MicroUDxTM: nopea diagnostiikkatyökalu, joka ehkäisee kuoleman ja vammautumisen yleisissä infektioissa (MicroUDxTM)
Nopean ja tarkan menetelmän kehittäminen virtsatieinfektiota aiheuttavien bakteerien havaitsemiseen ja herkkyystestaukseen metabolomista alustaa käyttämällä
Taustaa ja järkevää:
Antibiootit ovat modernin lääketieteen perusta. Antimikrobiaaleille resistenttien (AMR) organismien lisääntyminen maailmanlaajuisesti on vakava maailmanlaajuinen terveysongelma. Koska näköpiirissä on vähän uusia mikrobilääkkeitä, on välttämätöntä kehittää uusia lähestymistapoja olemassa olevien lääkkeidemme käyttöiän pidentämiseksi. AMR on monimutkainen ongelma, jota ohjaavat monet tekijät. Yli puolella määrätyistä antibiooteista ei ole lääketieteellistä hyötyä, ja avohoitokäynnit komplisoitumattomien virtsatieinfektioiden (UTI) vuoksi ovat suuri syy tähän ongelmaan. Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että lähes puolet virtsatietulehdusten vuoksi hoidetuista saa väärän etulinjan lääkkeen ja 75 prosentilla potilaista hoidon kesto on sopimaton. Nykyisen diagnostisen tekniikan rajoitukset tekevät mahdottomaksi tunnistaa virtsatieinfektioiden patogeenejä ja mitata niiden antibioottiherkkyyttä useimmille virtsatieinfektiopotilaille tyypillisten lyhyiden avohoitokäyntien aikana. Nämä olosuhteet johtavat tarpeettoman vahvempien tai sopimattomien mikrobilääkkeiden epäasianmukaiseen käyttöön. Tämän tutkimuksen tavoitteena on kehittää ja arvioida järjestelmä, joka pystyy havaitsemaan bakteerit virtsasta ja löytämään parhaan antibiootin alle 4 tunnissa, mikä mahdollistaa nopean diagnoosin ja sopivimman ja kustannustehokkaimman mikrobilääkkeen käytön havaitulle aineelle.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tässä tutkimuksessa tehtävät testit suoritetaan joko Calgaryn diagnostisen ja tieteellisen keskuksen mikrobiologian laboratoriossa säilytetyille bakteeri-isolaateille tai enintään yhdelle millilitralle jäännösvirtsanäytettä, joka toimitetaan diagnostiseen laboratorioon virtsan viljely- ja herkkyyspyynnön kanssa. Kaikki virtsaviljelmät suoritetaan ja niistä raportoidaan standardilaboratorioprotokollien mukaisesti. Tutkimustestejä tehdään vain jäännösnäytteelle, kun potilasnäytteet on käsitelty tai raportoitu kliinisiä tarkoituksia varten.
Tutkimuksen ensimmäisessä vaiheessa uropatogeenien metaboliset biomarkkerit tunnistetaan massaspektrometrialla diagnostisen mikrobiologian laboratorion jäädytettyjen isolaattien alaviljelmistä. Tämä sisältää vähintään 50 isolaattia kukin uropatogeeneista, jotka koostuvat muun muassa Escherichia colista, Klebsiella oxytocasta, Klebsiella pneumoniaesta, Enterobacter-lajeista, Proteus mirabilisista, Citrobacter-lajeista, Staphylococcus aureuksesta, Staphylococcus saprophyticus-, Pseudomonas aeruccginus- ja Enterocoeruccginus-lajeista. Biomarkkerit, joita esiintyy yli 95 prosentissa isolaateista, käyttävät myöhemmin 2000 negatiivisen ja 2000 positiivisen virtsaviljelmän analyysiä. Yhdisteet, jotka myöhemmin tunnistetaan suurisaataviksi, valitaan hiili-13-merkinnöille palvelustandardien mukaisesti.
Tutkimuksen vaiheessa II, sen jälkeen kun biomarkkerin rikastuslaite on kehitetty CMRF:ssä, laitteen suorituskykytesti suoritetaan käyttämällä jäännösvirtsanäytettä 1000 negatiivisesta ja 2000 positiivisesta virtsanäytteestä, kuten edellä on kuvattu. Uuden laitteen suorituskykyä arvioidaan suhteessa standardiviljelmiin ja virtsan nestekromatografia-massaspektrometriaan.
Sen jälkeen, kun herkkä ja spesifinen määritys on luotu, diagnostisen mikrobiologian laboratoriossa tehdään prospektiivinen tutkimus. 3000 virtsaviljelyyn lähetettyä näytettä käsitellään rinnakkain uuden laitteen ja mikrobiologisten standardien kanssa. Kunkin analyytin herkkyys, spesifisyys ja ennustearvo verrattuna standardiviljelmään määritetään tässä tutkimuksen osassa. Kustannuslaskelmia ja suorituskykyominaisuuksia, mukaan lukien uuden määrityksen läpimenoaika, verrataan laboratoriotavanomaiseen menettelyyn.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Ian A Lewis, PhD
- Puhelinnumero: 403-220-4366
- Sähköposti: ian.lewis2@ucalgary.ca
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Troy D Feener, MSc
- Puhelinnumero: 403-870-1201
- Sähköposti: tdfeener@ucalgary.ca
Opiskelupaikat
-
-
Alberta
-
Calgary, Alberta, Kanada, T2N 1N4
- University Of Calgary
-
Ottaa yhteyttä:
- Ian A Lewis, PhD
- Puhelinnumero: 403-220-4366
- Sähköposti: ian.lewis2@ucalgary.ca
-
Ottaa yhteyttä:
- Troy D Feener, MSc
- Puhelinnumero: 403-870-1201
- Sähköposti: tdfeener@ucalgary.ca
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Potilaita, jotka eivät ole toimittaneet virtsanäytteitä, ei oteta mukaan, koska näytteet tarvitaan sekä standarditesteihin että tutkimukseen. Tämä kattaa potilaat, joita lääkärit hoitavat empiirisesti.
Poissulkemiskriteerit:
- Potilaita, jotka eivät ole toimittaneet virtsanäytteitä viljelyyn, ei oteta mukaan tutkimukseen.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
UTI positiivinen
Jäännösvirtsanäytteitä testaavan tutkimuksen I vaiheessa tavoitteena on ottaa mukaan vähintään 50 positiivista näytettä jokaisesta bakteerilajista, jonka tiedetään yleisesti liittyvän virtsatietulehduksiin. Valitsimme 2 000 positiivista virtsaa, jotta näitä organismeja saadaan vangittua riittävästi kehitysprosessissa. Tutkimuksen vaiheen II osalta sama määrä positiivisia näytteitä, jotta kaikki yleiset virtsatieinfektioita aiheuttavat lajit saadaan mukaan. Mukana olevien negatiivisten näytteiden määrä on vähennetty 1000:een. Vaihe 3 - noin kolmasosa kaikista toimitetusta virtsanäytteestä on positiivinen uropatogeenin suhteen. Otoskoko on 3000, odotamme 1000 näistä olevan kulttuuripositiivisia. Odotamme, että useimmat uropatogeenit, joita esiintyy vähintään 5 %:n esiintymistiheydellä, sisällytetään riittävän määrän validointiprosessiin. |
|
UTI negatiivinen kontrolli
2000 negatiivista virtsanäytettä ajetaan kontrolloidusti sen varmistamiseksi, että väärän positiivisuuden määrä on alhainen.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Assay ID Validation
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Tutkimuksen validointivaiheessa herkkyys, spesifisyys sekä positiiviset ja negatiiviset ennustearvot merkittävän bakteriurian havaitsemiseksi käyttämällä kultastandardina viljelmää, nämä arvot lasketaan koko kohortille standardimääritelmien mukaisesti tilastoohjelmistolla (Analyse-it for Excel) .
|
2 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Herkkyys - uuden määrityksen antimikrobinen herkkyys verrattuna tavanomaisiin laboratoriomenetelmiin
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Toissijainen tulosmuuttuja on antimikrobisen herkkyyden havaitseminen uudella määrityksellä. Laskelma on olennainen ja kategorinen yhteensopivuus, suuret, erittäin suuret ja pienet virheet uuden määrityksen ja standardilaboratoriomenetelmien välillä standardilaboratorion määritelmien mukaisesti.
|
2 vuotta
|
|
Käänne-aika bakteerien havaitsemiseen ja herkkyyteen
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Toinen toissijainen tulos on bakteerien havaitsemisen kiertoaika (TAT) ja herkkyystulosten saatavuus.
|
2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Ian A Lewis, PhD, University Of Calgary
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Odotettu)
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- REB19-00442
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .