Změny mikrobiomu dýchacích cest po umělé výměně dýchacích cest u kriticky nemocných dětských pacientů.

Umělé dýchací cesty, jako jsou endotracheální kanyly a tracheostomie, na dětských a neonatálních jednotkách intenzivní péče (PICU, NICU) zachraňují mimo jiné životy pacientům s respiračním selháním. Tato zařízení nejsou bez rizika infekce – běžné jsou infekce spojené s ventilátorem (VAI), jmenovitě pneumonie spojená s ventilátorem (VAP) a tracheitida spojená s ventilátorem (VAT). Léčba podezření na VAI představuje téměř polovinu všech antibiotik užívaných na jednotce intenzivní péče (PICU). VAI může představovat kontinuum od kolonizace trachey, progrese k tracheobronchiálnímu zánětu a poté pneumonii. Kolonizace těchto dýchacích cest je běžná a bakteriální růst nemusí nutně znamenat klinicky významnou infekci. Tracheostomie, což jsou umělé dýchací cesty určené pro chronické použití, se běžně vyměňují jednou za půl měsíčně až jednou za měsíc, částečně k narušení tvorby bakteriálního biofilmu, který napomáhá bakteriální kolonizaci a možná i infekci. Když jsou pacienti s tracheostomií přijímáni pro akutní chronické respirační selhání nebo s obavou z infekce, jsou tyto umělé dýchací cesty v některých institucích také běžně vyměňovány. Zůstává však kritická potřeba porozumět tomu, jak umělá výměna dýchacích cest mění bakteriální prostředí těchto pacientů při nemoci a zdraví. Tento výzkum předpokládá, že výměna umělých dýchacích cest změní mikrobiom umělých dýchacích cest změnou mikrobiální diverzity a relativního množství různých bakteriálních druhů umělých dýchacích cest. Tato studie bude zahrnovat prospektivní odběr tracheálních aspirátů od pacientů s umělými dýchacími cestami. Budeme provádět screening a zařazovat všechny pacienty přijaté na NICU nebo PICU v Cohen Children's Medical Center (CCMC), kteří mají tracheostomii a během příjmu získávají tracheální aspiráty, jednou za dva týdny. Když dojde k výměně umělých dýchacích cest, budou odebrány tracheální aspiráty také ve dnech před a po. Tracheální aspiráty jsou rutinně získávány na JIP a PICU z odsávání umělých dýchacích cest a představují minimální rizikovou aktivitu. Tyto vzorky budou dopraveny do Feinstein Institutes for Medical Research pro sekvenování 16s ribozomální DNA (16srDNA), které umožňuje přesnou a citlivou detekci relativního množství a klasifikaci bakteriální flóry. Tracheální aspiráty budou rozděleny do 4 skupin, aby se zohlednilo použití antibiotik do týdne od odběru aspirátu, které zahrnují: (1) Žádná antibiotika, výměna dýchacích cest; (2) žádná antibiotika, žádná změna dýchacích cest; (3) antibiotika, změna dýchacích cest; (4) antibiotika, žádná změna dýchacích cest. Dále budou získána klinická a epidemiologická data z elektronické lékařské dokumentace.