Identifizierung von Biomarkern im Zusammenhang mit menschlichem hepatozellulärem Karzinom durch SELDI

Hepatozelluläres Karzinom (HCC) ist die häufigste Krebstodesursache in Taiwan. In Taiwan sterben jedes Jahr über 6000–8000 Menschen an dieser Krebserkrankung. Obwohl eine regelmäßige sonografische Untersuchung ein kleines HCC frühzeitig erkennen kann und es viele Therapiemöglichkeiten für ein HCC gibt, bleiben die Therapieergebnisse unbefriedigend. Obwohl Alpha-Fetoprotein (AFP) und Des-γ-Carboxy-Prothrombin (DCP) als Tumormarker für die Diagnose von HCCs verwendet werden, ist AFP bei etwa einem Drittel der kleinen (< 3 cm) HCC-Patienten normal. Erhöhte DCP-Aktivitäten waren bei 44–47,6 % vorhanden. mit HCCs unter 3 cm. Somit sind diese beiden Marker nicht gut genug für die Früherkennung kleiner HCCs. Um das Überleben zu verbessern, sind noch weitere Untersuchungen der frühen diagnostischen Marker erforderlich.

Die globale Analyse zellulärer Proteine ​​wurde kürzlich als Proteomik bezeichnet und ist ein Schlüsselbereich der Forschung, die sich im postgenomischen Bereich entwickelt. Im Hinblick auf Krebs hat die Proteomik das Potenzial, neue Ziele für die Therapie oder Marker für die Diagnose zu identifizieren. Zu den proteomischen Profilierungstechniken bei der Entdeckung von Biomarkern gehören (1) 2-D-PAGE / MALDI-MS (zweidimensionale Gelelektrophorese, Polyacrylamid-Gelelektrophorese) / Matrix-unterstützte Laserdesorption / Ionisations-Massenspektrometrie), (2) LC/MS/MS (Flüssigkeitschromatographie/MS/MS), (3) SELDI-TOF (surface-enhanced laser desorption ionization time-of-flight). Diese Techniken haben ihre eigenen Vor- und Nachteile.

SELDI ist eine kürzlich beschriebene Modifikation von MALDI-TOP, bei der kleine Mengen Protein direkt auf einen Biochip aufgetragen werden, der mit spezifischen chemischen Matrizen (hydrophob, kationisch, anionisch, normale Phase usw.) oder biochemischen Molekülen wie DNA-Oligonukleotiden beschichtet oder gereinigt ist Proteine. Die nach dem Waschen zurückbleibenden gebundenen Proteine ​​werden mittels Massenspektrometrie analysiert, um den Protein-Fingerabdruck der Probe zu erhalten. Die erkannten Proteine ​​werden als eine Reihe von Peaks angezeigt.

SELDI-TOF MS kann Proteinprofile mit hohem Durchsatz liefern. Den Patienten werden Blut-, Urin-, Körperflüssigkeits- oder Gewebeproben entnommen und dann auf verschiedene ProteinChip-Arrays aufgetragen. Auf diese Weise werden die Unterschiede in den Proteinexpressionsprofilen von zwei oder mehr unterschiedlichen Proben ermittelt. Der SELDI-Ansatz wurde erfolgreich zur Identifizierung von Biomarkern verschiedener Krebsarten wie Prostatakrebs, Blasenkrebs, Eierstockkrebs, Lungenkrebs, Dickdarmkrebs, Brustkrebs und Bauchspeicheldrüsenkrebs eingesetzt.

In diesem aktuellen Projekt werden wir die SELDI-Technik anwenden, um die HCC-Biomarker zu identifizieren. Es werden Serenproben von HCC-Patienten und relevanten Kontrollen gesammelt. Die Proben werden dann einer SELDI-Analyse unterzogen. Wir hoffen, dass wir die neuen HCC-Biomarker finden können. Wenn Biomarker für HCC identifiziert werden, kann dies für die klinische Anwendung zur möglichen Früherkennung von HCC genutzt werden.