Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Simian Foamy Virus överföring till människor

16 augusti 2022 uppdaterad av: Institut Pasteur

Epidemiologiska och molekylära aspekter av interspecies överföring av skummande virus från apor till människor: en modell av de tidiga stadierna av viral uppkomst.

Ungefär tre fjärdedelar av de virusagens som nyligen har dykt upp hos människor anses härröra från andra djur. Dessa virus har ofta utvecklats och spridit sig till den mänskliga befolkningen genom olika mekanismer efter den första kontakten som resulterade i överföring mellan arter. Men kunskapen om de inledande stadierna av uppkomsten av virus och associerade sjukdomar är fortfarande begränsad i många fall. Mikrobiologisk övervakning i populationer med risk för överföring skulle ge insikter om initiering och tidiga skeden av uppkomstprocessen.

Icke-mänskliga primater (NHP) delar många genetiska, fysiologiska och mikrobiologiska egenskaper med människor och är potentiella källor till många smittämnen. Detta har visats för flera apretrovirus. HIV-1 och 2 tros ha sitt ursprung från schimpans- respektive mangabeyvirus som finns i Central- och Västafrika. Den nuvarande fördelningen av de olika molekylära subtyperna av det onkogena retroviruset HTLV-1 i Afrika är huvudsakligen resultatet av många fall av överföring mellan arter av STLV-1 från NHP-arter i det avlägsna förflutna.

Skumliga virus tillhör familjen Retrovidae och släktet Spumavirus. De är komplexa exogena retrovirus och är mycket vanliga i många djurarter, inklusive primater, katter, nötkreatur och hästar, där de orsakar ihållande infektioner.

Det första syftet med arbetet är att studera de epidemiologiska och molekylära aspekterna av överföring av skumvirus från apor till människor i populationer i riskzonen, såsom invånarna (särskilt jägare) i byarna i de täta skogarna i södra Kamerun. Det är ett område där NHP fortfarande är mycket vanliga, med en stor mångfald av arter. Utredarna har redan visat att förekomsten av skumvirus är mycket hög hos dessa apor och människoapor (gorillor och schimpanser). Kontakt mellan dessa apor och byborna är mycket frekvent, främst under jakt. Det andra syftet med projektet är att studera de kliniska och biologiska egenskaperna hos infekterade personer och undersöka intrafamiliell överföring från infekterade indexfall.

Studieöversikt

Detaljerad beskrivning

BAKGRUND En stor andel, cirka 75 %, av de virala ämnen som nyligen har dykt upp hos människor har härstammat från andra djur. Efter den första kontakten, vilket resulterade i överföring mellan arter, har dessa virus ofta utvecklats och spridits genom den mänskliga befolkningen; olika mekanismer är involverade, men förståelsen för de inledande stadierna av uppkomsten av virus och associerade sjukdomar är fortfarande begränsad i många fall.

Mikrobiologisk övervakning i populationer med risk för överföring krävs för att identifiera och dokumentera initiering och tidiga skeden av uppkomstprocessen.

Icke-mänskliga primater (NPH), som delar många genetiska, fysiologiska och mikrobiologiska likheter med människor, är en potentiell källa till många smittämnen.

Detta har tydligt påvisats för flera apretrovirus: HIV-1 och 2 tros ha sitt ursprung från schimpans- respektive mangabeyvirus i Central- och Västafrika. Fördelningen av de olika molekylära subtyperna av det onkogena retroviruset HTLV-1 i Afrika är huvudsakligen resultatet av mönstret av överföring mellan arter av STLV-1 från olika NHP-arter i det avlägsna förflutna.

Skumliga virus tillhör familjen retrovidae och släktet spumavirus. De är komplexa exogena retrovirus och är mycket vanliga i många djurarter, inklusive primater, katter, nötkreatur och hästar, där de orsakar ihållande infektioner.

Skumliknande virus är i allmänhet icke-patogena, även hos experimentellt infekterade djur. De verkar inte orsaka sjukdom hos de få människor som av misstag har blivit infekterade och kliniskt och biologiskt följt upp på lång sikt (färre än 15 personer har följts hittills och de var ursprungligen friska så att det finns en selektionsbias). Frånvaron av patogenicitet in vivo står i kontrast till de starka cytopatogena effekterna av skumvirus in vitro där de orsakar syncytier i cellkulturer.

Till skillnad från lentivirus (HIV-SIV) är skumvirus extremt genetiskt stabila in vivo. Fylogenetisk analys har visat genetisk variation, beroende på den infekterade djurarten. Detta indikerar lång samutveckling av dessa retrovirus med deras naturliga värdar. Switzer et al., visade att skummande virus har utvecklats tillsammans med gamla världens primater i minst 30 miljoner år (Switzer et al. 2005). Dessa data kan förklara den uppenbara frånvaron av patogenicitet in vivo trots kronisk infektion.

De molekylära egenskaperna hos skummande virus har studerats omfattande in vitro, men lite är för närvarande känt om egenskaperna hos dessa virus in vivo, och i synnerhet om de epidemiologiska bestämningsfaktorerna för infektion. I själva verket är föroreningssätten och egenskaperna hos den primära infektionen hos människor under naturliga förhållanden fortfarande dåligt förstådda.

De sällsynta epidemiologiska data som publiceras är främst för populationer av NHP:er i fångenskap: seroprevalensen av skumbildande virus kan nå 75 % eller mer hos vuxna i dessa populationer. Flera studier har visat att saliven från infekterade djur har höga titrar av viruset, vilket tyder på smittsättet. Slemhinnan i orofarynx är en viktig plats för replikation hos gröna apor och en färsk artikel rapporterar höga nivåer av viralt RNA i saliv och munsvalgprover från makaker. Dessa observationer tyder på att bett eller kontakt med munslemhinna och saliv kan vara överföringsmekanismer, åtminstone i vissa fall. Andra studier i kolonier av babianer i fångenskap tyder på att överföring kan ske sexuellt och/eller från mor till barn genom upprepad salivkontakt.

Människors infektion med skummande virus har rapporterats: 1 till 4 % av personer som yrkesmässigt exponeras för NHP (som veterinärer och personal som arbetar i djurhus, djurparker och primatologiska laboratorier) i Nordamerika och, mer sällan, i Europa kan vara infekterad.

En amerikansk grupp har visat infektion av skumvirus, härrörande från gorillor och mandriller, hos vissa jägare som bor i Kamerun (Wolfe et al. 2004). Vissa fall av infektion har påvisats hos personer i Sydostasien i kontakt med apor (särskilt makaker): personer som arbetar i tempel, särskilt i Indonesien, eller som är involverade i jakt eller andra aktiviteter som sätter dem i nära kontakt med apor. Matematiska modeller har uppskattat att ungefär sex av 1 000 tempelbesökare i Bali, Indonesien, där det finns många makaker, har infekterats med ett skumliknande virus (Engel et al. 2006).

Det långsiktiga samarbetet mellan utredarna, Pasteur Center of Cameroon, IRD och University of Yaounde I, med hjälp av serologiska och molekylära tekniker (PCR), har visat på skummande virus i vilda populationer av gorillor, schimpanser, mandriller och borrar. i Kamerun. Vuxna populationer av NHP i dessa regioner är starkt infekterade med skumvirus, med ett specifikt virus för varje art (Calattini et al. 2004, Calattini et al. 2006b).

I enlighet med den amerikanska studien som citeras ovan har forskarna visat infektion av jägare av skumvirus som finns i gorillor, schimpanser och mandriller efter att ha varit i kontakt med dessa primater (Calattini et al. 2007).

EPVO-enheten vid Institut Pasteur har arbetat i nära samarbete med Pasteur Center i Kamerun och IRD i mer än 15 år på ett flertal epidemiologiska studier inom området för humana retrovirus HTLV-1 (Mahieux et al. 2000b, Mauclere et al. . 1997), HTLV-2 (Gessain et al. 1995, Mauclere et al. 1995), apretrovirusen STLV-1 och STLV-3 (Mahieux et al. 2000a, Meertens et al. 2002, Meertens et al. 2001, Meertens et al. 2003, Nerrienet et al. 2004, Nerrienet et al. 2001) och HTLV-3 (Calattini et al. 2009, Calattini et al. 2006a, Calattini et al. 2005).

De studerade mänskliga populationerna finns främst i södra Kamerun. Utredarna kommer att fortsätta att fokusera på flera populationer i södra Kamerun för att samla in ytterligare information om riskfaktorer för förvärv av skummande retrovirus efter kontakt med NHP.

Dessa populationer lever nära, eller i, täta regnskogsområden. De är särskilt utsatta på grund av den höga biologiska mångfalden av NHP i dessa regioner. Den största risken kommer från relativt frekvent kontakt med NHP vid jakt, vilket är för både konsumtion och försäljning av bushmeat.

MÅL Det här presenterade projektet består av fyra faser. Dessa faser kan utföras samtidigt.

Huvudmål (fas 1 och 2) Syftet med detta arbete är att genomföra en serologisk och molekylär kartläggning för att bedöma förekomsten av skumvirusinfektion hos personer med risk för kontakt med apor och att karakterisera riskfaktorer för överföring mellan arter.

Detta projekt motsvarar mikrobiologisk övervakning och i synnerhet studiet av de första stadierna av viral uppkomst.

Sekundära mål (fas 3 och 4)

  1. Undersök eventuell intrafamiliell överföring av skummande virus från indexfall, som alla fick viruset genom att bli biten av en människoapa.
  2. Undersök möjliga biologiska (särskilt immunvirologiska) och kliniska avvikelser hos infekterade individer genom en fallkontrollstudie. Detta kommer att kräva minst 30 indexfall och 30 till 60 kontroller, om möjligt.

ORGANISERING AV STUDIEN Värdet och betydelsen av detta arbete med viral uppkomst kommer att presenteras för både administrativa och traditionella (byhövding) lokala myndigheter. Utredarna kommer att arbeta i tre regioner i södra Kamerun: kustregionen (Bipindi/Lolodorf/Campo), en mer central region (Djoum/Oveng/Mintom/Akonolinga/Somolamo) och i öst i regionen Abong-Mang, Lomié och Messok.

I dessa skogsområden arbetar utredarna i bantubyar (Ngoumba, Fang, Mvae, Zimé, etc.) och med de två olika populationerna av pygméer, Bakolas i väst och Bakas i öst.

Information ges till varje individ och skriftligt medgivande från alla deltagare samlas in av läkare.

I fas 1 av projektet föreslås studien till alla vuxna. Det finns inget urval. En fysisk undersökning och blodtappning i ett 5/10 ml EDTA-rör utförs.

I fas 2 kommer utredarna specifikt att söka efter vuxna som har varit i kontakt med en NHP under sin livstid. Dessa kontakter kan innefatta bett, repor eller andra skador under jakt eller tillfälliga möten med NHP. En undersökning och blodtagning i ett 5/10 ml EDTA-rör görs. De epidemiologiska uppgifterna om riskfaktorer samlas in genom ett kort frågeformulär.

I fas 3 kommer utredarna att göra ett andra besök för att utöka undersökningen till kärnfamiljen av infekterade individer (maka och barn). En undersökning och blodtappning i ett 5/10 ml EDTA-rör utförs (tabell 1).

Under fas 4 kommer ytterligare kliniska och biologiska undersökningar att utföras på infekterade individer vid Pasteur Center i Kamerun i Yaoundé (fas 4). Under detta besök samlas saliv upp. Orala prover tas genom att gnugga insidan av kinden med en pinne och sedan skölja munnen och samla upp sköljvätskan i en steril flaska. Blod kommer att samlas in för vidare studier. Boende i Yaoundé, transport och måltider för ämnena kommer att täckas av EPVO.

Familjestudien för att upptäcka eventuell överföring av viruset, och den kliniska och biologiska fallkontrollstudien, kommer att genomföras under den andra fasen, om tillräckligt många infekterade personer upptäcks under den första sero-epidemiologiska och virologiska undersökningen.

EPVO-enheten vid Institut Pasteur är fullt ansvarig för organisationen och genomförandet av fältarbetet med logistiskt stöd från IRD (hyra fordon med förare) och CPC (mottagning på virologilaboratoriet). Prof Antoine Gessain koordinerar projektet i Paris och Kamerun, och Dr. Edouard Betsem organiserar arbetet i Kamerun.

Proverna är alikvoterade. Två alikvoter plasma och en buffy coat-preparat från perifert blod fryses in på Pasteur Center i Kamerun. I vissa fall kommer mononukleära celler från perifert blod att erhållas på Ficoll och sedan odlas.

Dessa prover skickas sedan till Institut Pasteur i Paris med flyg, enligt gällande transportstandarder.

Tillbaka i Paris utförs biologiska tester och statistisk analys av medlemmar i EPVO-enheten.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

1600

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studera Kontakt Backup

Studieorter

      • Yaoundé, Kamerun
        • Rekrytering
        • Centre Pasteur du Cameroun
        • Kontakt:
          • Edouard Betsem, MD

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

5 år till 90 år (Barn, Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

Undersökningen har genomförts och kommer att genomföras i byar i södra Kamerun och målpopulationen kommer att förändras under de fyra faserna av studien enligt följande:

  1. Till en början mötte alla vuxna (fas 1).
  2. I den andra fasen, personer som har varit i fysisk kontakt med apor (bett, repor, sår etc.) främst under jakt och rengöring av bushmeat
  3. Slutligen, efter screening: fokusera på infekterade individer och inkludering av deras närmaste familj (främst makar och barn) för att studera potentiell intrafamiliell överföring (fas 3).
  4. För infekterade individer en årlig klinisk, biologisk och immunologisk undersökning, under 3 år (Fas 4). En oinfekterad person matchad för ålder, kön, etnisk grupp och ort kommer att rekryteras som kontroll för varje fall.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Bor på landsbygden i Kamerun
  • Att vara > 5 år gammal
  • Att ha fått studieinformation och ha lämnat skriftligt samtycke för sig själv och barn, om tillämpligt (för alla faser)

Exklusions kriterier:

  • Att ha vägrat ge samtycke
  • Att vara mindre än 5 år gammal

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Observationsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiv: Tvärsnitt

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Kontroller
Vuxna som bor på landsbygden i Kamerun, inte infekterade med apeskumvirus
Plasmaprover testas med avseende på närvaron av antikroppar riktade mot skumvirus genom western blotting (WB). BHK-21-cellinjen infekterad med ett schimpansskumvirus används som en källa för viralt antigen. Prover anses vara positiva om det finns nettoreaktivitet mot GAG-dubbletten (70 till 74 kD). DNA med hög molekylvikt kommer att extraheras, från antingen buffy coats, cellkulturer eller båda, för molekylärbiologiska studier. Närvaron och kvaliteten på DNA:t kommer att verifieras genom amplifiering av ett fragment av beta-globingenen. Två regioner av genomiskt DNA från skummande virus kommer att amplifieras med kapslad PCR, med användning av generiska amplimerer, vilket ger upphov till fragment av integrasgenen (425 bp) och LTR (109 bp).
Simian Foamy virusinfektion
Vuxna som bor på landsbygden i Kamerun, infekterade med apskumsvirus
Plasmaprover testas med avseende på närvaron av antikroppar riktade mot skumvirus genom western blotting (WB). BHK-21-cellinjen infekterad med ett schimpansskumvirus används som en källa för viralt antigen. Prover anses vara positiva om det finns nettoreaktivitet mot GAG-dubbletten (70 till 74 kD). DNA med hög molekylvikt kommer att extraheras, från antingen buffy coats, cellkulturer eller båda, för molekylärbiologiska studier. Närvaron och kvaliteten på DNA:t kommer att verifieras genom amplifiering av ett fragment av beta-globingenen. Två regioner av genomiskt DNA från skummande virus kommer att amplifieras med kapslad PCR, med användning av generiska amplimerer, vilket ger upphov till fragment av integrasgenen (425 bp) och LTR (109 bp).

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Infektion med simian foamy virus genom bestämning av närvaron av specifika antikroppar i plasma
Tidsram: 3 år
Bestämning av närvaron av specifika antikroppar i plasma genom en positiv Western blot för skummande virus
3 år
Infektion med simian foamy virus genom bestämning av närvaron av viralt DNA i blodkroppar
Tidsram: 3 år
Bestämning av närvaron av viralt DNA i blodceller genom en positiv PCR-analys med användning av generiska amplimerer, vilket ger upphov till fragment av integrasgenen (425 bp) och LTR (109 bp).
3 år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Utredare

  • Huvudutredare: Antoine GESSAIN, MD, Institut Pasteur

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Allmänna publikationer

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

1 november 2010

Primärt slutförande (Förväntat)

1 oktober 2022

Avslutad studie (Förväntat)

1 oktober 2023

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

7 juli 2017

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

18 juli 2017

Första postat (Faktisk)

21 juli 2017

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

17 augusti 2022

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

16 augusti 2022

Senast verifierad

1 augusti 2022

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • 2010-27

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

Nej

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Kliniska prövningar på Simian Foamy Virus Infection (störning)

Kliniska prövningar på Simian foamy virus infektion

3
Prenumerera