Pneumokock nasofaryngeal kolonisering som prediktor för gemenskapsförvärvad lunginflammation (CAP) hos vuxna med kroniska sjukdomar. (CAP)

Streptococcus pneumoniae (pneumokocken) är ansvarig för mer än 5 miljoner dödsfall per år globalt (Aliberti et al., 2016; Reyes et al., 2017). Denna opportunistiska grampositiva bakterie är den mest frekvent identifierade bakterien hos patienter med CAP, akut meningit och öroninflammation hos barn och vuxna (Paterson et al., 2010; Hinojosa et al., 2014).

Pneumokocksjukdomen har förändrats under det senaste decenniet på grund av universella pneumokockvaccinationsprogram, särskilt hos barn, patienter med kroniska lungsjukdomar och patienter äldre än 65 år. Nu identifieras serotyper som inte anses vara kliniskt signifikanta ofta hos patienter med pneumokocksjukdomar (Imohl et al., 2015; Vlachopoulos et al., 2015; Cilloniz et al., 2016; Diao et al., 2016; Suzuki et al. , 2017).

Dödlighet och sjuklighet i samband med pneumokockinfektion hos vuxna har dock varit relativt stabil under de senaste decennierna (Jain et al., 2015; Bellew et al., 2018; Wunderink et al., 2018). Flera hypoteser har genererats för att förklara detta fenomen. Bland de mest studerade har forskare dokumenterat att serotyperna för cirkulerande pneumokocker är annorlunda nu, och att nu tillgängliga vacciner kanske inte är lika användbara för att förhindra invasiva pneumokocksjukdomar nu (Aliberti et al., 2013; Cilloniz et al., 2016).

Dessutom vaccineras vuxna inte ofta med pneumokockvaccinet, och endast en mycket restriktiv grupp patienter får vaccinet. I Colombia är det inte känt om ens den restriktiva gruppen vuxna med indikation för ett pneumokockvaccin har vaccinerats, enligt nationella och internationella riktlinjer. Ännu viktigare är det okänt om andra grupper av patienter med kroniska medicinska sjukdomar kan ha nytta av att få detta vaccin.

Viktigt är att det också är okänt, vilka är de vanligaste serotyperna som orsakar kolonisering och invasiva infektioner hos vuxna med kroniska sjukdomar i Colombia.

Vi har nyligen genomfört en multicenter, multinationell, världsomspännande studie utformad för att bättre karakterisera etiologin för CAP (den vanligaste infektionen orsakad av pneumokocken) (Aliberti et al., 2016; Carugati et al., 2016; Gramegna et al., 2018; Restrepo et al., 2018; Radovanovic et al., 2019).

I den här studien registrerade vi mer än 3 700 patienter på sex kontinenter, och fann att S. pneumoniae fortsätter att vara den vanligaste bakteriella patogenen som identifierats hos patienter med CAP över hela världen. Men i denna studie dokumenterade vi också att pneumokockvaccinationsfrekvensen är mager (data ännu inte publicerade). Därför är vi övertygade om att identifiering av om pneumokockvaccination är adekvat i vårt land (Colombia), och ännu viktigare, vilka är de vanligaste pneumokockserotyperna som koloniserar det nasofaryngeala epitelet hos patienter med kroniska medicinska tillstånd, kan hjälpa oss att identifiera nya indikationer för pneumokocker. vaccination och för att minska bördan av pneumokocksjukdomar.

Därför kommer vi här att försöka tillhandahålla ny information för att karakterisera bättre pneumokock-nasofaryngeal kolonisering av patienter med kroniska medicinska sjukdomar, dess implikationer, dess övertidsdynamik och hur denna kolonisering kan associeras med CPA-utveckling. Dessutom kommer vi här att kunna karakterisera vaccinationsefterlevnad och hur denna tidigare vaccination kan modifiera det naturliga förloppet av pneumokocksjukdom (d.v.s. nasofaryngeal kolonisering föregår pneumokockpneumoni). Slutligen, här kommer vi att utföra verkliga bevis, prospektiva studiebevis som kommer att tillhandahålla generaliserbara data för kliniker runt om i världen.

Detta är verkliga bevis, prospektiv, observationell, multicenter, en kohortstudie av på varandra följande patienter.

Inklusionskriterier

Alla konsekutiva ambulerande patienter som assisterar till 5 polikliniker med kroniska sjukdomar såsom hjärtsvikt, HBP, kroniska hjärtarytmier, reumatiska sjukdomar, icke-cystisk fibros bronkiektasi, KOL, bland annat, med följande inklusionskriterier kommer att inkluderas i studien :

• Äldre än 18 år
• Patienter som assisterar till kardiologi-, lung-, endokrinologi- eller reumatologiska kliniker på deltagande centra
• Patienter för vilka vaccinationsinformation finns tillgänglig och bekräftad i journalen (denna information kommer också att bekräftas under patientens intervju)
• Patienter som undertecknar informerat samtycke.

Exklusions kriterier

• Patienter som diagnostiserats med CAP under de senaste 90 dagarna
• Patienter inlagda på sjukhus under de senaste 7 dagarna
• Patienter med begränsningar att tillhandahålla biologiska prover

Baslinjeprocedurer

Efter att ha identifierat potentiella försökspersoner kommer informerat samtycke att erhållas för intresserade patienter, och ett unikt identifikationsnummer kommer att tilldelas varje studiedeltagare. Under alla omständigheter kommer patienter att få mer än ett identifikationsnummer. Sedan kommer demografiska data, tidigare medicinsk historia, samsjukliga tillstånd, senaste sjukhusvistelse och biologiska prover att samlas in.

Vi kommer att utföra ett nasofaryngealt byte för att identifiera vilka patienter som är koloniserade med S. pneumoniae och för att identifiera vilka som är de vanligaste pneumokockserotyperna. Vi kommer att ta 20 cc blod för att identifiera inflammatoriska biomarkörer, och 30 cc urinprover kommer att samlas in för laboratorieanalyser.

Bearbetning av biologiska prover

Efter att ha samlat prover på ambulatoriska kliniker under studiebesök kommer dessa att hänvisas till vårt centraliserade forskningslaboratorium lokaliserat i Universidad de La Sabana för att utföra laboratorieexperiment. Alla nasofaryngeala byten kommer att odlas för identifiering av pneumokocker; om S. pneumoniae identifieras kommer vi att karakterisera i vårt laboratorium pneumokockserotyper. Dessutom kommer vi att utföra rtPCR för att bättre identifiera och kvantifiera pneumokockkolonisering i nasofarynxproverna.

Vi kommer också att kvantifiera serumbiomarkörer för inflammation med hjälp av kommersiellt tillgängliga ELISA-kit. Viktigt är att all laboratoriepersonal kommer att bli blind för patienternas egenskaper och kliniska resultat, för att säkerställa datakvalitet och undvika observatörsbias.

Uppföljningar och resultatbestämning

Som det primära syftet med denna studie är att fastställa rollen av nasofaryngeal kolonisering i utvecklingen av CAP eller IPD; efter att ha identifierat patienter som koloniserats av S. pneumoniae under baseline-experiment, kommer patienter att följas varje månad per telefon och var sjätte månad på våra polikliniker för att identifiera patienter som utvecklar CAP eller IPD.

Patienterna kommer att uppmanas att rapportera alla sjukhusbesök (ärbesök, sjukhusinläggning och intensivvårdsinläggning) till studiekoordinatorn och att ta med utskrivningssammanfattningar från sjukhusen. Patienterna kommer att följas upp i två år i följd. Under uppföljningar kommer provtagning att utföras för att avgöra om patienter utvecklar nasofaryngeal kolonisering eller ändrar dess systemiska inflammatoriska profil. Prover kommer att samlas in och analyseras som baslinjeprocedurer.