Simian Foamy -viruksen tarttuminen ihmisiin

Tausta Suuri osa, noin 75 %, ihmisiin äskettäin ilmaantuista virusaineista on peräisin muista eläimistä. Lajien väliseen leviämiseen johtaneen ensimmäisen kosketuksen jälkeen nämä virukset ovat usein kehittyneet ja levinneet ihmispopulaatiossa; mukana on erilaisia ​​mekanismeja, mutta ymmärrys virusten ja niihin liittyvien sairauksien ilmaantumisen alkuvaiheista on edelleen monissa tapauksissa rajallista.

Mikrobiologista seurantaa tartuntariskissä olevissa populaatioissa tarvitaan itämisprosessin alkamisen ja varhaisten vaiheiden tunnistamiseksi ja dokumentoimiseksi.

Nonhuman-kädelliset (NPH:t), joilla on monia geneettisiä, fysiologisia ja mikrobiologisia yhtäläisyyksiä ihmisten kanssa, ovat monien tartunnanaiheuttajien mahdollinen lähde.

Tämä on selkeästi osoitettu useille apinan retroviruksille: HIV-1:n ja 2:n uskotaan olevan peräisin simpanssi- ja mangabey-viruksista Keski- ja Länsi-Afrikassa. Onkogeenisen retroviruksen HTLV-1:n eri molekyylialatyyppien leviäminen Afrikassa johtuu pääasiassa STLV-1:n lajien välisestä siirtymisestä eri NHP-lajeista kaukaisessa menneisyydessä.

Vaahtovirukset kuuluvat retrovidae-perheeseen ja spumavirus-sukuun. Ne ovat monimutkaisia ​​eksogeenisiä retroviruksia ja ovat hyvin yleisiä monissa eläinlajeissa, mukaan lukien kädelliset, kissat, naudat ja hevoset, joissa ne aiheuttavat pysyviä infektioita.

Vaahtovirukset eivät yleensä ole patogeenisiä edes kokeellisesti infektoiduissa eläimissä. Ne eivät näytä aiheuttavan sairauksia niille harvoille ihmisille, jotka ovat vahingossa saaneet tartunnan ja joita on seurattu kliinisesti ja biologisesti pitkällä aikavälillä (alle 15 ihmistä on seurattu tähän mennessä, ja he olivat alun perin terveitä, joten valinnassa on harhaa). Patogeenisyyden puuttuminen in vivo on ristiriidassa vaahtoviruksen voimakkaiden sytopatogeenisten vaikutusten kanssa in vitro, kun ne aiheuttavat synsyyttia soluviljelmissä.

Toisin kuin lentivirukset (HIV-SIV), vaahtovirukset ovat geneettisesti erittäin stabiileja in vivo. Fylogeneettinen analyysi on osoittanut geneettistä vaihtelua tartunnan saaneesta eläinlajista riippuen. Tämä osoittaa näiden retrovirusten pitkää yhteisevoluutiota luonnollisten isäntiensä kanssa. Switzer ym. osoittivat, että vaahtoiset virukset ovat kehittyneet yhdessä vanhan maailman kädellisten kanssa vähintään 30 miljoonan vuoden ajan (Switzer et al. 2005). Nämä tiedot voivat selittää patogeenisyyden ilmeisen puuttumisen in vivo kroonisesta infektiosta huolimatta.

Vaahtoisten virusten molekyyliominaisuuksia on tutkittu laajasti in vitro, mutta tällä hetkellä tiedetään vähän näiden virusten ominaisuuksista in vivo ja erityisesti tartunnan epidemiologisista determinanteista. Itse asiassa kontaminaatiotapoja ja primaarisen infektion ominaisuuksia ihmisillä luonnollisissa olosuhteissa ymmärretään edelleen huonosti.

Julkaistut harvinaiset epidemiologiset tiedot koskevat enimmäkseen vankeudessa pidettyjen NHP-populaatioita: vaahtovirusten seroepärevalenssi voi olla 75 % tai enemmän aikuisilla näissä populaatioissa. Useat tutkimukset ovat osoittaneet, että tartunnan saaneiden eläinten syljessä on korkeat virustiitterit, mikä viittaa tartuntatapaan. Suunnielun limakalvo on tärkeä replikaatiokohta vihreillä apinoilla, ja äskettäin julkaistussa artikkelissa kerrotaan korkeista virus-RNA-tasoista makakien syljen ja suunnielun näytteissä. Nämä havainnot viittaavat siihen, että puremat tai kosketus suun limakalvon ja syljen kanssa voivat olla välittymismekanismeja, ainakin joissakin tapauksissa. Muut tutkimukset vankeudessa pidettyjen paviaanien yhdyskunnissa viittaavat siihen, että tartunta voi tapahtua seksuaalisesti ja/tai äidiltä lapselle toistuvan sylkikontaktin kautta.

Ihmisten aiheuttamaa vaahtovirustartuntaa on raportoitu: 1–4 % ihmisistä, jotka ovat ammattimaisesti altistuneet NHP:lle (kuten eläinlääkärit ja eläintarhoissa, eläintarhoissa ja primatologian laboratorioissa työskentelevät henkilöt) Pohjois-Amerikassa ja harvemmin Euroopassa, voivat olla tartunnan saanut.

Amerikkalainen ryhmä on osoittanut joidenkin Kamerunissa asuvien metsästäjien tartunnan gorilloista ja mandrilleista peräisin olevien vaahtomäisten virusten kanssa (Wolfe et al. 2004). Joitakin infektiotapauksia on osoitettu ihmisillä Kaakkois-Aasiassa, jotka ovat olleet kosketuksissa apinoihin (erityisesti makakkiin): temppeleissä, erityisesti Indonesiassa, työskentelevillä tai metsästykseen tai muuhun toimintaan, joka saa heidät läheiseen kosketukseen apinoiden kanssa. Matemaattiset mallit ovat arvioineet, että noin kuusi tuhatta temppelivierailijaa kohden Balilla, Indonesiassa, jossa on paljon makakeja, on saanut apinavaahtoviruksen tartunnan (Engel et al. 2006).

Pitkäaikainen yhteistyö tutkijoiden, Kamerunin Pasteur-keskuksen, IRD:n ja Yaounde I:n yliopiston välillä serologisia ja molekyylitekniikoita (PCR) käyttäen on osoittanut vaahtoavia viruksia gorilla-, simpanssi-, mandrilli- ja porapopulaatioissa. Kamerunissa. Aikuiset NHP-populaatiot näillä alueilla ovat voimakkaasti infektoituneita vaahtoviruksilla, ja kullekin lajille on oma virus (Calattini et al. 2004, Calattini et al. 2006b).

Yllämainitun amerikkalaisen tutkimuksen mukaisesti tutkijat ovat osoittaneet, että gorillat, simpanssit ja mandrillit ovat saaneet metsästäjiä tartunnan, kun ne ovat olleet kosketuksissa näihin kädellisiin (Calattini et al. 2007).

Institut Pasteurin EPVO-yksikkö on työskennellyt tiiviissä yhteistyössä Kamerunin Pasteur Centerin ja IRD:n kanssa yli 15 vuoden ajan lukuisissa epidemiologisissa tutkimuksissa ihmisen retrovirusten HTLV-1 alalla (Mahieux et al. 2000b, Mauclere et al. 1997), HTLV-2 (Gessain et ai. 1995, Mauclere et ai. 1995), apinaretrovirukset STLV-1 ja STLV-3 (Mahieux et al. 2000a, Meertens ym. 2002, Meertens et al. 2001, Meertens ym. 2003, Nerrienet ym. 2004, Nerrienet ym. 2001) ja HTLV-3 (Calattini ym. 2009, Calattini ym. 2006a, Calattini ym. 2005).

Tutkitut ihmispopulaatiot ovat pääasiassa Etelä-Kamerunissa. Tutkijat keskittyvät edelleen useisiin Etelä-Kamerunin populaatioihin kerätäkseen lisätietoja vaahtoretrovirusten hankinnan riskitekijöistä kontaktin jälkeen NHP:n kanssa.

Nämä populaatiot elävät tiheiden sademetsäalueiden lähellä tai niillä. Ne ovat erityisen vaarassa näiden alueiden NHP-kasvien suuren biologisen monimuotoisuuden vuoksi. Suurin riski muodostuu suhteellisen usein kosketuksista NHP-eläinten kanssa metsästyksen aikana, joka on tarkoitettu sekä pensaanlihan kulutukseen että myyntiin.

TAVOITTEET Tässä esitettävä hanke koostuu neljästä vaiheesta. Nämä vaiheet voidaan suorittaa samanaikaisesti.

Päätavoite (vaiheet 1 ja 2) Tämän työn tarkoituksena on suorittaa serologinen ja molekyylitutkimus arvioidakseen vaahtovirusinfektion esiintyvyyttä ihmisillä, joilla on riski joutua kosketuksiin apinoiden kanssa, ja karakterisoida lajien välisen leviämisen riskitekijöitä.

Tämä hanke vastaa mikrobiologista seurantaa ja erityisesti virusten esiintymisen alkuvaiheiden tutkimusta.

Toissijaiset tavoitteet (vaiheet 3 ja 4)

1. Tutki vaahtovirusten mahdollista suvunsisäistä leviämistä indeksitapauksista, jotka kaikki ovat saaneet viruksen suurapinan puremana.
2. Tutki mahdollisia biologisia (erityisesti immunovirologisia) ja kliinisiä poikkeavuuksia tartunnan saaneilla henkilöillä tapauskontrollitutkimuksen avulla. Tämä vaatii vähintään 30 indeksitapausta ja 30–60 ohjausobjektia, jos mahdollista.

TUTKIMUKSEN ORGANISAATIO Tämän viruksen esiintymistä koskevan työn arvo ja merkitys esitellään sekä hallinnollisille että perinteisille (kyläpäällikkö) kunnille. Tutkijat työskentelevät kolmella Etelä-Kamerunin alueella: rannikkoalueella (Bipindi/Lolodorf/Campo), keskeisemmällä alueella (Djoum/Oveng/Mintom/Akonolinga/Somolamo) ja idässä Abong-Mangin alueella, Lomié ja Messok.

Näillä metsäalueilla tutkijat työskentelevät bantukylissä (Ngoumba, Fang, Mvae, Zimé jne.) sekä kahden eri pygmien populaation, lännessä bakolien ja idässä bakolaisten kanssa.

Tiedot toimitetaan jokaiselle yksilölle ja lääkärit keräävät kaikkien osallistujien kirjallisen suostumuksen.

Hankkeen 1. vaiheessa tutkimusta ehdotetaan kaikille aikuisille. Ei ole valintaa. Suoritetaan fyysinen tutkimus ja verinäyte 5/10 ml:n EDTA-putkeen.

Vaiheessa 2 tutkijat etsivät erityisesti aikuisia, jotka ovat olleet kosketuksissa NHP:n kanssa elämänsä aikana. Näihin kosketuksiin voi sisältyä puremia, naarmuja tai muita vammoja metsästyksen aikana tai satunnaisia ​​kohtaamisia naarmujen kanssa. Suoritetaan tutkimus ja verikoe 5/10 ml:n EDTA-putkeen. Epidemiologiset tiedot riskitekijöistä kerätään lyhyellä kyselylomakkeella.

Vaiheessa 3 tutkijat tekevät toisen vierailun laajentaakseen tutkimuksen tartunnan saaneiden yksilöiden ydinperheeseen (puoliso ja lapset). Suoritetaan tutkimus ja verenotto 5/10 ml:n EDTA-putkeen (taulukko 1).

Vaiheen 4 aikana tartunnan saaneille yksilöille tehdään lisätutkimuksia Kamerunin Pasteur-keskuksessa Yaoundéssa (vaihe 4). Tämän vierailun aikana kerätään sylkeä. Suun näytteet otetaan hieromalla posken sisäpuolta vanupuikolla ja huuhtelemalla sitten suu ja keräämällä huuhteluneste steriiliin pulloon. Veri otetaan jatkotutkimuksia varten. EPVO maksaa majoituksen Yaoundéssa, kuljetukset ja koehenkilöiden ruokailut.

Perhetutkimus viruksen mahdollisen leviämisen havaitsemiseksi sekä kliininen ja biologinen tapauskontrollitutkimus tehdään toisessa vaiheessa, mikäli ensimmäisen seroepidemiologisen ja virologisen tutkimuksen aikana havaitaan riittävästi tartunnan saaneita.

Institut Pasteurin EPVO-yksikkö on täysin vastuussa kenttätöiden organisoinnista ja toteutuksesta IRD:n (ajoneuvon vuokraus kuljettajineen) ja CPC:n (virologian laboratorion vastaanotto) logistiikkatuella. Professori Antoine Gessain koordinoi projektia Pariisissa ja Kamerunissa ja tri Edouard Betsem järjestää työn Kamerunissa.

Näytteet jaetaan eriin. Kaksi alikvoottia plasmaa ja perifeerisen veren buffy coat -valmistetta jäädytetään Pasteur Centerissä Kamerunissa. Joissakin tapauksissa perifeerisen veren mononukleaarisoluja saadaan Ficollilla ja sitten viljellään.

Nämä näytteet lähetetään sitten lentoteitse Pariisin Institut Pasteuriin nykyisten kuljetusstandardien mukaisesti.

Pariisissa EPVO-yksikön jäsenet tekevät biologisia testejä ja tilastollisia analyysejä.