Comparación del abordaje no invasivo y la secuenciación del exoma fetal en el diagnóstico prenatal cuando se descubren signos ecográficos fetales (DPNI-Exome)

El descubrimiento de malformaciones congénitas y/o signos inespecíficos por ecografía (5% de los embarazos) representa un auténtico reto médico. Su pronóstico es variable dependiendo de la etiología subyacente, desde fetopatías adquiridas hasta enfermedades genéticas raras. En Francia, el enfoque diagnóstico se basa actualmente en exámenes de imagen (ecografía, resonancia magnética cerebral, gammagrafía ósea 3D, etc.) y/o exámenes biológicos, generalmente en muestreo invasivo (biopsia de trofoblasto, amniocentesis o punción de sangre fetal) con enfermedades infecciosas (CMV, toxoplasmosis, parvovirus B19, etc.), metabólicas (enzimas en el torrente sanguíneo, etc.) y genéticas (cariotipo estándar, FISH, matriz CGH y secuenciación de genes específicos). El rendimiento de esta estrategia ronda el 30%, dejando al 70% de las parejas sin pronóstico posible.

Durante la última década, la genética médica ha experimentado una revolución tecnológica con el desarrollo de la secuenciación de ADN de alto rendimiento (HTS) que permite el análisis de genes específicos (panel) o el exoma (ES). Los estudios internacionales publicados sobre el uso de SE en el diagnóstico prenatal (DPN) se han vuelto más comunes, con criterios de inclusión variables, resultando en tasas de diagnóstico entre 15 y 36%, superiores a las del array CGH (8-15%). En Francia, FHU TRANSLAD coordina el estudio piloto nacional AndDI-PRENATOME, que ha permitido eliminar las barreras tecnológicas del PND ES y obtener un rendimiento diagnóstico del 39% en 33 días de media.

Paralelamente, el reciente desarrollo de NIPD (cribado prenatal no invasivo) sobre ADN fetal libre circulante en sangre materna ha permitido proponer una estrategia no invasiva. Sin embargo, esta técnica se utiliza actualmente en el control prenatal solo en unas pocas indicaciones: determinación del sexo fetal, búsqueda de aneuploidías, análisis del estado rhesus fetal o, más raramente, el diagnóstico dirigido de enfermedades monogénicas. El equipo de Estrasburgo ha realizado recientemente un estudio piloto utilizando un panel NIPD en parejas con antecedentes de neomutación en un gen responsable de la discapacidad intelectual, que ha demostrado la viabilidad de capturar y luego secuenciar un panel de 500 genes en el ADN fetal libre circulante. en sangre materna.

Dado que la secuenciación del exoma en profundidad a partir de pequeñas cantidades de ADN ahora es asequible y factible, los investigadores desean comparar enfoques invasivos y no invasivos para el descubrimiento de malformaciones fetales en la ecografía: se realizará un análisis del exoma en trío en paralelo con el ADN fetal circulante. y ADN fetal extraído después de una punción invasiva para comparar el rendimiento diagnóstico de estos dos enfoques.

Los investigadores proponen un estudio piloto para elaborar una evaluación organizativa que incluya una evaluación de los desafíos para la coordinación e interacción entre profesionales, la relevancia del sistema (aceptabilidad, expectativas, satisfacción de parejas y profesionales...), su eficacia y eficiencia . El objetivo de este proyecto piloto será observar el impacto organizacional en los Centros Pluridisciplinarios de Diagnóstico Prenatal y los laboratorios de genética, y afinar los indicadores necesarios para el seguimiento del sistema; también implicará la realización de entrevistas exploratorias a profesionales y parejas para elaborar el estudio cualitativo que permitirá posteriormente evaluar la pertinencia de la organización.