Zmiany mikrobiomu dróg oddechowych po sztucznej wymianie dróg oddechowych u krytycznie chorych dzieci.

Sztuczne drogi oddechowe, takie jak rurki dotchawicze i tracheostomie, stosowane na oddziałach intensywnej terapii pediatrycznej i noworodkowej (odpowiednio OIOM, OIOM) ratują życie między innymi pacjentom z niewydolnością oddechową. Urządzenia te wiążą się z ryzykiem infekcji – częste są infekcje związane z respiratorem (VAI), a mianowicie zapalenie płuc związane z respiratorem (VAP) i zapalenie tchawicy związane z respiratorem (VAT). Leczenie podejrzenia VAI stanowi prawie połowę przypadków stosowania antybiotyków na oddziałach intensywnej terapii pediatrycznej (PICU). VAI może reprezentować kontinuum od kolonizacji tchawicy, progresji do zapalenia tchawicy i oskrzeli, a następnie zapalenia płuc. Kolonizacja tych dróg oddechowych jest powszechna, a rozwój bakterii niekoniecznie oznacza klinicznie istotną infekcję. Tracheostomie, czyli sztuczne drogi oddechowe przeznaczone do długotrwałego stosowania, są rutynowo wymieniane co pół miesiąca lub co miesiąc, częściowo w celu zakłócenia tworzenia się biofilmu bakteryjnego, który ułatwia kolonizację bakterii i być może infekcję. Kiedy pacjenci z tracheostomią są przyjmowani z powodu ostrej, przewlekłej niewydolności oddechowej lub z powodu infekcji, w niektórych placówkach te sztuczne drogi oddechowe są również rutynowo wymieniane. Pozostaje jednak krytyczna potrzeba zrozumienia, w jaki sposób sztuczna wymiana dróg oddechowych zmienia środowisko bakteryjne tych pacjentów w zdrowiu i chorobie. W badaniu tym postawiono hipotezę, że wymiana sztucznych dróg oddechowych zmieni mikrobiom sztucznych dróg oddechowych, zmieniając różnorodność drobnoustrojów i względną liczebność różnych gatunków bakterii w sztucznych drogach oddechowych. Badanie to będzie obejmować prospektywne pobranie aspiratów z tchawicy od pacjentów ze sztucznymi drogami oddechowymi. Przeanalizujemy i zapiszemy wszystkich pacjentów przyjętych na oddział intensywnej terapii dla noworodków lub oddział intensywnej terapii w Cohen Children's Medical Center (CCMC), którzy mają tracheostomię i podczas przyjęcia pobierają aspiraty z tchawicy co dwa tygodnie. W przypadku wymiany sztucznych dróg oddechowych, aspiraty z tchawicy zostaną pobrane również w dniach poprzedzających i po zabiegu. Aspiraty z tchawicy są rutynowo pobierane na oddziałach intensywnej terapii dla noworodków i oddziałów intensywnej terapii poprzez odsysanie sztucznych dróg oddechowych i stanowią czynność o minimalnym ryzyku. Próbki te zostaną przekazane do Feinstein Institutes for Medical Research w celu sekwencjonowania 16-s rybosomalnego DNA (16srDNA), co pozwala na dokładne i czułe wykrywanie względnej liczebności i klasyfikację flory bakteryjnej. Aspiraty z tchawicy zostaną podzielone na 4 grupy w celu uwzględnienia zastosowania antybiotyków w ciągu tygodnia od pobrania aspiratów, które obejmują: (1) brak antybiotyków, zmiana dróg oddechowych; (2) brak antybiotyków, brak zmiany dróg oddechowych; (3) antybiotyki, zmiana dróg oddechowych; (4) antybiotyki, brak zmian w drogach oddechowych. Dodatkowo zostaną pozyskane dane kliniczne i epidemiologiczne z elektronicznej dokumentacji medycznej.