Colonisation nasopharyngée pneumococcique en tant que facteur prédictif de la pneumonie acquise en communauté (PAC) chez les adultes atteints de maladies chroniques. (CAP)

Streptococcus pneumoniae (le pneumocoque) est responsable de plus de 5 millions de décès par an dans le monde (Aliberti et al., 2016 ; Reyes et al., 2017). Cette bactérie opportuniste à Gram positif est la bactérie la plus fréquemment identifiée chez les patients atteints de PAC, de méningite aiguë et d'otite chez l'enfant et l'adulte (Paterson et al., 2010 ; Hinojosa et al., 2014).

La maladie pneumococcique a changé au cours de la dernière décennie en raison des programmes de vaccination universelle contre le pneumocoque, en particulier chez les enfants, les patients atteints de maladies pulmonaires chroniques et les patients de plus de 65 ans. Or, des sérotypes considérés comme non cliniquement significatifs sont fréquemment identifiés chez les patients atteints de maladies pneumococciques (Imohl et al., 2015 ; Vlachopoulos et al., 2015 ; Cilloniz et al., 2016 ; Diao et al., 2016 ; Suzuki et al. , 2017).

Cependant, la mortalité et la morbidité associées à l'infection pneumococcique chez les adultes sont restées relativement stables au cours des dernières décennies (Jain et al., 2015 ; Bellew et al., 2018 ; Wunderink et al., 2018). Plusieurs hypothèses ont été émises pour expliquer ce phénomène. Parmi les plus étudiés, les chercheurs ont documenté que les sérotypes pneumococciques circulants sont différents maintenant, et donc, les vaccins actuellement disponibles peuvent ne pas être aussi utiles pour prévenir les maladies pneumococciques invasives maintenant (Aliberti et al., 2013 ; Cilloniz et al., 2016).

De plus, les adultes ne sont pas fréquemment vaccinés avec le vaccin contre le pneumocoque, et seul un groupe très restreint de patients reçoit le vaccin. En Colombie, on ne sait pas si même ce groupe restreint d'adultes ayant une indication pour un vaccin contre le pneumocoque a été vacciné, conformément aux directives nationales et internationales. Plus important encore, on ne sait pas si d'autres groupes de patients atteints de maladies médicales chroniques pourraient bénéficier de ce vaccin.

Fait important, on ne sait pas non plus quels sont les sérotypes les plus répandus causant la colonisation et les infections invasives chez les adultes atteints de maladies chroniques en Colombie.

Nous avons récemment mené une étude multicentrique, multinationale et mondiale visant à mieux caractériser l'étiologie de la PAC (l'infection la plus fréquente causée par le pneumocoque) (Aliberti et al., 2016 ; Carugati et al., 2016 ; Gramegna et al., 2018 ; Restrepo et al., 2018 ; Radovanovic et al., 2019).

Dans cette étude, nous avons recruté plus de 3 700 patients sur six continents, constatant que S. pneumoniae continue d'être l'agent pathogène bactérien le plus fréquemment identifié chez les patients atteints de PAC dans le monde. Cependant, dans cette étude, nous avons également documenté que le taux de vaccination contre le pneumocoque est faible (données non encore publiées). Ainsi, nous croyons fermement que déterminer si la vaccination antipneumococcique est adéquate dans notre pays (Colombie) et, plus important encore, quels sont les sérotypes pneumococciques les plus répandus colonisant l'épithélium nasopharyngé des patients atteints de maladies chroniques, pourrait nous aider à identifier de nouvelles indications pour le pneumocoque. vaccination et pour aider à réduire le fardeau des maladies pneumococciques.

Par conséquent, nous tenterons ici de fournir de nouvelles informations pour mieux caractériser la colonisation nasopharyngée pneumococcique des patients atteints de maladies médicales chroniques, ses implications, sa dynamique au fil du temps et la manière dont cette colonisation pourrait être associée au développement de la CPA. De plus, nous pourrons ici caractériser l'observance de la vaccination et comment cette vaccination antérieure pourrait modifier l'évolution naturelle de la maladie pneumococcique (c'est-à-dire que la colonisation nasopharyngée précède la pneumonie pneumococcique). Enfin, ici, nous réaliserons des preuves du monde réel, des preuves d'études prospectives qui fourniront des données généralisables aux cliniciens du monde entier.

Il s'agit de preuves du monde réel, prospectives, observationnelles, multicentriques, une étude de cohorte de patients consécutifs.

Critère d'intégration

Tous les patients ambulatoires consécutifs qui assistent à 5 cliniques externes souffrant de maladies chroniques telles que l'insuffisance cardiaque, l'hypertension artérielle, les arythmies cardiaques chroniques, les maladies rhumatismales, la bronchectasie non fibrosante, la MPOC, entre autres, avec les critères d'inclusion suivants seront inclus dans l'étude :

• Plus de 18 ans
• Patients assistant à une clinique de cardiologie, pneumologie, endocrinologie ou rhumatologie dans les centres participants
• Les patients dont les informations de vaccination sont disponibles et confirmées dans le dossier médical (ces informations seront également confirmées lors de l'entretien avec le patient)
• Les patients qui signent le formulaire de consentement éclairé.

Critère d'exclusion

• Patients ayant reçu un diagnostic de PAC au cours des 90 derniers jours
• Patients admis à l'hôpital au cours des 7 derniers jours
• Patients ayant des limitations pour fournir des échantillons biologiques

Procédures de base

Après avoir identifié les sujets potentiels de l'étude, un consentement éclairé sera obtenu pour les patients intéressés et un numéro d'identification unique sera attribué à chaque participant à l'étude. En toutes circonstances, les patients recevront plus d'un numéro d'identification. Ensuite, les données démographiques, les antécédents médicaux, les conditions comorbides, les hospitalisations récentes et les échantillons biologiques seront recueillis.

Nous effectuerons un échange nasopharyngé pour identifier les patients colonisés par S. pneumoniae et identifier les sérotypes pneumococciques les plus répandus. Nous prélèverons 20 cc de sang pour identifier les biomarqueurs inflammatoires et 30 cc d'échantillons d'urine seront prélevés pour des analyses en laboratoire.

Traitement des échantillons biologiques

Après avoir collecté des échantillons dans des cliniques ambulatoires lors de visites d'étude, ceux-ci seront référés à notre laboratoire de recherche centralisé situé à l'Université de La Sabana pour effectuer des expériences de laboratoire. Tous les échanges nasopharyngés seront une culture pour l'identification du pneumocoque ; si S. pneumoniae est identifié, nous caractériserons dans notre laboratoire les sérotypes pneumococciques. De plus, nous effectuerons une rtPCR pour mieux identifier et quantifier la colonisation pneumococcique dans les écouvillons nasopharyngés.

Nous quantifierons également les biomarqueurs sériques de l'inflammation, à l'aide de kits ELISA disponibles dans le commerce. Il est important de noter que tout le personnel du laboratoire ne connaîtra pas les caractéristiques des patients et les résultats cliniques, afin d'assurer la qualité des données et d'éviter les biais de l'observateur.

Suivis et détermination des résultats

Comme l'objectif principal de cette étude est de déterminer le rôle de la colonisation nasopharyngée dans le développement de la PAC ou de l'IPD ; après avoir identifié les patients colonisés par S. pneumoniae lors des expériences de base, les patients seront suivis tous les mois par téléphone et tous les 6 mois dans nos cliniques externes pour identifier les patients qui développent une PAC ou une IPD.

Les patients seront invités à signaler toute visite à l'hôpital (visite aux urgences, admission à l'hôpital et admission aux soins intensifs) au coordinateur de l'étude et à apporter les résumés de sortie fournis par les hôpitaux. Les patients seront suivis pendant 2 années consécutives. Au cours des suivis, des prélèvements seront effectués pour déterminer si les patients développent une colonisation nasopharyngée ou modifient son profil inflammatoire systémique. Des échantillons seront prélevés et analysés en tant que procédures de base.