Сравнение неинвазивного подхода и секвенирования экзома плода в пренатальной диагностике при обнаружении ультразвуковых признаков плода (DPNI-Exome)

Выявление врожденных пороков развития и/или неспецифических признаков с помощью УЗИ (5% беременностей) представляет собой настоящую медицинскую проблему. Их прогноз варьируется в зависимости от основной этиологии, начиная от приобретенных фетопатий и заканчивая редкими генетическими заболеваниями. Во Франции диагностический подход в настоящее время основан на визуализирующих исследованиях (УЗИ, МРТ головного мозга, 3D-сканировании костей и т. д.) и/или биологических исследованиях, как правило, на инвазивных исследованиях (биопсия трофобласта, амниоцентез или пункция крови плода) на инфекционные (ЦМВ, токсоплазмоз, парвовирус В19 и др.), метаболические (ферменты в кровотоке и др.) и генетические (стандартный кариотип, FISH, массив CGH и таргетное секвенирование генов) исследования. Выход этой стратегии составляет около 30%, оставляя 70% пар без возможного прогноза.

За последнее десятилетие медицинская генетика претерпела технологическую революцию с развитием высокопроизводительного секвенирования ДНК (HTS), позволяющего анализировать целевые гены (панель) или экзом (ES). Международные исследования, опубликованные по использованию ES в пренатальной диагностике (PND), стали более распространенными, с различными критериями включения, в результате чего частота диагностики составляет от 15 до 36%, что выше, чем у матричного CGH (8-15%). Во Франции FHU TRANSLAD координирует национальное пилотное исследование AndDDI-PRENATOME, которое позволило устранить технологические барьеры для PND ES и получить диагностический выход 39% в среднем за 33 дня.

Параллельно с этим недавняя разработка NIPD (неинвазивного пренатального скрининга) свободной ДНК плода, циркулирующей в материнской крови, позволила предложить неинвазивную стратегию. Однако в настоящее время эта методика применяется в пренатальной помощи лишь по нескольким показаниям: определение пола плода, поиск анеуплоидий, анализ резус-статуса плода или, реже, прицельная диагностика моногенных заболеваний. Команда из Страсбурга недавно провела пилотное исследование с использованием панели NIPD у пар с неомутацией в гене, ответственном за умственную отсталость, в анамнезе, которое продемонстрировало возможность захвата и последующего секвенирования панели из 500 генов на свободной циркулирующей ДНК плода. в материнской крови.

Поскольку высокоглубинное секвенирование экзома из небольшого количества ДНК в настоящее время доступно и осуществимо, исследователи хотят сравнить инвазивные и неинвазивные подходы к обнаружению пороков развития плода на УЗИ: анализ трио-экзома будет выполняться параллельно с циркулирующей ДНК плода. и ДНК плода, извлеченная после инвазивной пункции, чтобы сравнить диагностические возможности этих двух подходов.

Исследователи предлагают провести пилотное исследование, чтобы подготовить организационную оценку, включая оценку ставок для координации и взаимодействия между профессионалами, актуальность системы (приемлемость, ожидания, удовлетворенность пар и профессионалов...), ее эффективность и действенность. . Целью этого пилотного проекта будет наблюдение за организационным влиянием на многопрофильные центры пренатальной диагностики и генетические лаборатории, а также уточнение показателей, необходимых для мониторинга системы; он также будет включать в себя проведение предварительных интервью со специалистами и супружескими парами для подготовки качественного исследования, которое впоследствии позволит оценить актуальность организации.