Prospektiv undersøgelse af lægemiddelresistente patogener blandt lever-, tarm- og multiviscerale transplantationsmodtagere

Metoder:

Dag 1 er, når patienter er indlagt på transplantationsintensiv afdeling (ICU) efter lever-, tarm- eller multivisceral transplantation. Afføringsprøver (i tilfælde af patienter med rektale poser og/eller diarré) for cefotaxim-resistente gramnegative stave ville blive opnået inden for 24 timer efter indlæggelse på intensivafdelingen og derefter ugentligt indtil udskrivelse fra hospitalet eller isolation af MDR P. aeruginosa og ESBL- K. pneumoniae, alt efter hvad der indtræffer først. Mens patienter intuberes, vil endotracheale aspirater også blive opnået på en ugentlig basis. Næsepodninger for MRSA ville blive opnået inden for 24 timer efter indlæggelse på intensivafdelingen og derefter ugentligt indtil udskrivelse fra hospitalet eller isolation af MRSA, alt efter hvad der kommer først.

Hvis der ikke er afføring de dage, der skal opsamles afføring, vil der blive anskaffet en rektal podning. Hvis der desuden trækkes i endotrakealtuben, vil der ikke blive opnået yderligere endotracheale aspirater. Prøver vil kun blive indhentet, hvis de er tilgængelige. Hvis podepinden opnået på dag 1 er positiv for de organismer, der undersøges, vil der ikke blive udtaget yderligere prøver.

Der vil ikke forekomme graviditetstest, da alle potentielle patienter, der skal transplanteres, ikke må være gravide. Gravide kvinder eller kvinder, der i øjeblikket ammer et spædbarn, vil ikke få lov til at deltage i denne undersøgelse.

Når først en lægemiddelresistent organisme (MDR P. aeruginosa, ESBL K. pneumoniae og/eller MRSA) er isoleret, vil der blive udtaget hudpodninger fra lysken og subclavia-områderne én gang. Der vil ikke blive indhentet yderligere podninger fra patienten, men han/hun vil blive fulgt klinisk for at bestemme organismens indvirkning på patientens kliniske resultat.

Kulturer opnået efter den behandlende læges skøn vil blive gennemgået, og hvis P. aeruginosa, ESBL-K. pneumoniae eller MRSA er isoleret, vil de blive indsamlet fra det diagnostiske mikrobiologiske laboratorium og opbevaret i Dr. Patersons laboratorium til yderligere analyse af molekylære resistensmekanismer. Disse prøver ville være blevet kasseret, når identifikation og modtagelighedstest er afsluttet af det diagnostiske laboratorium.

Følgende oplysninger vil også blive indsamlet: demografiske data (adresse, fødselsdato osv.), som omfatter alder, køn, højde, vægt og fødselstilstand, tidligere rapporter forbundet med deltagerens tilstand, laboratorieresultater, nuværende medicinbrug, og eventuelle andre tidligere medicinske problemer/historie, tidligere indlæggelseshistorie, årsag til transplantation, tidligere transplantationshistorie, anvendt immunsuppression, modtaget antimikrobielle stoffer, andre udførte operationer, varighed af mekanisk ventilation, behov for dialyse, tilgængelige mikrobiologiske undersøgelser, forenklet akut fysiologisk score (SAPS) ved indlæggelse, varighed af intensivophold. Disse oplysninger vil blive indhentet fra journalerne og/eller emnet og blive en del af forskningsjournalen.

Patienten vil blive set som en indlagt patient på University of Pittsburgh Medical Center, og hvert besøg vil tage cirka 30 minutter. Patienten vil blive tilset af et medlem af forskerteamet.

Prøveopbevaring af organismen

De biologiske prøver vil være under kontrol af hovedforskeren i dette forskningsprojekt. For at beskytte fortroligheden vil alle personlige identifikatorer (dvs. navn, personnummer og fødselsdato) blive fjernet (afidentificeret) og erstattet med et specifikt kodenummer. Oplysningerne, der forbinder disse kodenumre med de tilsvarende personers identiteter, vil blive opbevaret på et separat, sikkert sted. Efterforskerne i denne undersøgelse vil beholde prøverne på ubestemt tid. Alle prøver vil blive leveret afidentificerede. Hvis en forsøgsperson trækker sig tilbage og afgiver anmodningen skriftligt, vil prøver, der er indsamlet og ikke allerede behandlet, blive destrueret. Alle prøver vil blive opbevaret i Dr. Patersons laboratorium i Scaife Hall, Room 812, 3550 Terrace Street, Pittsburgh, PA.

Patienten har afsluttet undersøgelsen, når patienten er udskrevet fra hospitalet.

Laboratoriemetoder:

Podninger til P. aeruginosa og ESBL-K. pneumoniae vil blive plantet på cetrimidagar og næringsagar suppleret med cefotaxim, vancomycin og amphotericin B. Antimikrobiel modtagelighedstest vil blive udført ved hjælp af diskdiffusionstest og E-test. ESBL-screening vil blive udført ved hjælp af dobbelt diskdiffusionstest og E-test med cefotaxim-cefotaxim/clavulansyre og ceftazidim-ceftazidim/clavulansyre.

Podninger for MRSA vil blive plantet i et kromogent medie, der er selektivt for MRSA.

For at studere de molekylære mekanismer, der er ansvarlige for udviklingen af ​​antimikrobiel resistens blandt P. aeruginosa-isolaterne, kvantitativ realtids-PCR på gener, der koder for almindelige effluxpumper, PCR for mutationer i quinolonresistensbestemmende regioner gyrA-, gyrB- og parC-gener og PCR for beta-lactamaser vil blive udført.

Puls-field gelelektroforese (PFGE) vil blive udført på isolaterne af hver enkelt patient for at afgøre, om isolaterne er genotypisk ens. PFGE vil også blive udført i alle MDR P. aeruginosa isolater for at bestemme, om de tilhører en enkelt eller flere kloner på intensivafdelingen.