Srovnání neinvazivního přístupu a sekvenování fetálního exomu v prenatální diagnostice při objevení fetálních ultrazvukových známek (DPNI-Exome)

Odhalení vrozených vývojových vad a/nebo nespecifických příznaků ultrazvukem (5 % těhotenství) představuje skutečnou lékařskou výzvu. Jejich prognóza se liší v závislosti na základní etiologii, od získaných fetopatií až po vzácná genetická onemocnění. Ve Francii je diagnostický přístup v současnosti založen na zobrazovacích vyšetřeních (ultrazvuk, MRI mozku, 3D kostní skeny atd.) a/nebo biologických vyšetřeních, obecně na invazivních odběrech (biopsie trofoblastu, amniocentéza nebo punkce fetální krve) s infekčním (CMV, toxoplazmóza, parvovirus B19 atd.), metabolické (enzymy v krevním řečišti atd.) a genetické (standardní karyotyp, FISH, array CGH a cílené sekvenování genů). Výtěžnost této strategie je asi 30 %, takže 70 % párů zůstává bez možné prognózy.

Během posledního desetiletí prošla lékařská genetika technologickou revolucí s rozvojem vysoce výkonného sekvenování DNA (HTS), které umožňuje analýzu cílených genů (panel) nebo exomu (ES). Mezinárodní studie publikované o použití ES v prenatální diagnostice (PND) se staly běžnějšími, s proměnlivými zařazovacími kritérii, jejichž výsledkem je diagnostická míra mezi 15 a 36 %, vyšší než u array CGH (8–15 %). Ve Francii FHU TRANSLAD koordinuje národní pilotní studii AnDDI-PRENATOME, která umožnila odstranit technologické bariéry pro PND ES a získat diagnostickou výtěžnost 39 % v průměru za 33 dní.

Souběžně s tím nedávný vývoj NIPD (Non-invasive prenatální screening) na volné fetální DNA cirkulující v mateřské krvi umožnil navrhnout neinvazivní strategii. Tato technika je však v současnosti v prenatální péči využívána pouze v několika indikacích: určení pohlaví plodu, vyhledávání aneuploidií, analýza stavu rhesus plodu nebo vzácněji cílená diagnostika monogenních onemocnění. Tým ve Štrasburku nedávno provedl pilotní studii s použitím panelu NIPD u párů s anamnézou neomutace genu odpovědného za mentální postižení, která prokázala proveditelnost zachycení a následného sekvenování panelu 500 genů na volné cirkulující fetální DNA. v mateřské krvi.

Vzhledem k tomu, že sekvenování exomu s vysokou hloubkou z malých množství DNA je nyní dostupné a proveditelné, chtějí výzkumníci porovnat invazivní a neinvazivní přístupy k odhalení malformací plodu na ultrazvuku: paralelně s cirkulující fetální DNA bude provedena trojitá exomová analýza. a fetální DNA extrahovanou po invazivní punkci za účelem srovnání diagnostického výkonu těchto dvou přístupů.

Vyšetřovatelé navrhují pilotní studii s cílem připravit organizační hodnocení zahrnující vyhodnocení sázek na koordinaci a interakce mezi odborníky, relevanci systému (přijatelnost, očekávání, spokojenost párů a odborníků...), jeho účinnost a efektivitu . Cílem tohoto pilotního projektu bude sledování organizačního dopadu na Plurldisciplinární centra prenatální diagnostiky a genetické laboratoře a zpřesnění indikátorů nezbytných pro monitorování systému; bude také zahrnovat provádění průzkumných rozhovorů s odborníky a páry za účelem přípravy kvalitativní studie, která následně umožní vyhodnotit relevanci organizace.