokokserotyper er anderledes nu, og derfor er tilgængelige vacciner muligvis ikke så nyttige til at forhindre invasive pneumokoksygdomme nu (Aliberti et al., 2013; Cilloniz et al., 2016).

Voksne vaccineres desuden ikke hyppigt med pneumokokvaccinen, og kun en meget restriktiv gruppe patienter får vaccinen. I Colombia vides det ikke, om selv den restriktive gruppe af voksne med indikation for en pneumokokvaccine er blevet vaccineret efter nationale og internationale retningslinjer. Endnu vigtigere er det uvist, om andre grupper af patienter med kroniske medicinske sygdomme kan have gavn af at modtage denne vaccine.

Det er vigtigt, at det også er ukendt, hvilke serotyper der er de mest udbredte, der forårsager kolonisering og invasive infektioner hos voksne med kroniske sygdomme i Colombia.

Vi har for nylig udført et multicenter, multinationalt, verdensomspændende studie designet til bedre at karakterisere ætiologien af ​​CAP (den hyppigste infektion forårsaget af pneumokokken) (Aliberti et al., 2016; Carugati et al., 2016; Gramegna et al., 2018; Restrepo et al., 2018; Radovanovic et al., 2019).

I denne undersøgelse indskrev vi mere end 3.700 patienter på seks kontinenter og fandt ud af, at S. pneumoniae fortsat er det hyppigste bakterielle patogen, der er identificeret hos patienter med CAP på verdensplan. Men i denne undersøgelse dokumenterede vi også, at pneumokokvaccinationsraten er lav (data endnu ikke offentliggjort). Vi er derfor overbeviste om, at identifikation af, om pneumokokvaccination er tilstrækkelig i vores land (Colombia), og endnu vigtigere, som er de mest udbredte pneumokokserotyper, der koloniserer det nasopharyngeale epitel hos patienter med kroniske medicinske tilstande, kan hjælpe os med at identificere nye indikationer for pneumokok. vaccination og for at hjælpe med at mindske byrden af ​​pneumokoksygdomme.

Derfor vil vi her forsøge at give ny information til at karakterisere bedre pneumokok nasopharyngeal kolonisering af patienter med kroniske medicinske sygdomme, dens implikationer, dens overtidsdynamik, og hvordan denne kolonisering kan være forbundet med CPA-udvikling. Desuden vil vi her være i stand til at karakterisere overholdelse af vaccination, og hvordan denne tidligere vaccination kan ændre det naturlige forløb af pneumokoksygdom (dvs. nasopharyngeal kolonisering går forud for pneumokok-lungebetændelse). Endelig vil vi her udføre beviser fra den virkelige verden, prospektive undersøgelsesbeviser, der vil give generaliserbare data til klinikere over hele kloden.

Dette er evidens fra den virkelige verden, prospektiv, observationel, multicenter, en kohorteundersøgelse af på hinanden følgende patienter.

Inklusionskriterier

Alle på hinanden følgende ambulante patienter, der assisterer til 5 ambulatorier med kroniske sygdomme som hjertesvigt, HBP, kroniske hjertearytmier, gigtsygdomme, non-cystisk-fibrose bronkiektasi, KOL m.fl. med følgende inklusionskriterier vil blive inkluderet i undersøgelsen :

• Ældre end 18 år
• Patienter, der assisterer til kardiologisk, lunge-, endokrinologisk eller reumatologisk klinik i deltagende centre
• Patienter, hvor vaccinationsoplysninger er tilgængelige og bekræftet i journalerne (disse oplysninger vil også blive bekræftet under patientens samtale)
• Patienter, der underskriver informeret samtykkeformular.

Eksklusionskriterier

• Patienter diagnosticeret med CAP i løbet af de sidste 90 dage
• Patienter indlagt på hospitalet i løbet af de sidste 7 dage
• Patienter med begrænsning i at levere biologiske prøver

Basisprocedurer

Efter at have identificeret potentielle forsøgspersoner, vil der blive indhentet informeret samtykke for interesserede patienter, og et unikt identifikationsnummer vil blive tildelt hver undersøgelses deltager. Under alle omstændigheder vil patienter modtage mere end ét identifikationsnummer. Derefter vil demografiske data, tidligere sygehistorie, komorbide tilstande, nylig indlæggelse og biologiske prøver blive indsamlet.

Vi vil udføre en nasopharyngeal swap for at identificere hvilke patienter der er koloniseret med S. pneumoniae og for at identificere hvilke der er de mest udbredte pneumokokserotyper. Vi vil trække 20 cc blod for at identificere inflammatoriske biomarkører, og 30 cc urinprøver vil blive indsamlet til laboratorieanalyser.

Behandling af biologiske prøver

Efter at have indsamlet prøver i ambulante klinikker under studiebesøg, vil disse blive henvist til vores centraliserede forskningslaboratorium lokaliseret i Universidad de La Sabana for at udføre laboratorieeksperimenter. Alle nasopharyngeal swaps vil være kultur til pneumokok identifikation; hvis S. pneumoniae identificeres, vil vi i vores laboratorium karakterisere pneumokokserotyper. Desuden vil vi udføre rtPCR for bedre at identificere og kvantificere pneumokokkolonisering i de nasopharyngeale podninger.

Vi vil også kvantificere serumbiomarkører for inflammation ved hjælp af kommercielt tilgængelige ELISA-sæt. Det er vigtigt, at alt laboratoriepersonale bliver blindet over for patienternes karakteristika og kliniske resultater for at sikre datakvalitet og undgå observatørbias.

Opfølgninger og resultatbestemmelse

Da det primære formål med denne undersøgelse er at bestemme rollen af ​​nasopharyngeal kolonisering i udviklingen af ​​CAP eller IPD; efter at have identificeret patienter koloniseret af S. pneumoniae under baseline-eksperimenter, vil patienterne blive fulgt hver måned via telefon og hver 6. måned i vores ambulatorier for at identificere patienter, der udvikler CAP eller IPD.

Patienter vil blive bedt om at rapportere ethvert hospitalsbesøg (ER-besøg, hospitalsindlæggelse og ICU-indlæggelse) til undersøgelseskoordinatoren og om at medbringe udskrivelsesresuméer fra hospitalerne. Patienterne vil blive fulgt op i 2 på hinanden følgende år. Under opfølgninger vil prøvetagning blive udført for at bestemme, om patienter udvikler nasopharyngeal kolonisering eller ændrer dens systemiske inflammatoriske profil. Prøver vil blive indsamlet og analyseret som baseline procedurer.