Pneumokokin aiheuttama nenänielun kolonisaatio yhteisöstä hankitun keuhkokuumeen (CAP) ennustajana kroonisista sairauksista kärsivillä aikuisilla. (CAP)

Streptococcus pneumoniae (pneumokokki) on vastuussa yli 5 miljoonasta kuolemasta vuodessa maailmanlaajuisesti (Aliberti et al., 2016; Reyes et al., 2017). Tämä opportunistinen grampositiivinen bakteeri on yleisimmin tunnistettu bakteeri potilailla, joilla on CAP, akuutti aivokalvontulehdus ja otiitti lapsilla ja aikuisilla (Paterson et al., 2010; Hinojosa et al., 2014).

Pneumokokkitauti on muuttunut viimeisen vuosikymmenen aikana yleisten pneumokokkirokotusohjelmien myötä erityisesti lasten, kroonista keuhkosairautta sairastavien ja yli 65-vuotiaiden potilaiden kohdalla. Nyt serotyyppejä, joiden ei uskota olevan kliinisesti merkittäviä, tunnistetaan usein potilailla, joilla on pneumokokkisairauksia (Imohl et al., 2015; Vlachopoulos et al., 2015; Cilloniz et al., 2016; Diao et al., 2016; Suzuki et al. , 2017).

Aikuisten pneumokokki-infektioon liittyvä kuolleisuus ja sairastuvuus ovat kuitenkin pysyneet suhteellisen tasaisina viime vuosikymmeninä (Jain et al., 2015; Bellew et al., 2018; Wunderink ym., 2018). Tämän ilmiön selittämiseksi on luotu useita hypoteeseja. Tutkituimpien joukossa tutkijat ovat dokumentoineet, että kiertävät pneumokokkien serotyypit ovat nykyään erilaisia, joten tällä hetkellä saatavilla olevat rokotteet eivät ehkä ole yhtä hyödyllisiä invasiivisten pneumokokkisairauksien ehkäisyyn nyt (Aliberti et al., 2013; Cilloniz et al., 2016).

Lisäksi aikuisia ei usein rokoteta pneumokokkirokotteella, ja vain hyvin rajoitettu ryhmä potilaita saa rokotteen. Kolumbiassa ei tiedetä, onko edes se rajoittava ryhmä aikuisia, joilla on indikaatio pneumokokkirokotteen antamiseen, rokotettu kansallisten ja kansainvälisten ohjeiden mukaisesti. Vielä tärkeämpää on, että ei tiedetä, hyötyisivätkö muut kroonista sairautta sairastavat potilasryhmät tämän rokotteen saamisesta.

Tärkeää on, että ei myöskään tiedetä, mitkä ovat Kolumbiassa yleisimmät kolonisaatiota ja invasiivisia infektioita aiheuttavat serotyypit kroonista sairautta sairastavilla aikuisilla.

Olemme äskettäin tehneet monikeskuksen, monikansallisen, maailmanlaajuisen tutkimuksen, jonka tarkoituksena on karakterisoida paremmin CAP:n (yleisin pneumokokkien aiheuttama infektio) etiologia (Aliberti et al., 2016; Carugati et al., 2016; Gramegna et al., 2018; Restrepo ym., 2018; Radovanovic ym., 2019).

Tähän tutkimukseen otimme mukaan yli 3 700 potilasta kuudessa mantereessa ja havaitsimme, että S. pneumoniae on edelleen yleisin CAP-potilailla tunnistettu bakteeripatogeeni maailmanlaajuisesti. Tässä tutkimuksessa dokumentoimme kuitenkin myös, että pneumokokkirokotusten määrä on alhainen (tietoja ei vielä julkaistu). Näin ollen uskomme vakaasti, että sen selvittäminen, onko pneumokokkirokotus riittävä maassamme (Kolumbia) ja mikä tärkeintä, mitkä ovat yleisimpiä pneumokokkien serotyyppejä, jotka kolonisoivat kroonista sairautta sairastavien potilaiden nenänielun epiteeliä, voisi auttaa meitä tunnistamaan uusia pneumokokki-indikaatioita. rokotuksia ja auttaa vähentämään pneumokokkitautien aiheuttamaa taakkaa.

Siksi yritämme tässä tarjota uutta tietoa kroonisista lääketieteellisistä sairauksista kärsivien potilaiden paremman pneumokokkien nenänielun kolonisaation karakterisoimiseksi, sen seurauksista, sen ylityödynamiikasta ja siitä, kuinka tämä kolonisaatio voisi liittyä CPA:n kehitykseen. Lisäksi pystymme tässä karakterisoimaan rokotusmyöntyvyyttä ja sitä, kuinka tämä edellinen rokotus saattaa muuttaa pneumokokkitaudin luonnollista kulkua (eli nenänielun kolonisaatio edeltää pneumokokkikeuhkokuumetta). Lopuksi, tässä suoritamme todellisen maailman todisteita, prospektiivisia tutkimustodisteita, jotka tarjoavat yleistettäviä tietoja kliinikoille ympäri maailmaa.

Tämä on todellista näyttöä, tulevaisuutta, havainnointia, monikeskus, kohorttitutkimus peräkkäisistä potilaista.

Sisällyttämiskriteerit

Kaikki peräkkäiset avohoitopotilaat, jotka avustavat 5 poliklinikalla kroonisia sairauksia, kuten sydämen vajaatoimintaa, verenpainetautia, kroonisia sydämen rytmihäiriöitä, reumaattisia sairauksia, ei-kystistä fibroosista johtuvaa keuhkoputkentulehdusta, keuhkoahtaumatautia, otetaan mukaan tutkimukseen seuraavilla kriteereillä. :

• Yli 18-vuotias
• Osallistuvien keskusten kardiologian, keuhko-, endokrinologian tai reumatologian klinikoilla avustavat potilaat
• Potilaat, joiden rokotustiedot ovat saatavilla ja vahvistettu potilasasiakirjoissa (tämä tieto varmistuu myös potilaan haastattelussa)
• Potilaat, jotka allekirjoittavat tietoisen suostumuksen.

Poissulkemiskriteerit

• Potilaat, joilla on diagnosoitu CAP viimeisten 90 päivän aikana
• Potilaat, jotka on otettu sairaalaan viimeisen 7 päivän aikana
• Potilaat, joilla on rajoituksia toimittaa biologisia näytteitä

Perusmenettelyt

Mahdollisten tutkimushenkilöiden tunnistamisen jälkeen asiasta kiinnostuneille potilaille hankitaan tietoinen suostumus ja kullekin tutkimukseen osallistujalle annetaan yksilöllinen tunnistenumero. Joka tapauksessa potilaat saavat useamman kuin yhden tunnusnumeron. Sitten kerätään väestötiedot, aiempi sairaushistoria, samanaikaiset sairaudet, viimeaikainen sairaalahoito ja biologiset näytteet.

Suoritamme nenänielun vaihdon selvittääksemme, mitkä potilaat ovat kolonisoineet S. pneumoniae -bakteeria ja mitkä ovat yleisimmät pneumokokkien serotyypit. Otamme 20 cm3 verta tulehduksellisten biomarkkerien tunnistamiseksi ja 30 cm3 virtsanäytteitä otetaan laboratorioanalyysejä varten.

Biologisten näytteiden käsittely

Kun näytteitä on kerätty ambulatorisilla klinikoilla opintovierailujen aikana, ne ohjataan keskitettyyn tutkimuslaboratorioimme, joka sijaitsee Universidad de La Sabanassa, suorittamaan laboratoriokokeita. Kaikki nenänielun vaihdot ovat viljelyä pneumokokkien tunnistamiseksi; jos S. pneumoniae tunnistetaan, karakterisoimme laboratoriossamme pneumokokkien serotyypit. Lisäksi teemme rtPCR:n tunnistaaksemme ja kvantifioidaksemme paremmin pneumokokkien kolonisaation nenänielun vanupuikoista.

Määritämme myös seerumin tulehduksen biomarkkerit käyttämällä kaupallisesti saatavia ELISA-pakkauksia. Tärkeää on, että koko laboratorion henkilökunta sokeutuu potilaiden ominaisuuksiin ja kliinisiin tuloksiin, jotta voidaan varmistaa tietojen laatu ja välttää tarkkailijan harha.

Seuranta ja tulosten määrittäminen

Tämän tutkimuksen ensisijaisena tavoitteena on määrittää nenänielun kolonisaation rooli CAP:n tai IPD:n kehittymisessä; Sen jälkeen kun S. pneumoniae -bakteerin kolonisoimat potilaat on tunnistettu peruskokeiden aikana, potilaita seurataan puhelimitse kuukausittain ja 6 kuukauden välein poliklinikoissamme potilaiden tunnistamiseksi, joille kehittyy CAP tai IPD.

Potilaita pyydetään raportoimaan kaikista sairaalakäynneistä (päivystyskäynti, sairaalahoito ja teho-osastolle pääsy) tutkimuksen koordinaattorille ja tuomaan mukanaan sairaaloiden toimittamat kotiutusyhteenvedot. Potilaita seurataan 2 peräkkäisenä vuotena. Seurannan aikana näytteenotto suoritetaan sen määrittämiseksi, kehittyykö potilaiden nenänielun kolonisaatio tai muuttuuko sen systeeminen tulehdusprofiili. Näytteet kerätään ja analysoidaan perusmenetelminä.